BioLiP

>protein
TPAFNKPKVELHVHLDGAIKPETILYFGKKRGIALPADTVEELRNIIGMDKPLSLPGFLAKFDYYMPVIAGCREAIKRIA
YEFVEMKAKEGVVYVEVRYSPHLLANSKVDPMPWNQTEGDVTPDDVVDLVNQGLQEGEQAFGIKVRSILCCMRHQPSWSL
EVLELCKKYNQKTVVAMDLAGDETIEGSSLFPGHVEAYEGAVKNGIHRTVHAGEVGSPEVVREAVDILKTERVGEGYHTI
EDEALYNRLLKENMHFEVCPWSSYLTGAWDPKTTHAVVRFKNDKANYSLNTDDPLIFKSTLDTDYQMTKKDMGFTEEEFK
RLNINAAKSSFLPEEEKKELLERLYREYQ

The query sequence (length=349) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1a4l:A	349	349	0.9971	0.9971	0.9971	0.0	1a4l:B, 1a4l:C, 1a4l:D, 1a4m:A, 1a4m:B, 1a4m:C, 1a4m:D, 1add:A, 2ada:A, 1fkw:A, 1fkx:A, 3km8:A, 3km8:B, 3mvi:A, 3mvi:B, 3t1g:A, 1uio:A, 1uip:A
2	3iar:A	360	347	0.8252	0.8000	0.8300	0.0	2bgn:E, 2bgn:F, 2bgn:G, 2bgn:H, 2e1w:A, 1krm:A, 1ndv:A, 1ndw:A, 1ndy:A, 1ndz:A, 1o5r:A, 1qxl:A, 7rtg:A, 7rtg:B, 1uml:A, 1v79:A, 1v7a:A, 1vfl:A, 1w1i:E, 1w1i:F, 1w1i:G, 1w1i:H, 1wxy:A, 1wxz:A, 2z7g:A
3	6n9m:A	331	341	0.3181	0.3353	0.3255	8.18e-48
4	6n91:A	334	332	0.3066	0.3204	0.3223	2.19e-44	6n91:B
5	3ou8:B	314	336	0.2550	0.2834	0.2649	6.55e-34	3ou8:A, 3pan:A, 3pan:B, 3pao:A, 3pao:B, 3pbm:A, 3pbm:B
6	3rys:A	335	346	0.2751	0.2866	0.2775	1.59e-30	3rys:B
7	4gxw:A	369	336	0.2464	0.2331	0.2560	4.04e-25	4gxw:B
8	2amx:A	364	356	0.2722	0.2610	0.2669	4.31e-25	2amx:B
9	6ii7:A	355	352	0.2693	0.2648	0.2670	1.15e-23
10	3ewd:A	364	348	0.2636	0.2527	0.2644	3.01e-22	3ewc:A, 2pgf:A, 2pgr:A, 2qvn:A
11	6ijn:A	341	347	0.2693	0.2757	0.2709	6.17e-21	6ijm:A, 6ijp:A, 6iv5:A, 6j23:A, 6j4t:A
12	8qch:H	350	347	0.2149	0.2143	0.2161	7.00e-11	8qch:A, 8qch:B, 8qch:C, 8qch:D, 8qch:E, 8qch:F, 8qch:G
13	3lgd:A	482	181	0.1490	0.1079	0.2873	3.45e-05	3lgd:B, 3lgg:A, 3lgg:B
14	7d4c:A	595	44	0.0573	0.0336	0.4545	0.035	7c3h:A, 7c3h:B, 7c3i:A, 7c3i:B, 7c3j:A, 7c3j:B, 7c3l:A, 7c3l:B, 7d4d:A, 7d4e:A, 3x0v:A, 3x0v:B
15	6f4a:A	644	57	0.0487	0.0264	0.2982	1.9
16	7pyt:B	392	138	0.0946	0.0842	0.2391	2.7	7pyt:D, 7yxm:B, 7yxm:D
17	6cbd:A	787	28	0.0315	0.0140	0.3929	5.2	5wea:A
18	8d6j:A	810	28	0.0315	0.0136	0.3929	5.2	9bez:A, 9bez:B, 9bez:C, 9bf0:A, 9bf0:B, 9bf0:C, 9bf2:A, 9bf2:B, 9bf2:C, 7c6b:A, 7c6b:B, 7c6b:C, 7d7u:A, 7d7u:B, 7d7u:C, 8d71:A, 4f3t:A, 5js1:A, 5js2:A, 5ki6:A, 7ki3:A, 7ki3:D, 3luc:A, 3luc:B, 3luc:C, 3lud:A, 3lud:B, 3lud:C, 3lug:A, 3lug:B, 3lug:C, 3luh:A, 3luh:B, 3luh:C, 3luj:A, 3luj:B, 3luj:C, 3luk:A, 3luk:B, 3luk:C, 6mdz:A, 6mdz:B, 6mfn:A, 6mfr:A, 6mfr:B, 6n4o:A, 6nit:A, 6nit:B, 4ola:A, 4olb:A, 3qx8:A, 3qx8:B, 3qx8:C, 3qx9:A, 3qx9:B, 3qx9:C, 6ra4:A, 6ra4:B, 5t7b:A, 4w5n:A, 4w5o:A, 4w5q:A, 4w5r:A, 4w5t:A, 4z4c:A, 4z4d:A, 4z4e:A, 4z4f:A, 4z4g:A, 4z4h:A, 4z4i:A
19	8gym:s1	689	50	0.0487	0.0247	0.3400	6.1	8b6f:AB, 8bqs:AB, 8gym:S1, 8gzu:s1, 8gzu:S1, 7tgh:S1
20	6gwu:A	208	60	0.0487	0.0817	0.2833	6.5	6gwu:B, 6gwu:C, 6gwu:D
21	8e4y:A	651	34	0.0401	0.0215	0.4118	6.9	8e50:A

[Back]