Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TIMLRGLPTTITESDIREMMESFEGPQPADVRLMKRKTGVSRGFAFVEFYHLQDATSWMEANQKKLVIQGKHIAMHYSNP
RPKFEDWLCNKCGLNNFRKRLKCFRCG

The query sequence (length=107) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pcv:A 116 107 0.9907 0.9138 0.9907 1.45e-78 2lk0:A, 2lk1:A, 7pcv:B, 7pdv:E, 7pdv:A, 7pdv:C, 7pdv:G
2 2mxv:A 43 23 0.1589 0.3953 0.7391 3.39e-08
3 1fje:B 175 81 0.2056 0.1257 0.2716 3.80e-05 1rkj:A
4 2xs2:A 87 61 0.1589 0.1954 0.2787 7.71e-05 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
5 6xlv:A 203 74 0.1963 0.1034 0.2838 1.79e-04 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
6 2rra:A 99 75 0.2710 0.2929 0.3867 2.46e-04 2kxn:B
7 7dvq:Y 140 85 0.2804 0.2143 0.3529 0.002 8i0p:Y, 8i0r:Y
8 4ed5:B 169 48 0.1682 0.1065 0.3750 0.002 4ed5:A
9 6jvx:A 87 46 0.1682 0.2069 0.3913 0.002 6jvy:A
10 8xxm:3G 84 56 0.1869 0.2381 0.3571 0.009 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
11 1n0z:A 45 36 0.1495 0.3556 0.4444 0.018
12 7qde:B 169 83 0.2243 0.1420 0.2892 0.030 7qdd:B
13 2mb0:B 95 86 0.2710 0.3053 0.3372 0.033
14 4pkd:B 240 67 0.1776 0.0792 0.2836 0.037 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
15 4bs2:A 174 58 0.1776 0.1092 0.3276 0.041 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
16 4qqb:A 169 81 0.2056 0.1302 0.2716 0.044 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
17 6qx9:1K 201 56 0.1682 0.0896 0.3214 0.046 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
18 2fy1:A 108 60 0.1963 0.1944 0.3500 0.049
19 5vsu:A 387 83 0.1963 0.0543 0.2530 0.053 6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
20 8ch6:U 295 78 0.2150 0.0780 0.2949 0.056 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
21 2leb:A 101 38 0.1495 0.1584 0.4211 0.070 2lec:A
22 2cjk:A 167 81 0.2243 0.1437 0.2963 0.092 2km8:C
23 2cjk:A 167 53 0.1776 0.1138 0.3585 7.8 2km8:C
24 2x1f:A 94 59 0.1589 0.1809 0.2881 0.096 2km8:B, 2x1a:A
25 4lmz:A 176 59 0.1776 0.1080 0.3220 0.097 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
26 1fnx:H 174 79 0.1776 0.1092 0.2405 0.11 1fxl:A, 1g2e:A
27 7abi:P 237 78 0.2056 0.0928 0.2821 0.18 7aav:P, 7abg:P
28 8fkp:SH 150 92 0.2150 0.1533 0.2500 0.24 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
29 7ohx:o 112 61 0.1776 0.1696 0.3115 0.32
30 6fec:u 76 68 0.2056 0.2895 0.3235 0.46
31 6c0f:o 133 61 0.1776 0.1429 0.3115 0.50 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
32 7zew:A 117 75 0.2056 0.1880 0.2933 0.61 7zex:A
33 2vod:B 188 61 0.1402 0.0798 0.2459 0.62 2vod:A, 2von:A, 2von:B, 2voo:A, 2voo:B, 2vop:A, 1yty:A, 1yty:B, 1zh5:A, 1zh5:B
34 8ro0:O 342 72 0.1776 0.0556 0.2639 0.70 8ro1:O
35 7s7b:C 79 51 0.1682 0.2278 0.3529 0.81 7s7b:G, 7s7c:C
36 2kg1:A 105 65 0.1776 0.1810 0.2923 0.88
37 2xb2:D 89 70 0.1682 0.2022 0.2571 1.1 2xb2:Z
38 2n7c:A 89 58 0.1402 0.1685 0.2586 1.4
39 6r5k:H 394 41 0.1402 0.0381 0.3659 1.7 6r5k:D, 6r5k:F
40 6r5k:H 394 113 0.2804 0.0761 0.2655 2.8 6r5k:D, 6r5k:F
41 7moq:C 4159 43 0.1215 0.0031 0.3023 2.0 6zyy:C
42 8bx8:A 4453 43 0.1215 0.0029 0.3023 2.0 7k58:A, 7k5b:A, 7kek:A
43 6zyw:C 4433 43 0.1215 0.0029 0.3023 2.0
44 8bwy:C 4264 43 0.1215 0.0030 0.3023 2.0
45 8esq:o 137 61 0.1869 0.1460 0.3279 2.0 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
46 5f05:C 211 104 0.2150 0.1090 0.2212 2.6 5f05:A, 5f05:B, 5f05:D
47 8ghc:A 662 52 0.1682 0.0272 0.3462 3.1 8ghb:A, 8ghc:B, 8ghd:A, 8ghd:B, 8ghd:C, 8ghd:D, 8ghd:E, 8ghd:F, 8ghe:B, 8ghe:C, 8ghe:D, 8ghe:A
48 9gpj:A 184 71 0.1963 0.1141 0.2958 3.3 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
49 9gpj:A 184 84 0.1963 0.1141 0.2500 7.1 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
50 8ouw:2 701 68 0.2336 0.0357 0.3676 3.3
51 2mqo:A 105 79 0.1963 0.2000 0.2658 3.5
52 1la0:A 161 32 0.1308 0.0870 0.4375 3.5 1aj4:A, 1ap4:A, 2ctn:A, 3ctn:A, 1dtl:A, 1fi5:A, 8fmm:A, 8fmm:D, 8fmn:A, 8fmn:D, 8fmo:A, 8fmo:D, 8fmp:A, 8fmp:D, 8fmq:A, 8fmq:D, 8fmr:A, 8fmr:D, 8fms:A, 8fms:D, 8fmt:A, 8fmt:D, 4gje:A, 1ih0:A, 1j1d:A, 1j1d:D, 1j1e:A, 1j1e:D, 2jxl:A, 2kdh:A, 2kfx:T, 2kgb:C, 6klt:A, 6klu:A, 2krd:C, 2l1r:A, 2l98:A, 1lxf:C, 2mkp:C, 2mle:C, 2mlf:C, 1mxl:C, 2mzp:C, 2n79:C, 1ozs:A, 1r2u:A, 1r6p:A, 3rv5:A, 3rv5:B, 3rv5:C, 3rv5:D, 1sbj:A, 1scv:A, 3sd6:A, 3swb:A, 7uti:U, 7uti:Z, 8uzx:C, 8uzy:C, 8v01:C, 8v0i:C, 8v0k:C, 1wrk:A, 1wrk:B, 1wrl:A, 1wrl:B, 1wrl:C, 1wrl:D, 1wrl:E, 1wrl:F, 4y99:A
53 6s24:A 537 41 0.1121 0.0223 0.2927 3.8 6s22:A
54 6ueb:A 2099 32 0.0935 0.0048 0.3125 3.9
55 8cmo:4 207 64 0.1869 0.0966 0.3125 4.1
56 8sam:A 859 35 0.1215 0.0151 0.3714 4.6 8sam:B, 8sao:B, 8sao:D
57 5dfs:A 104 50 0.1589 0.1635 0.3400 4.6 5dfs:B, 6duj:A, 6duj:C, 6ecj:A, 6ecj:B, 6ecj:C, 6ecj:D, 6ecj:E, 6ecj:F, 6ecj:G, 6ecj:H, 5exq:A, 5exq:B, 1j3s:A, 2n3y:A, 2n9i:A, 2n9j:A, 3nwv:A, 3nwv:B, 3nwv:C, 3nwv:D, 5o10:A, 5o10:B, 5ty3:A, 5ty3:B, 6xnk:A, 6xnk:C, 6xnk:E, 6xnk:G, 3zcf:A, 3zcf:B, 3zcf:C, 3zcf:D, 3zoo:A, 3zoo:B, 3zoo:C, 3zoo:D
58 1rk8:A 87 28 0.1028 0.1264 0.3929 4.6
59 3zk4:B 571 38 0.0935 0.0175 0.2632 4.9 3zk4:A, 3zk4:C
60 6a4i:D 290 35 0.1121 0.0414 0.3429 5.3
61 5t61:L 348 31 0.1308 0.0402 0.4516 5.4 5t5i:F, 5t5i:N, 5t5m:F, 5t61:F, 5t61:R, 5t61:X, 5t61:d, 5t61:j, 5t61:p, 5t61:v
62 8izl:A 2067 70 0.1682 0.0087 0.2571 5.6 8izm:A, 8x01:A, 8yxm:A, 8yxp:A
63 7d8m:A 451 25 0.0935 0.0222 0.4000 5.8
64 7mvs:B 675 29 0.1028 0.0163 0.3793 6.0 8bp2:BBB, 8bp2:DDD, 5bs3:B, 5bs3:D, 4bul:A, 4bul:C, 5cdm:B, 5cdm:D, 5cdn:D, 5cdn:B, 5cdn:U, 5cdn:S, 5cdo:B, 5cdo:D, 5cdo:S, 5cdo:U, 5cdp:B, 5cdp:D, 5cdq:B, 5cdq:D, 5cdq:S, 5cdq:U, 5cdr:B, 5cdr:D, 6fm4:B, 6fm4:D, 6fqm:D, 6fqs:B, 6fqs:D, 6fqv:B, 6fqv:D, 6fqv:S, 6fqv:U, 7fvs:A, 7fvs:B, 7fvt:A, 7fvt:B, 5iwi:B, 5iwi:D, 5iwm:B, 5iwm:D, 7mvs:A, 5npk:B, 5npk:D, 5npk:b, 5npk:d, 5npp:B, 5npp:D, 4plb:B, 4plb:D, 6qtk:B, 6qtk:D, 6qtp:B, 6qtp:D, 6qx1:B, 6qx1:D, 6qx2:B, 6qx2:D, 6qx2:K, 6qx2:M, 6qx2:S, 6qx2:U, 6qx2:b, 6qx2:d, 6qx2:k, 6qx2:m, 6qx2:s, 6qx2:u, 2xcs:B, 2xcs:D, 2xct:B, 2xct:D, 2xct:S, 2xct:U, 6z1a:B, 6z1a:D
65 2xco:A 636 29 0.1028 0.0173 0.3793 6.1
66 2xcr:D 719 29 0.1028 0.0153 0.3793 6.2 8bp2:AAA, 8bp2:CCC, 5cdm:A, 5cdm:C, 5cdn:C, 5cdn:A, 5cdn:T, 5cdn:R, 5cdo:A, 5cdo:C, 5cdo:R, 5cdo:T, 5cdp:A, 5cdp:C, 5cdq:A, 5cdq:C, 5cdq:R, 5cdq:T, 5cdr:A, 5cdr:C, 6fqm:A, 6fqm:C, 6fqm:a, 6fqm:c, 6fqs:A, 6fqs:C, 6fqv:A, 6fqv:C, 6fqv:R, 6fqv:T, 5iwi:A, 5iwi:C, 5iwm:A, 5iwm:C, 6qtk:A, 6qtk:C, 6qtp:A, 6qtp:C, 6qx1:A, 6qx1:C, 6qx2:A, 6qx2:C, 6qx2:J, 6qx2:L, 6qx2:R, 6qx2:T, 6qx2:a, 6qx2:c, 6qx2:j, 6qx2:l, 6qx2:r, 6qx2:t, 2xcr:B, 2xcr:S, 2xcr:U
67 7slp:B 321 52 0.1402 0.0467 0.2885 7.2 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
68 8i0v:4 161 55 0.1589 0.1056 0.3091 7.6
69 7q33:A 93 50 0.1495 0.1720 0.3200 7.9 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
70 5mqf:o 223 32 0.1121 0.0538 0.3750 8.9 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
71 8pty:C 440 67 0.1869 0.0455 0.2985 9.2 8avg:C
72 7we4:A 1122 36 0.1028 0.0098 0.3056 9.4 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
73 8j1j:B 387 45 0.0935 0.0258 0.2222 9.4 8j12:B, 8j3r:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218