Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TNILAGAAVIKVLEAWGVDHLYGIPGGSINSIMDALSAERDRIHYIQVRHEEVGAMAAAADAKLTGKIGVCFGSAGPGGT
HLMNGLYDAREDHVPVLALIGQFGTTGMNMDTFQEMNENPIYADVADYNVTAVNAATLPHVIDEAIRRAYAHQGVAVVQI
PVDLPWQQIPAEDWYASANSYQTPLLPEPDVQAVTRLTQTLLAAERPLIYYGIGARKAGKELEQLSKTLKIPLMSTYPAK
GIVADRYPAYLGSANRVAQKPANEALAQADVVLFVGNNYPFAEVSKAFKNTRYFLQIDIDPAKLGKRHKTDIAVLADAQK
TLAAILAQVSERESTPWWQANLANVKNWRAYLASLEDKQEGPLQAYQVLRAVNKIAEPDAIYSIDVGDINLNANRHLKLT
PSNRHITSNLFATMGVGIPGAIAAKLNYPERQVFNLAGDGGASMTMQDLATQVQYHLPVINVVFTNCQYGFIKDEQEDTN
QNDFIGVEFNDIDFSKIADGVHMQAFRVNKIEQLPDVFEQAKAIAQHEPVLIDAVITGDRPLPAEKLRLDSAMSSAADIE
AFKQRYEAQDLQPLSTYLKQFGLDDL

The query sequence (length=586) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4fee:A 586 586 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 2ez4:A, 2ez4:B, 2ez8:A, 2ez8:B, 2ez9:A, 2ez9:B, 2ezt:A, 2ezt:B, 2ezu:A, 2ezu:B, 4fee:B, 4feg:A, 4feg:B, 6haf:A, 6haf:B, 4kgd:A, 4kgd:B, 1pow:A, 1pow:B, 1pox:A, 1pox:B, 1y9d:B
2 1y9d:D 560 585 0.9539 0.9982 0.9556 0.0 1y9d:A, 1y9d:C
3 2dji:A 590 580 0.4693 0.4661 0.4741 0.0 1v5e:A, 1v5f:A, 1v5g:A
4 3ey9:A 571 551 0.2884 0.2960 0.3067 3.77e-76 3ey9:B, 3eya:A, 3eya:B, 3eya:C, 3eya:D, 3eya:E, 3eya:F, 3eya:G, 3eya:H, 3eya:I, 3eya:J, 3eya:K, 3eya:L
5 6lpi:B 539 500 0.2440 0.2653 0.2860 6.12e-56 6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
6 8i01:A 594 552 0.2474 0.2441 0.2627 7.82e-53 8beo:A, 8beo:B, 8beo:C, 8beo:E, 8beo:D, 8beo:F, 8i01:B, 8i01:C, 8i01:E, 8i01:D, 8i01:F, 8i05:A, 8i05:B, 8i05:C, 8i05:E, 8i05:D, 8i05:F, 8i07:A, 8i07:B, 8i07:C, 8i07:E, 8i07:D, 8i07:F, 8i08:A, 8i08:B, 8i08:C, 8i08:E, 8i08:D, 8i08:F, 2pan:A, 2pan:B, 2pan:C, 2pan:D, 2pan:E, 2pan:F
7 9ev3:A 577 531 0.2491 0.2530 0.2750 1.04e-49 9ev5:A, 9ev5:B, 9ev5:C, 9ev5:D, 9ev6:A, 9ev6:B, 9ev6:C, 9ev6:D
8 6wo1:A 551 546 0.2406 0.2559 0.2582 3.10e-47
9 4rji:C 555 541 0.2560 0.2703 0.2773 9.86e-47 4rji:A, 4rji:B, 4rji:D, 4rjj:A, 4rjj:B, 4rjj:C, 4rjj:D, 4rjj:E, 4rjj:F, 4rjj:G, 4rjj:H, 4rjk:A, 4rjk:B, 4rjk:C, 4rjk:D, 4rjk:E, 4rjk:F, 4rjk:G, 4rjk:H
10 6deq:A 601 554 0.2543 0.2479 0.2690 1.44e-46 6dek:A, 6del:A, 6dem:A, 6den:A, 6deo:A, 6dep:A, 6der:A, 6des:A
11 5dx6:B 557 512 0.2423 0.2549 0.2773 1.49e-45 5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
12 1t9b:A 583 546 0.2355 0.2367 0.2527 3.04e-44 1t9d:B, 1t9d:C
13 6u9d:B 607 553 0.2372 0.2290 0.2514 4.68e-44 6bd3:A, 6bd3:B, 6bd9:A, 6bd9:B, 5fem:A, 5fem:B, 5ims:A, 5ims:B, 1jsc:A, 1jsc:B, 1n0h:A, 1n0h:B, 1t9a:A, 1t9a:B, 1t9b:B, 1t9c:A, 1t9c:B, 1t9d:A, 1t9d:D, 6u9d:A, 6u9d:E, 6u9d:F, 6u9d:I, 6u9d:J, 6u9d:M, 6u9d:N, 6u9d:Q, 6u9d:U, 6u9d:V, 5wkc:A, 5wkc:D, 5wkc:B, 5wkc:E
14 9ev4:A 553 531 0.2389 0.2532 0.2637 1.25e-42
15 5k2o:A 585 481 0.2201 0.2205 0.2682 3.93e-42 3e9y:A, 3ea4:A, 8et4:A, 8et5:A, 5k3s:A, 5k6q:A, 5k6r:A, 5k6t:A, 7stq:A, 7tzz:A, 7u1d:A, 7u1u:A, 7u25:A, 6u9h:A, 6u9h:B, 6u9h:H, 6u9h:I, 6u9h:L, 6u9h:M, 6u9h:P, 6u9h:Q, 6vz8:E, 6vz8:I, 6vz8:M, 6vz8:Q, 5wj1:A, 1ybh:A, 1yhy:A, 1yhz:A, 1yi0:A, 1yi1:A, 1z8n:A
16 8rph:D 608 556 0.2235 0.2155 0.2356 3.69e-40 8rph:A, 8rph:B, 8rph:C, 8rph:E, 8rpi:A, 8rpi:B, 8rpi:C, 8rpi:D, 8rpi:E, 8rpi:F, 8rpj:A, 8rpj:B, 8rpj:C, 8rpj:E, 8rpj:D, 8rpj:F
17 7egv:A 590 549 0.2440 0.2424 0.2605 8.87e-40 7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
18 6xn8:A 540 555 0.2560 0.2778 0.2703 1.11e-39 6xn8:B
19 7pt4:B 584 551 0.2406 0.2414 0.2559 1.82e-37 7pt1:A, 7pt1:B, 7pt2:A, 7pt2:B, 7pt3:A, 7pt3:B, 7pt4:A
20 6vz8:D 531 480 0.2150 0.2373 0.2625 1.69e-36 6vz8:H, 6vz8:L, 6vz8:P
21 4d5e:B 587 419 0.1962 0.1959 0.2745 5.53e-30 4d5e:A, 4d5g:A, 4d5g:B, 2pgn:A, 2pgn:B, 2pgo:A, 2pgo:B
22 2ihv:A 563 532 0.2321 0.2416 0.2556 1.60e-27 2iht:A, 2iht:B, 2iht:C, 2iht:D, 2ihu:A, 2ihu:B, 2ihu:C, 2ihu:D, 2ihv:B, 2ihv:C, 2ihv:D, 1upa:A, 1upa:B, 1upa:C, 1upa:D, 1upb:A, 1upb:B, 1upb:C, 1upb:D, 1upc:A, 1upc:B, 1upc:C, 1upc:D, 1upc:E, 1upc:F
23 2q28:A 550 477 0.2116 0.2255 0.2600 7.05e-27 2q27:A, 2q27:B, 2q28:B, 2q29:A, 2q29:B
24 4qq8:C 569 564 0.2253 0.2320 0.2340 1.19e-26 2ag0:A, 2ag0:B, 2ag0:C, 2ag0:D, 2ag1:A, 2ag1:B, 2ag1:C, 2ag1:D, 3d7k:A, 3d7k:B, 3iae:A, 3iae:B, 3iaf:A, 3iaf:B, 3iaf:C, 3iaf:D, 4qpz:A, 4qpz:B, 4qpz:C, 4qpz:D, 4qpz:E, 4qpz:F, 4qpz:G, 4qpz:H, 4qq8:A, 4qq8:B, 4qq8:D, 2uz1:A, 2uz1:B, 2uz1:C, 2uz1:D
25 5ahk:A 555 503 0.2133 0.2252 0.2485 2.84e-25 5ahk:B
26 6a50:A 527 546 0.2270 0.2524 0.2436 2.02e-24 6a50:B, 1bfd:A, 5dei:A, 5dei:C, 5dei:D, 5dei:B, 5dgd:A, 5dgt:A, 3f6b:X, 3f6e:X, 2fn3:A, 3fsj:X, 2fwn:A, 3fzn:A, 3fzn:B, 3fzn:D, 3fzn:C, 4gg1:A, 4gm0:A, 4gm1:A, 4gm4:A, 4gp9:A, 4gpe:A, 4jd5:A, 4ju8:A, 4ju9:A, 4jua:A, 4jub:A, 4jub:D, 4jub:B, 4jub:C, 4juc:A, 4juc:C, 4juc:B, 4juc:D, 4jud:X, 4juf:A, 4juf:C, 4juf:B, 4juf:D, 4k9k:A, 4k9l:A, 4k9m:A, 4k9n:A, 4k9n:C, 4k9n:B, 4k9n:D, 4k9o:A, 4k9o:C, 4k9o:B, 4k9o:D, 4k9p:A, 4k9p:C, 4k9p:B, 4k9p:D, 6m2y:A, 6m2z:A, 1mcz:A, 1mcz:B, 1mcz:C, 1mcz:D, 1mcz:E, 1mcz:F, 1mcz:G, 1mcz:H, 1mcz:I, 1mcz:J, 1mcz:K, 1mcz:L, 1mcz:M, 1mcz:N, 1mcz:O, 1mcz:P, 4mpj:A, 4mpp:A, 4mpr:A, 4mq5:A, 4mzx:A, 1pi3:A, 1po7:A, 1q6z:A, 4qel:A, 2v3w:A, 2v3w:C, 2v3w:B, 2v3w:D, 1yno:A
27 8rph:F 520 540 0.2048 0.2308 0.2222 7.53e-24
28 7b2e:A 548 548 0.2338 0.2500 0.2500 3.86e-22 7ayg:A, 7ayg:B, 7ayg:C, 7ayg:D, 7ayg:E, 7ayg:F, 7ayg:G, 7ayg:H, 7b2e:B, 7b2e:C, 7b2e:D, 7b2e:E, 7b2e:F, 7b2e:G, 7b2e:H
29 7orx:CCC 531 548 0.2253 0.2486 0.2409 8.37e-22 7orx:AAA, 7orx:BBB, 7orx:DDD
30 6qsi:A 525 541 0.2167 0.2419 0.2348 7.48e-20 6qsi:B
31 2ji6:A 559 562 0.2184 0.2290 0.2278 3.07e-18 2c31:A, 2c31:B, 2ji6:B, 2ji7:A, 2ji7:B, 2ji8:A, 2ji8:B, 2ji9:A, 2ji9:B, 2jib:A, 2jib:B
32 6u9d:R 416 342 0.1365 0.1923 0.2339 3.71e-18
33 2q5l:A 538 550 0.2099 0.2286 0.2236 2.92e-14 2nxw:A, 2nxw:B, 2q5j:A, 2q5j:B, 2q5l:B, 2q5o:A, 2q5o:B, 2q5q:A, 2q5q:B
34 1ovm:A 535 563 0.2270 0.2486 0.2362 1.92e-13 1ovm:B, 1ovm:C, 1ovm:D
35 2vbf:B 546 485 0.1638 0.1758 0.1979 1.18e-10 2vbf:A, 2vbg:A, 2vbg:B
36 4k9q:A 531 534 0.1911 0.2109 0.2097 1.89e-10 4k9q:B
37 5npu:A 547 438 0.1758 0.1883 0.2352 5.18e-10 5npu:B, 5npu:C, 5npu:D
38 2vjy:A 562 510 0.1826 0.1904 0.2098 1.16e-08 6efg:E, 6efh:A, 6efh:B, 2vjy:B, 2vjy:C, 2vjy:D, 2vk4:A, 2vk4:B, 2vk4:C, 2vk4:D
39 6efg:D 537 502 0.1809 0.1974 0.2112 1.69e-08 6efg:A, 6efg:B
40 4q9d:B 519 538 0.2031 0.2293 0.2212 2.20e-08 4q9d:A
41 2vk1:A 562 500 0.1894 0.1975 0.2220 3.87e-08 1pvd:A, 1pvd:B, 1pyd:A, 1pyd:B, 1qpb:A, 1qpb:B, 2vk1:B, 2vk1:C, 2vk1:D, 2vk8:A, 2vk8:B, 2vk8:C, 2vk8:D, 2w93:A, 2w93:B, 2w93:C, 2w93:D
42 4cok:B 549 182 0.0819 0.0874 0.2637 1.25e-07 4cok:A
43 8hp4:A 540 464 0.1604 0.1741 0.2026 5.89e-07 8hp4:B
44 6vgs:BBB 543 291 0.1058 0.1142 0.2131 9.42e-07 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
45 6vgs:BBB 543 135 0.0563 0.0608 0.2444 0.034 6vgs:AAA, 6vgs:CCC, 6vgs:DDD
46 5euj:E 556 236 0.0939 0.0989 0.2331 3.04e-06 5euj:A, 5euj:B, 5euj:C, 5euj:D, 5euj:F, 5euj:G, 5euj:H, 5euj:I, 5euj:J, 5euj:K, 5euj:L, 5euj:M, 5euj:N, 5euj:O, 5euj:P, 5euj:Q, 5euj:R, 5euj:S, 5euj:T, 5euj:U, 5euj:V, 5euj:W, 5euj:X
47 5tma:A 567 110 0.0546 0.0564 0.2909 3.50e-06 3oe1:A, 3oe1:B, 3oe1:C, 3oe1:D, 5tma:B, 2wva:A, 2wva:B, 2wva:E, 2wva:F, 2wva:V, 2wva:Z, 2wva:X, 2wva:Y, 2wvg:A, 2wvg:B, 2wvg:E, 2wvg:F, 1zpd:A, 1zpd:B, 1zpd:E, 1zpd:F, 4zp1:A, 4zp1:B, 4zp1:C, 4zp1:D
48 2vbi:A 554 181 0.0768 0.0812 0.2486 6.18e-05 2vbi:B, 2vbi:C, 2vbi:D, 2vbi:E, 2vbi:F, 2vbi:G, 2vbi:H
49 6sdx:A 347 97 0.0546 0.0922 0.3299 0.63 6rad:A
50 5ybi:B 345 87 0.0478 0.0812 0.3218 1.4 5ybh:A, 5ybh:B, 5ybi:A, 5zt1:B, 5zt1:A
51 4wa6:D 415 96 0.0427 0.0602 0.2604 1.5 4w4u:D
52 3cjt:A 254 78 0.0427 0.0984 0.3205 1.7 3cjq:A, 3cjq:D, 3cjq:G, 3cjr:A, 3cjt:C, 3cjt:E, 3cjt:G, 3cjt:I, 3cjt:K, 3cjt:M, 3cjt:O, 3egv:A, 2nxe:A, 2nxe:B, 2zbp:A, 2zbq:A, 2zbr:A
53 4gz8:A 557 61 0.0358 0.0377 0.3443 1.8 4gz8:B
54 4fyg:A 743 76 0.0358 0.0283 0.2763 3.8 4fye:A, 4fyf:A
55 3frk:A 365 72 0.0410 0.0658 0.3333 6.4 3frk:B
56 7xhl:G 485 80 0.0392 0.0474 0.2875 8.7 7xhl:A, 7xhl:B, 7xhl:E
57 4v5o:AC 229 33 0.0188 0.0480 0.3333 9.1 4bts:AC, 4bts:BC, 4bts:CC, 4bts:DC, 4v5o:BC
58 2pyb:A 151 37 0.0188 0.0728 0.2973 9.4 2pyb:B, 2pyb:C, 2pyb:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218