Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
THLRPYETLGAHADTMDGVTGTRFSVWAPNARRVSVVGQFNYWDGRRHPMRLRKESGIWELFIPGAHNGQLYKYEMIDAN
GNLRLKSDPYAFEAQMRPETASLICGLPEKVVQTEERKKANQFDAPISIYEVHLGSWRRHTDNNFWLSYRELADQLVPYA
KWMGFTHLELLPINEHPFDGSWGYQPTGLYAPTRRFGTRDDFRYFIDAAHAAGLNVILDWVPGHFPTDDFALAEFDGTNL
YEHSTLIYNYGRREVSNFLVGNALYWIERFGIDALRVDAVASMIYRDYIPNEFGGRENLEAIEFLRNTNRILGEQVSGAV
TMAEESTDFPGVSRPQDMGGLGFWYKWNLGWMHDTLDYMKLDPVYRQYHHDKLTFGILYNYTENFVLPLSHDEVVHGKKS
ILDRMPGDAWQKFANLRAYYGWMWAFPGKKLLFMGNEFAQGREWNHDASLDWHLLEGGDNWHHGVQRLVRDLNLTYRHHK
AMHELDFDPYGFEWLVVDDKERSVLIFVRRDKEGNEIIVASNFTPVPRHDYRFGINQPGKWREILNTDSMHYHGSNAGNG
GTVHSDEIASHGRQHSLSLTLPPLATIWLVREAE

The query sequence (length=594) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8sdb:C 604 603 0.9983 0.9818 0.9834 0.0 5e6y:A, 5e6y:B, 5e6y:D, 5e6z:A, 5e6z:B, 5e6z:D, 5e70:A, 5e70:B, 5e70:D, 4lpc:A, 4lpc:B, 4lpc:D, 4lq1:B, 4lq1:C, 4lq1:D, 4lq1:A, 8sdb:A, 8sdb:B
2 5e6y:C 584 594 0.9832 1.0000 0.9832 0.0 5e6z:C, 5e70:C, 4lpc:C
3 5gqv:A 755 635 0.5152 0.4053 0.4819 0.0 5gqx:A, 5gqy:A, 5gr1:A, 5gr4:A
4 7p43:B 690 666 0.2946 0.2536 0.2628 2.82e-43 7p43:A
5 5clt:A 646 653 0.2862 0.2632 0.2603 5.92e-41 5clt:B, 5clt:C, 5clw:A, 5clw:C, 5clw:B
6 3vu2:A 692 612 0.2710 0.2327 0.2631 2.00e-38 7ml5:A, 3vu2:B
7 3vgf:A 555 345 0.1498 0.1604 0.2580 4.83e-18 3vgg:A, 3vgh:A
8 2bhz:A 589 289 0.1380 0.1392 0.2837 4.80e-17 2bhy:A, 2bxy:A, 2bxz:A, 2by0:A, 2by1:A, 2by2:A, 2by3:A
9 3m07:A 584 156 0.0825 0.0839 0.3141 1.17e-15
10 2e8y:A 712 304 0.1347 0.1124 0.2632 6.24e-15 2e8y:B, 2e8z:A, 2e8z:B, 2e9b:A, 2e9b:B
11 8dl1:A 713 471 0.1936 0.1613 0.2442 5.26e-12 8dge:A, 8dge:B, 8dge:C, 8dge:D, 8dl1:B, 8dl1:C, 8dl1:D, 8dl2:A, 8dl2:B, 8dl2:C, 8dl2:D
12 8xx9:A 620 393 0.1599 0.1532 0.2417 8.79e-12 8xxa:A
13 2vr5:A 715 370 0.1431 0.1189 0.2297 2.17e-10 2vr5:B
14 5a2a:A 452 144 0.0690 0.0907 0.2847 8.05e-08 5a2b:A, 5a2c:A
15 1bf2:A 750 367 0.1498 0.1187 0.2425 2.53e-07
16 5jy7:B 571 213 0.0960 0.0998 0.2676 2.77e-07 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
17 5ot1:A 572 149 0.0774 0.0804 0.3087 4.06e-07
18 6jhf:A 653 313 0.1279 0.1164 0.2428 9.73e-07 6jeq:A, 6jfj:A, 6jfx:A, 6jhg:A, 6jhh:A, 6jhi:A
19 4lxf:B 546 229 0.1010 0.1099 0.2620 1.02e-06
20 8uzh:B 626 229 0.1010 0.0958 0.2620 1.37e-06 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
21 3wdh:A 698 304 0.1128 0.0960 0.2204 1.39e-06 3wdi:A, 3wdj:A
22 4jcm:A 669 164 0.0909 0.0807 0.3293 6.53e-06
23 4e2o:A 445 175 0.0741 0.0989 0.2514 7.25e-06
24 6sau:B 442 66 0.0370 0.0498 0.3333 9.69e-06 6sau:A
25 7u3b:C 696 343 0.1279 0.1092 0.2216 1.35e-05 7u3a:A, 7u3a:B, 7u3a:C, 7u3a:D, 7u3b:H, 7u3b:D, 7u3b:F, 7u3b:E, 7u3b:I, 7u3b:G, 7u3b:J, 7u3d:B, 7u3d:F, 7u3d:A
26 5ykb:D 523 193 0.0976 0.1109 0.3005 1.53e-05 5ykb:B
27 7u3d:C 677 263 0.1077 0.0945 0.2433 1.79e-05
28 1cyg:A 680 69 0.0421 0.0368 0.3623 3.70e-05
29 3vm7:A 470 83 0.0522 0.0660 0.3735 8.51e-05
30 6sao:A 438 76 0.0438 0.0594 0.3421 1.43e-04
31 1qho:A 686 117 0.0623 0.0539 0.3162 1.67e-04 1qhp:A
32 4okd:A 801 364 0.1397 0.1036 0.2280 1.71e-04 4okd:B
33 7lsu:A 765 182 0.0623 0.0484 0.2033 2.26e-04 7lsa:A, 7lsr:A, 7lst:A
34 1wza:A 488 160 0.0673 0.0820 0.2500 2.77e-04
35 6wni:A 494 116 0.0539 0.0648 0.2759 2.88e-04 6wni:B, 6wnu:A
36 5x7u:A 546 213 0.0892 0.0971 0.2488 4.29e-04
37 7d9b:A 588 152 0.0623 0.0629 0.2434 4.52e-04 7d9c:A, 7dcg:A, 7dch:A, 7ehh:A, 7ehi:A
38 1j0h:A 588 395 0.1465 0.1480 0.2203 4.64e-04 1j0h:B, 1j0i:A, 1j0i:B, 1j0j:B, 1j0j:A, 1j0k:A, 1j0k:B
39 6lga:A 570 61 0.0387 0.0404 0.3770 4.75e-04 6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B
40 3aib:G 844 128 0.0623 0.0438 0.2891 4.81e-04 3aib:A, 3aib:B, 3aib:C, 3aib:D, 3aib:E, 3aib:F, 3aib:H, 3aic:A, 3aic:B, 3aic:C, 3aic:D, 3aic:E, 3aic:F, 3aic:G, 3aic:H, 3aie:A, 3aie:B, 3aie:C, 3aie:D, 3aie:E, 3aie:F, 3aie:G, 3aie:H, 8fg8:A, 8fg8:B, 8fj9:A, 8fj9:B, 8fjc:A, 8fjc:B, 8fk4:A, 8fk4:B, 8fk4:C, 8fk4:D, 8fk4:E, 8fk4:F, 8fk4:G, 8fk4:H, 8uf5:A, 8uf5:B
41 1d7f:A 686 124 0.0640 0.0554 0.3065 4.88e-04 1d7f:B, 1ded:A, 1ded:B, 1i75:A, 1i75:B, 1pam:A, 1pam:B, 1ukq:A, 1ukq:B, 1uks:A, 1uks:B, 1ukt:A, 1ukt:B, 1v3j:A, 1v3j:B, 1v3k:A, 1v3k:B, 1v3l:A, 1v3l:B, 1v3m:A, 1v3m:B
42 2aaa:A 476 84 0.0488 0.0609 0.3452 4.88e-04
43 5yna:A 1055 200 0.0909 0.0512 0.2700 5.47e-04 2fgz:A, 2fh6:A, 2fh8:A, 2fhb:A, 2fhc:A, 2fhf:A, 6j33:A, 6j33:B, 6j34:A, 6j35:A, 6j35:B, 6j4h:A, 5yn2:A, 5yn7:A, 5ync:A, 5ynd:A, 5yne:A, 5ynh:A, 2yoc:A, 2yoc:B
44 4aio:A 883 346 0.1229 0.0827 0.2110 7.38e-04 4cvw:A, 4cvw:B, 4j3s:A, 4j3t:A, 4j3u:A, 4j3u:B, 4j3v:A, 4j3w:A, 4j3x:A, 2y4s:A, 2y5e:A
45 5brp:A 555 115 0.0556 0.0595 0.2870 0.001 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
46 3a6o:A 585 152 0.0657 0.0667 0.2566 0.002 3a6o:B, 2d2o:A, 2d2o:B, 1g1y:A, 1g1y:B, 1jf5:A, 1jf5:B, 1jf6:A, 1jf6:B, 1ji2:A, 1ji2:B, 1jib:A, 1jib:B, 1jl8:A, 1jl8:B, 1vb9:A, 1vb9:B, 1vfm:A, 1vfm:B, 1vfo:A, 1vfo:B, 1vfu:A, 1vfu:B, 1wzk:A, 1wzk:B, 1wzl:A, 1wzl:B, 1wzm:A, 1wzm:B
47 9ezl:A 548 217 0.0976 0.1058 0.2673 0.002 9ezl:B, 9ezl:C, 9ezl:D, 9ezl:E, 9ezl:F, 9ezl:G, 9ezl:H, 5gtw:A, 5gtw:B, 5gtw:C, 5gtw:D, 4tvu:A, 4tvu:B, 4tvu:C, 4tvu:D, 4tvu:E, 4tvu:F, 4tvu:G, 4tvu:H, 4wf7:A, 4wf7:B, 4wf7:C, 4wf7:D, 5ykb:A, 5ykb:C
48 4amc:A 1019 71 0.0421 0.0245 0.3521 0.003
49 3ueq:A 632 69 0.0370 0.0348 0.3188 0.004 4fls:A, 1jg9:A, 1jgi:A, 1mvy:A, 1mw0:A, 1mw1:A, 1mw2:A, 1mw3:A, 5n6v:A, 5n7j:A, 1s46:A, 1zs2:A
50 2ze0:A 531 62 0.0404 0.0452 0.3871 0.004
51 1bag:A 425 79 0.0438 0.0612 0.3291 0.004 3dc0:A, 1ua7:A
52 2taa:A 478 76 0.0387 0.0481 0.3026 0.006 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
53 2ya1:A 981 323 0.1178 0.0714 0.2167 0.007 2j44:A, 2ya0:A, 2ya2:A
54 6sav:A 438 143 0.0623 0.0845 0.2587 0.009 6sav:B
55 4ayg:A 1028 73 0.0404 0.0233 0.3288 0.010 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
56 1gvi:B 588 179 0.0673 0.0680 0.2235 0.013 1gvi:A
57 1cgt:A 684 56 0.0320 0.0278 0.3393 0.014 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
58 5h06:B 499 130 0.0606 0.0721 0.2769 0.017 5h05:A, 5h05:B, 5h05:C, 5h05:D, 5h06:A, 5h06:C, 5h06:D
59 7lv6:B 559 70 0.0354 0.0376 0.3000 0.017 4m56:A, 4m56:B, 4m8u:A, 4maz:A, 4mb1:A, 5wcz:A, 5wcz:B
60 5m99:A 506 70 0.0370 0.0435 0.3143 0.026 5m99:B
61 3k8k:A 650 73 0.0404 0.0369 0.3288 0.030 6bs6:A, 6bs6:B, 3k8k:B, 3k8l:A, 3k8l:B, 3k8m:A, 3k8m:B
62 8ibk:A 546 66 0.0337 0.0366 0.3030 0.034 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
63 3edd:B 597 157 0.0657 0.0653 0.2484 0.044 3edd:A, 3ede:A, 3ede:B, 3edf:A, 3edf:B, 3edj:A, 3edj:B, 3edk:A, 3edk:B, 1h3g:A, 1h3g:B
64 7jjn:A 514 66 0.0337 0.0389 0.3030 0.046 7jjn:B
65 7jjt:A 513 62 0.0387 0.0448 0.3710 0.046
66 1cdg:A 686 58 0.0370 0.0321 0.3793 0.050 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
67 6y9t:A 536 68 0.0337 0.0373 0.2941 0.061 6y9t:B
68 7zc0:AAA 710 31 0.0253 0.0211 0.4839 0.082
69 1gjw:A 636 80 0.0354 0.0330 0.2625 0.086
70 8slv:A 562 68 0.0354 0.0374 0.3088 0.093
71 1aqh:A 448 83 0.0370 0.0491 0.2651 0.095 1aqm:A, 1b0i:A, 8cqf:A, 8cqg:A, 1g94:A, 1g9h:A, 1jd7:A, 1jd9:A, 1kxh:A, 1l0p:A
72 6li9:A 623 29 0.0219 0.0209 0.4483 0.13 6li9:C, 6lid:A, 6lid:C, 6yup:A, 6yup:C, 6yuz:A, 6yuz:C
73 6k5p:A 531 43 0.0219 0.0245 0.3023 0.15 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
74 1a47:A 683 56 0.0320 0.0278 0.3393 0.16 3bmv:A, 3bmw:A, 1ciu:A
75 7nf6:A 623 29 0.0219 0.0209 0.4483 0.21 7nf7:A, 7nf8:A
76 5zcr:A 725 94 0.0387 0.0317 0.2447 0.23 5zcr:B
77 1lwh:A 441 68 0.0337 0.0454 0.2941 0.35 1lwh:B, 1lwj:A, 1lwj:B
78 1b2y:A 496 100 0.0488 0.0585 0.2900 0.38 3bai:A, 3baj:A, 3bak:A, 3baw:A, 3bax:A, 3bay:A, 3blk:A, 3blp:X, 1bsi:A, 1c8q:A, 1cpu:A, 2cpu:A, 3cpu:A, 3dhp:A, 5e0f:A, 5emy:A, 4gqq:A, 4gqr:A, 1hny:A, 3ij7:A, 3ij8:A, 3ij9:A, 1jxj:A, 1jxk:A, 1kb3:A, 1kbb:A, 1kbk:A, 5kez:A, 1kgu:A, 1kgw:A, 1kgx:A, 1mfu:A, 1mfv:A, 1nm9:A, 6obx:A, 6ocn:A, 3old:A, 3ole:A, 3olg:A, 3oli:A, 1q4n:X, 2qmk:A, 2qv4:A, 1smd:A, 5td4:A, 1u2y:A, 1u30:A, 1u33:A, 5u3a:A, 5va9:A, 5va9:B, 4w93:A, 4x9y:A, 1xcw:A, 1xcx:A, 1xd0:A, 1xd1:A, 1xgz:A, 1xh0:A, 1xh1:A, 1xh2:A, 1xv8:A, 1xv8:B, 1z32:X, 6z8l:A
79 6hvg:A 1278 31 0.0253 0.0117 0.4839 0.39 6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
80 3faw:A 775 264 0.0943 0.0723 0.2121 0.66 3fax:A
81 6aij:A 687 56 0.0320 0.0277 0.3393 0.71 4jcl:A, 6l2h:A, 3wms:A
82 3wy1:A 535 29 0.0219 0.0243 0.4483 0.83 3wy1:B, 3wy2:A, 3wy2:B, 3wy3:A, 3wy3:B, 3wy4:A
83 8swt:A 278 81 0.0354 0.0755 0.2593 1.6 8swt:B
84 6mqe:H 224 42 0.0219 0.0580 0.3095 2.3 6mqe:A
85 4wlc:A 536 66 0.0303 0.0336 0.2727 2.5 4xb3:A, 2zic:A, 2zid:A
86 3fid:A 296 85 0.0421 0.0845 0.2941 2.7 3fid:B
87 3czk:A 618 152 0.0606 0.0583 0.2368 3.1 3czg:A, 3czl:A
88 2cks:B 306 76 0.0303 0.0588 0.2368 3.8 2ckr:B, 2ckr:A, 2cks:A
89 1mxd:A 435 43 0.0269 0.0368 0.3721 6.1 1mwo:A, 1mxg:A
90 2wlt:A 326 41 0.0320 0.0583 0.4634 6.2 2wt4:A
91 2i0m:A 207 38 0.0202 0.0580 0.3158 6.3
92 1amy:A 403 62 0.0320 0.0471 0.3065 6.7 1ava:A, 1ava:B, 1bg9:A
93 3uer:A 651 69 0.0337 0.0307 0.2899 7.1
94 7fd2:B 419 51 0.0236 0.0334 0.2745 7.1 7fd2:F, 7fd2:J, 7fd2:N, 7vga:B, 7vga:E, 7vga:H, 7vga:K, 7wco:K

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218