BioLiP

>protein
THADYLLRTGQVVDISDTIYPRNPAMYSEEARLKSLTPRELASAGLYYTGIGDQVQCFACGGKLKNWEPGDRAWSEHRRH
FPNCFFVLGRNLN

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1c9q:A	117	102	1.0000	0.7949	0.9118	5.64e-65	8aza:C, 1i3o:E, 1i3o:F, 4j3y:A, 4j3y:C, 4j44:A, 4j44:C, 4j45:A, 4j45:C, 4j46:A, 4j46:C, 4j47:A, 4j47:C, 4j48:A, 4j48:C, 4kju:A, 4kju:C, 4kjv:A, 4kjv:C, 4wvs:A, 4wvt:A, 4wvt:B, 4wvu:A
2	7qgj:A	79	75	0.4946	0.5823	0.6133	1.11e-25	7qgj:B
3	1xb0:F	103	78	0.3656	0.3301	0.4359	2.13e-17	1xb0:A, 1xb0:B, 1xb0:C, 1xb0:D, 1xb0:E, 1xb1:A, 1xb1:B, 1xb1:C, 1xb1:D, 1xb1:E, 1xb1:F
4	1f9x:A	117	80	0.3441	0.2735	0.4000	7.45e-17	5c0k:A, 5c0l:A, 5c3h:A, 5c3k:A, 5c7a:A, 5c7b:A, 5c7c:A, 5c7d:A, 5c83:A, 5c84:A, 3clx:D, 3clx:A, 3clx:B, 3clx:C, 3cm2:D, 3cm2:H, 3cm2:A, 3cm2:B, 3cm2:C, 3cm2:G, 3cm2:E, 3cm2:F, 3cm2:I, 3cm2:J, 3cm7:C, 3cm7:A, 3cm7:B, 3cm7:D, 4ec4:A, 4ec4:F, 4ec4:B, 4ec4:G, 4ec4:C, 4ec4:D, 4ec4:K, 4ec4:E, 4ec4:L, 4ec4:J, 3eyl:A, 3eyl:B, 6ey2:A, 6ey2:C, 6ey2:B, 6ey2:G, 6ey2:D, 6ey2:E, 6ey2:F, 6ey2:H, 1g3f:A, 1g73:C, 1g73:D, 3g76:A, 3g76:B, 3g76:C, 3g76:D, 3g76:E, 3g76:F, 3g76:G, 3g76:H, 8gh7:A, 8gh7:B, 6h6q:A, 6h6q:B, 6h6r:A, 3hl5:A, 3hl5:B, 4hy0:A, 4hy0:D, 4hy0:B, 4hy0:G, 4hy0:C, 4hy0:E, 4hy0:F, 4hy0:H, 2jk7:A, 4kmp:A, 4kmp:B, 5m6e:A, 5m6f:A, 5m6h:A, 5m6l:A, 5m6m:A, 1nw9:A, 2opy:A, 2opz:A, 2opz:B, 2opz:C, 2opz:D, 5oqw:A, 5oqw:B, 1tfq:A, 1tft:A, 2vsl:A
5	5yud:A	1238	75	0.3656	0.0275	0.4533	9.73e-17
6	5yud:A	1238	79	0.2903	0.0218	0.3418	9.74e-08
7	7rav:A	773	75	0.3656	0.0440	0.4533	1.46e-16
8	7rav:A	773	69	0.2903	0.0349	0.3913	2.25e-11
9	7rav:A	773	79	0.2903	0.0349	0.3418	1.17e-07
10	3f7g:B	101	77	0.3656	0.3366	0.4416	3.15e-16	3f7g:A, 3f7g:C, 3f7g:D, 3f7g:E, 1oxn:E, 1oxn:A, 1oxn:B, 1oxn:C, 1oxn:D, 1oxq:E, 1oxq:A, 1oxq:B, 1oxq:C, 1oxq:D, 1oy7:E, 1oy7:A, 1oy7:B, 1oy7:C, 1oy7:D
11	2i3h:B	95	77	0.3656	0.3579	0.4416	3.76e-16	3f7h:A, 3f7h:B, 3f7i:A, 3f7i:B, 3gt9:A, 3gt9:B, 3gta:A, 3gta:B, 2i3h:A, 2i3i:A, 2i3i:B, 1tw6:A, 1tw6:B, 3uw5:A, 3uw5:B
12	4kmn:A	103	75	0.3333	0.3010	0.4133	5.64e-16	7trl:A
13	2uvl:B	95	75	0.3226	0.3158	0.4000	1.50e-15	2uvl:A
14	8fvu:A	1361	68	0.3871	0.0265	0.5294	1.51e-15	2vm5:A
15	8fvu:A	1361	69	0.3548	0.0242	0.4783	7.44e-15	2vm5:A
16	8fvu:A	1361	79	0.2796	0.0191	0.3291	5.82e-09	2vm5:A
17	1jd5:A	105	77	0.3226	0.2857	0.3896	1.78e-15	1jd4:A, 1jd4:B, 1jd6:A, 1q4q:G, 1q4q:I, 1q4q:F, 1q4q:H, 1q4q:J, 1q4q:A, 1q4q:C, 1q4q:D, 1q4q:B, 1q4q:E
18	3t6p:A	330	73	0.3226	0.0909	0.4110	5.00e-15	3d9t:A, 3d9t:B, 3d9u:A, 8dsf:A, 8dsf:B, 8dsf:C, 8dsf:D, 8dso:D, 4eb9:A, 4eb9:B, 4eb9:C, 4eb9:D, 6exw:A, 6exw:C, 6hpr:A, 4hy4:A, 4hy4:B, 4hy5:A, 4hy5:B, 4lge:A, 4lge:B, 4lgu:A, 4lgu:B, 5m6n:A, 5m6n:B, 4mti:A, 4mti:B, 3mup:A, 3mup:B, 3mup:C, 3mup:D, 4mu7:A, 4mu7:B, 3oz1:A, 3oz1:B, 3oz1:C, 3oz1:D, 1qbh:A, 7trm:A, 3uw4:A, 6w74:A, 6w7o:C, 6w7o:D, 6w8i:F, 6w8i:D, 6w8i:E
19	3m0d:D	75	52	0.2688	0.3333	0.4808	1.08e-14	3m0a:D, 7nk0:D, 7nk0:E
20	3m1d:A	78	52	0.2581	0.3077	0.4615	1.79e-14	3m1d:B
21	3sip:F	108	73	0.3226	0.2778	0.4110	2.54e-13	1sdz:A, 1se0:A, 3sip:E, 3siq:A, 3siq:B, 3siq:C, 3siq:D, 3siq:E, 3siq:F
22	8atu:A	2837	80	0.3441	0.0113	0.4000	1.01e-11	8atu:B, 8atx:A, 8atx:B, 8auk:A, 8auk:B, 8auw:B
23	8auw:A	2900	80	0.3441	0.0110	0.4000	1.08e-11
24	2pop:D	80	54	0.2581	0.3000	0.4444	2.62e-11	6gjw:A, 6gjw:B, 6gjw:C, 6gjw:D, 4mtz:A, 4mtz:B, 4mtz:C, 4mtz:D, 4oxc:A, 4oxc:B, 4oxc:C, 4oxc:D, 2poi:A, 2pop:B, 6qci:A, 6qci:B, 6qci:C, 6qci:D, 2qra:D, 2qra:C, 2qra:B, 2qra:A
25	1m4m:A	112	56	0.2366	0.1964	0.3929	1.86e-08
26	3ued:C	139	56	0.2151	0.1439	0.3571	1.81e-06	4a0i:A, 4a0i:B, 4a0j:A, 4a0j:B, 4a0n:A, 1e31:A, 1e31:B, 1f3h:A, 1f3h:B, 7lbk:B, 7lbk:A, 7lbo:A, 7lbo:B, 7lbp:A, 7lbp:C, 7lbq:A, 2qfa:A, 2raw:A, 2rax:A, 2rax:E, 2rax:X, 6sho:A, 6sho:B, 3uec:A, 3ued:A, 3uee:A, 3uee:C, 3uef:A, 3uef:C, 3ueg:A, 3ueg:B, 3ueh:A, 3ueh:B, 3uei:A, 3uei:B, 3uig:A, 3uig:B, 3uih:A, 3uih:B, 3uii:A, 3uii:B, 3uij:A, 3uij:B, 3uik:A, 3uik:B, 1xox:A, 1xox:B, 6yie:A, 6yie:D, 6yif:A, 6yih:A
27	2c4m:C	790	71	0.2043	0.0241	0.2676	1.6	2c4m:A, 2c4m:B, 2c4m:D
28	5oj5:A	310	28	0.1183	0.0355	0.3929	2.2	5ojr:A, 5ojr:B
29	3ubl:A	212	37	0.0968	0.0425	0.2432	2.2	3ubl:B
30	7lgm:A	719	34	0.1398	0.0181	0.3824	2.3	7lgm:B
31	4xqk:A	1517	38	0.1398	0.0086	0.3421	2.7	4xqk:B
32	5dz2:A	322	45	0.1613	0.0466	0.3333	5.7	5dz2:B
33	4a7p:A	429	15	0.1075	0.0233	0.6667	6.1	4a7p:B
34	4mca:A	367	28	0.1183	0.0300	0.3929	6.3	4mca:B
35	1wql:A	436	23	0.1075	0.0229	0.4348	7.6
36	7y9i:A	362	44	0.1398	0.0359	0.2955	8.2
37	2d5w:A	602	50	0.1720	0.0266	0.3200	8.7	2d5w:B
38	5wkf:I	198	40	0.1398	0.0657	0.3250	8.7	5wkh:D
39	3sig:A	265	64	0.1935	0.0679	0.2812	9.3	3sii:A

[Back]