BioLiP

>protein
TTATRLTGWGRTAPSVANVLRTPDAEMIVKAVARVAESGGGRGAIARGLGRSYGDNAQNGGGLVIDMTPLNTIHSIDADT
KLVDIDAGVNLDQLMKAALPFGLWVPVLPGTRQVTVGGAIACDIHGKNHHSAGSFGNHVRSMDLLTADGEIRHLTPTGED
AELFWATVGGNGLTGIIMRATIEMTPTSTAYFIADGDVTASLDETIALHSDGSEARYTYSSAWFDAISAPPKLGRAAVSR
GRLATVEQLPAKLRSEPLKFDAPPIGELWYRKSGTYRGKVQNLTQFYHGFLQYQFVIPTEAVDEFKKIIGVIQASGHYSF
LNVFKLFGPRNQAPLSFPIPGWNICVDFPIKDGLGKFVSELDRRVLEFGGRLYTAKDSRTTAETFHAMYPRVDEWISVRR
KVDPLRVFASDMARRLELL

The query sequence (length=419) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4p8l:A	457	454	1.0000	0.9168	0.9229	0.0	5oel:A, 4p8c:A, 4p8k:A, 4p8n:A, 4p8p:A, 4p8t:A, 4p8y:A
2	6hfw:A	429	430	0.9905	0.9674	0.9651	0.0	4fdn:A, 4fdo:A, 4fdp:A, 4fdp:B, 4feh:A, 4ff6:A, 4ff6:B, 6g83:A, 6g83:B, 6hez:A, 6hez:B, 6hf0:A, 6hf0:B, 6hf3:A, 6hf3:B, 6hfv:A, 6hfv:B, 6hfw:B, 4kw5:A, 4kw5:B, 4ncr:A, 4ncr:B, 5oel:B, 5oep:A, 5oep:B, 5oeq:A, 5oeq:B, 4p8c:B, 4p8h:A, 4p8h:B, 4p8k:B, 4p8l:B, 4p8m:A, 4p8n:B, 4p8p:B, 4p8t:B, 4p8y:B, 4pfa:A, 4pfa:B, 4pfd:A
3	4pfd:B	410	420	0.9737	0.9951	0.9714	0.0	4p8m:B
4	4aut:A	419	427	0.8186	0.8186	0.8033	0.0	4f4q:A
5	2vfr:A	418	397	0.2076	0.2081	0.2191	5.09e-08	2vfs:A, 2vft:A, 2vfu:A, 2vfv:A
6	6c80:B	486	160	0.1122	0.0967	0.2938	1.38e-07	6c80:A
7	4oal:A	444	142	0.1074	0.1014	0.3169	2.42e-07	4oal:B
8	2exr:A	491	148	0.1026	0.0876	0.2905	5.85e-07	2q4w:A
9	7qh2:C	467	130	0.0811	0.0728	0.2615	6.25e-07	7qh2:F
10	4o95:A	467	201	0.1384	0.1242	0.2886	1.21e-06	8ckq:A, 8ckt:A, 8clw:A, 8cm2:A, 5hhz:A, 5hmr:A, 5hqx:A, 6yao:A, 6yap:A
11	8ck6:A	499	192	0.1169	0.0982	0.2552	1.98e-06	8cj9:A, 8cj9:B, 6yaq:A
12	8jdb:A	456	158	0.0979	0.0899	0.2595	3.04e-06	8jdc:A, 8jdd:A, 8jde:A, 8jdf:A, 8jdg:A, 8jdn:A, 8jdo:A, 8jdp:A, 8jdq:A, 8jdr:A, 8jds:A, 8jdt:A, 8jdu:A, 8jdv:A, 8jdx:A, 8jdy:A, 8jdz:A
13	4ml8:A	488	142	0.0931	0.0799	0.2746	9.72e-06	4ml8:B, 4ml8:C, 4ml8:D, 4mla:A
14	4mla:B	460	142	0.0931	0.0848	0.2746	1.04e-05
15	8qnc:A	486	183	0.1050	0.0905	0.2404	4.56e-05	8qmy:A, 8qmy:B, 8qmy:C, 8qnb:A, 8qnr:A
16	8qnc:A	486	30	0.0263	0.0226	0.3667	7.1	8qmy:A, 8qmy:B, 8qmy:C, 8qnb:A, 8qnr:A
17	3s1e:A	499	150	0.1074	0.0902	0.3000	1.29e-04	3bw7:A, 3c0p:A, 3dq0:A, 3kjm:A, 2qkn:A, 2qpm:A, 3s1c:A, 3s1d:A, 3s1f:A, 1w1o:A, 1w1q:A, 1w1r:A, 1w1s:A
18	8ot8:A	412	387	0.2005	0.2039	0.2171	5.49e-04	8ot8:B, 8ot8:C, 8ot8:D
19	3pm9:A	465	187	0.1146	0.1032	0.2567	6.09e-04	3pm9:B, 3pm9:C, 3pm9:D, 3pm9:E, 3pm9:F
20	2bvf:A	453	138	0.0955	0.0883	0.2899	0.003	2bvf:B, 2bvg:A, 2bvg:B, 2bvg:C, 2bvg:D, 2bvh:A, 2bvh:B, 2bvh:C, 2bvh:D
21	5adz:A	566	131	0.0811	0.0601	0.2595	0.006	5ae1:A, 5ae1:C, 5ae1:D, 5ae2:A, 4bby:A, 4bc7:A, 4bc9:A, 4bca:A
22	5adz:C	557	131	0.0811	0.0610	0.2595	0.007	5adz:B, 5adz:D, 5ae1:B, 5ae2:B, 5ae2:C, 5ae2:D, 5ae3:A, 5ae3:B, 5ae3:C, 5ae3:D, 4bby:B, 4bby:C, 4bby:D, 4bc7:B, 4bc7:C, 4bc7:D, 4bc9:B, 4bc9:C, 4bc9:D, 4bca:B, 4bca:C, 4bca:D, 6gou:D, 6gou:A, 6gou:B, 6gou:C
23	3w8w:B	461	164	0.1026	0.0933	0.2622	0.016	6foq:A, 6foq:B, 6foq:C, 6foq:D, 6fow:A, 6fow:B, 6fow:C, 6fow:D, 6fp3:A, 6fp3:B, 6fp3:C, 6fp3:D, 6fy8:A, 6fy9:A, 6fya:A, 6fya:B, 6fyb:A, 6fyb:B, 6fyb:C, 6fyb:D, 6fyc:A, 6fyc:B, 6fyd:A, 6fyd:B, 6fyd:C, 6fyd:D, 6fye:A, 6fye:B, 6fyf:A, 6fyf:B, 6fyf:C, 6fyf:D, 6fyg:A, 6fyg:B, 6fyg:C, 6fyg:D, 3w8w:A, 3w8x:A, 3w8x:B, 3w8z:A, 3w8z:B, 4xlo:A, 4xlo:B, 4xlo:C, 4xlo:D
24	5k8e:A	473	189	0.1217	0.1078	0.2698	0.019	5l6f:A, 5l6g:A
25	5erg:B	324	51	0.0358	0.0463	0.2941	0.45
26	4fgo:A	181	80	0.0573	0.1326	0.3000	0.71
27	6lpn:B	467	201	0.1026	0.0921	0.2139	0.86	6lpn:A, 6lpp:A, 6lpp:B, 6lpq:A, 6lpq:B, 6lpt:A, 6lpt:B, 6lpu:A, 6lpu:B, 6lpx:A, 6lpx:B
28	3js8:A	538	66	0.0477	0.0372	0.3030	1.1
29	2wzv:B	223	32	0.0358	0.0673	0.4688	1.2	2wzv:A, 2wzw:A, 2wzw:B
30	6f72:A	548	72	0.0597	0.0456	0.3472	1.5	6f73:A, 6f73:B
31	4l05:A	154	56	0.0430	0.1169	0.3214	2.1
32	8siu:A	368	55	0.0334	0.0380	0.2545	3.2	8siy:A
33	6a6m:A	589	40	0.0430	0.0306	0.4500	3.7	7dqv:A, 7fc9:A, 7vr5:A, 3wmg:A
34	3rj8:A	473	153	0.0835	0.0740	0.2288	4.5	3rja:A
35	2axr:A	479	34	0.0358	0.0313	0.4412	4.8	3hsu:A, 1zr6:A
36	1iuq:A	357	39	0.0310	0.0364	0.3333	5.1
37	5jne:A	351	43	0.0334	0.0399	0.3256	6.9	3i2d:A, 5jne:E
38	2rfy:A	430	34	0.0263	0.0256	0.3235	6.9	2rfy:B, 2rfy:C, 2rfy:D, 2rfz:A, 2rfz:D, 2rfz:B, 2rfz:C, 2rg0:A, 2rg0:B, 2rg0:C, 2rg0:D
39	7p38:A	832	69	0.0430	0.0216	0.2609	8.9	8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B

[Back]