BioLiP

>protein
TLDVAAQCFLNSLVRETKDWRLTEYQPTQLIIPLGEQQALHFRVAYFSPTQHHRFEFPARLVTASGSHPVDFATLSRLIV
DKLQHQLLLPATSCETFHQRVMESHAHTQQAIDARHDWAALREKALNFGEAEQALLVGHAFHPAPKSHEPFNQQEAERYL
PDFAPHFPLRWFAVNKTQIAGESLHLNLQQRLTRFAAENAPQLLNELSDNQWLFPLHPWQGEYLLQQEWCQELVAKGLIK
DLGEAGAPWLPTTSSRSLYCATSRDMIKFSLSVRLTNSVRTLSVKEVKRGMRLARLAQTDDWQTLQARFPTFRVMQEDGW
AGLRDLHGNIMQESLFALRENLLVDQPQSQTNVLVSLTQAAPDGGDSLLVAAVKRLSDRLGITAQQAAHAWVDAYCHQVL
KPLFTAEADYGLVLLAHQQNILVQMLGDLPVGLIYRDCQGSAFMPHAAGWLDTIGEAQAENVFTREQLLRYFPYYLLVNS
TFAVTAALGAAGLDSEANLMARVRTLLAEMRDQVTHKTCLNYVLENPYWNVKGNFFCYLNDYFDFANPLL

The query sequence (length=550) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5jm8:A	556	554	1.0000	0.9892	0.9928	0.0	5jm8:B, 5jm8:C, 5jm8:D, 5jm8:E, 5jm8:F, 5jm8:G, 5jm8:H
2	2x3j:A	586	404	0.1909	0.1792	0.2599	4.92e-14	2w02:A, 2w02:B, 2w03:A, 2w03:B, 2w04:B, 2x3j:B, 2x3k:A, 2x3k:B
3	3to3:B	595	322	0.1309	0.1210	0.2236	1.51e-10
4	7cbb:A	576	175	0.0891	0.0851	0.2800	3.06e-08	7cbb:B
5	2x0q:A	582	419	0.1691	0.1598	0.2220	9.82e-06	2x0p:A
6	7tgn:B	576	335	0.1455	0.1389	0.2388	7.26e-04	7tgn:A, 7tgn:C, 7tgn:D
7	6p63:C	595	338	0.1382	0.1277	0.2249	0.001	6p63:A, 6p63:B, 6p63:D, 6xrc:A, 6xrc:B
8	7tgk:D	593	335	0.1327	0.1231	0.2179	0.002	7tgk:B, 7tgk:E, 7tgk:A, 7tgk:C, 7tgl:A, 7tgl:B, 7tgl:C, 7tgl:D, 7tgl:E, 7tgm:A, 7tgm:B, 7tgm:C, 7tgm:E, 7tgm:D
9	2zjs:Y	415	55	0.0364	0.0482	0.3636	0.023
10	8xi9:A	201	48	0.0309	0.0846	0.3542	1.1	1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
11	1e5e:A	394	94	0.0436	0.0609	0.2553	1.3	1e5e:B, 1e5f:A, 1e5f:B
12	8rch:A	2036	48	0.0309	0.0083	0.3542	1.5	8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
13	6bcu:A	2204	48	0.0309	0.0077	0.3542	1.7	6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
14	6zwm:B	2185	48	0.0309	0.0078	0.3542	1.8	6zwm:A
15	6qcl:A	215	45	0.0309	0.0791	0.3778	2.7
16	7moa:D	638	120	0.0527	0.0455	0.2417	2.9	1bht:A, 1bht:B, 5cp9:B, 5cs3:B, 5cs5:B, 5ct3:B, 1gmn:B, 1gmn:A, 1gmo:B, 1gmo:H, 1gmo:F, 1gmo:C, 1gmo:G, 1gmo:A, 1gmo:D, 1gmo:E, 6lz9:B, 3mkp:C, 3mkp:A, 7mo7:A, 7mo8:A, 7mo9:A, 7moa:A, 4o3t:A, 4o3u:A
17	8wb4:C	451	74	0.0345	0.0421	0.2568	3.3	8wb4:c, 8xlp:c, 8xlp:C, 8xr6:c, 8xr6:C
18	4xnh:A	786	43	0.0255	0.0178	0.3256	3.5	4hnw:A, 6o07:A, 4xpd:A, 4y49:G
19	8pn9:G	411	72	0.0382	0.0511	0.2917	4.7	6s7o:G, 6s7t:G
20	6xig:B	383	128	0.0636	0.0914	0.2734	6.1	6xi9:A, 6xi9:B, 6xig:A
21	6a06:A	188	66	0.0364	0.1064	0.3030	6.7	6a03:A, 6a03:B, 6a04:A, 6a04:B, 6a05:A, 6a05:B, 6a06:B, 6iyf:A, 6iyf:B
22	5v9x:A	772	81	0.0400	0.0285	0.2716	9.7

[Back]