Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TLKWSKMNLTYRIVNYTPDMTHSEVEKAFKKAFKVWSDVTPLNFTRLHDGIADIMISFGIKEHGDFYPFDGPSGLLAHAF
PPGPNYGGDAHFDDDETWTSSSKGYNLFLVAAHEFGHSLGLDHSKDPGALMFPIYTYTGKSHFMLPDDDVQGIQSLYGPG

The query sequence (length=160) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4fu4:A 368 160 0.9938 0.4321 0.9938 3.10e-114 830c:A, 830c:B, 456c:A, 456c:B, 4a7b:A, 4a7b:B, 5b5o:A, 5b5o:B, 5b5p:A, 5b5p:B, 5bot:A, 5bot:B, 5boy:A, 5boy:B, 5bpa:A, 5bpa:B, 1cxv:A, 1cxv:B, 2d1n:A, 2d1n:B, 2e2d:A, 3elm:A, 3elm:B, 1eub:A, 1fls:A, 1fm1:A, 4fu4:B, 4fvl:A, 4fvl:B, 4g0d:A, 4g0d:B, 4g0d:C, 4g0d:D, 6hv2:A, 3i7g:A, 3i7g:B, 3i7i:A, 3i7i:B, 4jp4:A, 4jp4:B, 4jpa:A, 4jpa:B, 7ju8:A, 7ju8:B, 3kec:A, 3kec:B, 3kej:A, 3kej:B, 3kek:A, 3kek:B, 3kry:A, 3kry:B, 3kry:C, 3kry:D, 4l19:A, 4l19:B, 3ljz:A, 3ljz:B, 3ljz:C, 3ljz:D, 3o2x:A, 3o2x:B, 3o2x:C, 3o2x:D, 2ow9:A, 2ow9:B, 2ozr:A, 2ozr:B, 2ozr:C, 2ozr:D, 2ozr:E, 2ozr:F, 2ozr:G, 2ozr:H, 1pex:A, 2pjt:A, 2pjt:B, 2pjt:C, 2pjt:D, 3tvc:A, 5uwk:A, 5uwk:B, 5uwl:A, 5uwl:B, 5uwm:A, 5uwm:B, 5uwn:A, 5uwn:B, 5uwn:C, 5uwn:D, 5uwn:E, 3wv1:A, 3wv1:B, 3wv2:A, 3wv2:B, 3wv3:A, 3wv3:B, 1xuc:A, 1xuc:B, 1xud:A, 1xud:B, 1xur:A, 1xur:B, 2yig:A, 2yig:B, 1you:A, 1you:B, 1ztq:A, 1ztq:B, 1ztq:C, 1ztq:D, 3zxh:A, 3zxh:B
2 1bzs:A 165 156 0.6062 0.5879 0.6218 2.72e-71 1a85:A, 1a86:A, 3dng:A, 3dng:B, 3dpe:A, 3dpf:A, 3dpf:B, 5h8x:A, 1i73:A, 1i76:A, 1jan:A, 1jao:A, 1jap:A, 1jaq:A, 1jh1:A, 1jj9:A, 1kbc:A, 1kbc:B, 1mmb:A, 1mnc:A, 2oy2:A, 2oy2:F, 2oy4:A, 2oy4:F, 4qkz:A, 3tt4:A, 1zp5:A, 1zs0:A, 1zvx:A
3 1slm:A 226 158 0.6312 0.4469 0.6392 3.27e-71 1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
4 8h78:A 168 157 0.6375 0.6071 0.6497 4.90e-70 3ayu:A, 8h78:B, 1hov:A, 1qib:A, 7xgj:A, 7xgj:B, 7xgj:C, 7xjo:A, 7xjo:B
5 1q3a:B 160 157 0.6250 0.6250 0.6369 7.49e-69 4ilw:D, 4ilw:F, 1q3a:A, 1q3a:C, 3v96:B
6 2jsd:A 160 157 0.5938 0.5938 0.6051 1.55e-66
7 1fbl:A 367 157 0.5813 0.2534 0.5924 5.74e-63
8 8k5v:B 232 158 0.5875 0.4052 0.5949 1.11e-60 5cuh:A, 5cuh:B, 6esm:A, 1gkc:A, 1gkc:B, 1gkd:A, 1gkd:B, 4h1q:A, 4h1q:B, 4h2e:A, 4h2e:B, 4h3x:A, 4h3x:B, 4h82:A, 4h82:B, 4h82:C, 4h82:D, 4hma:A, 4hma:B, 5i12:A, 4jij:A, 4jij:B, 4jqg:A, 4jqg:B, 8k5v:A, 8k5w:A, 8k5w:B, 8k5x:A, 8k5x:B, 8k5y:A, 8k5y:B, 2ovx:A, 2ovx:B, 2ovz:A, 2ovz:B, 2ow0:A, 2ow0:B, 2ow1:A, 2ow1:B, 2ow2:A, 2ow2:B, 5th6:A, 5th6:B, 5th6:C, 5th6:D, 5th9:A, 5th9:B, 5th9:C, 5ue3:A, 5ue3:B, 5ue4:A, 5ue4:B, 4wzv:A, 4wzv:B, 4xct:A
9 3ba0:A 365 155 0.5687 0.2493 0.5871 1.25e-60 8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
10 1su3:B 416 156 0.5750 0.2212 0.5897 2.24e-60 966c:A, 4auo:A, 4auo:B, 1ayk:A, 2ayk:A, 3ayk:A, 4ayk:A, 1cge:A, 1cgf:A, 1cgf:B, 1cgl:A, 1cgl:B, 2clt:A, 2clt:B, 1hfc:A, 2j0t:A, 2j0t:B, 2j0t:C, 3shi:A, 3shi:G, 3shi:M, 1su3:A, 2tcl:A
11 1bqq:M 174 168 0.5188 0.4770 0.4940 3.88e-52 1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
12 2mze:A 250 157 0.5062 0.3240 0.5159 1.38e-51 2ddy:A, 8jud:A, 8juf:A, 8jug:A, 8k4z:A, 1mmp:A, 1mmp:B, 1mmq:A, 1mmr:A, 2mzh:A, 2mzi:A, 5ue2:A, 5ue5:A, 7wxx:A, 2y6c:A, 2y6d:A
13 1rm8:A 169 167 0.5312 0.5030 0.5090 3.02e-51
14 1hv5:E 165 157 0.5000 0.4848 0.5096 1.24e-49 1hv5:A, 1hv5:B, 1hv5:C, 1hv5:D, 1hv5:F
15 1gxd:A 624 97 0.4062 0.1042 0.6701 7.98e-40 1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
16 1gxd:A 624 70 0.2687 0.0689 0.6143 2.54e-21 1ck7:A, 1eak:A, 1eak:B, 1eak:D, 1eak:C, 1gen:A, 1gxd:B, 1rtg:A
17 4r3v:A 179 160 0.4437 0.3966 0.4437 1.93e-39 8b2q:A, 4in9:A, 4r3v:B, 2xs3:A, 2xs3:B, 2xs4:A
18 1l6j:A 405 147 0.4500 0.1778 0.4898 3.51e-37
19 1l6j:A 405 70 0.2437 0.0963 0.5571 1.48e-15
20 3hda:P 382 144 0.2812 0.1178 0.3125 0.003 3hbv:P
21 7pol:B 336 27 0.0938 0.0446 0.5556 0.009 8wen:C, 8wen:A
22 6qig:A 581 36 0.0875 0.0241 0.3889 0.012 3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
23 5gwd:A 239 99 0.1625 0.1088 0.2626 0.035 5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
24 1af0:A 470 120 0.2125 0.0723 0.2833 0.045 5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
25 1go7:P 462 172 0.3000 0.1039 0.2791 0.068 1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
26 2ero:A 426 26 0.0938 0.0352 0.5769 0.13 2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
27 3lmc:A 191 21 0.0688 0.0576 0.5238 0.37
28 8h3x:C 357 27 0.0750 0.0336 0.4444 0.41 8h3y:A, 8h3y:B, 8h3y:C, 3p24:A, 3p24:B, 3p24:C, 3p24:D, 7pnd:A, 7pnd:B, 7pol:A, 7poo:A, 7poo:B, 7poq:A, 7poq:B, 7pou:A, 7pou:B, 8wem:C, 8wem:A, 8weo:B, 8weo:A
29 6d3j:A 247 157 0.2250 0.1457 0.2293 0.44
30 6ixx:A 463 107 0.2000 0.0691 0.2991 0.66 1g9k:A, 1h71:P, 1o0q:A, 1o0t:A, 1om6:A, 1om7:A, 1om8:A, 1omj:A, 3u1r:A
31 4jz6:A 484 31 0.0875 0.0289 0.4516 0.68
32 4on1:A 334 38 0.1062 0.0509 0.4474 1.1 4on1:B
33 4axq:A 163 48 0.1000 0.0982 0.3333 1.5 4a3w:A, 3zvs:A, 3zvs:B, 3zvs:C
34 3k7l:A 409 25 0.0625 0.0244 0.4000 1.6
35 1wni:A 198 21 0.0688 0.0556 0.5238 2.5
36 1of6:A 350 57 0.1062 0.0486 0.2982 3.1 1hfb:A, 1hfb:B, 1hfb:C, 1hfb:D, 1hfb:E, 1hfb:F, 1hfb:G, 1hfb:H, 1oab:A, 1oab:B, 1of6:B, 1of6:C, 1of6:D, 1of6:E, 1of6:F, 1of6:G, 1of6:H, 1of8:A, 1of8:B, 1ofa:B, 1ofa:A, 1ofb:A, 1ofb:B, 1ofo:A, 1ofo:B, 1ofq:A, 1ofq:B, 1ofq:C, 1ofq:D, 1ofr:A, 1ofr:H, 1ofr:C, 1ofr:D, 1ofr:E, 1ofr:F, 1ofr:G, 1ofr:B, 1og0:A, 1og0:B, 1og0:C, 1og0:D, 1og0:E, 1og0:F, 1og0:G, 1og0:H
37 1kuf:A 201 23 0.0625 0.0498 0.4348 3.2 1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
38 9clp:A 420 23 0.0688 0.0262 0.4783 3.2
39 6v85:A 1901 120 0.1437 0.0121 0.1917 3.3 6v86:A
40 4j4m:B 200 27 0.0750 0.0600 0.4444 4.5 4j4m:A
41 4q1l:A 202 23 0.0625 0.0495 0.4348 5.7
42 4dd8:D 208 15 0.0563 0.0433 0.6000 6.7 4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
43 8snl:A 656 38 0.0938 0.0229 0.3947 6.7 2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
44 1r54:A 206 15 0.0688 0.0534 0.7333 6.9 1r55:A
45 3zzm:A 520 54 0.1125 0.0346 0.3333 7.7 4a1o:A, 4a1o:B
46 1nd1:A 202 15 0.0563 0.0446 0.6000 8.8 2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
47 6c01:A 819 164 0.2562 0.0501 0.2500 8.9 6c01:B, 6c02:A, 6c02:B
48 5n5s:B 481 60 0.0875 0.0291 0.2333 9.7 5n5s:A, 5n5s:C, 5n5s:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218