BioLiP

>protein
TGQNHPFFRRSDSMTFLGCIPPNPFEVPLAEAIPLADQPHLLQPNARKEDLFGRPSQGLYLGGFEVKESKFRREMEKLRN
QQSRDLSLEVDRDRDLLIQQTMRQLNNHFGPMAVHRVKVTFKDEPGEGSGVARSFYTAIAQAFLSNEKLPNLNAPLFYQP
GKRGFYTPRPGKNTEARLNCFRNIGRILGLCLLQNELCPITLNRHVIKVLLGRKVNWHDFAFFDPVMYESLRQLILASQS
SDADAVFSAMDLAFAIDLCKEEGGGQVELIPNGVNIPVTPQNVYEYVRKYAEHRMLVVAEQPLHAMRKGLLDVLPKNSLE
DLTAEDFRLLVNGCGEVNVQMLISFTSFNDESGENAEKLLQFKRWFWSIVEKMSMTERQDLVYFWTSSPSLPASEEGFQP
MPSITIRPPDDQHLPTANTCISRLYVPLYSSKQILKQKLLLAIKTKNFGF

The query sequence (length=450) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8c07:B	450	450	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	8bja:A	1563	464	0.9244	0.2662	0.8966	0.0
3	8bja:B	1638	408	0.8733	0.2399	0.9632	0.0
4	8bja:B	1638	27	0.0556	0.0153	0.9259	2.64e-08
5	8p82:A	1596	417	0.8756	0.2469	0.9448	0.0	8p82:B
6	8p82:A	1596	56	0.1222	0.0345	0.9821	3.30e-30	8p82:B
7	8d4x:B	1669	411	0.8667	0.2337	0.9489	0.0	8c06:A, 8c06:D
8	8d4x:B	1669	60	0.1333	0.0359	1.0000	1.10e-33	8c06:A, 8c06:D
9	8e0q:A	1689	411	0.8667	0.2309	0.9489	0.0	8d4x:A, 8e0q:B
10	8e0q:A	1689	60	0.1333	0.0355	1.0000	1.15e-33	8d4x:A, 8e0q:B
11	8ewi:A	1775	411	0.8667	0.2197	0.9489	0.0	8ewi:B, 8ewi:C, 8ewi:D
12	8ewi:A	1775	60	0.1333	0.0338	1.0000	1.26e-33	8ewi:B, 8ewi:C, 8ewi:D
13	8q0n:B	831	335	0.2422	0.1312	0.3254	2.32e-31
14	9b59:C	377	338	0.2044	0.2440	0.2722	2.18e-30	9b5a:C, 9b5b:C
15	7mop:A	2445	388	0.2222	0.0409	0.2577	1.71e-26	6fyh:A, 6pfl:A, 6pfl:B, 8r7o:A, 8r7o:C, 8rd0:C, 8rd0:D, 8rd1:A, 8rd1:C, 8rd1:D, 8rd7:D, 6xz1:A
16	4lcd:A	419	332	0.1978	0.2124	0.2681	2.33e-26	4lcd:B
17	5c91:A	375	403	0.2378	0.2853	0.2655	4.73e-24	2xbf:A
18	8ei7:A	375	371	0.2000	0.2400	0.2426	5.57e-18	8ei5:A, 8ei5:B, 8ei5:C, 8ei5:D, 8ei6:A, 8ei6:B, 8ei7:B, 8ei8:A
19	8ei4:A	365	326	0.1844	0.2274	0.2546	2.43e-16
20	7qpb:A	106	80	0.0667	0.2830	0.3750	1.69e-08	7qpb:C, 7qpb:B, 7qpb:D, 6tgk:C
21	8rev:A	709	64	0.0422	0.0268	0.2969	0.73
22	8hw0:A	329	89	0.0556	0.0760	0.2809	1.4
23	8c5s:A	924	40	0.0311	0.0152	0.3500	3.7	8ap1:A, 8att:A, 8atv:A, 8atw:A, 8c5u:A, 8q63:A, 6ymw:A
24	6ymv:A	887	40	0.0311	0.0158	0.3500	3.9
25	4bac:A	368	88	0.0489	0.0598	0.2500	5.9	7adu:A, 7adv:A, 7adv:B, 4bac:B, 4bdy:A, 4bdz:A, 4be0:A, 4be1:A, 4be1:B, 4be2:A, 4be2:B, 3dlr:A, 4e7h:A, 4e7i:A, 4e7i:B, 4e7j:A, 4e7k:A, 4e7k:B, 4e7l:A, 4e7l:B, 5frm:A, 5frn:A, 5fro:A, 5fro:B, 4ikf:A, 3l2q:A, 3l2r:A, 3l2r:B, 3l2u:A, 3l2u:B, 3l2v:A, 3l2v:B, 3l2w:A, 3l2w:B, 5mma:A, 5mma:B, 5mmb:A, 5mmb:B, 5no1:A, 5no1:B, 3os0:A, 3os0:B, 3os1:A, 3os1:B, 3os2:A, 3oy9:A, 3oy9:B, 3oya:A, 3oya:B, 3oyb:A, 3oyb:B, 3oyc:A, 3oyd:A, 3oyd:B, 3oye:A, 3oye:B, 3oyf:A, 3oyf:B, 3oyg:A, 3oyg:B, 3oyh:A, 3oyh:B, 3oyi:A, 3oyi:B, 3oyj:A, 3oyj:B, 3oyk:A, 3oyk:B, 3oyl:A, 3oyl:B, 3oym:A, 3oym:B, 3oyn:A, 6rny:K, 6rny:O, 3s3m:A, 3s3n:A, 3s3o:A, 5uop:A, 5uoq:A, 2x6n:A, 2x6n:B, 2x6n:C, 2x6n:D, 2x6n:E, 2x6n:F, 2x6s:A, 2x6s:B, 2x6s:C, 2x6s:D, 2x6s:E, 2x6s:F, 4ztf:A, 4ztj:A
26	6xyw:Aj	155	111	0.0600	0.1742	0.2432	6.0
27	1s4m:A	277	68	0.0400	0.0650	0.2647	9.3	1s4m:B, 1t6x:A, 1t6x:B, 1t6y:A, 1t6y:B, 1t6z:A, 1t6z:B

[Back]