BioLiP

>protein
TPQNITDLCAEYHNTQIHTLNDKIFSYTESLAGKREMAIITFKNGATFQVEVPGSQHIDSQKKAIERMKDTLRIAYLTEA
KVEKLCVWNNKTPHAIAAISMAN

The query sequence (length=103) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7lvb:F	108	103	1.0000	0.9537	1.0000	2.45e-75	2chb:D, 2chb:E, 2chb:F, 2chb:G, 2chb:H, 3chb:D, 3chb:E, 3chb:F, 3chb:G, 3chb:H, 1ct1:F, 1ct1:G, 1ct1:H, 1eei:D, 1eei:E, 1eei:F, 1eei:G, 1eei:H, 3efx:D, 3efx:E, 3efx:F, 3efx:G, 3efx:H, 3efx:I, 3efx:J, 3efx:K, 3efx:L, 3efx:M, 5elb:A, 5elb:B, 5elb:C, 5elb:D, 5elb:E, 5elb:F, 5elb:G, 5elb:H, 5elb:I, 5elb:J, 5elc:A, 5elc:B, 5elc:C, 5elc:D, 5elc:E, 5elc:G, 5elc:H, 5elc:I, 5elc:J, 5elc:F, 5eld:A, 5eld:C, 5eld:D, 5eld:E, 5ele:D, 5ele:G, 5ele:J, 5ele:A, 5ele:F, 5ele:H, 5ele:I, 5elf:A, 5elf:D, 5elf:E, 5elf:F, 5elf:G, 5elf:I, 5elf:J, 5elf:B, 5elf:H, 1g8z:D, 1g8z:F, 1g8z:G, 1g8z:H, 6hjd:A, 6hjd:B, 6hjd:C, 6hjd:D, 6hjd:E, 6hjd:G, 6hjd:H, 6hjd:I, 6hjd:F, 6hmw:A, 6hmw:B, 6hmw:C, 6hmw:D, 6hmw:E, 6hmw:F, 6hmw:G, 6hmw:H, 6hmw:I, 6hmw:J, 6hmy:A, 6hmy:B, 6hmy:C, 6hmy:D, 6hmy:E, 6hmy:F, 6hmy:G, 6hmy:H, 6hmy:I, 6hmy:J, 1jr0:D, 1jr0:E, 1jr0:F, 1jr0:G, 1jr0:H, 1llr:D, 1llr:E, 1llr:F, 1llr:G, 1llr:H, 7lvb:D, 7lvb:E, 7lvb:G, 7lvb:H, 7lvb:A, 7lvb:B, 7lvb:C, 7lvb:I, 7lvb:J, 5lzg:A, 5lzg:B, 5lzg:C, 5lzg:D, 5lzg:E, 5lzh:A, 5lzh:B, 5lzh:C, 5lzh:D, 5lzh:E, 5lzj:C, 5lzj:D, 1md2:D, 1md2:E, 1md2:F, 8oxs:D, 8oxs:E, 8oxs:F, 8oxs:G, 8oxs:H, 8oxs:C, 8oxs:I, 8oxs:K, 8oxs:L, 1pzj:D, 1pzj:E, 1pzj:F, 1pzj:G, 1pzj:H, 1pzk:D, 1pzk:E, 1pzk:F, 1pzk:G, 1pzk:H, 8qre:D, 8qre:E, 8qre:F, 8qre:G, 8qre:H, 8qre:C, 8qre:I, 8qre:J, 8qre:K, 8qre:L, 1rcv:D, 1rcv:E, 1rcv:F, 1rcv:G, 1rcv:H, 1rd9:D, 1rd9:E, 1rd9:F, 1rd9:G, 1rd9:H, 1rdp:D, 1rdp:E, 1rdp:F, 1rdp:G, 1rdp:H, 1rf2:D, 1rf2:E, 1rf2:F, 1rf2:G, 1rf2:H, 1s5d:D, 1s5d:E, 1s5d:F, 1s5d:G, 1s5d:H, 1s5e:D, 1s5e:J, 1s5f:D, 1s5f:E, 1s5f:F, 1s5f:G, 1s5f:H
2	1djr:D	103	102	0.8155	0.8155	0.8235	4.77e-63	1djr:E, 1djr:F, 1djr:G, 1djr:H, 1eef:D, 1eef:E, 1eef:F, 1eef:G, 1eef:H, 1eef:L, 1eef:M, 1eef:N, 1eef:O, 1eef:P, 1efi:D, 1efi:E, 1efi:F, 1efi:G, 1efi:H, 1fd7:D, 1fd7:E, 1fd7:F, 1fd7:G, 1fd7:H, 1fd7:L, 1fd7:M, 1fd7:N, 1fd7:O, 1fd7:P, 6ial:H, 6ial:J, 6ial:C, 1jqy:D, 1jqy:E, 1jqy:F, 1jqy:G, 1jqy:H, 1jqy:L, 1jqy:M, 1jqy:N, 1jqy:O, 1jqy:P, 1jqy:V, 1jqy:W, 1jqy:X, 1jqy:Y, 1jqy:Z, 1lt3:D, 1lt3:E, 1lt3:F, 1lt3:G, 1lt3:H, 1lt4:D, 1lt4:E, 1lt4:F, 1lt4:G, 1lt4:H, 1lt5:H, 1lt5:D, 1lt5:E, 1lt5:F, 1lt5:G, 1lt6:D, 1lt6:E, 1lt6:F, 1lt6:G, 1lt6:H, 1lt6:L, 1lt6:M, 1lt6:N, 1lt6:O, 1lt6:P, 1lta:D, 1lta:E, 1lta:F, 1lta:G, 1lta:H, 1lti:G, 1lti:D, 1lti:E, 1lti:H, 1ltt:D, 1ltt:E, 1ltt:F, 1ltt:G, 1ltt:H, 5lzi:A, 5lzi:B, 5lzi:C, 5lzi:D, 5lzi:E, 2o2l:D, 2o2l:E, 2o2l:F, 2o2l:G, 2o2l:H, 2o2l:I, 2o2l:J, 2o2l:K, 2o2l:L, 2o2l:M, 1pzi:D, 1pzi:E, 1pzi:F, 1pzi:G, 1pzi:H, 2xrq:D, 2xrq:E, 2xrq:F, 2xrq:G, 2xrq:H, 2xrs:D, 2xrs:E, 2xrs:F, 2xrs:G, 2xrs:H, 2xrs:L, 2xrs:M, 2xrs:O, 2xrs:P, 2xrs:N
3	4l6t:B	105	103	0.6990	0.6857	0.6990	8.46e-54	4l6t:C, 4l6t:D, 4l6t:E, 4l6t:F
4	3gbe:A	558	63	0.1553	0.0287	0.2540	0.16
5	2e2o:A	299	51	0.1748	0.0602	0.3529	0.33	2e2p:A, 2e2p:B, 2e2q:A, 2e2q:B
6	3zzm:A	520	57	0.1748	0.0346	0.3158	1.3	4a1o:A, 4a1o:B
7	3hpv:A	297	47	0.1456	0.0505	0.3191	6.2	3hpv:B, 3hpv:C, 3hpv:D, 3hpy:A, 3hpy:B, 3hpy:C, 3hpy:D, 3hq0:A, 3hq0:B, 3hq0:C, 3hq0:D
8	4how:A	559	39	0.0971	0.0179	0.2564	6.6	4hox:A, 4hoz:A, 4hp5:A, 4hph:A
9	2jw1:A	115	61	0.1650	0.1478	0.2787	7.3	1y9t:A
10	4qs7:A	455	75	0.1845	0.0418	0.2533	8.6	4qs9:A
11	5xx1:G	735	26	0.0971	0.0136	0.3846	9.3	5xx1:B, 5xx1:C, 5xx1:D, 5xx1:E, 5xx1:F, 5xx1:H, 5xx1:I
12	2igt:A	313	30	0.1068	0.0351	0.3667	9.3	2igt:B, 2igt:C

[Back]