BioLiP

>protein
TPNANCAPAYWNYQEIRPLLVLENPALRGQSSITATLYAGLQLIMPGEVAPSHRHNQSALRFIVEGKGAFTAVDGERTPM
NEGDFILTPQWRWHDHGNPGDEPVIWLDGLDLPLVNILGCGFAEDYPQQPVTRKEGDYLPRYAANMLPLRHQTGNSSPIF
NYRYDRSREVLHDLTRLGDADEWDGYKMRYVNPVTGGYPMPSMGAFLQLLPKGFASRVARTTDSTIYHVVEGSGQVIIGN
ETFSFSAKDIFVVPTWHGVSFQTTQDSVLFSFSDRPVQEALGLFREARY

The query sequence (length=289) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2d40:A	289	289	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2d40:B, 2d40:C, 2d40:D
2	3bu7:B	358	311	0.4014	0.3240	0.3730	7.18e-60	3bu7:A
3	3nl1:A	366	282	0.3702	0.2923	0.3794	2.50e-53	4fag:A, 4fah:A, 4fbf:A, 3njz:A, 3nkt:A, 3nst:A, 3nvc:A, 3nw4:A, 2phd:A, 2phd:B, 2phd:C, 2phd:D
4	3nl1:A	366	133	0.1073	0.0847	0.2331	1.4	4fag:A, 4fah:A, 4fbf:A, 3njz:A, 3nkt:A, 3nst:A, 3nvc:A, 3nw4:A, 2phd:A, 2phd:B, 2phd:C, 2phd:D
5	8ch4:D	183	93	0.1246	0.1967	0.3871	7.04e-11	8ch4:A, 8ch4:B, 8ch4:C
6	8ch4:D	183	76	0.0657	0.1038	0.2500	0.002	8ch4:A, 8ch4:B, 8ch4:C
7	5uqp:B	112	60	0.0588	0.1518	0.2833	0.045	5uqp:A
8	6nu9:A	168	108	0.1142	0.1964	0.3056	0.054
9	5i8s:A	179	47	0.0588	0.0950	0.3617	0.21	5i8t:A, 5i8y:A, 5i91:A, 5i93:A
10	6d03:C	679	114	0.1073	0.0457	0.2719	0.67	1a8e:A, 1a8f:A, 1b3e:A, 8brc:A, 6ctc:A, 6d03:D, 6d04:C, 6d04:D, 6d05:C, 6d05:D, 1d3k:A, 1d4n:A, 1dtg:A, 5dyh:A, 5dyh:B, 7ffm:A, 7ffu:A, 3fgs:A, 1fqe:A, 1fqf:A, 4h0w:A, 5h52:A, 6jas:A, 1jqf:A, 1n7w:A, 1n7x:A, 1n84:A, 2o7u:B, 2o7u:A, 2o7u:C, 2o7u:D, 2o7u:E, 2o7u:F, 2o7u:G, 2o7u:H, 2o7u:I, 2o84:X, 1oqg:A, 1oqh:A, 3qyt:A, 1ryo:A, 6soy:C, 6soz:C, 1suv:C, 1suv:D, 6uj6:A, 3v83:A, 3v83:B, 3v83:C, 3v83:D, 3v83:E, 3v83:F, 3ve1:B, 3ve1:D, 5wtd:A, 4x1b:A, 4x1d:A, 4x1d:B, 5x5p:A, 5y6k:A
11	5vg3:A	382	82	0.0830	0.0628	0.2927	0.74	5hi0:A, 1j58:A, 1l3j:A, 4met:A, 4met:B, 4met:C, 4met:D, 3s0m:A, 6tzp:A, 6ufi:A, 1uw8:A, 2uy8:A, 2uy9:A, 2uya:A, 2uyb:A, 2v09:A, 5vg3:B, 5vg3:C
12	3h50:A	114	71	0.0761	0.1930	0.3099	0.83
13	3jzv:A	148	64	0.0588	0.1149	0.2656	1.1
14	1lr5:D	160	30	0.0415	0.0750	0.4000	1.4	1lr5:C, 1lr5:B, 1lr5:A, 1lrh:D, 1lrh:C, 1lrh:B, 1lrh:A
15	6l9i:A	338	87	0.0900	0.0769	0.2989	2.2	6l9i:B, 6l9i:C, 6l9i:D, 6l9i:E, 6l9i:F
16	7jxg:A	178	47	0.0519	0.0843	0.3191	2.5	4qgn:A
17	6z1p:Bi	626	54	0.0623	0.0288	0.3333	3.4
18	3cew:A	118	35	0.0450	0.1102	0.3714	4.4	3cew:B, 3cew:C, 3cew:D
19	6c4t:A	428	36	0.0484	0.0327	0.3889	5.6	6gmz:A, 6h3d:A, 6h3f:A
20	8p0o:A	622	44	0.0450	0.0209	0.2955	5.6	8p0o:B, 8p0p:A, 8p0p:B, 8p0q:A, 8p0q:B
21	5vj0:D	300	37	0.0519	0.0500	0.4054	6.4	5gt2:A, 5gt2:B, 5gt2:C, 5gt2:D, 5vj0:A, 5vj0:B, 5vj0:C
22	6vzy:A	464	89	0.0830	0.0517	0.2697	7.2	8e8w:A, 8e8w:B, 6m9r:A, 6m9r:B, 6m9s:A, 6m9s:B, 6m9s:C, 6m9s:D, 6vzy:B
23	7bef:G	106	64	0.0554	0.1509	0.2500	7.7	7beg:G
24	6kxh:B	294	40	0.0484	0.0476	0.3500	8.2	7clz:A, 7clz:C, 7clz:D, 6kxh:A, 6kxh:C, 6kxh:D
25	7zvy:A	112	58	0.0415	0.1071	0.2069	9.3
26	8d6m:A	822	97	0.0934	0.0328	0.2784	9.9	8d6o:A

[Back]