Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TKKIVAIWAQDEEGVIGKDNRLPWYLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFH
DVQSVLDWYSAQEKNLYIVGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPAEFDLSLFETVSSKFYTKDEKNPYDFTIQ
YRKRKE

The query sequence (length=166) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ix9:A 166 166 1.0000 1.0000 1.0000 7.14e-124 3ix9:B
2 4m7u:A 170 152 0.4157 0.4059 0.4539 2.83e-43 4m7v:A
3 8uvz:A 160 162 0.4217 0.4375 0.4321 1.16e-40
4 3e0b:A 166 155 0.3916 0.3916 0.4194 1.29e-38 3dat:A, 3e0b:B, 4elb:A, 4elb:H, 4elb:C, 4elb:B, 4elb:G, 4elb:F, 4elb:D, 4elb:E, 4ele:A, 4ele:B, 4ele:C, 4ele:D, 4ele:E, 4ele:F, 4ele:G, 4ele:H, 4elf:A, 4elf:B, 4elf:C, 4elf:D, 4elf:E, 4elf:F, 4elf:G, 4elf:H, 4elg:A, 4elg:B, 4elg:C, 4elg:D, 4elg:E, 4elg:F, 4elg:G, 4elg:H, 4elh:A, 4elh:H, 4elh:C, 4elh:B, 4elh:G, 4elh:F, 4elh:D, 4elh:E, 3fl8:A, 3fl8:B, 3fl8:C, 3fl8:D, 3fl8:E, 3fl8:F, 3fl8:G, 3fl8:H, 3fl9:A, 3fl9:B, 3fl9:C, 3fl9:D, 3fl9:E, 3fl9:F, 3fl9:G, 3fl9:H, 3jvx:A, 3jvx:B, 3jw3:A, 3jw3:B, 3jw5:A, 3jw5:B, 3jwc:A, 3jwc:B, 3jwf:A, 3jwf:B, 3jwk:A, 3jwk:B, 3jwm:A, 3jwm:B, 2kgk:A, 2qk8:A, 3s9u:A, 3s9u:B, 3sa1:A, 3sa1:B, 3sa2:A, 3sa2:B, 3sai:A, 3sai:B
5 3tq8:A 171 163 0.3675 0.3567 0.3742 5.02e-29 3tq9:A, 3tqa:A, 3tqb:A
6 3ia4:A 161 150 0.3193 0.3292 0.3533 1.11e-27 3ia4:B, 3ia4:C, 3ia4:D, 2zza:A, 2zza:B
7 7tj3:A 164 166 0.3554 0.3598 0.3554 2.24e-27
8 5hi6:B 162 165 0.3133 0.3210 0.3152 2.90e-27 5hi6:A, 4qi9:A, 4qi9:B, 4qi9:C, 8szd:A, 8sze:A, 8sze:B
9 6cxk:A 165 153 0.3012 0.3030 0.3268 1.48e-26 2ano:A, 2anq:A, 5cc9:A, 5ccc:A, 6cqa:A, 6cw7:A, 7d3z:A, 7d49:A, 7d4l:A, 7d4x:A, 7d6g:A, 3dau:A, 8dai:A, 1ddr:A, 1ddr:B, 1dds:A, 1dds:B, 4dfr:A, 4dfr:B, 6dfr:A, 7dfr:A, 1dhi:A, 1dhi:B, 1dhj:A, 1dhj:B, 1dra:A, 1dra:B, 1drb:A, 1drb:B, 1dre:A, 1drh:A, 2drc:A, 2drc:B, 3drc:A, 3drc:B, 1dyh:A, 1dyh:B, 1dyi:B, 1dyj:A, 1dyj:B, 7f3b:A, 4fhb:A, 7fpl:A, 7fpm:A, 7fpn:A, 7fpo:A, 7fpp:A, 7fpq:A, 7fpr:A, 7fps:A, 7fpt:A, 7fpu:A, 7fpv:A, 7fpw:A, 7fpx:A, 7fpy:A, 7fpz:A, 7fq0:A, 7fq1:A, 7fq2:A, 7fq3:A, 7fq4:A, 7fq5:A, 7fq6:A, 7fq7:A, 7fq8:A, 7fq9:A, 7fqa:A, 7fqb:A, 7fqc:A, 7fqd:A, 7fqe:A, 7fqf:A, 7fqg:A, 8g4z:A, 8g50:A, 8g50:B, 4gh8:B, 4gh8:A, 2inq:A, 2inq:B, 1jol:A, 1jol:B, 1jom:A, 3kfy:A, 4kjj:A, 4kjk:A, 4kjl:A, 7lvc:A, 7mqp:A, 6mr9:A, 6mt8:A, 6mth:A, 7mym:A, 7mym:C, 7mym:B, 7nae:A, 4nx6:A, 4nx7:A, 3och:A, 3och:B, 4or7:A, 4osg:A, 4osg:B, 4osg:C, 4osg:D, 4p3q:A, 4p3r:A, 4p66:A, 4p68:A, 4pdj:A, 4pss:A, 4pst:A, 4psy:A, 4pth:A, 4ptj:A, 3ql0:A, 3ql3:A, 4qle:A, 4qle:B, 4qlf:A, 4qlg:A, 4qlg:B, 3qyl:A, 3qyo:A, 3r33:A, 1ra1:A, 1ra2:A, 1ra3:A, 1ra8:A, 1ra9:A, 1rb2:A, 1rb2:B, 1rb3:A, 1rb3:B, 1rc4:A, 7reb:A, 1rf7:A, 1rg7:A, 4rgc:A, 1rh3:A, 1rx1:A, 1rx2:A, 1rx3:A, 1rx4:A, 1rx5:A, 1rx6:A, 1rx8:A, 1rx9:A, 5sss:A, 5sst:A, 5ssu:A, 5ssv:A, 5ssw:A, 1tdr:A, 1tdr:B, 8ucx:A, 5uih:A, 5uii:A, 5uio:A, 5uio:B, 5uio:C, 5uio:D, 5uio:E, 5uip:A, 5uip:B, 8uw0:A, 8vz4:A, 8vz4:B, 5w3q:A, 4x5f:A, 4x5f:B, 4x5g:A, 4x5g:B, 4x5h:A, 4x5i:A, 4x5j:A, 6xg4:A, 6xg5:A, 5z6f:A, 5z6j:A, 5z6k:A, 5z6l:A, 5z6m:A
10 4fgg:A 163 158 0.3133 0.3190 0.3291 2.44e-24 6e4e:A, 3f0b:X, 3f0q:X, 3f0s:X, 3f0u:X, 3f0v:X, 3f0x:X, 4fgh:A, 3fq0:A, 3fqc:A, 3fqc:B, 3fqf:A, 3fqo:A, 3fqv:A, 3fqz:A, 3fra:X, 3frb:X, 3frd:X, 3fre:X, 3frf:X, 3fy8:X, 3fy9:X, 3fyv:X, 3fyw:X, 5hf0:X, 5hf2:X, 3i8a:X, 5isp:X, 5isq:X, 5ist:X, 5jg0:X, 4lae:X, 4lag:X, 4lah:X, 4lek:X, 3lg4:A, 3lg4:B, 3m08:A, 3m09:A, 6nd2:X, 6p9z:X, 6pbo:X, 6pr6:A, 6pr7:A, 6pr8:A, 6pr9:A, 6pra:A, 6prb:A, 6prd:A, 4q67:A, 4q6a:A, 3sgy:A, 3sgy:B, 3sh2:A, 3sh2:B, 3sqy:X, 3sr5:X, 3srq:X, 3srr:X, 3srs:X, 3sru:X, 3srw:X, 7t7q:X, 7t7s:X, 4tu5:X, 2w9g:A, 2w9h:A, 4xe6:X, 4xec:X
11 1ao8:A 162 151 0.3494 0.3580 0.3841 3.58e-24 1bzf:A, 3dfr:A, 1dis:A, 1diu:A, 2hm9:A, 2hqp:A, 2lf1:A, 1lud:A
12 2w9s:A 157 159 0.3193 0.3376 0.3333 1.05e-22 2w9s:B, 2w9s:C, 2w9s:D, 2w9s:E, 2w9s:F
13 7l9t:A 156 130 0.2530 0.2692 0.3231 1.93e-21 6cxm:A, 6cxm:B
14 6rul:A 276 143 0.2651 0.1594 0.3077 2.18e-20 6cyv:A, 6rum:A
15 2w3v:A 165 116 0.2229 0.2242 0.3190 1.42e-19 2w3w:A
16 7k6c:B 160 162 0.3253 0.3375 0.3333 1.82e-19 7k6c:A, 7k6c:E, 7k6c:C, 7k6c:D, 7k6c:F, 7k6c:G
17 7ki9:A 166 116 0.2349 0.2349 0.3362 6.12e-19 8f80:A, 8f81:A, 8f82:A, 8f83:A, 8f84:A, 8f85:A, 7k68:A, 7k69:A, 7k6a:A, 7ki8:A, 7km7:A, 7km8:A, 7km8:B, 7km9:A, 8ta0:A, 8ta1:A, 8tbr:A, 6uwq:A, 6uww:A
18 7k62:A 165 116 0.2289 0.2303 0.3276 1.30e-18 7k62:B
19 5sct:A 173 130 0.2530 0.2428 0.3231 2.87e-18 2cig:A, 8cop:A, 8cop:B, 8coq:A, 8coq:B, 8cow:A, 8cow:B, 8cox:A, 8cox:B, 8cq8:A, 8cq8:B, 8cq9:A, 8cq9:B, 8cqa:A, 8cqa:B, 6ddp:A, 6ddp:B, 6ddp:C, 6ddp:D, 6dds:A, 6dds:B, 6dds:C, 6dds:D, 6ddw:A, 1df7:A, 1dg5:A, 1dg7:A, 1dg8:A, 5ja3:A, 5ja3:B, 5ja3:C, 5ja3:D, 4kl9:A, 4klx:A, 4klx:B, 4km0:A, 4km0:B, 4km2:A, 4km2:B, 4kne:A, 4kne:B, 4m2x:A, 4m2x:C, 4m2x:E, 4m2x:G, 6nnc:A, 6nnc:B, 6nnd:A, 6nnd:B, 6nne:A, 6nne:B, 6nnh:A, 6nnh:B, 6nni:A, 6nni:B, 5scm:A, 5scn:A, 5sco:A, 5scp:A, 5scp:B, 5scq:A, 5scr:A, 5scs:A, 5scu:A, 5scv:A, 5scv:B, 5scw:A, 5scx:A, 5scy:A, 5scz:A, 5sd0:A, 5sd1:A, 5sd2:A, 5sd3:A, 5sd4:A, 5sd5:A, 5u26:A, 5u27:A, 5ujf:A, 6vs5:A, 6vs5:B, 6vs6:A, 6vs6:B, 6vs8:A, 6vs8:B, 6vs9:A, 6vs9:B, 6vsd:A, 6vsd:B, 6vse:A, 6vse:B, 6vsf:A, 6vsf:B, 6vsg:A, 6vsg:B, 6vv6:A, 6vv6:B, 6vv7:A, 6vv7:B, 6vv8:A, 6vv8:B, 6vv9:A, 6vv9:B, 6vvb:A
20 7myl:B 158 130 0.2349 0.2468 0.3000 3.46e-13 5ecc:A, 5ecc:B, 5ecx:A, 5ecx:B, 7myl:A, 7myl:C, 7myl:D, 7myl:E, 7myl:F, 7reg:A, 7reg:B, 7rgj:A, 7rgj:B
21 7r6g:A 157 130 0.2289 0.2420 0.2923 4.64e-13 7r6g:B, 7rgk:A, 7rgk:B, 7rgo:A, 7rgo:B
22 1qzf:A 519 165 0.2771 0.0886 0.2788 2.16e-12 3dl5:A, 3dl5:B, 3dl5:C, 3dl5:D, 3dl5:E, 3dl6:A, 3dl6:B, 3dl6:C, 3dl6:D, 3dl6:E, 3hj3:A, 3hj3:B, 3hj3:C, 3hj3:D, 4ky8:A, 4ky8:B, 4ky8:C, 4ky8:D, 4ky8:E, 2oip:A, 2oip:B, 2oip:C, 2oip:D, 2oip:E, 6ojs:A, 6ojs:C, 6ojs:B, 6ojs:E, 6ojs:D, 6pf7:A, 6pf7:B, 6pf7:C, 6pf7:D, 6pf7:E, 6pf8:A, 6pf8:B, 6pf8:C, 6pf8:D, 6pf8:E, 6pf9:A, 6pf9:B, 6pf9:C, 6pf9:D, 6pf9:E, 6pfa:A, 6pfa:B, 6pfa:C, 6pfa:D, 6pfa:E, 6pfb:A, 6pfb:B, 6pfb:C, 6pfb:D, 6pfb:E, 6pfc:A, 6pfc:B, 6pfc:D, 6pfc:C, 6pfc:E, 6pfd:A, 6pfd:B, 6pfd:C, 6pfd:D, 6pfd:E, 6pfe:A, 6pfe:B, 6pfe:C, 6pfe:E, 6pfe:D, 6pff:A, 6pff:B, 6pff:C, 6pff:D, 6pff:E, 6pfg:A, 6pfg:B, 6pfg:C, 6pfg:D, 6pfg:E, 6pfh:A, 6pfh:B, 6pfh:C, 6pfh:D, 6pfh:E, 6pfi:A, 6pfi:B, 6pfi:C, 6pfi:D, 6pfi:E, 4q0d:E, 4q0d:A, 4q0d:B, 4q0d:C, 4q0d:D, 4q0e:A, 4q0e:C, 4q0e:B, 4q0e:D, 4q0e:E, 1qzf:B, 1qzf:C, 1qzf:D, 1qzf:E, 1sej:A, 1sej:B, 1sej:C, 1sej:D, 1sej:E, 6wep:A, 6wep:B
23 1cd2:A 206 142 0.2289 0.1845 0.2676 2.76e-11 2cd2:A, 3cd2:A, 1daj:A, 1dyr:A, 1e26:A, 2fzh:A, 2fzi:A, 4g8z:X, 4ixe:D, 4ixf:X, 4ixg:X, 1klk:A, 1ly3:A, 1ly4:A, 3nz6:X, 3nz9:X, 3nza:X, 3nzb:X, 3nzc:X, 4qjz:D, 1s3y:A, 3td8:A, 1vj3:A
24 5dxv:A 149 106 0.1867 0.2081 0.2925 7.53e-10
25 5dxv:A 149 36 0.0904 0.1007 0.4167 0.086
26 1ai9:A 192 137 0.2410 0.2083 0.2920 1.74e-09 1ai9:B, 1aoe:A, 1aoe:B, 4h95:A, 4h95:B, 4h96:A, 4h96:B, 4h97:A, 4h97:B, 4hoe:A, 4hoe:B, 4hof:A, 4hof:B, 1ia1:A, 1ia1:B, 1ia2:A, 1ia2:B, 1ia3:A, 1ia3:B, 1ia4:A, 1ia4:B, 1m78:A, 1m78:B, 1m79:A, 1m79:B, 1m7a:A, 1m7a:B, 3qlr:A, 3qlr:B, 3qls:A, 3qls:B, 3qlw:A, 3qlw:B
27 3k2h:A 503 170 0.2651 0.0875 0.2588 1.16e-08 3k2h:B, 3kjr:A, 3kjr:B, 3nrr:A, 3nrr:B
28 8a0n:B 212 126 0.2349 0.1840 0.3095 1.54e-08 8a0z:B, 8a0z:A, 8crh:B, 8crh:A
29 8e4f:A 181 124 0.1867 0.1713 0.2500 2.26e-07
30 3cse:A 225 156 0.2289 0.1689 0.2436 5.18e-07 3cse:B, 3eej:A, 3eej:B, 3eek:A, 3eek:B, 3eel:A, 3eel:B, 3eem:A, 3eem:B, 4h98:A, 4h98:B, 4hog:A, 4hog:B, 3qlx:A, 3qlx:B, 3qly:A, 3qly:B, 3qlz:A, 3qlz:B, 3ro9:A, 3ro9:B, 3roa:A, 3roa:B
31 8dfr:A 186 161 0.2711 0.2419 0.2795 8.96e-07 1dr1:A, 1dr2:A, 1dr3:A, 1dr4:A, 1dr5:A, 1dr6:A, 1dr7:A
32 1d1g:A 164 123 0.2289 0.2317 0.3089 1.56e-06 1d1g:B
33 3qfx:A 219 171 0.2530 0.1918 0.2456 1.88e-06 3qfx:B, 3rg9:A, 3rg9:B
34 1juv:A 193 171 0.2892 0.2487 0.2807 9.00e-06
35 3d80:A 186 160 0.2530 0.2258 0.2625 4.45e-05 3d84:X, 2fzj:A, 3k45:A, 3k47:A, 1u70:A
36 5sd6:A 187 149 0.2470 0.2193 0.2752 0.002 6a7c:A, 6a7e:A, 1boz:A, 2c2s:A, 2c2s:B, 2c2t:A, 2c2t:B, 6dav:A, 6dav:B, 4ddr:A, 6de4:A, 6de4:B, 2dhf:A, 2dhf:B, 1dlr:A, 1dls:A, 3eig:A, 7ese:A, 3f8y:A, 3f8z:A, 3f91:A, 3fs6:A, 4g95:A, 3ghc:A, 3ghv:A, 3ghw:A, 3gi2:A, 3gyf:A, 1hfp:A, 1hfq:A, 1hfr:A, 5hpb:A, 5hqy:A, 5hqz:A, 5hsr:A, 5hsu:A, 5ht4:A, 5ht5:A, 5hui:A, 5hvb:A, 5hve:A, 4kak:A, 4kak:B, 4kbn:A, 4kbn:B, 4kd7:A, 4kd7:B, 4keb:A, 4keb:B, 4kfj:A, 4kfj:B, 1kms:A, 1kmv:A, 3l3r:A, 4m6j:A, 4m6k:A, 4m6l:A, 1mvs:A, 1mvt:A, 3n0h:A, 3ntz:A, 3nu0:A, 3nxo:A, 3nxr:A, 3nxt:A, 3nxv:A, 3nxx:A, 3nxy:A, 3nzd:A, 3oaf:A, 1ohj:A, 1ohk:A, 1pd8:A, 1pd9:A, 4qhv:A, 4qjc:A, 1s3u:A, 1s3v:A, 1s3w:A, 3s3v:A, 3s7a:A, 5sd7:A, 5sd8:A, 5sd9:A, 5sda:A, 5sdb:A, 5sdb:B, 1u71:A, 1u72:A, 6vcj:A, 6vcj:B, 6vcj:C, 6vcj:D, 2w3a:A, 2w3a:B, 2w3b:A, 2w3b:B, 2w3m:A, 2w3m:B, 8wgn:A, 7xi7:A, 1yho:A
37 3irm:A 520 141 0.2048 0.0654 0.2411 0.002 3cl9:A, 3clb:A, 3clb:B, 3clb:C, 3clb:D, 2h2q:A, 2h2q:B, 3hbb:A, 3hbb:B, 3hbb:C, 3hbb:D, 3inv:A, 3inv:B, 3irm:B, 3irm:C, 3irm:D, 3irn:A, 3irn:B, 3irn:C, 3irn:D, 3iro:A, 3iro:B, 3iro:C, 3iro:D, 3kjs:A, 3kjs:B, 3kjs:C, 3kjs:D, 5t7o:A, 5t7o:B, 5t7o:C, 5t7o:D
38 6drs:A 244 65 0.1325 0.0902 0.3385 0.050 6dtc:A
39 1w6t:B 430 86 0.1506 0.0581 0.2907 3.4 1w6t:A
40 4v8m:AT 131 27 0.0723 0.0916 0.4444 3.4 7ase:y, 5opt:Y, 8ova:AT, 8ove:AT
41 3ddj:A 279 41 0.0723 0.0430 0.2927 4.6
42 4qi7:A 805 73 0.1265 0.0261 0.2877 5.7 4qi7:B
43 6thh:C 816 42 0.0663 0.0135 0.2619 6.4 6yes:A
44 7ane:f 148 83 0.1386 0.1554 0.2771 6.6
45 8ye0:C 290 92 0.1205 0.0690 0.2174 7.4 8ye0:A, 8ye0:B, 8ye0:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218