Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TLNGGITDMLTELANFEKNVSQAIHKYNAYRKAASVIAKYPHKIKSGAEAKKLPGVGTKIAEKIDEFLATGKLRKLEKIR
QDDTSSSINFLTRVSGIGPSAARKFVDEGIKTLEDLRKNEDKLNHHQRIGLKYFGDFEKRIPREEMLQMQDIVLNEVKKV
DSEYIATVCGSFRRGAESSGDMDVLLTHPSFTSESTKQPKLLHQVVEQLQKVHFITDTLSKGETKFMGVCQLPSKNDEKE
YPHRRIDIRLIPKDQYYCGVLYFTGSDIFNKNMRAHALEMGFTINEYTIRPLGVTGVAGEPLPVDSEKDIFDYIQWKYRE
PKDRSE

The query sequence (length=326) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4rq2:A 333 326 0.9969 0.9760 0.9969 0.0 6bel:A, 6bem:A, 5bol:A, 5bom:A, 1bpd:A, 1bpe:A, 1bpx:A, 1bpy:A, 1bpz:A, 2bpc:A, 2bpf:A, 2bpg:A, 2bpg:B, 5bpc:A, 6bte:A, 6btf:A, 3c2k:A, 3c2l:A, 3c2m:A, 6cly:A, 6cpq:A, 6cr3:A, 6cr4:A, 6cr5:A, 6cr6:A, 6cr7:A, 6cr8:A, 6cr9:A, 6crb:A, 6crc:A, 6crh:A, 6cti:A, 6ctj:A, 6ctk:A, 6ctl:A, 6ctm:A, 6ctn:A, 6cto:A, 6ctp:A, 6ctq:A, 6ctr:A, 6ctt:A, 6ctu:A, 6ctv:A, 6ctw:A, 6ctx:A, 6cu9:A, 6cua:A, 6cub:A, 5db6:A, 5db7:A, 5db8:A, 5db9:A, 5dba:A, 5dbb:A, 5dbc:A, 6dia:A, 6dic:A, 4do9:A, 4doa:A, 4dob:A, 4doc:A, 6e3r:A, 6e3v:A, 6e3w:A, 6e3x:A, 5eoz:A, 4f5n:A, 4f5o:A, 4f5p:A, 4f5q:A, 4f5r:A, 4f5r:B, 2fmp:A, 2fmq:A, 2fms:A, 6g2q:A, 3gdx:A, 4gxi:A, 4gxj:A, 4gxk:A, 5hhh:A, 5hhi:A, 1huo:A, 1huo:B, 1huz:A, 1huz:B, 2i9g:A, 7ice:A, 7icf:A, 7icg:A, 7ich:A, 7ici:A, 7icj:A, 7ick:A, 7icl:A, 7icm:A, 7icn:A, 7ico:A, 7icp:A, 7icq:A, 7icr:A, 7ics:A, 7ict:A, 7icu:A, 7icv:A, 8ica:A, 8icb:A, 8icc:A, 8ice:A, 8icf:A, 8icg:A, 8ich:A, 8ici:A, 8icj:A, 8ick:A, 8icl:A, 8icm:A, 8icn:A, 8ico:A, 8icp:A, 8icq:A, 8icr:A, 8ics:A, 8ict:A, 8icu:A, 8icv:A, 8icw:A, 8icx:A, 8icy:A, 8icz:A, 9ica:A, 9icb:A, 9icc:A, 9ice:A, 9icf:A, 9icg:A, 9ich:A, 9ici:A, 9icj:A, 9ick:A, 9icl:A, 9icm:A, 9icn:A, 9ico:A, 9icp:A, 9icq:A, 9icr:A, 9ics:A, 9ict:A, 9icu:A, 9icv:A, 9icw:A, 9icx:A, 9icy:A, 2iso:A, 2isp:A, 3isb:A, 3isc:A, 3isd:A, 5j0o:A, 5j0p:A, 5j0q:A, 5j0r:A, 5j0s:A, 5j0t:A, 5j0u:A, 5j0w:A, 5j0x:A, 5j0y:A, 5j29:A, 5j2a:A, 5j2b:A, 5j2c:A, 5j2d:A, 5j2e:A, 5j2f:A, 5j2g:A, 5j2h:A, 5j2i:A, 5j2j:A, 5j2k:A, 3jpn:A, 3jpo:A, 3jpp:A, 3jpq:A, 3jpr:A, 3jps:A, 3jpt:A, 4jwm:A, 4jwn:A, 7k96:A, 7k97:A, 4kld:A, 4kle:A, 4klf:A, 4klg:A, 4klh:A, 4kli:A, 4klj:A, 4kll:A, 4klm:A, 4klo:A, 4klq:A, 4kls:A, 4klt:A, 4klu:A, 3lk9:A, 4lvs:A, 4m2y:A, 4m47:A, 4m9g:A, 4m9h:A, 4m9j:A, 4m9l:A, 4m9n:A, 3mby:A, 4mf2:A, 4mf8:A, 4mfa:A, 4mfc:A, 4mff:A, 1mq2:A, 1mq3:A, 6mr7:A, 6mr8:A, 7mz0:A, 7mz1:A, 7mz2:A, 7mz3:A, 7mz4:A, 7mz8:A, 6n2r:A, 6n2s:A, 6n2t:A, 6nkr:A, 6nks:A, 6nkt:A, 6nku:A, 6nkv:A, 6nkw:A, 6nkx:A, 6nky:A, 6nkz:A, 4nlk:A, 4nln:A, 4nlz:A, 6nl0:A, 4nm1:A, 4nm2:A, 1nom:A, 4nxz:A, 4ny8:A, 4o5c:A, 4o5e:A, 4o5k:A, 4o9m:A, 3ogu:A, 4p2h:A, 2p66:A, 4pgq:A, 4pgx:A, 4pgy:A, 4ph5:A, 4pha:A, 4phd:A, 4phe:A, 4php:A, 6ph5:A, 6ph6:A, 6pkz:A, 4ppx:A, 2pxi:A, 4r63:A, 4r64:A, 4r65:A, 4r66:A, 7rbe:A, 7rbf:A, 7rbg:A, 7rbh:A, 7rbi:A, 7rbj:A, 7rbk:A, 7rbl:A, 7rbm:A, 7rbn:A, 7rbo:A, 3rh4:A, 3rh5:A, 3rh6:A, 3rje:A, 3rjf:A, 3rjg:A, 3rjh:A, 3rji:A, 3rjj:A, 3rjk:A, 4rpx:A, 4rpy:A, 4rpz:A, 4rq0:A, 4rq1:A, 4rq3:A, 4rq4:A, 4rq5:A, 4rq6:A, 4rq7:A, 4rq8:A, 4rt2:A, 4rt3:A, 7s9j:A, 7s9k:A, 7s9l:A, 7s9m:A, 7s9n:A, 7s9o:A, 7s9p:A, 7s9q:A, 5tb8:A, 5tb9:A, 5tba:A, 5tbb:A, 5tbc:A, 3tfr:A, 3tfs:A, 4tup:A, 4tuq:A, 4tur:A, 4tus:A, 1tv9:A, 1tva:A, 5tzv:A, 5u2r:A, 5u2s:A, 5u2t:A, 6u2o:A, 6u6b:A, 5u8g:A, 5u8h:A, 5u8i:A, 5u9h:A, 4uaw:A, 4uay:A, 4uaz:A, 4ub1:A, 4ub2:A, 4ub3:A, 4ub4:A, 4ub5:A, 4ubb:A, 4ubc:A, 5ugn:A, 5ugo:A, 5ugp:A, 6uok:F, 6uok:A, 6uol:A, 6uom:A, 3uxp:A, 3uxp:B, 5v1f:A, 5v1g:A, 5v1h:A, 5v1i:A, 5v1j:A, 5v1n:A, 5v1o:A, 5v1p:A, 5v1r:A, 3v72:A, 3v7j:A, 3v7k:A, 5vez:A, 8vf8:A, 8vf9:A, 8vfa:A, 8vfb:A, 8vfc:A, 8vfd:A, 8vfe:A, 8vff:A, 8vfg:A, 8vfh:A, 8vfi:A, 8vfj:A, 5vrw:A, 5vrx:A, 5vry:A, 5vrz:A, 5vs0:A, 5vs1:A, 5vs2:A, 5vs3:A, 5vs4:A, 6w2m:A, 5wnx:A, 5wny:A, 5wnz:A, 5wo0:A, 4ymm:A, 4ymn:A, 4ymo:A, 4yn4:A, 4z6c:A, 4z6d:A, 4z6e:A, 4z6f:A, 1zjm:A, 1zjn:A, 1zqa:A, 1zqb:A, 1zqc:A, 1zqd:A, 1zqe:A, 1zqf:A, 1zqg:A, 1zqh:A, 1zqi:A, 1zqj:A, 1zqk:A, 1zql:A, 1zqm:A, 1zqn:A, 1zqo:A, 1zqp:A, 1zqq:A, 1zqr:A, 1zqs:A, 1zqt:A, 1zqz:A
2 7m0d:B 340 335 0.3528 0.3382 0.3433 4.26e-59 2bcq:A, 2bcr:A, 2bcs:A, 2bcu:A, 2bcv:A, 3c5f:A, 3c5f:B, 3c5g:A, 3c5g:B, 5ca7:B, 5ca7:A, 5chg:A, 5chg:B, 5cj7:A, 5cj7:B, 5cp2:B, 5cr0:A, 5cr0:B, 5cwr:A, 5cwr:B, 5ddm:B, 5ddy:A, 5ddy:C, 5ddy:E, 5ddy:G, 5dkw:A, 5dkw:B, 4fo6:A, 2gws:A, 2gws:E, 2gws:I, 2gws:M, 3hw8:A, 3hwt:A, 3hx0:A, 3hx0:F, 3hx0:K, 3hx0:P, 5iii:A, 5iij:A, 5iik:A, 5iil:A, 5iim:A, 5iin:A, 5iio:A, 5iio:M, 5iio:E, 5iio:I, 4k4g:A, 4k4g:M, 4k4g:E, 4k4g:I, 4k4h:A, 4k4h:E, 4k4h:I, 4k4h:M, 4k4i:A, 4k4i:E, 4k4i:I, 4k4i:M, 7m07:A, 7m08:A, 7m09:A, 7m0a:A, 7m0b:A, 7m0c:A, 7m0d:A, 7m0e:A, 7m0e:B, 7m0e:C, 7m0e:D, 7m43:A, 7m44:A, 7m45:A, 7m46:A, 7m47:A, 7m48:A, 7m49:A, 7m4a:A, 7m4b:A, 7m4c:A, 7m4d:A, 7m4e:A, 7m4f:A, 7m4g:A, 7m4h:A, 7m4i:A, 7m4j:A, 7m4k:A, 7m4l:A, 3mda:A, 3mdc:A, 3mgh:A, 3mgh:C, 3mgi:A, 2pfn:A, 2pfo:A, 2pfp:A, 2pfq:A, 3pml:A, 3pml:B, 3pmn:A, 3pnc:A, 1rzt:A, 1rzt:M, 1rzt:E, 1rzt:I, 8u0o:A, 8u0p:A, 7un7:A, 3upq:A, 3uq0:A, 3uq2:A, 4x5v:A, 4xa5:A, 4xq8:B, 4xq8:A, 4xrh:B, 4xrh:A, 1xsl:A, 1xsl:E, 1xsl:I, 1xsl:M, 1xsn:A, 1xsp:A, 4xus:A
3 4p4o:A 306 273 0.2791 0.2974 0.3333 1.23e-36 4p4m:A, 4p4p:A
4 4yd1:A 334 331 0.2638 0.2575 0.2598 3.83e-32 6aec:A, 6aeh:A, 6ak5:A, 6ak6:A, 6ak8:A, 6ak9:A, 6akh:A, 7co6:A, 7co8:A, 7co9:A, 7coa:A, 7cob:A, 7coc:A, 7cod:A, 6ipd:A, 6ipe:A, 6ipf:A, 6ipg:A, 6iph:A, 6ipi:A, 6ipj:A, 6ipk:A, 6ipl:A, 6ipm:A, 6ipn:A, 7kss:A, 7kst:A, 7ksu:A, 7ksv:A, 7ksw:A, 7ksx:A, 7ksy:A, 7ksz:A, 7kt0:A, 7kt1:A, 7kt2:A, 7kt3:A, 7kt4:A, 7kt5:A, 7kt6:A, 7kt7:A, 7kt8:A, 7kt9:A, 7kta:A, 7ktb:A, 7ktc:A, 7ktd:A, 7kte:A, 7ktf:A, 7ktg:A, 7kth:A, 7kti:A, 7ktj:A, 7ktk:A, 7ktl:A, 7ktm:A, 7ktn:A, 4lzg:A, 4m04:A, 4m0a:A, 6p1m:A, 6p1n:A, 6p1o:A, 6p1p:A, 6p1q:A, 6p1r:A, 6p1s:A, 6p1t:A, 6p1u:A, 6p1v:A, 6p1w:A, 5twp:A, 5twq:A, 5twr:A, 5tws:A, 5txx:A, 5txz:A, 5tyb:A, 5tyc:A, 5tyd:A, 5tye:A, 5tyf:A, 5tyg:A, 5tyu:A, 5tyv:A, 5tyw:A, 5tyx:A, 5tyy:A, 5tyz:A, 6vez:A, 6vf0:A, 6vf1:A, 6vf2:A, 6vf3:A, 6vf4:A, 6vf5:A, 6vf6:A, 6vf7:A, 6vf8:A, 6vf9:A, 6vfa:A, 6vfb:A, 6vfc:A, 5vz7:A, 5vz8:A, 5vz9:A, 5vza:A, 5vzb:A, 5vzc:A, 5vzd:A, 5vze:A, 5vzf:A, 5vzg:A, 5vzh:A, 5vzi:A, 6wic:A, 6wid:A, 6wie:A, 4ycx:A, 4yd2:A, 5zlc:A
5 2ihm:B 336 329 0.2638 0.2560 0.2614 2.16e-31 2ihm:A
6 4i27:A 361 345 0.2607 0.2355 0.2464 4.48e-21 5d46:A, 5d49:A, 5d4b:A, 5d4b:B, 6go4:A, 6go5:A, 6go6:A, 4i28:A, 4i29:A, 4i2a:A, 4i2b:A, 4i2c:A, 4i2d:A, 4i2e:A, 4i2f:A, 4i2g:A, 4i2h:A, 4i2j:A, 4iqt:A, 4iqu:A, 4iqv:A, 4iqw:A, 1jms:A, 1kdh:A, 1kej:A, 4qz8:A, 4qz9:A, 4qza:A, 4qzb:A, 4qzc:A, 4qzd:A, 4qzg:A
7 6go7:A 338 325 0.2393 0.2308 0.2400 6.97e-21 6go5:B, 4i2i:A, 4qze:A, 4qzf:A, 4qzh:A, 4qzi:A
8 3au2:A 575 282 0.2454 0.1391 0.2837 4.33e-20 3au6:A, 3auo:A, 3auo:B, 3b0x:A, 3b0y:A
9 5hrf:A 178 169 0.1227 0.2247 0.2367 0.004 7cpw:A, 7cpw:B, 8e9a:A, 8e9a:B, 5hr9:A, 5hr9:B, 5hrb:A, 5hrd:A, 5hrd:B, 5hrd:C, 5hrd:D, 5hre:A, 5hrf:B, 5hrg:A, 5hrg:B, 5hrh:A, 5hrh:B, 5hri:A, 5hri:B, 5hrk:A, 5hrk:B, 5hrl:A, 5hrl:B, 8ild:A, 8ild:B, 8ile:B, 8ile:A, 8ilf:B, 8ilf:A, 8ilg:A, 8ilg:B, 8ilh:B, 8ilh:A, 8ilh:C, 8ilh:D, 8ili:A, 8ili:B, 8ili:C, 8ili:D, 2m2u:A, 2m2w:A, 5xm8:A, 5xm8:B, 5xm8:C, 5xm8:D, 5xm9:A, 5xm9:B, 5xm9:C, 5xm9:D, 5xma:A, 5xma:B
10 5foi:A 389 40 0.0460 0.0386 0.3750 0.21 5foi:B
11 6z7n:A 788 35 0.0399 0.0165 0.3714 0.82
12 6z7n:H 894 35 0.0399 0.0145 0.3714 0.84 6z7n:G, 6z7n:D, 6z7n:E, 6z7n:F
13 6z7n:K 840 35 0.0399 0.0155 0.3714 0.85
14 6yba:E 917 35 0.0399 0.0142 0.3714 0.85 6yba:F, 6yba:D, 6yba:A, 6yba:C, 6yba:G, 6yba:I, 6yba:B, 6z7n:I, 6z7n:J
15 6z7n:C 860 35 0.0399 0.0151 0.3714 0.87 6z7n:L
16 6z7n:B 847 35 0.0399 0.0153 0.3714 0.90
17 7bu5:A 84 39 0.0429 0.1667 0.3590 1.2
18 6b11:A 385 42 0.0491 0.0416 0.3810 2.4 6b11:B
19 2obe:A 915 37 0.0337 0.0120 0.2973 2.8 2obe:B, 2obe:C
20 8otz:EV 425 129 0.1043 0.0800 0.2636 4.8
21 7yll:A 329 28 0.0429 0.0426 0.5000 4.8
22 1ksf:X 714 150 0.1196 0.0546 0.2600 4.8 1mbu:A, 1mbu:B, 1mbx:A, 1mbx:B, 1r6b:X, 1r6o:A, 1r6o:B, 1r6q:A, 1r6q:B, 7uiv:B, 7uiv:C, 7uiv:D, 7uiv:E, 7uiv:A, 7uiv:F, 7uiw:A, 7uiw:B, 7uiw:C, 7uiw:D, 7uiw:E, 7uix:B, 7uix:C, 7uix:D, 7uix:E, 7uix:F, 7uix:A, 7uiy:B, 7uiy:C, 7uiy:D, 7uiy:E, 7uiy:A, 7uiy:F, 7uiz:B, 7uiz:C, 7uiz:D, 7uiz:E, 7uiz:A, 7uiz:F, 7uj0:B, 7uj0:C, 7uj0:D, 7uj0:E, 7uj0:A, 7uj0:F, 6uqe:A, 6uqe:B, 6uqe:C, 6uqe:D, 6uqe:E, 6uqe:F, 6uqo:C, 6uqo:D, 6uqo:A, 6uqo:B, 6uqo:E, 6uqo:F, 6w1z:A, 6w1z:B, 6w1z:C, 6w1z:D, 6w1z:E, 6w1z:F, 6w20:A, 6w20:B, 6w20:C, 6w20:D, 6w20:E, 6w20:F, 6w21:A, 6w21:B, 6w21:C, 6w21:D, 6w21:E, 6w21:F, 6w22:A, 6w22:B, 6w22:C, 6w22:D, 6w22:E, 6w22:F, 6w23:A, 6w23:B, 6w23:C, 6w23:D, 6w23:E, 6w23:F, 6w24:A, 6w24:B, 6w24:C, 6w24:D, 6w24:E, 6w24:F
23 7an1:AAA 483 90 0.0675 0.0455 0.2444 5.5 7oqd:AAA
24 7rd1:J 942 37 0.0337 0.0117 0.2973 6.3 7rd1:L, 7rd1:A, 7rd1:C, 7rd1:D, 7rd1:F, 7rd1:B, 7rd1:E, 7rd1:G, 7rd1:H, 7rd1:K, 7rd1:I
25 5zz7:A 206 70 0.0613 0.0971 0.2857 7.0 7wb3:A, 7wb3:B, 5zz6:A, 5zz6:B, 5zz6:C, 5zz6:D, 5zz7:B
26 5xe0:A 457 93 0.0951 0.0678 0.3333 7.1 5zit:A
27 7oa5:B 186 57 0.0583 0.1022 0.3333 7.6 7oa5:A, 7oa5:E, 7oa5:H, 7oa5:C, 7oa5:G, 7oa5:D, 7oa5:F
28 6a9t:A 417 54 0.0552 0.0432 0.3333 7.8 6a9u:A, 6a9v:A
29 8ps2:G 2036 50 0.0552 0.0088 0.3600 9.4 3hmj:G, 3hmj:H, 3hmj:I, 8prv:G, 8prw:G, 8prw:J, 8prw:I, 8prw:H, 8prw:K, 8prw:L, 8ps1:G, 8ps9:G, 8psa:G, 8psf:G, 8psg:G, 8psj:G, 8psk:G, 8psl:G, 8psm:G, 8psp:G, 6ql5:I, 6ql5:G, 6ql5:H, 6ql5:L, 6ql5:J, 6ql5:K, 6ql6:G, 6ql6:H, 6ql6:I, 6ql6:J, 6ql6:K, 6ql6:L, 6ql9:G, 6ql9:H, 6ql9:I, 6ql9:J, 6ql9:K, 6ql9:L, 6ta1:G, 6ta1:C, 6ta1:E, 6ta1:L, 6ta1:H, 6ta1:J, 6u5t:G, 6u5u:G, 2uv8:G, 2uv8:H, 2uv8:I, 2vkz:G, 2vkz:H, 2vkz:I
30 4nbu:B 244 118 0.0890 0.1189 0.2458 9.4 4nbu:A, 4nbu:C, 4nbu:D
31 6gsd:A 364 36 0.0429 0.0385 0.3889 9.4 5mlh:A, 5mlm:A, 5mlr:A
32 7bge:m 72 34 0.0491 0.2222 0.4706 9.7 7kwg:m

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218