BioLiP

>protein
TSRDITVYPKDFLTYFQRNGSAAGFDYDLATYTQTLTPNKASQAGNVTLKTKVDMSQNFTFTGKINLGDKAQNAGGADGV
GFLFHPGDTNVVGAPGGAAGIGGVNGAFGFKLDTYYNGVGENSFTPDPSNFKGKPFGAFVDGLNGQAKTIASSAQSISEP
SNNNFVDFTMSYNGATKVMSVTYGGQTWTQDVSSFVGTNQAMSFSIAASTGAFMNLQQLRNVNFTYTVAQGTVIANYVDE
QGNTIAQQETTSGDIDTPYVTSQKTIPGYTFKASNGAATSGNYAANDQTVNYVYTRNQGSIDVTYIDQTTGQTLSKKDLS
GGTGDSSNYTTTDTIKSYTDAGYELVSDNYPSGGTVFTDTAQHYVVNLKQKLVVSSEQTRSVTTNQVTGEKTYGDWQA

The query sequence (length=398) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7yl4:A	472	426	1.0000	0.8432	0.9343	0.0	7yl4:B, 7yl5:A, 7yl5:B, 7yl6:A, 7yl6:B
2	4m00:A	501	271	0.2814	0.2236	0.4133	2.96e-40	4m01:A, 4m01:B, 4m01:C, 4m01:D, 4m02:A, 4m03:A
3	7smh:A	257	188	0.1332	0.2062	0.2819	7.41e-09	8g1m:A, 7smh:B, 7smh:C, 7smh:D
4	8tb2:A	259	199	0.1382	0.2124	0.2764	3.57e-08
5	7sjk:A	266	210	0.1307	0.1955	0.2476	1.30e-06	7sjk:B, 7sp2:A
6	3i57:A	184	53	0.0578	0.1250	0.4340	3.27e-06	3i57:B
7	8deo:A	454	221	0.1407	0.1233	0.2534	1.16e-04	8deo:B, 8g1l:A, 7sie:A
8	1n3o:A	241	103	0.0678	0.1120	0.2621	0.50	2ar6:A, 2ar6:B, 2arb:A, 2arb:B, 2are:A, 2are:B, 2arx:A, 2arx:B, 2auy:A, 2auy:B, 2gmm:A, 2gmm:B, 2gmp:A, 2gmp:B, 2gn3:A, 2gn3:B, 2gn7:A, 2gn7:B, 2gnb:B, 2gnd:A, 2gnd:B, 2gnm:A, 2gnm:B, 2gnt:A, 2gnt:B, 1n3o:B, 1n3p:A, 1n3p:B, 1n3q:A, 1n3q:B, 2phf:A, 2phf:B, 2phr:A, 2phr:B, 2pht:A, 2pht:B, 2phu:B, 2phu:A, 2phw:A, 2phw:B, 2phx:A, 2phx:B, 1q8o:A, 1q8o:B, 1q8p:A, 1q8p:B, 1q8q:A, 1q8q:B, 1q8s:A, 1q8s:B, 1q8v:A, 1q8v:B, 1s1a:A, 1s1a:B, 1ukg:A, 1ukg:B
9	7rml:A	281	55	0.0427	0.0605	0.3091	0.62	7rml:B, 7rml:C
10	7elv:E	207	192	0.1256	0.2415	0.2604	0.81	7exo:A
11	6pey:B	290	76	0.0528	0.0724	0.2763	1.3	1b5t:A, 1b5t:B, 1b5t:C, 2fmn:A, 2fmn:B, 2fmn:C, 2fmo:A, 2fmo:B, 2fmo:C, 3fst:A, 3fst:C, 3fst:E, 3fsu:A, 3fsu:C, 3fsu:E, 6pey:A, 6pey:C, 1zp3:A, 1zp3:B, 1zp3:C, 1zp4:A, 1zp4:B, 1zp4:C, 1zpt:A, 1zpt:B, 1zpt:C, 1zrq:A, 1zrq:B, 1zrq:C
12	5ume:E	292	42	0.0377	0.0514	0.3571	1.4	5ume:A, 5ume:B, 5ume:C, 5ume:D, 5ume:F
13	9c4i:A	241	61	0.0503	0.0830	0.3279	3.2	9c4i:B, 5eyx:A, 5eyx:B, 5eyy:A
14	5kxb:A	238	118	0.0754	0.1261	0.2542	3.5	5kxb:B, 5kxb:C, 5kxb:D, 5kxc:A, 5kxc:B, 5kxc:C, 5kxc:D, 5kxd:A, 5kxd:B, 5kxd:C, 5kxd:D, 5kxe:A, 5kxe:B, 5kxe:C, 5kxe:D
15	3zvx:A	242	61	0.0477	0.0785	0.3115	4.5	5u38:A, 3zvx:B, 3zyr:A, 3zyr:B

[Back]