Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TLDKTDIKILQVLQENGRLTNVELSERVALSPSPCLRRLKQLEDAGIVRQYAALLSPESVNLGLQAFIRVSIRKAKDARE
DFAASVRKWPEVLSCFALTGETDYLLQAFFTDMNAFSHFVLDTLLSHHGVQDAQSSFVLKEIKHTTSLPLNHLL

The query sequence (length=154) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2p5v:G 158 154 1.0000 0.9747 1.0000 1.79e-112 2p5v:A, 2p5v:B, 2p5v:C, 2p5v:E, 2p5v:D, 2p5v:F, 2p5v:H, 2p6s:A, 2p6s:G, 2p6s:B, 2p6s:D, 2p6s:C, 2p6s:F, 2p6s:E, 2p6s:H, 2p6t:A, 2p6t:G, 2p6t:B, 2p6t:D, 2p6t:C, 2p6t:F, 2p6t:E, 2p6t:H
2 2cyy:A 151 149 0.2857 0.2914 0.2953 1.70e-22 2e1c:A, 2zny:A, 2zny:C, 2zny:E, 2zny:B, 2zny:D, 2zny:F, 2zny:H, 2zny:G, 2znz:A, 2znz:B, 2znz:C, 2znz:D, 2znz:E, 2znz:F, 2znz:G, 2znz:H
3 7fby:A 153 138 0.2792 0.2810 0.3116 1.48e-17
4 2e7w:A 150 147 0.2273 0.2333 0.2381 2.13e-15 2e7x:A, 2efp:A, 2efq:A, 2pmh:A, 2pn6:A, 2yx4:A, 2yx7:A
5 2vbw:A 147 105 0.2338 0.2449 0.3429 4.83e-12 2vbx:A, 2vby:A, 2vbz:A, 2vc0:A, 2vc1:A, 2w24:A
6 2cg4:A 149 139 0.2078 0.2148 0.2302 9.51e-10 2cg4:B
7 6yxx:E8 154 73 0.1494 0.1494 0.3151 0.13
8 8q6x:A 389 56 0.1299 0.0514 0.3571 0.21 8q6x:B, 8q6y:A, 8q6y:B
9 8c7u:D 262 52 0.1039 0.0611 0.3077 0.41 8c7u:A, 8c7u:B, 8c7u:C
10 3dwg:A 325 31 0.0779 0.0369 0.3871 1.7 3dwg:B, 3dwi:A, 3dwi:B, 5i6d:B, 5i6d:C, 5i6d:D, 5i7a:B, 5i7a:C, 5i7a:D, 5i7h:B, 5i7h:C, 5i7h:D, 5i7o:B, 5i7o:C, 5i7o:D, 5i7r:B, 5i7r:A, 5iw8:A, 5iw8:B
11 2djw:B 80 66 0.0909 0.1750 0.2121 1.7 2djw:E, 2djw:G, 2djw:J
12 5iwc:A 297 31 0.0779 0.0404 0.3871 1.7 5i6d:A, 5i7a:A, 5i7h:A, 5i7o:A, 5iwc:B
13 1cg0:A 431 45 0.1104 0.0394 0.3778 1.9 1cg1:A, 1cg3:A, 1cg4:A, 1ch8:A, 1cib:A, 2gcq:A, 1gim:A, 1gin:A, 1hon:A, 1hoo:A, 1juy:A, 1kjx:A, 1kkb:A, 1kkf:A, 1ksz:A, 1nht:A, 1qf4:A, 1qf5:A, 1son:A, 1soo:A
14 8c7s:A 256 65 0.1299 0.0781 0.3077 2.9 8c7s:B, 5ey0:B, 5ey0:A, 5ey1:A, 5ey1:B
15 4un1:B 159 150 0.2013 0.1950 0.2067 2.9 4un1:D
16 6e4q:A 505 36 0.0714 0.0218 0.3056 4.1 6e4q:B, 6e4q:C, 6e4q:D
17 3hf2:A 428 44 0.0974 0.0350 0.3409 5.0 3dgi:B, 3hf2:B, 3psx:A, 3psx:B, 7y9m:B
18 5yhx:N 146 30 0.0519 0.0548 0.2667 5.1 5yhx:A, 5yhx:B, 5yhx:G, 5yhx:H, 5yhx:M, 5yhx:S, 5yhx:T, 5yhy:A, 5yhz:A, 5yi0:B, 5yi0:A, 5yi0:C, 5yi0:D, 5yi2:A, 5yi2:B, 5yi2:E, 5yi2:F, 5yi2:I, 5yi2:J, 5yi2:M, 5yi2:N, 5yi3:A, 5yi3:B, 5yi3:E, 5yi3:F, 5yi3:I, 5yi3:J, 5yi3:M, 5yi3:N
19 8q6z:A 390 46 0.1104 0.0436 0.3696 5.3
20 7x3j:D 469 54 0.1299 0.0426 0.3704 6.3
21 7x0s:I 521 54 0.1299 0.0384 0.3704 6.8 8i1u:D, 8i1u:L, 8i9u:D, 8i9u:L, 7nvl:D, 7nvl:d, 7nvm:D, 7nvm:d, 7nvn:D, 7nvn:d, 8sff:D, 8sff:d, 8sg8:D, 8sg8:d, 8sg9:D, 8sg9:d, 8sgc:D, 8sgc:d, 8sgl:D, 8sgl:d, 8sgq:D, 8sgq:d, 8sh9:D, 8sh9:d, 8sha:D, 8sha:d, 8shd:D, 8shd:d, 8she:D, 8she:d, 8shf:D, 8shf:d, 8shg:D, 8shg:d, 8shl:D, 8shl:d, 8shn:D, 8shn:d, 8sho:D, 8sho:d, 8shp:D, 8shp:d, 8shq:D, 8shq:d, 8sht:D, 8sht:d, 7trg:F, 7ttn:F, 7ttt:F, 7tub:F, 7x0s:M, 7x0v:I, 7x0v:M, 7x3j:d, 7x3u:d
22 8sfe:d 489 54 0.1299 0.0409 0.3704 7.0 8sfe:D
23 8fcj:A 212 58 0.1299 0.0943 0.3448 7.1 8fcu:A, 8fd2:A, 8fd3:A, 8ff4:A, 8ff5:A
24 5loe:A 258 55 0.1039 0.0620 0.2909 7.4 2b18:A, 2gx5:C, 2hgv:A, 5loe:B, 5loe:C, 5loe:D
25 3a8r:B 167 51 0.1299 0.1198 0.3922 7.5 3a8r:A
26 8dme:A 1034 45 0.0974 0.0145 0.3333 9.2 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218