BioLiP

>protein
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLT
YCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDD
TVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARY
FERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT

The query sequence (length=295) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3w0s:A	298	295	0.9831	0.9732	0.9831	0.0	3tyk:A, 3w0n:A, 3w0o:A, 3w0p:A, 3w0q:A, 3w0r:A
2	3ham:A	299	218	0.1559	0.1538	0.2110	8.69e-04	4dca:A, 3ham:B, 3hav:A, 3hav:B, 3hav:C, 3uzr:A
3	5igi:A	300	84	0.0915	0.0900	0.3214	0.001	5igj:A, 5igp:A, 5igr:A, 5igs:A, 5igt:A
4	7f0b:A	282	43	0.0610	0.0638	0.4186	0.002	7f0c:A, 7f0f:A
5	8i85:A	280	43	0.0644	0.0679	0.4419	0.005	8i82:A, 8i84:A, 8i86:A, 8i89:A, 8i8g:A, 8i8h:A
6	3dxp:A	329	226	0.1695	0.1520	0.2212	0.037
7	5uxd:A	300	32	0.0475	0.0467	0.4375	0.046	5uxc:A, 5uxd:B
8	7w15:A	294	54	0.0644	0.0646	0.3519	0.20	7w15:B, 7w19:A, 7w19:B, 7w1a:B, 7w1a:A
9	3tdw:A	302	207	0.1356	0.1325	0.1932	0.75	6ctz:A, 3tdv:A, 3tdv:B
10	2b0q:A	263	166	0.1220	0.1369	0.2169	0.84	2bkk:A, 2bkk:C, 1j7l:A, 1j7l:B, 1j7u:A, 1j7u:B, 1l8t:A, 3q2j:A, 3q2j:B, 3tm0:A
11	7s3l:A	254	52	0.0508	0.0591	0.2885	0.92
12	3f69:B	283	94	0.0915	0.0954	0.2872	0.95	6b2p:A, 3f61:A, 3f69:A, 2fum:A, 2fum:B, 2fum:C, 2fum:D, 6i2p:A, 6i2p:B, 1mru:A, 1mru:B, 1o6y:A, 3ori:A, 3ori:B, 3ori:C, 3ori:D, 3ork:A, 3orl:A, 3orm:A, 3oro:A, 3orp:A, 3ort:A, 5u94:A
13	6a5n:A	502	53	0.0610	0.0359	0.3396	0.97
14	4dfb:B	301	34	0.0441	0.0432	0.3824	1.2	5c4k:A, 5c4l:A, 5c4l:B, 6cd7:B, 4dfb:A, 4dfu:A, 4dfu:B, 4dt8:A, 4dt8:B, 4dt9:A, 4dt9:B, 4dta:A, 4dta:B, 4dtb:A, 4dtb:B, 4n57:A, 4n57:B, 3sg8:A, 3sg8:B, 3sg9:A, 3sg9:B
15	7khj:A	288	61	0.0576	0.0590	0.2787	1.3	7khj:B, 7khk:B, 1pkg:B, 8pqb:A, 8pqe:A, 8pqe:B
16	1y9g:A	517	64	0.0712	0.0406	0.3281	1.4
17	5uxa:A	301	85	0.0678	0.0664	0.2353	3.5	5igv:A, 5igw:A, 5igy:A, 5igz:A, 5ih0:A, 5ih1:A, 5iwu:A
18	3g0e:A	332	29	0.0339	0.0301	0.3448	3.7	3g0f:A, 3g0f:B, 6gqj:A, 6gqj:B, 6gqk:A, 6gqk:B, 6gql:A, 6gql:B, 6gqm:A, 6gqm:B, 6hh1:A, 4hvs:A, 6itt:A, 6itt:B, 6itv:A, 7khg:A, 7khk:A, 6kla:A, 6mob:A, 1pkg:A, 8pq9:A, 8pq9:C, 8pqa:A, 8pqa:C, 8pqc:A, 8pqc:B, 8pqd:A, 8pqd:B, 8pqf:A, 8pqf:C, 8pqg:A, 8pqg:C, 1t46:A, 4u0i:A, 6xv9:A, 6xv9:B, 6xva:A, 6xva:B, 6xvb:A, 6xvb:B, 7zw8:A, 7zy6:A
19	7ezt:B	727	23	0.0441	0.0179	0.5652	3.8
20	2rcc:C	311	66	0.0678	0.0643	0.3030	3.9	2rcc:B
21	3i0o:A	329	30	0.0407	0.0365	0.4000	4.2	3i0q:A, 3q2m:A
22	4e1z:A	288	87	0.0746	0.0764	0.2529	4.8	4e20:A
23	2q83:A	332	51	0.0441	0.0392	0.2549	5.4	2q83:B
24	3d45:A	383	69	0.0644	0.0496	0.2754	6.3	2a1r:A, 2a1r:B
25	3d45:B	373	69	0.0644	0.0509	0.2754	7.4	3ctr:A
26	8bx8:C	3947	76	0.0610	0.0046	0.2368	8.1	7k58:C, 7k5b:C, 7kek:C
27	6il3:A	310	31	0.0339	0.0323	0.3226	9.5	6jqr:A, 4rt7:A, 5x02:A, 4xuf:A, 4xuf:B

[Back]