BioLiP

>protein
TNKPIVLSTFNFGLHANVEAWKVLSKGGKALDAVEKGVRLVEDDPTERSVGYGGRPDRDGRVTLDACIMDENYNIGSVAC
MEHIKNPISVARAVMEKTPHVMLVGDGALEFALSQGFKKENLLTAESEKEWKEWLYKPIVNIENHDTIGMIALDAQGNLS
GACTTSGMAYKMHGRVGDSPIIGAGLFVDNEIGAATATGHGEEVIRTVGTHLVVELMNQGRTPQQACKEAVERIVKIVNR
RGKNLKDIQVGFIALNKKGEYGAYCIQDGFNFAVHDQKGNRLETPGFALK

The query sequence (length=290) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1p4v:A	295	294	0.9931	0.9763	0.9796	0.0	9gac:A, 9gac:C, 9gaf:A, 9gaf:C, 2gl9:B, 2gl9:D, 3ljq:C, 1p4v:C, 4r4y:A
2	4osx:A	300	252	0.3276	0.3167	0.3770	4.27e-44	4o0d:A, 4o0d:B, 4o0f:A, 4o0f:B, 4o0h:A, 4o0h:B, 4osx:B, 4osy:A, 4osy:B, 4pvr:A, 4pvr:B, 4pvs:A, 4pvs:B, 4zm9:A, 4zm9:B, 4zm9:C, 4zm9:D
3	4o48:A	298	243	0.3172	0.3087	0.3786	3.77e-35	4o48:B
4	1jn9:A	158	109	0.1655	0.3038	0.4404	1.94e-20	8c0i:AAA
5	1apz:B	141	139	0.1724	0.3546	0.3597	8.77e-18	1apz:D
6	2a8j:B	313	200	0.1966	0.1821	0.2850	1.80e-16	2a8j:A, 2a8m:A
7	2gez:B	133	114	0.1552	0.3383	0.3947	6.46e-16	2gez:D, 2gez:F, 2gez:H
8	8c23:DDD	135	121	0.1517	0.3259	0.3636	9.49e-16	8c23:HHH, 2zal:B, 2zal:D
9	4pv2:C	158	157	0.1724	0.3165	0.3185	8.39e-13	4pu6:A, 4pu6:C, 4pv2:A, 4pv3:A, 4pv3:C
10	2gez:C	166	123	0.1621	0.2831	0.3821	7.01e-12	2gez:A, 2gez:E, 2gez:G
11	4pu6:B	131	132	0.1483	0.3282	0.3258	5.23e-11
12	5msy:A	457	57	0.0586	0.0372	0.2982	0.37	5msy:B, 5msy:C
13	7ojr:A	445	40	0.0517	0.0337	0.3750	1.3	7oml:A
14	1m32:B	362	45	0.0517	0.0414	0.3333	1.8	1m32:A, 1m32:C, 1m32:D, 1m32:E, 1m32:F
15	2g88:A	331	36	0.0483	0.0423	0.3889	2.6	2odn:A, 2odw:A, 2oep:A, 1ube:A, 1ubf:A, 1ubg:A, 2zr9:A, 2zra:A, 2zrd:A, 2zre:A, 2zrf:A, 2zrg:A, 2zri:A, 2zrj:A, 2zrk:A, 2zrl:A, 2zrm:A, 2zro:A, 2zrp:A
16	4plt:B	319	80	0.0724	0.0658	0.2625	4.8	4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
17	2ynp:A	601	85	0.0724	0.0349	0.2471	5.5	8ens:A, 8enw:A, 8enw:B, 8enx:A, 8hqt:A, 8hqv:A, 8hqx:A, 4j73:A, 4j77:A, 4j77:B, 4j78:A, 4j79:A, 4j81:B, 4j81:A, 4j82:A, 4j82:B, 4j84:A, 4j84:B, 4j86:A, 4j86:B, 2ynn:A
18	6hq7:A	377	110	0.0931	0.0716	0.2455	5.9	6hq3:B, 6hq3:C, 6hq3:A, 6hq3:D, 6hq4:A, 6hq4:B, 6hq5:A, 6hq5:B, 6hq7:B
19	6a8a:A	327	72	0.0828	0.0734	0.3333	9.6	6a8a:B, 6a8b:A, 6a8b:B, 6a8c:A, 6a8c:B, 5zwy:A, 5zwy:B

[Back]