BioLiP

>protein
TGVENSGAGPTSFKTMKVIDPQHSDKPNVLILGSGWGAISFLKHIDTKKYNVSIISPRSYFLFTPLLPSAPVGTVDEKSI
IEPIVNFALKKKGNVTYYEAEATSINPDRNTVTIKSLSAPAEIKYDYLISAVGAEPNTFGIPGVTDYGHFLKEIPNSLEI
RRTFAANLEKANLLPKGDPERRRLLSIVVVGGGPTGVEAAGELQDYVHQDLRKFLPALAEEVQIHLVEALPIVLNMFEKK
LSSYAQSHLENTSIKVHLRTAVAKVEEKQLLAKTKHEDGKITEETIPYGTLIWATGNKARPVITDLFKKIPEQNSSKRGL
AVNDFLQVKGSNNIFAIGDNAFAGLPPTAQVAHQEAEYLAKNFDKMAQIPNFQKNLDKIDLLFEENNFKPFKYNDLGALA
YLGSERAIATIRSGKRTFYTGGGLMTFYLWRILYLSMILSARSRLKVFFDWIKLAFFKRDFFKGL

The query sequence (length=465) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5yjy:B	465	465	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5yjw:A, 5yjx:A, 5yjx:B, 5yjy:A
2	4g6h:A	472	472	0.9699	0.9555	0.9555	0.0	4g6g:A, 4g6g:B, 4g6h:B, 4g73:A, 4g73:B, 4g74:A, 4g74:B, 4g9k:A, 4g9k:B, 4gap:A, 4gap:B, 4gav:A, 4gav:B
3	5jwa:A	495	321	0.2602	0.2444	0.3769	4.14e-57	5jwa:H, 5jwb:A, 5jwb:H, 5jwc:A, 5jwc:H
4	5na1:A	398	405	0.2430	0.2839	0.2790	9.77e-35	5na4:A
5	6bdo:D	395	434	0.2538	0.2987	0.2719	9.72e-33	6bdo:B, 6bdo:A, 6bdo:C, 5kmp:A, 5kmp:B, 5kmq:A, 5kmq:B, 5kmq:C, 5kmq:D, 5kmr:B, 5kmr:A, 5kmr:C, 5kmr:D, 5kms:A, 5kms:B, 5kms:C, 5kms:D, 4nwz:A, 4nwz:B, 4nwz:C, 4nwz:D, 5wed:B, 5wed:A, 5wed:C, 5wed:D
6	3hyv:A	429	82	0.0688	0.0746	0.3902	9.66e-07	3hyv:B, 3hyv:C, 3hyv:D, 3hyv:E, 3hyv:F, 3hyw:A, 3hyw:B, 3hyw:C, 3hyw:D, 3hyw:E, 3hyw:F, 3hyx:A, 3hyx:B, 3hyx:C, 3hyx:D, 3hyx:E, 3hyx:F
7	7xpi:A	363	352	0.1785	0.2287	0.2358	1.72e-06	7ytl:A
8	3dh9:A	482	266	0.1462	0.1411	0.2556	3.92e-06	3dgh:A, 3dgh:B, 3dh9:B, 2nvk:X
9	3lxd:A	409	247	0.1376	0.1565	0.2591	2.96e-05
10	6pfz:A	541	275	0.1290	0.1109	0.2182	4.79e-05	6pfz:D, 6pfz:C, 6pfz:B
11	3ict:A	557	244	0.1161	0.0969	0.2213	7.17e-05	3icr:A, 3icr:B, 3ics:A, 3ics:B, 3ict:B
12	3t2z:A	427	269	0.1290	0.1405	0.2230	7.75e-05	3kpk:A, 3sx6:A, 3sxi:A, 3sy4:A, 3syi:A, 3sz0:A, 3szc:A, 3szf:A, 3szw:A, 3t0k:A, 3t14:A, 3t2k:A, 3t2y:A, 3t2z:B, 3t31:A
13	8a1r:A	593	330	0.1591	0.1248	0.2242	1.21e-04	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
14	3h8i:A	356	140	0.0882	0.1152	0.2929	1.50e-04	3h8i:B, 3h8l:A, 3h8l:B
15	1f8w:A	447	131	0.0839	0.0872	0.2977	1.87e-04	1joa:A, 1nhp:A, 1nhq:A, 1nhr:A, 1nhs:A, 1npx:A, 2npx:A
16	8a56:B	539	242	0.1226	0.1058	0.2355	4.08e-04	8a56:A
17	3oc4:A	422	168	0.0989	0.1090	0.2738	0.001	3oc4:B
18	3nt6:A	565	325	0.1656	0.1363	0.2369	0.003	3nt6:B, 3nta:A, 3nta:B, 3ntd:A, 3ntd:B, 4ocg:A, 4ocg:B
19	1lvl:A	458	189	0.1075	0.1092	0.2646	0.004
20	2cdu:A	451	256	0.1333	0.1375	0.2422	0.005	2cdu:B
21	2c3c:A	522	286	0.1419	0.1264	0.2308	0.011	2c3c:B, 2c3d:A, 2c3d:B, 7mgn:A, 7mgn:B, 7mgo:B, 1mo9:A, 1mo9:B, 1mok:A, 1mok:B, 1mok:C, 1mok:D, 3q6j:A, 3q6j:B
22	2r9z:B	453	153	0.0796	0.0817	0.2418	0.021	2r9z:A, 2rab:A, 2rab:B
23	2v3a:A	381	275	0.1462	0.1785	0.2473	0.027	2v3b:A
24	5er0:A	450	268	0.1290	0.1333	0.2239	0.031	5er0:B, 5er0:C, 5er0:D, 5vn0:A, 5vn0:B, 5vn0:C, 5vn0:D, 5vn0:E, 5vn0:F, 5vn0:G, 5vn0:H, 5voh:A, 5voh:B, 5voh:C, 5voh:D
25	6ruz:A	443	254	0.1183	0.1242	0.2165	0.035	6ruz:B, 6ruz:C, 6ruz:D, 6rvb:A, 6rvb:B, 6rvb:C, 6rvb:D, 6rvh:A, 6rvh:B, 6rvh:C, 6rvh:D
26	1ger:B	449	252	0.1548	0.1604	0.2857	0.035	1ger:A, 1ges:A, 1ges:B, 1get:A, 1get:B, 1geu:A, 1geu:B
27	7mgo:A	489	286	0.1419	0.1350	0.2308	0.042
28	3lad:A	472	137	0.0774	0.0763	0.2628	0.044	3lad:B
29	8wik:A	364	74	0.0538	0.0687	0.3378	0.048	8jsc:C
30	6awa:A	475	119	0.0710	0.0695	0.2773	0.087	6awa:B, 5tr3:A, 5tr3:B
31	8k40:A	448	244	0.1290	0.1339	0.2459	0.12	8k40:B, 8k41:A
32	3klj:A	378	117	0.0774	0.0952	0.3077	0.13
33	4fx9:B	443	74	0.0495	0.0519	0.3108	0.19	4fx9:A, 5l1n:A, 5l1n:B
34	1q1w:A	422	104	0.0667	0.0735	0.2981	0.39	3lb8:A, 3lb8:B, 1q1r:A, 1q1r:B, 1q1w:B
35	2hqm:A	461	116	0.0731	0.0738	0.2931	0.45	2hqm:B
36	6mo6:B	414	96	0.0516	0.0580	0.2500	0.46	8dhk:A, 8dhk:B, 6mo6:A, 6mo6:C, 6mo6:D, 6mp5:A, 6mp5:B, 6mp5:C, 6mp5:D, 6oi5:A, 6oi5:B, 6oi6:A, 6oi6:B, 6oib:A, 6oib:B, 6oic:A, 6oic:B, 6wh6:A, 6wh6:B
37	3cgb:A	444	182	0.0860	0.0901	0.2198	0.72	3cgb:B, 3cgc:A, 3cgc:B, 3cgd:A, 3cgd:B, 3cge:A, 3cge:B
38	5h71:B	492	50	0.0344	0.0325	0.3200	0.85	5h6u:A, 5h6u:B, 5h71:A, 1j1n:A, 1j1n:B, 6jhx:A, 6jhx:B, 1kwh:A, 4tqu:Q, 4xig:Q, 4xtc:Q
39	4ylf:B	468	128	0.0839	0.0833	0.3047	0.93	4ylf:D, 4yry:B, 4yry:D
40	1xhc:A	346	117	0.0753	0.1012	0.2991	1.0
41	1ebd:A	455	176	0.0925	0.0945	0.2443	1.3	1ebd:B
42	3ven:A	571	49	0.0323	0.0263	0.3061	1.7	3veo:A, 3ver:A, 3ves:A, 3vet:A, 3vew:A, 3vex:A, 3vez:A, 3vf2:A, 3vf4:A
43	2bc0:A	473	123	0.0839	0.0825	0.3171	2.1	2bc0:B, 2bc1:A, 2bc1:B, 2bcp:A, 2bcp:B
44	6brd:A	474	21	0.0258	0.0253	0.5714	2.3	6brd:B, 6brd:C, 5vqb:A, 5vqb:B, 5vqb:C
45	5wvp:A	924	85	0.0538	0.0271	0.2941	2.4
46	7d5s:RD	265	70	0.0538	0.0943	0.3571	3.2	6lqu:RD, 7suk:NJ, 5wlc:NJ
47	5gzs:A	432	89	0.0602	0.0648	0.3146	4.2
48	2gmh:A	581	63	0.0387	0.0310	0.2857	5.1	2gmh:B, 2gmj:A, 2gmj:B
49	1hyu:A	521	54	0.0430	0.0384	0.3704	5.1	1fl2:A, 4o5q:A, 4o5u:A, 4xvg:A, 4ykf:A, 4ykg:A
50	3fkq:A	354	117	0.0710	0.0932	0.2821	5.3
51	5kow:A	474	21	0.0215	0.0211	0.4762	6.1	6c7s:A, 5kox:A
52	6ihd:B	304	212	0.1075	0.1645	0.2358	6.9	6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
53	3oig:A	260	78	0.0430	0.0769	0.2564	8.3	3oif:A, 3oif:D
54	6i7n:A	490	244	0.1247	0.1184	0.2377	9.5	4adw:A, 4adw:B, 4apn:A, 4apn:B, 5ebk:A, 5ebk:B, 6er5:A, 6i7n:B, 2jk6:A, 2jk6:B, 6t95:A, 6t97:A, 6t98:A, 2w0h:A, 2w0h:B, 2x50:A, 2x50:B, 2yau:A, 2yau:B
55	2nzy:C	351	32	0.0301	0.0399	0.4375	9.8	2nzx:A, 2nzx:B, 2nzx:C, 2nzy:A, 2nzy:B, 5zoi:A, 5zoi:B

[Back]