BioLiP

>protein
TPVEEAQQKTIEAITKAINYMAKRRIGALLTIERDTGMGDYIETGIPLNAKVSSELLINIFIPNTPLHDGAVIMKNNEIA
AAACYLPLSESPFISKELGTRHRAAVGISEVTDSLTIIVSEETGGVSVAKNGDLHRELTEEALKEMLEAEF

The query sequence (length=151) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ogp:A	153	151	1.0000	0.9869	1.0000	2.28e-108	8ogn:A, 8ogo:A, 8ogq:A, 8ogr:B, 8ogs:A, 8ogs:B, 8ogt:A, 8ogu:A, 8ogv:A, 8ogw:A, 8ogw:B, 8ogy:A, 8ogz:B, 8oh0:A, 8oh0:B, 8oh1:A, 8ohb:A, 8ohb:B, 8ohc:B, 8ohe:A, 8ohf:A, 8ohf:B, 8ohg:A, 8ohh:A, 8ohj:B, 8ohk:A, 8ohl:A, 8oho:A, 8oho:B
2	6hvn:A	175	149	0.6954	0.6000	0.7047	3.09e-75	8c4j:A, 8c4j:B, 8c4m:A, 8c4n:A, 8c4n:B, 8c4o:A, 8c4o:B, 8c4p:A, 8c4p:B, 8c4r:A, 6hvl:A, 6hvl:B, 6hvm:B, 4rv7:A, 4rv7:B, 4rv7:C, 4rv7:D, 8s45:B, 8s46:B, 8s47:A, 8s47:B, 8s48:B, 8s49:B, 8s4a:A, 8s4a:B, 8s4b:B
3	6gyx:B	152	141	0.5828	0.5789	0.6241	3.76e-65	6gyx:A
4	7l8n:A	151	145	0.5497	0.5497	0.5724	7.54e-58
5	8ofg:A	151	146	0.5497	0.5497	0.5685	2.61e-56	8ofg:B
6	7dg0:A	155	144	0.3510	0.3419	0.3681	7.87e-33	7dg0:B
7	3c1y:A	349	117	0.2053	0.0888	0.2650	0.066	3c1y:B, 3c21:A, 3c21:B, 3c23:A, 3c23:B, 4yvz:A, 4yvz:B, 4yxj:A, 4yxj:B, 4yxm:A, 4yxm:B
8	3o78:A	402	77	0.1523	0.0572	0.2987	0.37	7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
9	3u8p:A	336	61	0.1126	0.0506	0.2787	4.1	3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
10	6hr1:A	406	61	0.1126	0.0419	0.2787	4.7	6hr1:B
11	7rt0:A	385	107	0.1788	0.0701	0.2523	4.7
12	7bvy:A	333	86	0.1788	0.0811	0.3140	5.5	7bvz:A
13	8smu:D	394	61	0.1126	0.0431	0.2787	6.8	8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
14	4z4k:A	282	61	0.1126	0.0603	0.2787	8.4	5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
15	4jls:B	135	40	0.1060	0.1185	0.4000	9.1	4jls:A, 4jls:C, 4jls:D, 4jls:E, 4jls:H, 4jls:I, 4jls:J

[Back]