BioLiP

>protein
TLMFKRFFGAVRTSWRDPSTRGAVLSLAIIVTAATIFYTLAEKWSVIDSLFYAVSVGLPMGNGPLSPTLTLSKIFTLVYA
ILVVGLFVTVGGSLASAIVQNN

The query sequence (length=102) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5cbf:A	102	102	1.0000	1.0000	1.0000	1.32e-68	5cbf:B, 5cbf:D, 5cbg:A, 5cbg:D, 5cbg:F, 5cbh:A, 5cbh:B, 5cbh:D, 5cbh:E
2	2q67:A	104	85	0.2549	0.2500	0.3059	4.68e-08	2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
3	8ctn:B	96	54	0.1961	0.2083	0.3704	3.08e-05	8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
4	6v3c:B	260	45	0.1667	0.0654	0.3778	0.019	6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
5	6cq6:B	282	45	0.1667	0.0603	0.3778	0.020	6cq6:A, 6cq8:A, 6cq8:B, 6cq9:A, 6cq9:B, 4twk:A, 8ue2:A, 8ue2:B, 8ue9:A, 8ue9:B, 8uec:A, 8uec:B, 8uf6:A, 8uf6:B, 6v36:B, 6v37:A, 6v37:B, 6v3i:B, 6w7b:B, 6w7c:A, 6w7c:B, 6w7d:B, 6w7e:B, 6w82:A, 6w82:B, 6w83:A, 6w83:B, 6w84:A, 6w84:B, 6w85:A, 6w85:B, 6w86:A, 6w86:B, 6w87:A, 6w87:B, 6w88:A, 6w88:B, 6w8a:A, 6w8a:B, 6w8c:A, 6w8c:B, 6w8f:A, 6w8f:B
6	4twk:B	241	45	0.1667	0.0705	0.3778	0.028
7	6rv2:D	261	56	0.1569	0.0613	0.2857	0.059	6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
8	8de8:B	276	78	0.2157	0.0797	0.2821	0.062	8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
9	6oly:C	318	68	0.2059	0.0660	0.3088	0.066	2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
10	8qz3:B	266	47	0.1471	0.0564	0.3191	0.081	4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
11	8qz1:A	242	45	0.1471	0.0620	0.3333	0.11	4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
12	8k1j:B	242	56	0.1471	0.0620	0.2679	0.54	8k1j:A, 8k1q:A, 8k1q:B, 8k1v:A, 8k1v:B, 8k1z:A, 8k1z:B
13	7yid:A	660	56	0.1471	0.0227	0.2679	1.1	7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
14	2zyt:X	291	51	0.1569	0.0550	0.3137	1.3	2zpt:X, 2zvp:X, 2zvq:X, 2zyu:X, 2zyv:X, 2zyw:X
15	6rxx:UV	1061	45	0.1275	0.0123	0.2889	8.1
16	7pub:CE	426	46	0.1275	0.0305	0.2826	8.7	7aor:a, 6hiv:CE, 6hiw:CE, 6hiy:CE, 7pua:CE, 6sga:CE, 6sgb:CE
17	7ane:a	408	46	0.1275	0.0319	0.2826	9.4

[Back]