Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TTCTNCFTQTTPLWRRNPEGQPLCNACGLFLKLHGVVRPLSL

The query sequence (length=42) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4gat:A 66 42 1.0000 0.6364 1.0000 1.73e-26 5gat:A, 6gat:A, 7gat:A, 2vus:I, 2vus:J, 2vus:K, 2vus:L, 2vus:M, 2vus:N, 2vus:O, 2vus:P, 2vut:I, 2vut:J, 2vut:K, 2vut:L, 2vut:M, 2vut:N, 2vut:O, 2vut:P, 2vuu:I, 2vuu:J, 2vuu:K, 2vuu:L, 2vuu:M, 2vuu:N, 2vuu:O, 2vuu:P
2 2m9w:A 63 41 0.6667 0.4444 0.6829 8.47e-18 8vg0:T, 8vg1:T
3 2gat:A 66 42 0.6429 0.4091 0.6429 6.81e-16 1gat:A, 1gau:A, 3gat:A
4 5o9b:A 68 42 0.6429 0.3971 0.6429 6.21e-15
5 4hc7:A 108 42 0.6190 0.2407 0.6190 6.85e-15 3dfv:D, 3dfv:C, 3dfx:A, 3dfx:B, 4hc9:A
6 4hc7:A 108 38 0.5238 0.2037 0.5789 1.21e-10 3dfv:D, 3dfv:C, 3dfx:A, 3dfx:B, 4hc9:A
7 4hca:A 99 42 0.6190 0.2626 0.6190 7.42e-15 4hc7:B
8 4hca:A 99 38 0.5238 0.2222 0.5789 1.33e-10 4hc7:B
9 6zfv:A 63 38 0.5238 0.3492 0.5789 7.12e-11 1gnf:A
10 3vd6:C 96 38 0.5238 0.2292 0.5789 1.95e-10 2l6y:A, 2l6z:A, 3vek:C, 3vek:F, 1y0j:A
11 3vd6:C 96 30 0.4762 0.2083 0.6667 3.96e-10 2l6y:A, 2l6z:A, 3vek:C, 3vek:F, 1y0j:A
12 8j48:A 38 33 0.4286 0.4737 0.5455 1.98e-06 8j48:D
13 2kae:A 56 41 0.3571 0.2679 0.3659 0.008
14 4a7z:A 881 12 0.1905 0.0091 0.6667 0.71 4a7k:A, 4a7y:A
15 8cen:M 310 30 0.2619 0.0355 0.3667 2.0 8ceo:M, 5fmf:P, 6gyk:M, 6gyl:M, 6gym:M, 7ml0:M, 7ml1:M, 7ml2:M, 7o4i:M, 7o4j:M, 7o72:M, 7o73:M, 7o75:M, 5oqj:M, 5oqm:M, 7zs9:M, 7zsa:M, 7zsb:M
16 7b6s:FFF 271 30 0.3571 0.0554 0.5000 2.2 7b6s:AAA, 7b6s:BBB, 7b6s:CCC, 7b6s:DDD, 7b6s:EEE, 7b6s:GGG, 7b6s:HHH, 7b6s:III, 7b6s:JJJ, 7b6t:AAA, 7b6t:CCC, 7b6t:DDD, 7b6t:FFF, 7b6t:HHH, 7b6t:JJJ, 7b6t:GGG, 7b6t:III, 7b6u:AAA, 7b6u:BBB, 7b6u:CCC, 7b6u:DDD, 7b6u:EEE, 7b6u:FFF, 7b6u:GGG, 7b6u:HHH, 7b6u:III, 7b6u:JJJ, 7b6v:AAA, 7b6v:BBB, 7b6v:CCC, 7b6v:DDD, 7b6v:EEE, 7b6v:FFF, 7b6v:GGG, 7b6v:HHH, 7b6v:III, 7b6v:JJJ, 6y63:AAA, 6y63:BBB, 6y63:HHH, 6y63:III, 6y63:EEE, 6y63:DDD, 6y63:GGG, 6y64:D, 6y64:F, 6y64:G, 6y64:J, 6y64:B, 6y64:A, 6y64:C, 6y64:E, 6y64:H, 6y64:I
17 4v1n:M 299 30 0.2619 0.0368 0.3667 2.4 4bbr:M, 4bbs:M, 4v1o:M
18 7ml4:M 234 30 0.2619 0.0470 0.3667 2.7 5fyw:M, 5fz5:M
19 4lv7:A 390 35 0.2619 0.0282 0.3143 2.8 3uds:A, 3uds:B
20 8om2:Q 235 16 0.2381 0.0426 0.6250 4.9 8d8j:Q, 8d8k:Q, 8d8l:Q, 5mrc:QQ, 5mre:QQ, 5mrf:QQ, 8om3:Q, 8om4:Q
21 4gy5:A 215 27 0.1905 0.0372 0.2963 5.7 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
22 2cg9:B 618 12 0.1667 0.0113 0.5833 6.0 1a4h:A, 1am1:A, 1amw:A, 4as9:A, 4asa:A, 4asb:A, 4asf:A, 4asg:A, 1bgq:A, 2brc:A, 2bre:A, 2bre:B, 3c11:A, 4ce1:A, 4ce2:A, 4ce3:A, 2cg9:A, 2cgf:A, 2fxs:A, 2iws:A, 2iwu:A, 2iwx:A, 8oxu:B, 8oxu:C, 2vw5:A, 2vw5:B, 2vw5:C, 2vw5:D, 2vwc:A, 2wep:A, 2weq:A, 2wer:A, 2wer:B, 2xd6:A, 6xlc:A, 6xlc:B, 6xld:A, 6xld:B, 6xle:A, 6xle:B, 6xlf:A, 6xlf:B, 6xlg:A, 6xlg:B, 6xlh:A, 6xlh:B, 2xx2:A, 2xx2:B, 2xx2:C, 2xx2:D, 2xx4:A, 2xx5:A, 2yga:A, 2yge:A, 2ygf:A, 1zw9:A, 1zwh:A
23 1qhg:A 622 11 0.1429 0.0096 0.5455 6.4
24 3pjr:A 646 11 0.1429 0.0093 0.5455 6.4 2pjr:A, 2pjr:B, 2pjr:F, 2pjr:G, 1qhh:A, 1qhh:D
25 5ze8:A 385 29 0.2619 0.0286 0.3793 6.4
26 8gft:A 639 13 0.1429 0.0094 0.4615 7.9 8eoa:A, 5fwk:A, 5fwk:B, 5fwl:A, 5fwl:B, 5fwm:A, 5fwm:B, 5fwp:A, 5fwp:B, 8fx4:B, 8gae:A, 8gae:B, 8gft:B, 8h77:A, 6n8y:A, 3nmq:A, 8qmo:B, 5uc4:A, 5uc4:B, 5uc4:C, 5uc4:D, 5uch:A, 5uch:B, 5uch:C, 5uch:D, 5uci:A, 5uci:B, 5uci:C, 5uci:D, 5ucj:A, 5ucj:B, 5ucj:C, 5ucj:D, 7ulj:A, 7ulj:B, 7ulj:C, 7ulj:D, 1uym:A, 7z37:AP1, 7z37:BP1, 7z38:A, 7z38:B, 7zr0:A, 7zr5:A, 7zr6:A, 7zub:B
27 8ffv:B 644 13 0.1429 0.0093 0.4615 7.9 8agi:A, 8agi:B, 8agj:A, 8agj:B, 8agl:A, 8agl:B, 4awo:A, 4awo:B, 4awp:A, 4awp:B, 4awq:A, 4awq:B, 3b24:A, 3b24:B, 3b25:A, 3b26:A, 3b27:A, 3b28:A, 3b28:B, 4b7p:A, 6b99:A, 6b9a:A, 3bm9:A, 3bmy:A, 4bqg:A, 4bqj:A, 2bsm:A, 2bt0:A, 2bt0:B, 1byq:A, 2byh:A, 2byi:A, 2bz5:A, 2bz5:B, 2ccs:A, 2cct:A, 2ccu:A, 6ceo:A, 5cf0:A, 4cwf:A, 4cwn:A, 4cwo:A, 4cwp:A, 4cwq:A, 4cwr:A, 4cws:A, 4cwt:A, 6cyg:A, 6cyg:B, 6cyh:A, 3d0b:A, 7d1v:A, 7d22:A, 7d24:A, 7d25:A, 7d26:A, 7dmc:A, 4eeh:A, 4eft:A, 4efu:A, 4egh:A, 4egi:A, 4egk:A, 6ei5:A, 3eko:A, 3eko:B, 3ekr:A, 3ekr:B, 6el5:A, 6eln:A, 6elo:A, 6elp:A, 8eoa:B, 8eob:A, 8eob:B, 6ey8:A, 6ey9:A, 6eya:A, 6eyb:A, 6f1n:A, 4fcp:A, 4fcp:B, 4fcq:A, 4fcr:A, 6fcj:A, 8ffv:A, 8ffw:A, 8ffw:B, 5fnc:A, 5fnd:A, 5fnf:A, 3ft5:A, 3ft8:A, 2fwy:A, 2fwz:A, 8fx4:A, 5ggz:B, 5ggz:A, 5ggz:D, 5ggz:C, 6gp8:A, 6gpf:A, 6gph:A, 6gpo:A, 6gpp:A, 6gpr:A, 6gpt:A, 6gpy:A, 6gq6:A, 6gqr:A, 6gqs:A, 6gqu:A, 6gr1:A, 6gr3:A, 6gr5:A, 5h22:A, 2h55:A, 8h77:B, 3hek:A, 3hek:B, 3hhu:A, 3hhu:B, 6hhr:A, 3hyy:A, 3hyz:A, 3hyz:B, 4hy6:A, 3hz1:A, 3hz5:A, 3inw:A, 3inx:A, 5j20:A, 5j27:A, 5j2x:A, 5j64:A, 5j6l:A, 5j6m:A, 5j6n:A, 5j82:A, 5j86:A, 5j8m:A, 5j8m:B, 5j8u:A, 5j8u:B, 5j9x:A, 4jql:A, 3k97:A, 3k98:A, 3k98:B, 3k99:A, 3k99:B, 3k99:C, 3k99:D, 7krj:A, 7krj:B, 7l7i:A, 7l7i:B, 7l7j:A, 7l7j:B, 4l8z:A, 4l90:A, 4l91:A, 4l93:A, 4l93:B, 4l94:A, 5lny:A, 5lnz:A, 5lo0:A, 5lo1:A, 5lo5:A, 5lo6:A, 5lq9:A, 5lr1:A, 5lr7:A, 5lrl:A, 5lrz:A, 6lr9:A, 5ls1:A, 6lsz:A, 7lsz:A, 6lt8:A, 6lti:A, 6ltk:A, 7lt0:A, 4lwe:A, 4lwf:A, 4lwg:A, 4lwh:A, 4lwi:A, 5m4e:A, 5m4h:A, 3mnr:P, 6n8x:A, 4nh7:A, 4nh7:B, 4nh8:A, 5nyh:A, 5nyi:A, 3o0i:A, 4o04:A, 4o05:A, 4o07:A, 4o09:A, 4o0b:A, 5oci:A, 5od7:A, 5odx:A, 6olx:A, 1osf:A, 3ow6:A, 3owb:A, 3owd:A, 3qdd:A, 2qf6:A, 2qf6:B, 2qf6:C, 2qf6:D, 2qfo:A, 2qg0:A, 2qg0:B, 2qg2:A, 8qmo:A, 3qtf:A, 4r3m:A, 3r4m:A, 3r4n:A, 3r4n:B, 3r4o:A, 3r4o:B, 3r4p:A, 3r4p:B, 3r91:A, 3r92:A, 3rkz:A, 3rlp:A, 3rlp:B, 3rlq:A, 3rlq:B, 3rlr:A, 3rlr:B, 7ry1:A, 7ry1:B, 7ry1:C, 7s90:A, 7s95:A, 7s98:A, 7s99:A, 7s9f:A, 7s9g:A, 7s9h:A, 7s9i:A, 3t0z:A, 3t10:A, 3t1k:A, 3t1k:B, 3t2s:A, 3t2s:B, 5t21:A, 6tn4:AAA, 6tn5:AAA, 3tuh:A, 3tuh:B, 4u93:A, 6u98:A, 6u99:A, 6u9a:A, 6u9b:A, 7ur3:A, 2uwd:A, 1uy6:A, 1uy7:A, 1uy8:A, 1uy9:A, 1uyc:A, 1uyd:A, 1uye:A, 1uyf:A, 1uyg:A, 1uyh:A, 1uyi:A, 1uyk:A, 2vci:A, 2vcj:A, 3vha:A, 3vhc:A, 3vhd:A, 3vhd:B, 5vyy:A, 8w4v:A, 4w7t:A, 8w8k:A, 8w8k:B, 3wha:A, 3wha:B, 2wi1:A, 2wi2:A, 2wi2:B, 2wi3:A, 2wi4:A, 2wi5:A, 2wi6:A, 2wi7:A, 3wq9:A, 2xab:A, 2xab:B, 2xdk:A, 2xdl:A, 2xds:A, 2xdu:A, 2xdx:A, 2xhr:A, 2xht:A, 2xhx:A, 4xip:A, 4xiq:A, 4xir:A, 4xit:A, 2xjg:A, 2xjj:A, 2xjj:B, 2xjx:A, 2xk2:A, 5xqd:A, 5xqe:A, 5xr5:A, 5xr9:A, 5xrb:A, 5xrd:A, 5xre:A, 7y04:A, 7y04:B, 1yc1:A, 1yc3:A, 1yc4:A, 1yet:A, 2ye2:A, 2ye3:A, 2ye4:A, 2ye5:A, 2ye6:A, 2ye7:A, 2ye8:A, 2ye9:A, 2yea:A, 2yeb:A, 2yec:A, 2yed:A, 2yee:A, 2yef:A, 2yeg:B, 2yeh:A, 2yei:A, 2yej:A, 2yi0:A, 2yi5:A, 2yi6:A, 2yi7:A, 2yjw:A, 2yjx:A, 2yk2:A, 2yk9:A, 2ykb:A, 2ykc:A, 2yke:A, 2yki:A, 2ykj:A, 4ykq:A, 4ykr:A, 4ykt:A, 4yku:A, 4ykw:A, 4ykw:B, 4ykx:A, 4yky:A, 4ykz:A, 5zr3:A, 5zr3:C, 5zr3:E, 5zr3:G, 7zr0:B, 7zr5:B, 7zr6:B, 7zub:A
28 1d5y:A 288 13 0.1905 0.0278 0.6154 8.4 1d5y:B, 1d5y:D, 1d5y:C, 7vwy:G, 7vwz:G, 7vwz:I
29 4h44:C 289 34 0.3095 0.0450 0.3824 8.9 4ogq:C, 1tu2:B, 2zt9:C
30 2e74:C 288 34 0.3095 0.0451 0.3824 9.6 2d2c:C, 2d2c:P, 2e75:C, 2e76:C, 4h0l:C, 4h13:C, 4i7z:C, 4pv1:C, 1vf5:C, 1vf5:P
31 4y7u:A 224 19 0.2143 0.0402 0.4737 10.0 4y7v:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218