BioLiP

>protein
TLKVIGVGGGGNNAVNRMIDHGMNNVEFIAINTDGQALNLSKAESKIQIGEKLTRGLGAGANPEIGKKAAEESREQIEDA
IQGADMVFVTSGMGGGTGTGAAPVVAKIAKEMGALTVGVVTRPFSAEGRKRQTQAAAGVEAMKAAVDTLIVIPNDRLLDI
VDKSTPMMEAFKEADNVLRQGVQGISDLIAVNLDFADVKTIMSNQGSALMGIGVSSGENRAVEAAKKAISSPLLETSIVG
AQGVLMNITGGESLSLFEAQEAADIVQDAADEDVNMIFGTVINPELQDEIVVTVIATGF

The query sequence (length=299) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4m8i:A	311	303	0.9866	0.9486	0.9736	0.0	4dxd:A, 5h5g:A, 5h5g:B, 5h5h:A, 5h5i:A, 8htb:A, 6kvp:A, 6kvq:A, 5mn4:A, 5mn5:A, 5mn5:B, 5mn6:A, 5mn6:B, 5mn7:A, 5mn7:B, 5mn8:B, 5mn8:A, 7ohh:A, 7ohk:A, 7ohl:A, 7ohn:A, 7oi2:A, 7oja:A, 7ojb:A, 7ojc:A, 7ojd:A, 7ojz:A, 7on2:A, 7on3:A, 7on4:A, 6rvm:A, 6rvm:B, 6rvm:C, 6rvn:A, 6rvp:A, 6rvq:A, 6si9:A, 3vo8:A, 3vo8:B, 3voa:A, 3vob:A, 3wgj:A, 3wgj:B, 3wgk:A, 3wgk:B, 3wgl:A, 3wgl:B, 3wgm:A, 3wgm:B, 3wgn:A, 3wgn:B, 5xdt:A, 5xdu:A, 5xdv:A, 5xdw:A, 6yd1:A, 6yd5:A, 6yd6:A
2	2rhl:B	315	292	0.7793	0.7397	0.7979	5.35e-152	2rhl:A, 2rho:A, 2rho:B, 4u39:B, 4u39:E, 4u39:F, 4u39:G
3	4u39:D	280	287	0.7291	0.7786	0.7596	4.50e-132	4u39:H, 4u39:I
4	7yop:B	304	303	0.5987	0.5888	0.5908	6.14e-117	8grw:A, 8grw:B, 7yop:A, 7ysz:A, 7ysz:B
5	5zue:A	309	291	0.6054	0.5858	0.6220	3.36e-114	4kwe:A, 4kwe:B, 4kwe:C, 2q1y:A, 1rlu:A, 1rq7:A, 5v68:B, 5v68:E, 6y1u:A, 6y1u:B, 6y1v:A, 6y1v:B, 6ym1:A, 6ym9:A
6	2vaw:A	315	292	0.5184	0.4921	0.5308	4.49e-91	1ofu:A, 1ofu:B
7	1w5f:A	315	305	0.5050	0.4794	0.4951	2.08e-87	1w5f:B
8	8h1o:A	314	291	0.4983	0.4745	0.5120	1.15e-86	8gzv:A, 8gzw:A, 8gzw:C, 8gzw:E, 8gzx:A, 8gzy:A, 8gzy:C, 8gzy:E, 8ibn:A, 8ibn:B, 8ibn:C, 8ibn:D, 6ll5:A, 6ll6:A, 6umk:A, 6unx:A
9	1w58:1	337	301	0.4983	0.4421	0.4950	8.46e-79	1fsz:A, 2vap:A, 1w5a:A, 1w5a:B, 1w5b:A, 1w5b:B, 1w5e:A, 1w5e:B, 1w5e:C, 1w5e:D, 1w5e:E, 1w5e:F, 1w5e:G, 1w5e:H, 1w5e:I
10	2r6r:1	323	293	0.4348	0.4025	0.4437	9.81e-72	2r75:1
11	3zid:A	360	257	0.2308	0.1917	0.2685	6.21e-10	3zid:B
12	4b46:A	330	169	0.1806	0.1636	0.3195	1.10e-04
13	4b45:A	334	169	0.1538	0.1377	0.2722	0.030
14	4xcq:A	303	110	0.1070	0.1056	0.2909	0.043
15	5ycd:B	193	83	0.0836	0.1295	0.3012	0.14	5x6k:A, 5x6k:B, 5x6l:A, 5x6l:B, 5xru:A, 5xru:B, 5xz2:A, 5xz2:B, 5ycb:A, 5ycb:B, 5ycc:A, 5ycc:B, 5ycd:A, 5ycf:B, 5ycf:A
16	5ysc:A	255	20	0.0334	0.0392	0.5000	1.8
17	6kbn:C	504	75	0.0769	0.0456	0.3067	2.2	6kbm:A, 6kbn:A
18	4rnh:A	423	93	0.0903	0.0638	0.2903	3.4
19	5l22:B	540	53	0.0635	0.0352	0.3585	5.3	5l22:A
20	8x2h:A	2363	113	0.1003	0.0127	0.2655	5.9	8jb5:A, 2vkd:A, 2vkd:B, 2vkd:C, 2vkh:A, 2vkh:B, 2vkh:C, 2vl8:A, 2vl8:B, 2vl8:C
21	3jz4:A	481	55	0.0736	0.0457	0.4000	6.7	3jz4:B, 3jz4:C, 3jz4:D

[Back]