Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TSYTLNEVVPLKEFVPEWVRIGFSATTGAEFAAHEVLSWYFHSELAG

The query sequence (length=47) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1lof:D 52 47 1.0000 0.9038 1.0000 1.94e-29 1lgb:B, 1lgc:B, 1lgc:D, 1lgc:F, 1loa:B, 1loa:D, 1loa:F, 1loa:H, 1lob:B, 1lob:D, 1lob:F, 1lob:H, 1loc:B, 1loc:D, 1loc:F, 1loc:H, 1lod:B, 1lod:D, 1lod:F, 1lod:H, 1lof:B, 1log:B, 1log:D
2 5t7p:A 229 47 0.8298 0.1703 0.8298 1.91e-22 1bqp:A, 1bqp:B, 1bqp:C, 1bqp:D, 2bqp:A, 2bqp:B, 1hkd:A, 1hkd:B, 1hkd:C, 1hkd:D, 2lal:A, 2lal:C, 1lem:A, 1len:A, 1len:C, 1les:A, 1les:C, 1lgb:A, 1lgc:A, 1lgc:C, 1lgc:E, 1loa:A, 1loa:C, 1loa:E, 1loa:G, 1lob:A, 1lob:C, 1lob:E, 1lob:G, 1loc:A, 1loc:C, 1loc:E, 1loc:G, 1lod:A, 1lod:C, 1lod:E, 1lod:G, 1loe:A, 1loe:C, 1lof:A, 1lof:C, 1log:A, 1log:C, 2ltn:A, 2ltn:C, 1ofs:A, 1ofs:B, 1ofs:C, 1ofs:D, 1rin:A, 1rin:B, 1rin:C, 1rin:D, 5t7p:B
3 1lem:B 47 46 0.8085 0.8085 0.8261 2.88e-22 1les:B, 1les:D
4 2b7y:B 47 45 0.7872 0.7872 0.8222 1.95e-21 2b7y:D
5 3ipv:A 249 50 0.5532 0.1044 0.5200 3.75e-11 3ipv:B, 3ipv:C, 3ipv:D, 4m3c:E, 4m3c:F, 4m3c:G, 4m3c:H
6 1g9f:A 241 47 0.5745 0.1120 0.5745 1.47e-10 4d69:I, 4d69:B, 4d69:D, 4d69:G, 4d69:F, 4d69:K, 4d69:H, 4d69:A, 4d69:C, 4d69:E, 4d69:J, 4d69:L, 1sbd:A, 1sbe:A, 1sbf:A, 2sba:A
7 5kxb:A 238 48 0.5106 0.1008 0.5000 1.52e-10 5kxb:B, 5kxb:C, 5kxb:D, 5kxc:A, 5kxc:B, 5kxc:C, 5kxc:D, 5kxd:A, 5kxd:B, 5kxd:C, 5kxd:D, 5kxe:A, 5kxe:B, 5kxe:C, 5kxe:D
8 3usu:A 250 49 0.5532 0.1040 0.5306 2.75e-10 4m3c:A, 4m3c:D, 4m3c:B, 4m3c:C, 3usu:H, 3usu:B, 3usu:C, 3usu:D, 3usu:E, 3usu:F, 3usu:G
9 1dbn:A 239 47 0.5319 0.1046 0.5319 1.62e-09 1dbn:B
10 1fny:A 234 50 0.5106 0.1026 0.4800 1.70e-09 1fnz:A
11 3zvx:A 242 43 0.4681 0.0909 0.5116 1.80e-09 5u38:A, 3zvx:B, 3zyr:A, 3zyr:B
12 1dzq:B 236 47 0.5319 0.1059 0.5319 6.59e-09 1dzq:A, 1dzq:C, 1dzq:D, 1qnw:A, 1qnw:B, 1qnw:C, 1qnw:D, 1qoo:A, 1qoo:B, 1qoo:C, 1qoo:D, 1qos:A, 1qos:B, 1qot:A, 1qot:B, 1qot:C, 1qot:D
13 1fat:B 233 49 0.4894 0.0987 0.4694 6.98e-09 1fat:A, 1fat:C, 1fat:D, 1g8w:A, 1g8w:B, 1g8w:C, 1g8w:D
14 1fx5:A 240 45 0.5106 0.1000 0.5333 1.36e-08 1fx5:B, 1jxn:A, 1jxn:B, 1jxn:C, 1jxn:D
15 4wv8:D 239 48 0.5106 0.1004 0.5000 2.37e-08 4u2a:A, 4u36:A, 4wv8:A, 4wv8:B, 4wv8:C, 4xtm:A, 4xtp:A, 4xxa:A, 4xxa:B
16 9c4i:A 241 43 0.4255 0.0830 0.4651 3.13e-08 9c4i:B, 5eyx:A, 5eyx:B, 5eyy:A
17 1n47:B 233 49 0.4681 0.0944 0.4490 3.99e-08 1n47:A, 1n47:C, 1n47:D
18 6tt9:AAA 233 49 0.4468 0.0901 0.4286 4.64e-08 6tt9:BBB, 6tt9:CCC, 6tt9:DDD
19 3wog:B 243 49 0.4468 0.0864 0.4286 5.24e-08 5ava:A, 5ava:B, 5ava:C, 5ava:D, 5ava:E, 5ava:F, 5ava:G, 5ava:H, 3wcs:A, 3wcs:B, 3wog:A
20 3ujo:A 253 49 0.5106 0.0949 0.4898 6.43e-08 3ujo:B, 3ujo:D, 3ujo:C, 3ujq:A, 3ujq:B, 3ujq:C, 3ujq:D, 3uk9:A, 3uk9:B, 3uk9:C, 3uk9:D, 3uk9:E, 3uk9:F, 3uk9:G, 3uk9:H, 3ul2:A, 3ul2:B, 3ul2:C, 3ul2:D
21 1bjq:B 253 48 0.5106 0.0949 0.5000 7.17e-08 1bjq:A, 1bjq:C, 1bjq:D, 1bjq:E, 1bjq:F, 1bjq:G, 1bjq:H, 1lu1:A, 1lu2:A, 1lu2:B
22 3n35:A 242 46 0.4468 0.0868 0.4565 1.20e-07 6aq5:A, 6aq5:B, 6aq6:A, 6aq6:B, 1ax0:A, 1ax1:A, 1ax2:A, 1axy:A, 1axz:A, 1fyu:A, 1fyu:B, 1gz9:A, 1gzc:A, 1lte:A, 3n36:A, 3n3h:A, 1sfy:A, 1sfy:B, 1sfy:C, 1sfy:D, 1sfy:E, 1sfy:F, 1uzy:A, 1uzy:B, 1uzz:A, 1uzz:B, 1uzz:C, 1uzz:D, 1v00:A, 1v00:B, 1v00:C, 1v00:D
23 1g7y:D 253 48 0.5106 0.0949 0.5000 2.10e-07 1g7y:A, 1g7y:B, 1g7y:C, 1g7y:E, 1g7y:F, 1lul:A, 1lul:B, 1lul:C, 1lul:D, 1lul:E, 1lul:F
24 1n3o:A 241 45 0.4043 0.0788 0.4222 2.18e-07 2ar6:A, 2ar6:B, 2arb:A, 2arb:B, 2are:A, 2are:B, 2arx:A, 2arx:B, 2auy:A, 2auy:B, 2gmm:A, 2gmm:B, 2gmp:A, 2gmp:B, 2gn3:A, 2gn3:B, 2gn7:A, 2gn7:B, 2gnb:B, 2gnd:A, 2gnd:B, 2gnm:A, 2gnm:B, 2gnt:A, 2gnt:B, 1n3o:B, 1n3p:A, 1n3p:B, 1n3q:A, 1n3q:B, 2phf:A, 2phf:B, 2phr:A, 2phr:B, 2pht:A, 2pht:B, 2phu:B, 2phu:A, 2phw:A, 2phw:B, 2phx:A, 2phx:B, 1q8o:A, 1q8o:B, 1q8p:A, 1q8p:B, 1q8q:A, 1q8q:B, 1q8s:A, 1q8s:B, 1q8v:A, 1q8v:B, 1s1a:A, 1s1a:B, 1ukg:A, 1ukg:B
25 1fay:A 236 50 0.5319 0.1059 0.5000 2.45e-07 1f9k:A, 1f9k:B, 1fay:B, 1fay:C, 1fay:D, 1fay:E, 1fay:F, 1fay:G, 1fay:H
26 2d3s:A 237 54 0.4681 0.0928 0.4074 2.74e-07 2d3s:B, 2d3s:C, 2d3s:D, 2dtw:A, 2dtw:B, 2dtw:C, 2dtw:D, 2dty:A, 2dty:B, 2dty:C, 2dty:D, 2du0:A, 2du0:B, 2du0:C, 2du0:D, 2du1:A, 2du1:B, 2du1:C, 2du1:D, 2e51:A, 2e51:B, 2e51:C, 2e51:D, 2e53:A, 2e53:B, 2e53:C, 2e53:D, 2e7q:A, 2e7q:B, 2e7q:C, 2e7q:D, 2e7t:C, 2e7t:A, 2e7t:B, 2e7t:D, 1wbf:A, 1wbf:B, 1wbl:A, 1wbl:B, 1wbl:C, 1wbl:D, 2zmk:A, 2zmk:B, 2zmk:C, 2zmk:D, 2zml:A, 2zml:B, 2zml:C, 2zml:D, 2zmn:A, 2zmn:B, 2zmn:C, 2zmn:D
27 2je9:A 238 45 0.4468 0.0882 0.4667 4.57e-07 3a0k:A, 3a0k:C, 3a0k:E, 3a0k:G, 3ax4:A, 6cj9:A, 1dgl:A, 1dgl:B, 2gdf:B, 2gdf:D, 1h9p:A, 1h9w:A, 1h9w:B, 2jdz:A, 2je7:A, 2je9:B, 2je9:C, 2je9:D, 2jec:A, 2jec:B, 2jec:C, 2jec:D, 7ljg:A, 7ljg:B, 4mye:A, 4not:A, 3rrd:A, 3rs6:A, 3sh3:A, 5tg3:A, 5tg3:B, 5tg3:C, 5tg3:D, 5uuy:A, 8ux7:A, 8ux7:B, 4z8b:A, 2zbj:A
28 2d3p:A 236 45 0.4255 0.0847 0.4444 7.35e-07 2d3p:B, 2d3p:C, 2d3p:D, 2d3r:A, 2d3r:B, 2d3r:C, 2d3r:D, 1mvq:A, 3u4x:A
29 8szo:A 233 44 0.4255 0.0858 0.4545 1.24e-06
30 2a7a:A 237 44 0.4255 0.0844 0.4545 1.42e-06 6ahg:A, 6ahg:C, 6ahg:B, 1azd:A, 1azd:B, 1azd:C, 1azd:D, 9b33:E, 9b33:F, 9b34:E, 9b34:F, 9b36:H, 9b36:G, 9b36:F, 9b36:E, 9b37:F, 9b37:E, 1bxh:A, 1bxh:D, 1bxh:B, 1bxh:C, 5byn:A, 5byn:B, 1c57:A, 1cjp:A, 1cjp:B, 1cjp:C, 1cjp:D, 2cna:A, 3cna:A, 5cna:A, 5cna:B, 5cna:C, 5cna:D, 1con:A, 2ctv:A, 1cvn:A, 1cvn:B, 1cvn:C, 1cvn:D, 2cwm:A, 2cwm:D, 2cy6:A, 2cy6:D, 2cyf:A, 2cyf:C, 4czs:A, 4czs:B, 4czs:C, 4czs:D, 3d4k:A, 3d4k:B, 3d4k:C, 3d4k:D, 2d7f:A, 2d7f:F, 2d7f:L, 2d7f:S, 4dpn:A, 4dpn:D, 1dq1:A, 1dq4:A, 1dq4:B, 1dq5:A, 1dq6:A, 2ef6:A, 2ef6:B, 2ef6:C, 2ef6:D, 1enq:A, 1enq:B, 1enq:C, 1enq:D, 1enr:A, 1ens:A, 1ens:B, 2enr:A, 3enr:A, 3enr:B, 5f5q:A, 5f5q:B, 2g4i:A, 1gic:A, 1gic:B, 1gkb:A, 1gkb:B, 6gw9:A, 6h2m:A, 4h55:A, 1hqw:A, 1i3h:A, 4i30:A, 8i7q:A, 1jbc:A, 1jn2:P, 1joj:A, 1joj:B, 1joj:C, 1joj:D, 1jui:A, 1jui:B, 1jui:C, 1jui:D, 3ju9:A, 1jw6:A, 1jyc:A, 1jyc:B, 1jyc:C, 1jyc:D, 1jyi:A, 1jyi:B, 1jyi:C, 1jyi:D, 4k1y:A, 4k1y:B, 4k1y:C, 4k1y:D, 4k1z:A, 4k1z:B, 4k1z:C, 4k1z:D, 4k20:A, 4k20:B, 4k21:A, 4l8q:A, 7mg1:A, 7mg2:A, 7mg3:A, 7mg4:A, 7mg5:A, 7mg5:B, 7mg6:A, 7mg6:B, 7mg7:A, 7mg7:B, 7mg8:A, 7mg8:B, 7mg9:A, 7mg9:B, 7mga:A, 7mga:B, 7mgb:A, 7mgb:B, 7mgb:C, 7mgb:D, 7mgc:A, 7mgc:B, 7mgc:C, 7mgc:D, 7mgd:A, 7mgd:B, 7mgd:C, 7mgd:D, 1nls:A, 3nwk:A, 3nwk:B, 3nwk:C, 3nwk:D, 1nxd:1, 1nxd:2, 1nxd:3, 1nxd:4, 5o6n:A, 1ona:A, 1ona:B, 1ona:C, 1ona:D, 2ovu:A, 2ow4:A, 4p14:A, 2p2k:A, 2p2k:B, 2p2k:C, 2p2k:D, 2p34:A, 2p34:B, 2p34:C, 2p34:D, 2p37:A, 2p37:B, 2p37:C, 2p37:D, 4p9w:A, 4p9w:B, 4p9w:C, 4p9w:D, 4p9x:A, 4p9x:B, 4p9x:C, 4p9x:D, 4p9y:A, 4p9y:B, 4pcr:A, 4pcr:D, 4pf5:A, 4pf5:B, 1qdc:A, 1qdc:B, 1qdc:C, 1qdc:D, 1qdo:A, 1qdo:B, 1qdo:C, 1qdo:D, 1qgl:A, 1qgl:B, 3qlq:A, 3qlq:B, 3qlq:C, 3qlq:D, 1qny:A, 1scr:A, 1scs:A, 3snm:A, 1tei:A, 1tei:B, 1tei:C, 1tei:D, 1tei:E, 1tei:F, 1tei:G, 1tei:H, 4tys:A, 4tys:E, 4tzd:A, 4tzd:D, 5u3e:A, 7un2:A, 7un2:B, 7uod:A, 7uod:B, 2uu8:A, 1val:A, 1val:B, 1val:C, 1val:D, 1vam:A, 1vam:B, 1vam:C, 1vam:D, 6vb8:A, 1vln:A, 1vln:B, 1vln:C, 1vln:D, 1vln:E, 1vln:F, 1vln:G, 1vln:H, 5wey:A, 8wmg:A, 8wmg:B, 8wmk:A, 8wmk:B, 1wuv:A, 1wuv:D, 1wuv:G, 1wuv:J, 1xqn:A, 5ygm:A, 2yz4:A, 5z5l:A, 5z5l:B, 5z5l:C, 5z5l:D, 5z5n:A, 5z5n:B, 5z5n:C, 5z5n:D, 5z5p:A, 5z5p:B, 5z5y:A, 5z5y:B, 5zac:A, 5zac:B, 5zac:C, 5zac:D
31 2fmd:A 232 39 0.4043 0.0819 0.4872 2.12e-06
32 6xt6:A 241 44 0.4255 0.0830 0.4545 2.45e-06 6xt6:B
33 1qmo:E 117 42 0.4043 0.1624 0.4524 4.06e-06 1qmo:F, 1qmo:G, 1qmo:H
34 1gsl:A 243 46 0.4468 0.0864 0.4565 9.45e-06 1lec:A, 1led:A
35 1dhk:B 195 47 0.4255 0.1026 0.4255 1.13e-05
36 1hql:A 236 46 0.4043 0.0805 0.4130 3.02e-05 1hql:B
37 2eig:A 230 43 0.4043 0.0826 0.4419 4.27e-04 2eig:B, 2eig:C, 2eig:D
38 5t50:A 229 42 0.4043 0.0830 0.4524 7.22e-04 5t50:B, 5t52:A, 5t52:B, 5t54:A, 5t54:B, 5t55:A, 5t55:B, 5t5j:A, 5t5j:B, 5t5l:A, 5t5l:B, 5t5o:A, 5t5o:B, 5t5o:F, 5t5o:C, 5t5o:I, 5t5o:D, 5t5o:E, 5t5o:G, 5t5o:J, 5t5o:H, 5t5p:A, 5t5p:B
39 1bzw:A 232 43 0.3830 0.0776 0.4186 0.041 1bzw:B, 1bzw:C, 1bzw:D, 1ciw:A, 1ciw:B, 1ciw:C, 1ciw:D, 1cq9:A, 1cq9:B, 1cq9:C, 1cq9:D, 1cr7:A, 1cr7:B, 1cr7:E, 1cr7:C, 1cr7:D, 1cr7:F, 1cr7:G, 1cr7:H, 2dv9:A, 2dv9:B, 2dv9:C, 2dv9:D, 2dva:A, 2dva:B, 2dva:C, 2dva:D, 2dvb:A, 2dvb:B, 2dvb:C, 2dvb:D, 2dvd:A, 2dvd:B, 2dvd:C, 2dvd:D, 2dvf:A, 2dvf:B, 2dvf:C, 2dvf:D, 2dvg:D, 2dvg:A, 2dvg:B, 2dvg:C, 2pel:A, 2pel:B, 2pel:C, 2pel:D, 1qf3:A, 1qf3:B, 1qf3:C, 1qf3:D, 1rir:A, 1rir:B, 1rir:C, 1rir:D, 1rit:C, 1rit:D, 1rit:A, 1rit:B, 2tep:A, 2tep:B, 2tep:C, 2tep:D, 1v6i:A, 1v6i:B, 1v6i:C, 1v6i:D, 1v6j:A, 1v6j:B, 1v6j:C, 1v6j:D, 1v6k:A, 1v6k:B, 1v6k:C, 1v6k:D, 1v6l:A, 1v6l:B, 1v6l:C, 1v6l:D, 1v6m:A, 1v6m:B, 1v6m:C, 1v6m:D, 1v6m:E, 1v6m:F, 1v6m:G, 1v6m:H, 1v6n:A, 1v6n:B, 1v6n:C, 1v6n:D, 1v6n:E, 1v6n:F, 1v6n:G, 1v6n:H, 1v6o:A, 1v6o:B, 1v6o:C, 1v6o:D, 1v6o:E, 1v6o:F, 1v6o:G, 1v6o:H, 6v95:A, 6v95:B, 6v95:C, 6v95:D, 6vav:A, 6vav:B, 6vav:C, 6vav:D, 6vaw:A, 6vaw:B, 6vaw:C, 6vaw:D, 6vc3:A, 6vc3:B, 6vc3:C, 6vc3:D, 6vc4:A, 6vc4:B, 6vc4:C, 6vc4:D, 6vgf:A, 6vgf:B, 6vgf:C, 6vgf:D
40 8clq:B 309 18 0.1702 0.0259 0.4444 3.7 8clq:A, 8clq:C, 8clq:D
41 5dfa:A 685 50 0.3617 0.0248 0.3400 4.9 5dfa:B, 5dfa:C, 4oif:A, 4oif:B, 4oif:C
42 6s6z:A 1083 28 0.2979 0.0129 0.5000 4.9 6s6z:D, 6s6z:B, 6s6z:H, 6s6z:F, 6s6z:G, 6s6z:E, 6s6z:C, 6sd0:A, 6sd0:B, 6sd0:C, 6sd0:D
43 6l4t:13 150 17 0.1915 0.0600 0.5294 5.2 6l4u:13
44 6l8a:F 457 19 0.1702 0.0175 0.4211 5.7 6l8a:E
45 6l8a:C 429 19 0.1702 0.0186 0.4211 6.0
46 6af6:A 383 34 0.2553 0.0313 0.3529 6.1 5zw2:A, 5zw7:A, 5zw8:A
47 6qv4:A 1666 21 0.1915 0.0054 0.4286 6.7 6qv3:A
48 4wm0:A 299 18 0.2340 0.0368 0.6111 7.0 4wlm:A, 4wlm:B, 4wlz:A, 4wlz:B, 4wma:A, 4wmb:A, 4wmi:A, 4wmk:A, 4wn2:A, 4wnh:A
49 3o3m:C 401 33 0.2340 0.0274 0.3333 7.2 3o3m:A, 3o3n:A, 3o3n:C, 3o3o:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218