BioLiP

>protein
TNTLQVKLLSKNARMPERNHKTDAGYDIFSAETVVLEPQEKAVIKTDVAVSIPEGYVGLLTSRSGVSSKTHLVIETGKIN
AGYHGNLGINIKNDHEDDKMQTIFLRNIDNEKIFEKERHLYKLGSYRIEKGERIAQLVIVPIWTPELKQVEEFES

The query sequence (length=155) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5cct:A	169	155	0.9935	0.9112	0.9935	9.97e-113	5cco:A, 5nyz:A, 5nz2:A, 3zez:A, 3zf0:A, 3zf1:A, 3zf4:A, 3zf5:A, 3zf6:A
2	4wrk:A	158	156	0.7613	0.7468	0.7564	1.24e-78	4gv8:A, 4gv8:C, 4gv8:B, 4gv8:D, 4gv8:F, 4gv8:E, 4wrk:B, 4wrk:C, 4wrk:D, 4wrk:E, 4wrk:F
3	6mjk:A	144	151	0.2968	0.3194	0.3046	5.75e-22
4	6ljj:A	150	148	0.2968	0.3067	0.3108	1.23e-21	3ara:A, 3ara:C, 3ara:B, 3arn:A, 3arn:C, 3arn:B, 3ehw:A, 3ehw:B, 3ehw:C, 3ehw:X, 3ehw:Y, 3ehw:Z, 5h4j:A, 2hqu:A, 2hqu:B, 2hqu:C
5	5f9k:B	130	154	0.2968	0.3538	0.2987	3.95e-19	5f9k:A, 5f9k:C
6	4gcy:A	163	156	0.3097	0.2945	0.3077	3.54e-18	8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
7	4oop:B	142	151	0.2968	0.3239	0.3046	5.57e-17	4oop:A, 4oop:C
8	2ol1:C	125	144	0.2839	0.3520	0.3056	2.75e-16	2oke:A, 2oke:C, 2oke:B, 2ol1:A, 2ol1:B
9	3f4f:A	138	136	0.2065	0.2319	0.2353	1.76e-12	3f4f:B, 3f4f:C, 3p48:A, 3p48:C, 3p48:B
10	1f7r:A	133	127	0.2581	0.3008	0.3150	5.96e-11	1f7k:A, 1f7k:B, 1f7n:A, 1f7n:B, 1f7p:A, 1f7p:C, 1f7p:B, 1f7q:A, 1f7q:C, 1f7q:B
11	6hde:B	152	152	0.2516	0.2566	0.2566	5.66e-10	1eu5:A, 1euw:A, 6hde:A, 6hde:C, 2hrm:A, 1rn8:A, 1rnj:A, 1seh:A, 1syl:A
12	5y5p:D	171	113	0.2323	0.2105	0.3186	9.60e-10	5y5p:A, 5y5p:B, 5y5p:C, 5y5p:E, 5y5p:F, 5y5q:A, 5y5q:B, 5y5q:C
13	8hrv:B	145	153	0.1806	0.1931	0.1830	1.47e-06	8hrv:A, 8hrv:C
14	6mao:A	137	160	0.2516	0.2847	0.2437	2.02e-05
15	7n6s:C	147	129	0.2065	0.2177	0.2481	2.49e-05	7n6s:A, 7n6s:B, 7n6s:F, 7n6s:D, 7n6s:E
16	2y8c:C	136	92	0.1742	0.1985	0.2935	0.003	2y8c:B
17	3t64:A	153	100	0.1935	0.1961	0.3000	0.005	3t60:A, 3t60:B, 3t60:C, 3t64:B, 3t64:C, 3t6y:A, 3t6y:B, 3t6y:C, 3t70:A, 3t70:B, 3t70:C, 1vyq:A, 1vyq:B, 1vyq:C, 2y8c:A
18	4aoo:A	143	117	0.2129	0.2308	0.2821	0.038	4ao5:A, 4ao5:B, 4ao5:C, 4ao5:D, 4ao5:E, 4ao5:F, 4aoo:B, 4aoo:C, 4aoo:D, 4aoz:A, 4aoz:B, 4aoz:C, 4apz:1, 4apz:Y, 4apz:2, 4apz:3, 4apz:4, 4apz:5, 4apz:7, 4apz:6, 4apz:8, 4apz:9, 4apz:a, 4apz:A, 4apz:C, 4apz:B, 4apz:D, 4apz:E, 4apz:F, 4apz:G, 4apz:I, 4apz:H, 4apz:J, 4apz:K, 4apz:L, 4apz:M, 4apz:N, 4apz:O, 4apz:P, 4apz:R, 4apz:Q, 4apz:S, 4apz:U, 4apz:T, 4apz:V, 4apz:W, 4apz:X, 4apz:Z, 4apz:b, 4apz:d, 4apz:c, 4apz:e, 4apz:g, 4apz:f, 4apz:h, 4apz:j, 4apz:i, 4apz:k, 4apz:m, 4apz:l, 4b0h:A, 4b0h:B, 4b0h:C, 2xce:A, 2xce:B, 2xce:C, 2xce:D, 2xce:E, 2xce:F, 2xy3:A, 2xy3:B, 2xy3:C, 2xy3:D, 2xy3:E, 2xy3:F
19	1jda:A	418	56	0.1161	0.0431	0.3214	0.63	2amg:A, 1gcy:A, 6iwk:A, 6iyg:A, 6j3x:A, 1jdc:A, 1jdd:A, 6jqb:A, 1qi3:A, 1qi4:A, 1qi5:A, 1qpk:A
20	6lj3:A	164	80	0.1484	0.1402	0.2875	0.98	6ky9:A, 6ky9:B, 6ky9:C, 6kz6:C, 6kz6:B, 6kz6:A, 6lis:A, 6lis:B, 6lis:C, 6lis:D, 6lis:F, 6lis:E, 6lj3:C, 6lj3:B
21	6n7j:L	214	54	0.0903	0.0654	0.2593	1.2
22	7vo5:A	276	47	0.0968	0.0543	0.3191	2.8
23	8oo6:A	604	88	0.1484	0.0381	0.2614	3.2	1d8y:A, 1d9d:A, 1d9f:A, 1kfs:A, 2kfn:A, 2kfz:A, 1kln:A, 1krp:A, 1ksp:A, 2kzm:A, 2kzz:A, 8ooy:A, 1qsl:A
24	1kfd:A	560	88	0.1484	0.0411	0.2614	3.5
25	7nac:m	666	43	0.0903	0.0210	0.3256	6.9	8e5t:s, 6em1:m, 6em3:B, 7nad:m, 7ohp:m, 7ohs:m, 7ohw:m, 7ohx:m, 7r6q:m, 7r72:m, 7r7a:m, 8v87:m
26	6elz:m	645	43	0.0903	0.0217	0.3256	7.0	6em5:m, 7ohr:m, 7ohv:m
27	6v59:A	419	29	0.0774	0.0286	0.4138	8.4	6nx0:A, 6v59:B
28	7mfm:G	1483	37	0.0839	0.0088	0.3514	8.6	7mfm:H, 7mft:G
29	8i0w:J	571	40	0.0903	0.0245	0.3500	9.0	7dvq:J, 8i0u:J, 8i0v:J, 6icz:J, 6id0:J, 6id1:J, 6qdv:S, 7w59:J, 7w5a:J, 7w5b:J, 5xjc:J, 5yzg:J, 5z56:J, 5z57:J, 5z58:J

[Back]