BioLiP

>protein
TPQWNDWCPGCGNFGILNAEQQAIVELGVDTKNVVVVSGIGCSGKIPHFTPISGVHTLHGRAIAFATGIKLSNPDLVVIV
NGGDGDLLGIGAGHFVAAGRRNVDMVVILHDNGVYGLTKGQASPTLKRGENINDAVNPIALAISSGYTFVARGYAYDVKH
LKELIKSAIKHKGLALIDVLQPCPTYNDINTKEWRIYKLDTLPDWDPVVKKPEEVNEKIKRAIDKSLEWGDIPIGIFYQN
ELVPSYEERIKANSPAYLDYTPAKQLIEKEGKLTTIIDPLLKEREV

The query sequence (length=286) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5b48:B	286	286	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	5b46:B	301	299	0.7203	0.6844	0.6890	3.45e-147
3	5b47:B	275	284	0.6783	0.7055	0.6831	8.94e-138
4	6n2n:B	291	207	0.3217	0.3162	0.4444	8.66e-60	6n2n:D, 6n2o:B, 6n2o:D
5	5exe:C	314	125	0.1084	0.0987	0.2480	0.011	5c4i:C, 5c4i:F, 5exd:C, 5exd:F, 5exd:I, 5exd:L, 5exe:F
6	6lpi:B	539	121	0.1154	0.0612	0.2727	0.020	6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
7	6a50:A	527	122	0.1189	0.0645	0.2787	0.021	6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
8	6cin:B	1169	177	0.1818	0.0445	0.2938	0.042	6cin:A, 6cin:C, 6cin:D, 6cin:E, 6cin:F, 6cio:A, 6cio:B, 6cio:C, 6cio:D, 6cio:E, 6cio:F, 6cip:A, 6cip:B, 6cip:C, 6cip:D, 6cip:E, 6cip:F, 6ciq:A, 6ciq:B, 6ciq:C
9	7pt4:B	584	178	0.1678	0.0822	0.2697	0.11	7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
10	7orx:CCC	531	122	0.1294	0.0697	0.3033	0.57	7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
11	7plm:A	1177	118	0.1119	0.0272	0.2712	0.74	7plm:B
12	1b0p:A	1231	118	0.1119	0.0260	0.2712	0.79	1b0p:B, 2c3m:A, 2c3m:B, 2c3o:A, 2c3o:B, 2c3p:A, 2c3p:B, 2c3u:A, 2c3u:B, 2c3y:A, 2c3y:B, 2c42:A, 2c42:B, 1kek:A, 1kek:B, 2pda:A, 2pda:B, 2uza:A, 2uza:B
13	1fdi:A	715	101	0.0769	0.0308	0.2178	0.95	1aa6:A, 1fdo:A, 2iv2:X, 7z0t:A
14	4bm1:A	337	113	0.0909	0.0772	0.2301	1.3	4bm1:B, 4bm2:A, 4bm3:A, 4bm4:A
15	8rf0:A	2780	83	0.0734	0.0076	0.2530	1.6	8rfe:A, 8rfg:A
16	1t8q:B	329	44	0.0524	0.0456	0.3409	4.3	1t8q:A, 1t8q:C, 1t8q:D, 1ydy:A, 1ydy:B
17	3il5:A	320	67	0.0699	0.0625	0.2985	5.3	3il4:A, 3il4:B, 3il4:C, 3il4:D, 3il5:B, 3il5:C, 3il5:D, 3il6:A
18	6m6a:M	459	28	0.0455	0.0283	0.4643	5.7	6m6b:M
19	8cwp:A	327	48	0.0490	0.0428	0.2917	6.1
20	6gaw:B6	52	36	0.0490	0.2692	0.3889	6.1	5aj4:B6, 4ce4:6, 6gb2:B6, 7nqh:B6, 7nql:B6, 7nsh:B6, 7nsi:B6, 7nsj:B6, 8oin:BI, 8oiq:BI, 4v19:6, 6ydp:B6, 6ydw:B6
21	2w3z:A	238	32	0.0385	0.0462	0.3438	7.0
22	6kik:A	275	94	0.0944	0.0982	0.2872	9.0	5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B

[Back]