Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTATLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGVGGPGHK
A

The query sequence (length=81) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2l6e:A 94 81 0.9506 0.8191 0.9506 3.56e-54
2 6rwg:A 157 81 0.9630 0.4968 0.9630 9.83e-54 1a1t:A, 1aaf:A, 1bj6:A, 2buo:A, 1esk:A, 2exf:A, 1f6u:A, 5i1r:A, 2jzw:A, 2l4l:A, 2m3z:A, 1mfs:A, 1q3y:A, 1q3z:A, 7r7p:I, 7r7p:L
3 8eep:A 221 74 0.9012 0.3303 0.9865 6.57e-50 6axv:A, 6ay9:A, 6aya:A, 4b4n:A, 8cky:A, 8cl0:A, 8cl0:F, 8cl0:B, 8cl0:C, 8cl0:D, 8cl0:E, 8cl1:A, 8cl3:A, 3ds0:A, 3ds1:A, 3ds3:A, 3ds3:B, 3ds4:A, 4e91:A, 4e91:B, 4e92:A, 4e92:B, 8ejl:L, 8ejl:M, 8f22:A, 8f22:F, 8f22:B, 8f22:C, 8f22:D, 8f22:E, 8fiu:A, 8fiu:B, 8fiu:C, 8gdv:A, 8gdv:F, 8gdv:C, 8gdv:D, 8gdv:E, 5hgl:A, 5hgl:B, 5hgl:C, 5hgl:D, 5hgl:E, 5hgl:F, 4inb:A, 4j93:A, 2jpr:A, 7m9f:A, 7mkc:A, 3nte:A, 3nte:B, 4nx4:C, 6pu1:A, 4qnb:A, 8qub:A, 8quh:A, 8qui:A, 8quj:A, 8quk:A, 8qul:A, 8quw:A, 8qux:A, 8quy:A, 8qv1:A, 8qv4:A, 8qv9:A, 8qva:A, 7rhn:C, 7rj2:C, 7rj4:A, 7rj4:B, 7rj4:C, 7rmj:A, 7rmj:B, 7rmj:C, 7snl:A, 7snn:A, 7snq:A, 7snq:F, 7snq:B, 7snq:C, 7snq:D, 7snq:E, 7snq:G, 7snq:L, 7snq:H, 7snq:I, 7snq:J, 7snq:K, 8tov:G, 8tov:J, 8tov:I, 8tov:K, 8tov:L, 8tov:H, 8tov:A, 8tov:C, 8tov:B, 8tov:D, 8tov:E, 8tov:F, 8tqp:A, 8tqp:D, 8tqp:B, 8tqp:C, 8tqp:E, 8tqp:F, 8tqp:G, 8tqp:J, 8tqp:I, 8tqp:K, 8tqp:L, 8tqp:H, 5tsv:A, 5tsv:B, 5tsx:A, 5tsx:D, 5tsx:B, 5tsx:C, 5tsx:J, 5tsx:L, 5tsx:I, 5tsx:K, 5tsx:E, 5tsx:H, 5tsx:F, 5tsx:G, 4u0a:A, 4u0b:A, 4u0b:B, 4u0b:D, 4u0b:F, 4u0b:L, 4u0b:H, 4u0b:I, 4u0c:A, 4u0d:A, 4u0d:F, 4u0d:G, 4u0d:H, 4u0d:B, 4u0d:C, 4u0d:J, 4u0e:A, 4u0f:A, 7urn:A, 6v2f:A, 6v2f:B, 6v2f:C, 6v2f:D, 6v2f:E, 6v2f:F, 6vkv:A, 6vkv:B, 6vkv:C, 4wym:A, 4wym:F, 4wym:B, 4wym:C, 4wym:D, 4wym:E, 4wym:G, 4wym:H, 4wym:I, 4wym:J, 4wym:K, 4wym:L, 2xde:A, 2xde:B, 4xfz:A, 4xrq:A, 2xxm:A, 7zud:A
4 4u0b:C 198 73 0.7778 0.3182 0.8630 1.62e-38 8gdv:B, 4u0b:E, 4u0b:G, 4u0b:J, 4u0b:K, 4u0d:I
5 7rqu:A 604 45 0.1852 0.0248 0.3333 0.70 5irx:A, 5irx:B, 5irx:D, 5irx:C, 5irz:D, 5irz:E, 5irz:B, 5irz:C, 5is0:C, 5is0:B, 5is0:D, 5is0:E, 7l2l:A, 7l2l:D, 7l2l:C, 7l2l:B, 7l2m:A, 7l2m:C, 7l2m:D, 7l2m:B, 7l2n:A, 7l2n:D, 7l2n:C, 7l2n:B, 7l2o:A, 7l2o:C, 7l2o:D, 7l2o:B, 7lpa:A, 7lpa:B, 7lpa:D, 7lpa:C, 7lpb:A, 7lpb:B, 7lpb:C, 7lpb:D, 7lpc:C, 7lpc:A, 7lpc:B, 7lpc:D, 7lpd:A, 7lpd:B, 7lpd:C, 7lpd:D, 7lpe:C, 7lpe:B, 7lpe:A, 7lpe:D, 7mz5:A, 7mz5:D, 7mz5:C, 7mz5:B, 7rqu:C, 7rqu:B, 7rqu:D, 7rqv:A, 7rqv:D, 7rqv:C, 7rqv:B, 7rqx:A, 7rqx:C, 7rqx:D, 7rqx:B, 8t0y:B, 8t0y:A, 8t0y:D, 8t0y:C, 8t10:B, 8t10:A, 8t10:D, 8t10:C, 8t3l:A, 8t3l:D, 8t3l:B, 8t3l:C, 8t3m:A, 8t3m:D, 8t3m:C, 8t3m:B, 8u2z:A, 8u2z:D, 8u2z:B, 8u2z:C
6 3jap:p 634 68 0.2469 0.0315 0.2941 0.90 6fyx:q, 6fyy:q
7 6gsn:q 675 68 0.2469 0.0296 0.2941 0.90 8cah:q, 8cas:q, 6gsm:q, 8s8e:p, 4uer:c, 6zce:q, 6zu9:q
8 7v0b:A 539 29 0.1235 0.0186 0.3448 1.2 7v0b:B, 7v0b:C, 7v0b:D
9 5b8i:A 359 39 0.1481 0.0334 0.3077 1.4 6tz7:A
10 7prb:B 438 35 0.1852 0.0342 0.4286 1.6 8ohw:AAA, 8ohw:BBB, 7pr9:A, 7pr9:B, 7prb:A
11 6fah:B 262 41 0.1481 0.0458 0.2927 1.8 6fah:F
12 6tz8:D 373 37 0.1481 0.0322 0.3243 2.0 6tz8:A
13 4krh:A 430 71 0.2593 0.0488 0.2958 3.3 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
14 5upm:A 753 36 0.1605 0.0173 0.3611 3.5 5t4a:A, 5t4c:A, 5t4g:A, 5upi:A, 5upn:A, 5upo:A, 5v1w:A
15 7lqy:A 659 31 0.1481 0.0182 0.3871 5.1 8gf8:A, 8gf8:B, 8gf8:C, 8gf8:D, 8gf9:A, 8gf9:B, 8gf9:C, 8gf9:D, 8gfa:A, 8gfa:B, 8gfa:C, 8gfa:D, 8jqr:A, 8jqr:B, 8jqr:C, 8jqr:D, 7l2h:A, 7l2h:D, 7l2h:B, 7l2h:C, 7l2i:A, 7l2i:C, 7l2i:D, 7l2i:B, 7l2j:A, 7l2j:B, 7l2j:C, 7l2j:D, 7l2p:A, 7l2p:B, 7l2p:D, 7l2p:C, 7l2r:A, 7l2r:B, 7l2r:C, 7l2r:D, 7l2s:D, 7l2s:A, 7l2s:B, 7l2s:C, 7l2t:A, 7l2t:D, 7l2t:B, 7l2t:C, 7l2u:A, 7l2u:B, 7l2u:D, 7l2u:C, 7l2v:A, 7l2v:D, 7l2v:B, 7l2v:C, 7l2w:A, 7l2w:D, 7l2w:B, 7l2w:C, 7l2x:A, 7l2x:D, 7l2x:B, 7l2x:C, 7lp9:A, 7lp9:B, 7lp9:C, 7lp9:D, 7lqy:B, 7lqy:C, 7lqy:D, 7lqz:A, 7lqz:B, 7lqz:C, 7lqz:D, 7lr0:A, 7lr0:B, 7lr0:C, 7lr0:D, 7mz6:A, 7mz6:B, 7mz6:D, 7mz6:C, 7mz7:A, 7mz7:D, 7mz7:B, 7mz7:C, 7mz9:A, 7mz9:D, 7mz9:C, 7mz9:B, 7mza:A, 7mza:D, 7mza:B, 7mza:C, 7mzb:A, 7mzb:D, 7mzb:B, 7mzb:C, 7mzc:A, 7mzc:D, 7mzc:C, 7mzc:B, 7mzd:A, 7mzd:D, 7mzd:B, 7mzd:C, 7mze:A, 7mze:D, 7mze:B, 7mze:C, 2nyj:A, 2pnn:A, 7rqw:A, 7rqw:C, 7rqw:D, 7rqw:B, 7rqy:A, 7rqy:C, 7rqy:B, 7rqy:D, 7rqz:A, 7rqz:C, 7rqz:B, 7rqz:D, 8t0c:A, 8t0c:D, 8t0c:B, 8t0c:C, 8t0e:A, 8t0e:D, 8t0e:B, 8t0e:C, 8u30:A, 8u30:D, 8u30:B, 8u30:C, 8u3a:D, 8u3c:D, 8u43:A, 8u43:B, 8u43:C, 8u43:D, 8u4d:A, 8u4d:D, 8u4d:C, 8u4d:B, 8x94:A, 8x94:B, 8x94:C, 8x94:D
16 2uvq:A 211 17 0.1235 0.0474 0.5882 5.8
17 7txy:F 293 37 0.1358 0.0375 0.2973 6.6 7txy:B, 7txy:D, 7txy:H
18 5x7u:A 546 38 0.1605 0.0238 0.3421 6.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218