BioLiP

>protein
TNTSTLLEKALQIAVKAHSGQIDKAGSAYIFHPIRVSNRCSTDDERIVALLHDTIEDTEVTAEYLLMEGFPRNIVDAILS
VTRNEDESYDDFIKRSRLNPIGRQVKLHDLEDNMDITRLNELTEKDIYRLNKYIKAYKYLKEHH

The query sequence (length=144) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7smg:B	144	144	1.0000	1.0000	1.0000	5.49e-105	7smg:A, 7smg:C, 7smg:D
2	7oiw:A	327	59	0.1944	0.0856	0.4746	3.75e-07	7oiw:B
3	7qpr:D	689	83	0.2083	0.0435	0.3614	5.04e-07	7qpr:A, 7qpr:B, 7qpr:C, 7qps:A
4	1vj7:A	326	84	0.2014	0.0890	0.3452	1.37e-06	1vj7:B
5	7ohg:A	351	81	0.2014	0.0826	0.3580	9.19e-06	6s2t:A, 6s2u:A, 6s2v:A
6	6yxa:A	536	83	0.2083	0.0560	0.3614	1.34e-05	8acu:A, 8acu:B
7	6s2v:C	336	108	0.2292	0.0982	0.3056	1.66e-05	6s2v:B
8	5xnx:D	321	43	0.1458	0.0654	0.4884	0.002	5xnx:C
9	3nr1:A	178	70	0.1944	0.1573	0.4000	0.003	3nr1:B, 5vxa:A, 5vxa:B
10	8ro0:A	2231	61	0.1458	0.0094	0.3443	0.047	8ro1:A
11	7qoc:A	193	66	0.1667	0.1244	0.3636	0.11	7qoc:B, 7qod:A, 7qod:B
12	3nqw:A	178	71	0.1736	0.1404	0.3521	0.17	3nqw:B
13	6z3o:AAA	178	101	0.1736	0.1404	0.2475	0.50	6yvc:A, 6yvc:B, 6yvc:C, 6yvc:D, 6z3o:BBB, 6z3o:CCC, 6z3o:DDD
14	2ijd:1	644	68	0.1458	0.0326	0.3088	0.50	4dcd:A, 2ijd:2, 2ily:A, 2ilz:A, 2im0:A, 2im1:A, 2im2:A, 2im3:A, 4k4s:A, 4k4s:E, 4k4t:A, 4k4t:E, 4k4u:A, 4k4u:E, 4k4v:A, 4k4v:E, 4k4w:A, 4k4w:E, 3ol6:A, 3ol6:E, 3ol6:I, 3ol6:M, 3ol7:A, 3ol7:E, 3ol7:I, 3ol7:M, 3ol8:A, 3ol8:E, 3ol8:I, 3ol8:M, 3ol9:A, 3ol9:E, 3ol9:I, 3ol9:M, 3ola:A, 3ola:E, 3ola:I, 3ola:M, 3olb:A, 3olb:E, 3olb:I, 3olb:M, 1ra7:A
15	5xe0:A	457	41	0.0972	0.0306	0.3415	0.52	5zit:A
16	5tv6:A	239	79	0.1667	0.1004	0.3038	0.59	5tv6:B, 5tv8:A, 5tv8:B, 5tva:A, 5tva:B
17	1rdr:A	316	68	0.1458	0.0665	0.3088	0.81
18	8q7x:A	1914	61	0.1389	0.0104	0.3279	1.6
19	8qp8:A	1918	61	0.1389	0.0104	0.3279	1.6
20	5z57:A	1978	61	0.1389	0.0101	0.3279	1.6
21	5z56:A	2232	61	0.1389	0.0090	0.3279	1.7	7aav:A, 7abf:A, 8ch6:a, 7dvq:A, 8i0s:A, 5z58:A
22	9c9y:A	612	89	0.2014	0.0474	0.3258	3.8	9ca0:A, 9ca1:A
23	2wnr:B	222	36	0.0833	0.0541	0.3333	4.2	2wnr:D, 2wnr:F
24	3cdu:A	468	41	0.0903	0.0278	0.3171	4.4	3cdw:A, 4k4x:A, 4k4x:E, 4k4x:I, 4k4x:M, 4k4y:A, 4k4y:E, 4k4y:I, 4k4y:M, 4k4z:A, 4k4z:E, 4k4z:I, 4k4z:M, 4y2a:A, 4y34:A
25	7qoe:A	187	153	0.2569	0.1979	0.2418	5.9
26	8h6k:5B	2253	61	0.1389	0.0089	0.3279	6.1	8h6l:5B, 8i0u:A, 8i0v:A, 8q7n:A, 8qo9:A, 8qpe:A, 7qtt:a, 8qzs:A
27	8i0p:A	2149	61	0.1389	0.0093	0.3279	6.3	8q7q:A, 8q7v:A, 8q7w:A
28	8y6o:C	2227	61	0.1389	0.0090	0.3279	6.4	8h6e:5B, 8h6j:5B, 8qp9:A, 6qw6:5A, 6qx9:5A, 8qxd:A, 8r08:A
29	8c6j:A	2261	61	0.1389	0.0088	0.3279	6.4	6ah0:A, 6ahd:A, 8bc8:J, 6ff4:A, 6ff7:A, 9fmd:A, 8i0r:A, 8i0t:A, 8i0w:A, 6icz:A, 6id0:A, 6id1:A, 4jk9:A, 4jk9:B, 4jka:A, 4jka:B, 5mqf:A, 5o9z:A, 6qdv:A, 8qoz:A, 8qpa:A, 8qpb:A, 8qpk:A, 8r09:A, 8r0a:A, 8r0b:A, 8rm5:A, 8ro2:A, 7w59:A, 7w5a:A, 7w5b:A, 5xjc:A, 5yzg:A, 6zym:A
30	7abg:A	2174	61	0.1389	0.0092	0.3279	6.5	7abi:A, 8q91:A, 8rc0:A
31	4b10:A	385	42	0.0903	0.0338	0.3095	9.3	4a95:A, 4a95:B, 4a95:C, 4b10:B, 4b10:C, 4b11:A, 4b11:B, 4b11:C, 4b12:A, 4b12:B, 4b12:C, 4b13:A, 4b13:B, 4b13:C, 4b14:A, 4b14:B, 4b14:C, 6b1l:A, 4bbh:A, 4bbh:B, 4bbh:C, 4c68:A, 4c68:B, 4c68:C, 4cae:A, 4cae:B, 4cae:C, 4caf:A, 4caf:B, 4caf:C, 8fbq:A, 5g1z:A, 5g1z:B, 5g1z:C, 5g22:A, 5g22:B, 5g22:C, 6may:A, 6may:B, 6may:C, 6maz:A, 6maz:B, 6maz:C, 6mb0:A, 6mb0:B, 6mb0:C, 6mb1:A, 6mb1:B, 6mb1:C, 6nxg:A, 6nxg:B, 6nxg:C, 5o48:A, 5o48:B, 5o48:C, 5o4v:A, 5o4v:B, 5o4v:C, 6tw5:AAA, 6tw5:BBB, 6tw5:CCC, 6tw6:AAA, 6tw6:BBB, 6tw6:CCC, 4ufv:A, 4ufv:B, 4ufv:C, 4ufw:A, 4ufw:B, 4ufw:C, 4ufx:A, 4ufx:B, 4ufx:C, 5v0w:A, 5v0w:B, 5v0w:C, 5v0x:A, 5v0x:B, 5v0x:C, 8vka:A, 8vka:B, 8vka:C, 8vkb:A, 8vkb:B, 8vkb:C, 2ync:A, 2ync:B, 2ync:C, 2ynd:A, 2ynd:B, 2ynd:C, 2yne:A, 2yne:B, 2yne:C

[Back]