Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
THVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSK
YVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLY
IGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYADALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGIL
GSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQY
SQGHLNLMVR

The query sequence (length=330) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7xnk:A 348 339 1.0000 0.9483 0.9735 0.0 7tci:A, 7tci:G, 7tci:E, 7tci:C, 4umo:A, 6v01:A, 6v01:J, 6v01:D, 6v01:G, 7xnk:C, 7xnk:E, 7xnk:G, 7xnl:A, 7xnl:C, 7xnl:E, 7xnl:G, 7xnn:B, 7xnn:G, 7xnn:C, 7xnn:E
2 7byl:A 354 339 0.5727 0.5339 0.5575 6.69e-133 7byl:C, 7byl:E, 7byl:G, 7bym:A, 7bym:C, 7bym:E, 7bym:G, 7byn:A, 7byn:C, 7byn:E, 7byn:G, 7vnp:A, 7vnp:C, 7vnp:G, 7vnp:E, 7vnq:A, 7vnq:C, 7vnq:E, 7vnq:G
3 7vnr:A 333 328 0.5697 0.5646 0.5732 2.76e-127 7vnr:C, 7vnr:E, 7vnr:G
4 7cr7:A 354 340 0.5424 0.5056 0.5265 2.33e-125 7cr1:A, 7cr1:B, 7cr1:C, 7cr1:D, 7cr2:B, 7cr2:C, 7cr2:D, 7cr2:A, 7cr4:A, 7cr4:B, 7cr4:D, 7cr4:F, 7cr7:G, 7cr7:B, 7cr7:D, 8ijk:A, 8ijk:C, 8ijk:B, 8ijk:D, 8izy:A, 8izy:B, 8izy:D, 8izy:C, 8j01:G, 8j01:A, 8j01:B, 8j01:D, 8j02:G, 8j02:A, 8j02:B, 8j02:D, 8j03:A, 8j03:D, 8j03:G, 8j03:I, 8j04:A, 8j04:G, 8j04:B, 8j04:D, 8w4u:A, 8w4u:B, 8w4u:D, 8w4u:G
5 8x43:A 327 328 0.5364 0.5413 0.5396 3.27e-125 8j00:A, 8j00:B, 8j00:C, 8j00:D, 8x43:G, 8x43:C, 8x43:E
6 4umo:B 96 79 0.2000 0.6875 0.8354 2.32e-39
7 7ssy:A 346 218 0.1970 0.1879 0.2982 2.64e-22 7ssy:B, 7ssy:C, 7ssy:D, 7wf3:B, 7wf3:D, 7wf3:F, 7wf3:H
8 7e8e:D 459 284 0.2333 0.1678 0.2711 4.39e-21 7e87:B, 7e87:A, 7e87:C, 7e87:D, 7e8e:B, 1nn7:A, 7ukg:A, 7ukg:B, 7ukg:C, 7ukg:D
9 4jta:Q 363 210 0.1818 0.1653 0.2857 2.25e-20 4jtc:H, 4jtd:H, 2r9r:H
10 5wie:B 390 210 0.1818 0.1538 0.2857 3.90e-20 4jta:B, 4jtc:B, 4jtd:B, 3lnm:B, 2r9r:B
11 8quc:A 395 265 0.2030 0.1696 0.2528 1.20e-17 8f1c:A, 8f1c:B, 8f1c:C, 8f1c:D, 8f1d:A, 8f1d:B, 8f1d:C, 8f1d:D, 7phi:C, 7phi:B, 7phi:D, 8quc:B, 8quc:D, 8quc:C, 8qud:A, 8qud:B, 8qud:C, 8qud:D
12 5wie:H 328 150 0.1424 0.1433 0.3133 4.03e-17 3lnm:D
13 4chv:D 343 181 0.1758 0.1691 0.3204 3.10e-13 4chw:D, 3cl1:A, 3cl1:B, 3clp:A, 3clp:C, 2k0g:A, 4muv:A, 4muv:B, 1u12:A, 1u12:B, 1vp6:A, 1vp6:C
14 4uuj:C 111 110 0.1121 0.3333 0.3364 1.23e-08 2bob:C, 2dwd:C, 2dwe:C, 2h8p:C, 2h8p:D, 2hfe:C, 2hfe:D, 2hg5:C, 2hg5:D, 2hvj:C, 3ifx:A, 3ifx:B, 3ifx:C, 3ifx:D, 2jk5:C, 7m2h:C, 7m2h:F, 3stz:C, 8thn:C, 2w0f:C
15 7rjt:A 902 223 0.1636 0.0599 0.2422 3.45e-04 7rjt:B, 7rjt:C, 7rjt:D, 7rk6:A, 7rk6:B, 7rk6:C, 7rk6:D, 5tj6:A
16 8ctn:B 96 26 0.0515 0.1771 0.6538 0.002 8cts:B, 8ctu:B, 8cu2:B, 8cu3:B, 8cu4:B, 6dz1:B, 6fiz:C, 6fiz:D, 6fiz:E, 6fiz:G, 6fiz:H, 6fiz:J, 6fiz:L, 6fiz:N, 6fiz:A, 6fiz:O, 6fiz:P, 4r50:B, 4r6z:A, 4r6z:B, 4r7c:C, 4r8c:A, 4ro2:A, 4ro2:B, 4ro2:D
17 2x6b:A 287 123 0.1061 0.1220 0.2846 0.006 7n9k:A, 7n9l:A, 6o9t:A, 6o9u:A, 6o9v:A, 6o9v:B, 2x6a:A, 2x6c:A
18 3rbz:A 289 49 0.0545 0.0623 0.3673 0.014 3rbz:B, 3rbz:C, 3rbz:D
19 6oly:C 318 49 0.0545 0.0566 0.3673 0.015 2aef:A, 2aef:B, 5bkj:A, 5bkj:C, 5bkj:E, 5bkj:G, 5bkk:A, 5bkk:C, 5bkk:G, 8fz7:A, 8fz7:C, 8fz7:E, 8fz7:G, 3kxd:A, 3kxd:B, 4l73:A, 4l73:B, 4l74:A, 4l74:B, 4l75:A, 4l75:B, 4l75:C, 4l75:D, 4l75:E, 4l75:F, 4l76:A, 4l76:B, 4l76:C, 4l76:D, 4l76:E, 4l76:F, 1lnq:A, 1lnq:B, 1lnq:C, 1lnq:D, 1lnq:E, 1lnq:F, 1lnq:G, 1lnq:H, 6oly:A, 6oly:B, 6oly:D, 3rbx:A, 3rbx:B, 3rbx:C, 3rbx:D, 3rbx:E, 3rbx:F, 6u5n:A, 6u5n:E, 6u5n:B, 6u5n:F, 6u5n:C, 6u5n:G, 6u5n:D, 6u5n:H, 6u5p:A, 6u5p:E, 6u5p:B, 6u5p:F, 6u5p:C, 6u5p:G, 6u5p:D, 6u5p:H, 6u5r:A, 6u5r:B, 6u5r:C, 6u5r:D, 6u5r:E, 6u5r:F, 6u5r:G, 6u5r:H, 6uwn:A, 6uwn:E, 6uwn:B, 6uwn:F, 6uwn:C, 6uwn:G, 6uwn:D, 6uwn:H, 6ux4:A, 6ux4:E, 6ux4:B, 6ux4:F, 6ux4:C, 6ux4:G, 6ux4:D, 6ux4:H
20 2wll:B 266 103 0.0939 0.1165 0.3010 0.018
21 2q67:A 104 26 0.0455 0.1442 0.5769 0.020 2q67:B, 2q68:A, 2q68:B, 2q69:A, 2q6a:A, 2q6a:B, 4ro2:C, 6v8y:A
22 8fhd:A 1294 194 0.1273 0.0325 0.2165 0.023
23 8gz2:B 1174 194 0.1273 0.0358 0.2165 0.046 8gz1:B
24 7ryr:A 389 51 0.0485 0.0411 0.3137 0.052 7ru0:A, 7ru0:B, 7ru0:C, 7ru0:D, 7ryr:C, 7ryr:D, 7ryr:B, 7rys:A, 7rys:B, 7rys:C, 7rys:D
25 8vt9:A 406 51 0.0485 0.0394 0.3137 0.053 6cjq:A, 6cjq:B, 6cjq:C, 6cjq:D, 6cjt:A, 6cjt:B, 6cjt:C, 6cjt:D, 6cju:A, 6cju:B, 6cju:C, 6cju:D, 4d7s:A, 4d7s:B, 4d7t:A, 7rsh:A, 7rsh:B, 7rsh:C, 7rsh:D, 7rtf:A, 7rtf:B, 7rtf:C, 7rtf:D, 7rtj:A, 7rtj:B, 7rtj:C, 7rtj:D, 7tj5:A, 7tj5:B, 7tj5:C, 7tj5:D, 7tj6:A, 7tj6:B, 7tj6:C, 7tj6:D, 7tkt:A, 7tkt:B, 7tkt:C, 7tkt:D, 8vt9:D, 8vt9:B, 8vt9:C, 8vta:A, 8vta:B, 8vta:C, 8vta:D, 8vtb:A, 8vtb:B, 8vtb:C, 8vtb:D, 6vxz:A, 6vxz:B, 6vxz:C, 6vxz:D
26 6v1x:A 446 82 0.0727 0.0538 0.2927 0.059 6v1x:B, 6v1x:C, 6v1x:D, 6v1y:A, 6v1y:B, 6v1y:C, 6v1y:D, 6v1y:M, 6v1y:N, 6v1y:O, 6v1y:P
27 7pxe:A 885 118 0.0909 0.0339 0.2542 0.11 7pxe:B, 7pxe:C, 7pxe:D, 7pxf:A, 7pxf:B, 7pxf:C, 7pxf:D, 7pxg:A, 7pxg:B, 7pxg:C, 7pxg:D, 7pxh:A, 7pxh:B, 7pxh:C, 7pxh:D
28 8qz1:A 242 82 0.0848 0.1157 0.3415 0.20 4bw5:C, 8qz1:B, 4xdj:C, 4xdk:C, 4xdk:D, 4xdl:C
29 8qz3:B 266 65 0.0636 0.0789 0.3231 0.26 4bw5:A, 4bw5:B, 4bw5:D, 8qz2:A, 8qz2:B, 8qz3:A, 8qz4:A, 8qz4:B, 4xdj:A, 4xdj:B, 4xdj:D, 4xdk:A, 4xdk:B, 4xdl:A, 4xdl:B, 4xdl:D
30 8k1j:B 242 39 0.0394 0.0537 0.3333 0.29 8k1j:A, 8k1q:A, 8k1q:B, 8k1v:A, 8k1v:B, 8k1z:A, 8k1z:B
31 8ghf:A 910 125 0.0848 0.0308 0.2240 0.61 8ghf:B, 8ghf:C, 8ghf:D, 3mt5:A, 8s3e:A, 8s3e:B, 8s3e:C, 8s3e:D, 3u6n:A, 3u6n:B, 3u6n:C, 3u6n:D, 3u6n:E, 3u6n:F, 3u6n:G, 3u6n:H, 6v22:A, 6v22:B, 6v22:C, 6v22:D, 6v38:A, 6v38:B, 6v38:C, 6v38:D, 6v5a:A, 7ynz:A, 7ynz:C, 7ynz:E, 7ynz:G, 7yo0:A, 7yo0:C, 7yo0:E, 7yo0:G, 7yo1:A, 7yo1:C, 7yo1:E, 7yo1:G, 7yo3:A, 7yo5:A, 7yo5:B, 7yo5:C, 7yo5:D
32 6v35:A 914 125 0.0848 0.0306 0.2240 0.61 6v35:D, 6v35:B, 6v35:C, 8z3s:A, 8z3s:B, 8z3s:C, 8z3s:D
33 4twk:B 241 31 0.0424 0.0581 0.4516 0.62
34 6rv2:D 261 39 0.0364 0.0460 0.3077 0.69 6rv2:A, 6rv2:B, 6rv2:C, 6rv3:A, 6rv3:B, 6rv3:C, 6rv3:D, 6rv4:A, 6rv4:B, 6rv4:C, 6rv4:D
35 7rbq:A 614 85 0.0848 0.0456 0.3294 0.78 7t39:A
36 8fhs:A 1282 51 0.0485 0.0125 0.3137 0.85 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
37 7vfs:A 1266 99 0.0758 0.0197 0.2525 0.87 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
38 7mix:A 1326 99 0.0758 0.0189 0.2525 0.96 7miy:A
39 4gx0:D 376 74 0.0576 0.0505 0.2568 1.6 4gx0:A, 4gx1:A, 4gx1:D, 4gx2:A, 4gx2:D, 4gx5:A, 4gx5:D
40 3ukm:A 252 42 0.0424 0.0556 0.3333 1.7 3ukm:B, 3ukm:C, 3ukm:D
41 8tkf:A 2272 67 0.0545 0.0079 0.2687 1.7 8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
42 8epm:A 991 147 0.0879 0.0293 0.1973 1.7
43 8hir:A 918 27 0.0273 0.0098 0.3333 3.3 8hir:B, 8hir:C, 8hir:D, 8hk6:A, 8hk6:B, 8hk6:C, 8hk6:D, 8hkf:A, 8hkf:B, 8hkf:C, 8hkf:D, 8hkk:A, 8hkk:B, 8hkk:C, 8hkk:D, 8hkm:A, 8hkm:B, 8hkm:C, 8hkm:D, 8hkq:D, 8hkq:A, 8hkq:C, 8hkq:B
44 4gx2:B 548 74 0.0576 0.0347 0.2568 4.0 4gvl:A, 4gvl:B, 4gvl:D, 4gvl:C, 4gx0:B, 4gx0:C, 4gx1:B, 4gx1:C, 4gx2:C, 4gx5:B, 4gx5:C
45 4up7:A 529 102 0.0697 0.0435 0.2255 4.1 4up9:A, 4upa:A
46 8de8:B 276 89 0.0727 0.0870 0.2697 4.1 8de7:B, 8de7:A, 8de8:A, 8de9:A, 8de9:B
47 7yid:A 660 37 0.0394 0.0197 0.3514 4.9 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
48 6a91:A 1323 115 0.0818 0.0204 0.2348 7.2 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
49 6v3c:B 260 74 0.0606 0.0769 0.2703 9.0 6v36:A, 6v3c:A, 6v3i:A, 6w7b:A, 6w7d:A, 6w7e:A
50 9ayh:A 1056 164 0.1273 0.0398 0.2561 9.6 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218