Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TKVLVLGGRFGALTAAYTLKRLVGSKADVKVINKSRFSYFRPALPHVAIGVRDVDELKVDLSEALPEKGIQFQEGTVEKI
DAKSSMVYYTKPDGSMAEEEYDYVIVGIGAHLATELVKGWDKYGYSVCEPEFATKLREKLESFQGGNIAIGSGPFYQGHN
PKPKVPENFVPNADSACEGPVFEMSLMLHGYFKKKGMLDKVHVTVFSPGEYLSDLSPNSRKAVASIYNQLGIKLVHNFKI
KEIREHEIVDEKGNTIPADITILLPPYTGNPALKNSTPDLVDDGGFIPTDLNMVSIKYDNVYAVGDANSMTVPKLGYLAV
MTGRIAAQHLANRLGVPTKVDKYYPTIVCVADNPYE

The query sequence (length=356) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3h8i:A 356 356 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 3h8i:B, 3h8l:A, 3h8l:B
2 3t2z:A 427 315 0.2416 0.2014 0.2730 1.29e-25 3kpk:A, 3sx6:A, 3sxi:A, 3sy4:A, 3syi:A, 3sz0:A, 3szc:A, 3szf:A, 3szw:A, 3t0k:A, 3t14:A, 3t2k:A, 3t2y:A, 3t2z:B, 3t31:A
3 3hyv:A 429 361 0.2640 0.2191 0.2604 1.72e-25 3hyv:B, 3hyv:C, 3hyv:D, 3hyv:E, 3hyv:F, 3hyw:A, 3hyw:B, 3hyw:C, 3hyw:D, 3hyw:E, 3hyw:F, 3hyx:A, 3hyx:B, 3hyx:C, 3hyx:D, 3hyx:E, 3hyx:F
4 6bdo:D 395 140 0.1180 0.1063 0.3000 7.99e-12 6bdo:B, 6bdo:A, 6bdo:C, 5kmp:A, 5kmp:B, 5kmq:A, 5kmq:B, 5kmq:C, 5kmq:D, 5kmr:B, 5kmr:A, 5kmr:C, 5kmr:D, 5kms:A, 5kms:B, 5kms:C, 5kms:D, 4nwz:A, 4nwz:B, 4nwz:C, 4nwz:D, 5wed:B, 5wed:A, 5wed:C, 5wed:D
5 6mo6:B 414 334 0.2079 0.1787 0.2216 3.66e-08 8dhk:A, 8dhk:B, 6mo6:A, 6mo6:C, 6mo6:D, 6mp5:A, 6mp5:B, 6mp5:C, 6mp5:D, 6oi5:A, 6oi5:B, 6oi6:A, 6oi6:B, 6oib:A, 6oib:B, 6oic:A, 6oic:B, 6wh6:A, 6wh6:B
6 5jwa:A 495 152 0.1039 0.0747 0.2434 1.10e-04 5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
7 5yjy:B 465 131 0.1124 0.0860 0.3053 1.24e-04 5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
8 8wik:A 364 129 0.0927 0.0907 0.2558 1.54e-04 8jsc:C
9 5n1t:A 393 311 0.2107 0.1908 0.2412 2.07e-04
10 7xpi:A 363 131 0.0899 0.0882 0.2443 2.74e-04 7ytl:A
11 4g6h:A 472 147 0.1124 0.0847 0.2721 0.004 4g6g:A, 4g6g:B, 4g6h:B, 4g73:A, 4g73:B, 4g74:A, 4g74:B, 4g9k:A, 4g9k:B, 4gap:A, 4gap:B, 4gav:A, 4gav:B
12 1jcg:A 335 98 0.0730 0.0776 0.2653 0.35
13 8hku:ALX0 76 40 0.0449 0.2105 0.4000 0.43 8hkv:ALX0, 8hky:ALX0, 8hkz:ALX0, 8hl1:ALX0, 8hl2:ALX0, 8hl3:ALX0, 8hl4:ALX0, 8hl5:ALX0
14 7d0p:A 276 92 0.0815 0.1051 0.3152 0.44 7d0o:A, 7d0q:A, 7d0r:A, 7d0s:A, 5gk9:A, 6maj:A, 6mak:A
15 8a56:B 539 69 0.0618 0.0408 0.3188 0.44 8a56:A
16 2zxi:B 606 75 0.0674 0.0396 0.3200 1.2 2zxh:A, 2zxh:B, 2zxi:A, 2zxi:C, 2zxi:D
17 2imc:B 405 103 0.0758 0.0667 0.2621 2.0 3dse:A, 4hev:A, 4hev:B, 2ima:A, 2ima:B, 2imb:A, 2imb:B, 2imc:A, 7ky2:A, 7ky2:B, 7kyh:A, 7kyh:B, 7kyh:C, 7kyh:D, 7n18:A, 7n18:B, 3nf3:A, 3qix:A, 3qix:B, 3qiy:A, 3qiz:A, 3qj0:A, 5v8p:A, 5v8p:B, 5v8r:A, 5v8r:B, 5v8u:A, 5v8u:B
18 2cdu:A 451 120 0.1011 0.0798 0.3000 2.3 2cdu:B
19 5edm:A 550 107 0.0815 0.0527 0.2710 2.6 5edk:A, 4o03:A
20 7wv3:A 668 64 0.0534 0.0284 0.2969 2.7 7wv3:B, 7wv3:C, 7wv3:D, 7wv4:A, 7wv4:B, 7wv4:C, 7wv4:D, 7wv5:A, 7wv5:B, 7wve:A, 7wve:B, 7wvf:A, 7wvf:B, 7wvj:A, 7wvj:B
21 6bjr:A 575 107 0.0815 0.0504 0.2710 2.7 2a0q:D, 1a2c:H, 2a2x:H, 5a2m:H, 1a3b:H, 1a3e:H, 1a46:H, 1a4w:H, 2a45:B, 2a45:E, 1a5g:H, 1a61:H, 1abi:H, 1abj:H, 7ac9:H, 1ad8:H, 1ae8:H, 1afe:H, 2afq:B, 2afq:D, 5af9:H, 5afy:H, 5afz:H, 1aht:H, 5ahg:H, 1ai8:H, 1aix:H, 2ank:H, 2anm:H, 8ase:H, 8ase:B, 8asf:H, 8asf:B, 1awf:H, 1awh:B, 1awh:D, 4ax9:H, 1ay6:H, 4ayv:B, 4ayy:B, 4az2:B, 3b23:B, 1b5g:H, 2b5t:B, 2b5t:D, 1b7x:B, 3b9f:H, 1ba8:B, 4bah:B, 4bak:B, 4bam:B, 4ban:B, 4bao:B, 4baq:B, 1bb0:B, 1bcu:H, 2bdy:A, 3bef:A, 3bef:B, 3bef:D, 3bef:E, 3bf6:H, 1bhx:B, 1bhx:F, 3biu:H, 3biv:H, 1bmm:H, 1bmn:H, 4boh:A, 4boh:H, 2bvr:H, 2bvs:H, 2bvx:H, 3bv9:B, 8bw5:H, 2bxt:H, 2bxu:H, 1c1u:H, 1c1v:H, 1c1w:H, 3c1k:A, 3c27:B, 6c2w:A, 6c2w:B, 1c4u:2, 1c4v:2, 1c4y:2, 1c5l:H, 1c5n:H, 1c5o:H, 2c8w:B, 2c8x:B, 2c8y:B, 2c8z:B, 2c90:B, 2c93:B, 1ca8:B, 2cf8:H, 2cf9:H, 4ch2:D, 4ch2:B, 4ch8:B, 4ch8:F, 4ch8:H, 4ch8:D, 5cmx:H, 2cn0:H, 6cym:A, 6cym:C, 1d3d:B, 1d3p:B, 1d3q:B, 1d3t:B, 1d4p:B, 3d49:H, 1d6w:A, 1d9i:A, 3da9:B, 3dd2:H, 1de7:H, 1de7:K, 3dhk:H, 1dit:H, 4dih:H, 4dii:H, 1dm4:B, 1doj:A, 5do4:L, 5do4:H, 3dt0:H, 4dt7:B, 4dt7:D, 3dux:H, 1dwb:H, 1dwc:H, 1dwd:H, 1dwe:H, 1dx5:M, 1dx5:N, 1dx5:O, 1dx5:P, 4dy7:A, 4e05:H, 4e06:H, 3e6p:H, 4e7r:H, 4e7r:G, 5e8e:H, 1eb1:H, 3egk:H, 1eoj:A, 1eol:A, 6eo6:H, 6eo7:H, 6eo8:H, 6eo9:H, 3eq0:H, 6evv:H, 5ew1:H, 5ew2:H, 3f68:H, 2feq:H, 2fes:H, 6fjt:H, 1fpc:H, 1fph:H, 1g30:B, 1g32:B, 1g37:A, 6gbw:H, 2gde:H, 5gds:H, 1ghv:H, 1ghw:H, 1ghx:H, 1ghy:H, 3gic:B, 5gim:B, 1gj4:H, 1gj5:H, 6gn7:H, 6gwe:A, 6gwe:H, 1h8d:H, 1h8i:H, 2h9t:H, 1hag:E, 1hah:H, 1hai:H, 1hao:H, 1hap:H, 3hat:H, 1hbt:H, 1hdt:H, 4hfp:B, 4hfp:D, 1hgt:H, 2hgt:H, 3hkj:B, 3hkj:E, 1hlt:H, 1hlt:K, 2hnt:C, 2hnt:E, 2hnt:F, 2hpp:H, 2hpq:H, 6hsx:H, 1hut:H, 2hwl:B, 2hwl:D, 1hxe:H, 1hxf:H, 6i51:H, 4i7y:H, 1ihs:H, 1iht:H, 5jdu:D, 5jfd:H, 2jh0:D, 2jh5:D, 2jh6:D, 1jou:B, 1jou:D, 1jou:F, 1jwt:A, 3jz2:B, 5jzy:H, 1k21:H, 1k22:H, 7kme:H, 8kme:2, 1kts:B, 1ktt:B, 5l6n:H, 5lce:H, 3ldx:H, 1lhc:H, 1lhd:H, 1lhe:H, 1lhf:H, 1lhg:H, 4loy:H, 5lpd:H, 3lu9:B, 3lu9:E, 4lxb:H, 4lz1:H, 4lz4:B, 4lz4:D, 5mjt:H, 7mj5:E, 7mj5:G, 7mj5:J, 7mj5:M, 7mj5:C, 5mls:H, 5mm6:H, 1mu6:B, 1mu8:B, 1mue:B, 5nhu:H, 5nhu:C, 5nhu:A, 1nm6:A, 1no9:H, 1nrn:H, 1nro:H, 1nrp:H, 1nrq:H, 1nrr:H, 1nrs:H, 1nt1:A, 7ntu:B, 7ntu:D, 1nu7:B, 1nu7:F, 1nu9:A, 1nu9:D, 1ny2:2, 1nzq:H, 1o0d:H, 1o2g:H, 1o5g:H, 2od3:B, 1ook:B, 1oyt:H, 3p17:H, 3p6z:B, 3p6z:H, 3p70:B, 3p70:D, 3p70:F, 3p70:H, 1p8v:C, 2pgq:A, 2pgq:B, 7phx:H, 2pks:B, 2pks:C, 3pmh:B, 3po1:B, 3po1:C, 1ppb:H, 2pw8:H, 6px5:X, 6px5:B, 6pxj:B, 1qbv:H, 3qdz:B, 3qdz:D, 3qgn:B, 1qhr:B, 1qj1:B, 1qj6:B, 1qj7:B, 3qlp:H, 3qto:H, 3qtv:H, 1qur:H, 3qwc:H, 3qx5:H, 2r2m:B, 3r3g:B, 1riw:B, 1riw:C, 4rko:B, 3rlw:H, 3rly:H, 3rm0:H, 3rm2:H, 3rml:H, 3rmm:H, 3rmn:H, 3rmo:H, 4rn6:A, 4rn6:B, 6rot:H, 3s7h:B, 1sb1:H, 1sfq:B, 1sfq:E, 1sg8:B, 1sg8:E, 1sgi:E, 1shh:B, 1shh:E, 3sha:H, 3shc:H, 3si3:H, 3si4:H, 1sl3:A, 3sv2:H, 6t3m:H, 6t3q:H, 1t4u:H, 1t4v:H, 6t4a:H, 3t5f:H, 6t52:H, 6t53:H, 6t54:H, 6t55:H, 6t56:H, 6t57:H, 6t7h:B, 6t7h:H, 6t89:H, 6t8a:H, 1ta2:A, 1ta6:A, 1tb6:H, 1tbz:H, 6tdt:H, 1thp:B, 1thr:H, 1ths:H, 2thf:B, 4thn:H, 6tkg:H, 6tkh:H, 6tki:H, 6tkj:H, 6tkl:H, 1tmb:H, 1tmt:H, 1tmu:H, 1tom:H, 1tq0:D, 1tq7:B, 8tqs:H, 3tu7:H, 1twx:B, 3u8o:H, 3u8r:H, 3u8t:H, 3u98:H, 3u9a:H, 4ud9:H, 4udw:H, 4ue7:H, 4ueh:H, 4ufd:H, 4ufe:H, 4uff:H, 4ufg:H, 1uma:H, 3utu:H, 2uuf:B, 2uuj:B, 2uuk:B, 1uvs:H, 3uwj:H, 2v3h:H, 2v3o:H, 6v64:B, 1vr1:H, 3vxe:H, 3vxf:H, 1vzq:H, 1w7g:H, 1way:B, 1wbg:B, 1xm1:A, 1xmn:F, 1xmn:H, 1xmn:D, 1xmn:B, 6y02:H, 6y9h:H, 6yb6:H, 1ycp:M, 4yes:B, 6yhg:H, 6yhj:H, 6yhj:L, 6ymp:H, 6yn3:H, 1ype:H, 1ypg:H, 1ypj:H, 1ypk:H, 1ypl:H, 1ypm:H, 6yqv:H, 6ysj:H, 6ysx:H, 6z48:H, 6z48:B, 6z48:D, 6z48:F, 1z71:A, 1z8i:B, 1z8j:B, 6z8v:H, 6z8w:H, 6z8x:H, 2zc9:H, 2zda:H, 2zdv:H, 2zf0:H, 2zff:H, 2zfp:H, 2zfq:H, 2zfr:H, 1zgi:A, 1zgv:A, 2zg0:H, 2zgb:H, 2zgx:H, 6zgo:H, 2zhe:H, 2zhf:H, 2zhq:H, 2zhw:H, 2zi2:H, 2ziq:H, 7zkl:H, 7zkm:H, 7zkn:B, 7zkn:D, 7zko:H, 2znk:H, 2zo3:H, 1zrb:A, 6zug:H, 6zuh:H, 6zun:H, 6zuu:H, 6zuw:H, 6zux:H, 6zv7:H, 6zv8:H
22 8qci:B 269 56 0.0534 0.0706 0.3393 2.8
23 8acs:A 598 50 0.0421 0.0251 0.3000 2.9 8acs:B, 8acs:C, 8acs:D
24 6uvn:B 498 42 0.0449 0.0321 0.3810 3.3 8fuk:G
25 5fdn:A 914 90 0.0646 0.0252 0.2556 3.3 5fdn:B
26 2i6k:A 224 59 0.0478 0.0759 0.2881 4.0 2dho:A, 2i6k:B, 2icj:A, 2ick:A
27 6pfz:A 541 138 0.1039 0.0684 0.2681 4.4 6pfz:D, 6pfz:C, 6pfz:B
28 4c7w:A 353 43 0.0478 0.0482 0.3953 5.0 4c7w:B
29 6ks6:z 538 73 0.0562 0.0372 0.2740 5.6 6ks6:Z, 4v81:F, 4v81:N, 4v81:f, 4v81:n, 4v8r:AZ, 4v8r:Az, 4v8r:BZ, 4v8r:Bz, 4v94:F, 4v94:N, 4v94:f, 4v94:n, 7ylw:Z, 7ylw:z, 7ylx:Z, 7ylx:z, 7yly:Z, 7yly:z
30 3v0a:A 1280 103 0.0787 0.0219 0.2718 5.7 8agk:AAA, 3bon:A, 3boo:A, 3bta:A, 3bwi:A, 3c88:A, 3c89:A, 3c8a:A, 3c8b:A, 3dda:A, 3ddb:A, 3ds9:A, 1e1h:A, 1e1h:C, 4ej5:A, 4el4:A, 4elc:A, 2g7n:A, 2g7p:A, 2g7p:B, 2g7q:A, 2g7q:B, 8hkh:A, 8hkh:B, 2ilp:A, 2ilp:B, 2ise:A, 2ise:B, 2isg:A, 2isg:B, 2ish:A, 2ish:B, 3k3q:B, 4ks6:A, 4ktx:A, 4kuf:A, 7kyf:C, 7l6v:A, 7lzp:A, 7lzp:D, 7m1h:A, 2nyy:A, 2nz9:A, 2nz9:B, 7qpt:A, 7qpu:A, 3qw5:A, 3qw6:A, 3qw7:A, 3qw8:A, 5tpb:B, 5tpc:A, 3v0b:A, 3v0c:A, 5vgv:A, 2vu9:A, 2w2d:A, 2w2d:C, 6xcb:A, 6xcc:A, 6xcd:A, 6xce:A, 6xcf:A, 1xtf:A, 1xtf:B, 1xtg:A, 4zjx:A, 3zus:A, 3zus:B, 3zus:C, 3zus:D
31 8a1r:A 593 48 0.0478 0.0287 0.3542 7.0 8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
32 3c4q:A 393 68 0.0562 0.0509 0.2941 7.9 3c4q:B, 3c4v:A, 3c4v:B
33 4ewt:A 389 50 0.0421 0.0386 0.3000 9.0 4ewt:C, 4ewt:D, 4ewt:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218