Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TGLLDGKRILVSGIITDSSIAFHIARVAQEQGAQLVLTGFDRLRLIQRITDRLPAKAPLLELDVQNEEHLASLAGRVTEA
IGAGNKLDGVVHSIGFMPQTGMGINPFFDAPYADVSKGIHISAYSYASMAKALLPIMNPGGSIVGMDFDPSRAMPAYNWM
TVAKSALESVNRFVAREAGKYGVRSNLVAAGPIRTGWDQRAPIGWNMKDATPVAKTVCALLSDWLPATTGDIIYADGGAH
TQLL

The query sequence (length=244) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2b35:C 248 248 1.0000 0.9839 0.9839 6.07e-180 2b35:B, 2b35:D, 2b36:C, 2b36:D, 2b37:A, 2b37:B, 2b37:F, 4bqp:F, 5cpb:B, 5g0v:C, 5oiq:C, 4qxm:G, 6r9w:F
2 2aqh:A 268 268 0.9959 0.9067 0.9067 5.68e-177 2aq8:A, 2aqi:A, 2aqk:A, 2b35:A, 2b35:E, 2b35:F, 2b36:A, 2b36:B, 2b36:E, 2b36:F, 2b37:C, 2b37:D, 2b37:E, 4bge:A, 4bge:B, 4bge:C, 4bge:D, 4bge:E, 4bge:F, 4bgi:A, 4bgi:B, 4bgi:C, 4bgi:D, 4bgi:E, 4bgi:F, 4bii:A, 4bii:B, 4bii:C, 4bii:D, 4bqp:A, 4bqp:B, 4bqp:C, 4bqp:D, 4bqp:E, 4bqr:A, 4bqr:B, 4bqr:C, 4bqr:D, 1bvr:A, 1bvr:B, 1bvr:C, 1bvr:D, 1bvr:E, 1bvr:F, 4cod:B, 4cod:D, 4cod:F, 4cod:H, 5coq:A, 5coq:B, 5coq:C, 5coq:D, 5cp8:A, 5cpb:A, 5cpb:C, 5cpb:D, 5cpb:E, 5cpb:F, 5cpf:A, 5cpf:B, 5cpf:C, 5cpf:D, 4d0r:A, 4d0s:A, 4d0s:B, 4d0s:C, 4d0s:D, 4dqu:A, 4dre:A, 4dti:A, 7e48:A, 7e48:B, 7e48:C, 7e48:D, 1eny:A, 1enz:A, 6ep8:A, 3fne:A, 3fne:B, 3fne:C, 3fne:D, 3fnf:A, 3fnf:B, 3fnf:C, 3fnf:D, 3fng:A, 3fnh:A, 5g0s:A, 5g0s:B, 5g0s:C, 5g0s:D, 5g0t:A, 5g0t:B, 5g0t:C, 5g0t:D, 5g0u:A, 5g0u:B, 5g0u:C, 5g0u:D, 5g0v:A, 5g0v:B, 5g0v:D, 5g0w:A, 5g0w:B, 5g0w:C, 5g0w:D, 2h9i:A, 2idz:A, 2ie0:A, 2ieb:A, 5jfo:A, 5jfo:B, 5jfo:C, 5jfo:D, 7kxa:A, 5mtp:A, 5mtp:B, 5mtp:E, 5mtp:G, 5mtp:C, 5mtp:D, 5mtp:F, 5mtp:H, 5mtq:A, 5mtq:B, 5mtq:E, 5mtq:G, 5mtq:C, 5mtq:D, 5mtq:F, 5mtq:H, 5mtr:A, 5mtr:B, 5mtr:E, 5mtr:G, 5mtr:C, 5mtr:D, 5mtr:F, 5mtr:H, 2nsd:A, 2nsd:B, 2ntj:A, 2ntj:B, 2nv6:A, 3oew:A, 3oey:A, 3of2:A, 4ohu:A, 4ohu:B, 4ohu:C, 4ohu:D, 4oim:A, 5oic:A, 5oif:A, 5oif:B, 5oil:A, 5oim:A, 5oin:A, 5oin:B, 5oin:C, 5oin:D, 5oio:A, 5oio:B, 5oip:A, 5oiq:A, 5oiq:B, 5oiq:D, 5oir:A, 5ois:B, 5ois:D, 5ois:F, 5ois:H, 5oit:B, 5oit:D, 5oit:F, 5oit:H, 8otl:A, 8otl:B, 8otl:C, 8otl:D, 8otl:E, 8otl:F, 8otm:A, 8otm:C, 8otm:B, 8otm:D, 8otn:A, 8otn:B, 8otn:C, 8otn:D, 4oxk:A, 4oxk:B, 4oxk:C, 4oxk:D, 4oxn:A, 4oxn:B, 4oxy:A, 4oxy:B, 4oxy:C, 4oxy:D, 4oyr:A, 4oyr:B, 4oyr:C, 4oyr:D, 1p44:A, 1p44:B, 1p44:C, 1p44:D, 1p44:E, 1p44:F, 1p45:A, 1p45:B, 2pr2:A, 4qxm:A, 4qxm:C, 4qxm:E, 4r9r:A, 4r9r:C, 4r9r:E, 4r9r:G, 4r9s:A, 4r9s:C, 4r9s:E, 4r9s:G, 6r9w:A, 6r9w:B, 6r9w:C, 6r9w:D, 6r9w:E, 6sq5:A, 6sq7:A, 6sq9:A, 6sqb:A, 6sqd:A, 6sql:A, 4trj:A, 4trn:A, 4tro:A, 4tzk:A, 4tzt:A, 4u0j:A, 4u0k:A, 5ugs:A, 5ugs:B, 5ugs:E, 5ugs:G, 5ugs:C, 5ugs:D, 5ugt:A, 5ugt:B, 5ugt:E, 5ugt:G, 5ugu:A, 4uvd:A, 4uve:A, 4uvg:A, 4uvh:A, 4uvh:B, 4uvh:C, 4uvh:D, 4uvi:A, 4uvi:B, 4uvi:C, 4uvi:D, 5vrl:A, 5vrm:A, 5vrm:B, 5vrm:C, 5vrm:D, 5vrn:A, 5vrn:B, 5vrn:C, 5vrn:D, 5vrn:E, 5vrn:F, 5w07:A, 2x22:A, 2x22:B, 2x23:A, 2x23:B, 2x23:E, 2x23:G, 6yuu:A, 1zid:A
3 7l6c:B 268 267 0.8811 0.8022 0.8052 2.57e-159 7l6c:A, 7l6c:C, 7l6c:D, 7u0m:A, 7u0m:B
4 2ntv:A 268 267 0.9016 0.8209 0.8240 2.35e-158 2ntv:B, 6q1y:A
5 7k73:A 268 267 0.8852 0.8060 0.8090 4.64e-157 7k73:C, 7k73:E, 7k73:G, 7u0o:A, 7u0o:B
6 4m87:A 257 260 0.3689 0.3502 0.3462 1.77e-32 4m87:B, 4m89:A, 4m89:B
7 5i9n:A 261 255 0.3443 0.3218 0.3294 5.10e-32 4bku:A, 5i7f:B, 5i7f:E, 5i7f:H, 5i7f:C, 5i7f:A, 5i7f:F, 5i7f:G, 5i7f:D, 5i7f:I, 5i7f:K, 5i7f:L, 5i7f:J, 5i7s:A, 5i7v:A, 5i7v:B, 5i7v:C, 5i8w:A, 5i8z:A, 5i9l:A, 5i9m:A, 5i9m:B, 5i9m:C, 5ifl:B, 5ifl:A, 5ifl:C, 5ifl:D, 5ifl:E, 5ifl:F, 5ifl:G, 5ifl:H, 5ifl:I, 5ifl:J, 5ifl:K, 5ifl:L, 5ifl:M, 5ifl:N, 5ifl:O, 5ifl:P, 4rlh:A, 4rlh:B, 4rlh:D, 4rlh:C, 5trt:A, 5trt:B, 5trt:C, 5trt:D
8 2wyw:A 259 253 0.3484 0.3282 0.3360 5.25e-32 2wyv:B, 2wyv:D, 2wyw:B, 2wyw:C, 2wyw:D, 2yw9:D, 2yw9:H
9 7umw:B 260 254 0.3525 0.3308 0.3386 1.87e-31 1c14:A, 1c14:B, 5cg1:A, 5cg1:B, 5cg2:A, 5cg2:B, 4cv2:A, 4cv2:B, 4cv3:A, 4cv3:B, 4d46:A, 4d46:B, 1d8a:A, 1d8a:B, 1dfg:A, 1dfg:B, 1dfh:A, 1dfh:B, 1dfi:A, 1dfi:B, 1dfi:C, 1dfi:D, 1i2z:A, 1i2z:B, 1i30:A, 1i30:B, 4jqc:A, 4jqc:B, 4jx8:A, 4jx8:B, 1lx6:A, 1lx6:B, 1lxc:A, 1lxc:B, 1mfp:A, 1mfp:B, 3pjd:A, 3pjd:B, 3pje:A, 3pje:B, 3pjf:A, 3pjf:B, 1qg6:A, 1qg6:B, 1qg6:C, 1qg6:D, 1qsg:A, 1qsg:B, 1qsg:C, 1qsg:D, 1qsg:E, 1qsg:F, 1qsg:G, 1qsg:H, 7um8:A, 7um8:B, 7umw:A
10 4j3f:A 259 260 0.3566 0.3359 0.3346 6.37e-31 4j1n:A, 4j1n:B, 4j3f:B, 4j3f:C, 4j3f:D, 4j3f:E, 4j3f:F, 4j3f:G, 4j3f:H, 4j4t:A, 4j4t:B, 4j4t:C, 4j4t:D, 4j4t:E, 4j4t:F, 4j4t:G, 4j4t:H, 2jjy:D, 3nrc:A, 3nrc:B, 3uic:A, 3uic:B, 3uic:C, 3uic:D, 3uic:E, 3uic:F, 3uic:G, 3uic:H, 3uic:I, 3uic:J, 3uic:K, 3uic:L, 3uic:M, 3uic:N, 3uic:O, 3uic:P
11 2pd3:A 274 256 0.3361 0.2993 0.3203 1.74e-30 8jfm:A, 8jfm:B, 8jfm:C, 8jfm:D, 8jfm:E, 8jfm:F, 8jfm:G, 8jfm:H, 8jfn:A, 2pd3:B, 2pd3:C, 2pd3:D, 2pd4:A, 2pd4:B, 2pd4:C, 2pd4:D
12 6ah9:A 260 263 0.3525 0.3308 0.3270 1.35e-28 6ahe:A, 6ahe:D, 6ahe:C, 6ahe:B, 6k23:A, 6k23:B, 6k23:C, 6k23:D, 7umx:A, 7umx:B, 7umx:C, 7umx:D, 7umx:E, 7umx:F, 7umy:A, 7umy:B, 7umy:C, 7umy:D, 7umy:E, 7umy:F, 4zju:A
13 3ojf:A 257 256 0.3238 0.3074 0.3086 1.79e-28 3ojf:D, 3ojf:B, 3ojf:C, 2qio:A, 2qio:B, 2qio:C, 2qio:D, 5ycr:A, 5ycr:B, 5ycr:C, 5ycr:D, 5ycs:A, 5ycs:B, 5ycs:C, 5ycs:D
14 7fcm:B 269 262 0.3402 0.3086 0.3168 6.38e-28 7f44:A, 7fcm:A
15 5koi:A 271 259 0.3484 0.3137 0.3282 3.70e-27 5koi:B, 5koi:C, 5koi:D, 5koi:E, 5koi:F, 5koi:G, 5koi:H
16 4cv1:H 263 255 0.3361 0.3118 0.3216 2.64e-26 4ali:A, 4ali:B, 4ali:C, 4ali:D, 4ali:E, 4ali:F, 4ali:G, 4ali:H, 4alj:A, 4alj:B, 4alj:C, 4alj:D, 4alj:E, 4alj:F, 4alj:G, 4alj:H, 4alk:A, 4alk:B, 4alk:C, 4alk:D, 4alk:E, 4alk:F, 4alk:G, 4alk:H, 4all:A, 4all:B, 4all:C, 4all:D, 4bnf:A, 4bnf:B, 4bnf:C, 4bnf:D, 4bnf:E, 4bnf:F, 4bnf:G, 4bnf:H, 4bng:A, 4bng:B, 4bng:C, 4bng:D, 4bng:E, 4bng:F, 4bng:G, 4bng:H, 4bnh:A, 4bnh:B, 4bnh:C, 4bnh:D, 4bnh:F, 4bnh:E, 4bnh:G, 4bnh:H, 4bni:E, 4bni:A, 4bni:B, 4bni:C, 4bni:D, 4bni:F, 4bni:G, 4bni:H, 4bnj:A, 4bnj:B, 4bnj:C, 4bnj:D, 4bnj:E, 4bnj:F, 4bnj:G, 4bnj:H, 4bnk:A, 4bnk:F, 4bnk:B, 4bnk:C, 4bnk:D, 4bnk:E, 4bnk:G, 4bnk:H, 4bnl:A, 4bnl:B, 4bnl:C, 4bnl:D, 4bnl:E, 4bnl:F, 4bnl:G, 4bnl:H, 4bnm:A, 4bnm:B, 4bnm:C, 4bnm:D, 4bnm:E, 4bnm:F, 4bnm:G, 4bnm:H, 4bnn:A, 4bnn:B, 4bnn:C, 4bnn:D, 4bnn:E, 4bnn:F, 4bnn:G, 4bnn:H, 4cuz:A, 4cuz:B, 4cuz:C, 4cuz:D, 4cuz:E, 4cuz:F, 4cuz:G, 4cuz:H, 4cv0:A, 4cv0:B, 4cv0:C, 4cv0:D, 4cv1:A, 4cv1:B, 4cv1:C, 4cv1:D, 4cv1:E, 4cv1:F, 4cv1:G, 4d41:A, 4d41:B, 4d41:C, 4d41:D, 4d41:E, 4d41:F, 4d41:G, 4d41:H, 4d42:A, 4d42:B, 4d42:F, 4d42:C, 4d42:D, 4d42:E, 4d42:G, 4d42:H, 4d43:A, 4d43:B, 4d43:C, 4d43:D, 4d43:E, 4d43:F, 4d43:G, 4d43:H, 4d44:A, 4d44:B, 4d44:C, 4d44:D, 4d44:E, 4d44:F, 4d44:G, 4d44:H, 4d45:A, 4d45:B, 4d45:C, 4d45:D, 4d45:E, 4d45:F, 4d45:G, 4d45:H, 4fs3:A, 3gr6:A, 3gr6:D, 3gr6:G, 3gr6:J, 4nz9:A, 4nz9:B, 6tbb:A, 6tbb:B, 6tbb:C, 6tbb:D, 6tbb:E, 6tbb:F, 6tbb:G, 6tbb:H, 6tbc:A, 6tbc:B, 6tbc:C, 6tbc:D, 6tbc:E, 6tbc:F, 6tbc:G, 6tbc:H, 6yur:A, 6yur:B, 6yur:C, 6yur:D, 6yur:E, 6yur:F, 6yur:G, 6yur:H
17 3oig:A 260 257 0.3156 0.2962 0.2996 3.03e-26 3oif:A, 3oif:D
18 3k31:A 262 255 0.3033 0.2824 0.2902 3.09e-26
19 5tf4:D 268 262 0.3238 0.2948 0.3015 2.10e-23 5tf4:A, 5tf4:B, 5tf4:C, 5tf4:E, 5tf4:F
20 4nk5:A 258 257 0.3156 0.2984 0.2996 3.09e-22 4nk5:C, 4nk5:D, 4nk5:E
21 7fc8:A 243 260 0.3197 0.3210 0.3000 7.32e-22
22 4nr0:C 261 267 0.3402 0.3180 0.3109 1.09e-21 4nr0:A, 4nr0:B, 4nr0:D
23 6vly:A 293 255 0.3197 0.2662 0.3059 1.12e-16 6vly:B, 6vly:C, 6vly:D
24 1d7o:A 297 287 0.3279 0.2694 0.2787 8.82e-15 1cwu:A, 1cwu:B, 1eno:A, 1enp:A
25 4q9n:A 295 285 0.3156 0.2610 0.2702 1.38e-13 4q9n:B, 4q9n:C, 4q9n:D, 4q9n:E, 4q9n:F, 4q9n:G, 4q9n:H
26 2o2s:A 303 141 0.1926 0.1551 0.3333 1.82e-12 3nj8:A, 3nj8:B, 4o1m:A, 4o1m:B, 4o1m:C, 4o1m:D, 4o1m:E, 4o1m:F, 2o2s:B
27 3f4b:B 289 219 0.2500 0.2111 0.2785 2.40e-11 3f4b:A, 3f4b:C, 3f4b:D
28 2o2y:C 293 239 0.2459 0.2048 0.2510 1.08e-09 3am3:A, 3am3:B, 3am4:A, 3am4:B, 3am5:A, 3am5:B, 2foi:A, 2foi:C, 2foi:B, 2foi:D, 4ige:A, 4ige:B, 4igf:A, 4igf:B, 3lsy:A, 3lsy:B, 3lt0:A, 3lt0:B, 3lt1:A, 3lt1:B, 3lt2:A, 3lt2:B, 3lt4:A, 3lt4:B, 1nhg:A, 1nhg:B, 1nhw:A, 1nhw:B, 1nnu:A, 1nnu:B, 2nq8:A, 2nq8:C, 2nq8:B, 2nq8:D, 2o2y:A, 2o2y:B, 2o2y:D, 2ol4:A, 2ol4:B, 2oos:A, 2oos:B, 2op0:B, 2op1:A, 2op1:B, 1uh5:A, 1uh5:B, 1v35:A, 1v35:B, 1vrw:A, 1vrw:B, 1zsn:A, 1zsn:B, 1zw1:A, 1zw1:B, 1zxb:A, 1zxb:B, 1zxl:A, 1zxl:B
29 5t2u:A 241 255 0.2828 0.2863 0.2706 4.51e-09 5t2u:B, 5t2u:C, 5t2u:D
30 1vl8:B 252 258 0.2500 0.2421 0.2364 5.72e-09 1vl8:A
31 5thq:B 250 195 0.2131 0.2080 0.2667 8.99e-08 5thq:G, 5thq:C, 5thq:F, 5thq:A, 5thq:E, 5thq:H, 5thq:D, 5tii:E, 5tii:B, 5tii:F
32 7krm:C 244 252 0.2664 0.2664 0.2579 1.60e-06 7krm:A, 7krm:B, 7krm:D
33 7ucw:B 281 87 0.1148 0.0996 0.3218 1.80e-06 7ucw:A, 7ucw:C, 7ucw:D
34 3ijr:F 290 254 0.2418 0.2034 0.2323 7.63e-06 3i3o:A, 3i3o:B, 3i3o:C, 3i3o:D, 3i3o:E, 3i3o:F, 3i3o:H, 3ijr:A, 3ijr:B, 3ijr:C, 3ijr:D, 3ijr:E, 3ijr:G, 3ijr:H
35 8dt1:C 259 151 0.1803 0.1699 0.2914 9.79e-06 8dt1:A, 8dt1:B, 8dt1:D
36 5ha5:D 244 253 0.2746 0.2746 0.2648 5.03e-05 5ha5:B, 5ha5:C
37 3r3s:A 292 220 0.2049 0.1712 0.2273 1.06e-04 3r3s:B, 3r3s:C, 3r3s:D
38 7pcs:B 247 229 0.2377 0.2348 0.2533 1.23e-04 7pcs:D
39 5izc:C 241 92 0.1270 0.1286 0.3370 1.84e-04 6gd0:C, 6how:C, 5jcj:C, 5jdc:C, 3jq7:C, 5k6a:C, 6rx0:C, 6rx5:C, 6tbx:C
40 2c7v:C 260 100 0.1352 0.1269 0.3300 1.93e-04 3bmc:A, 3bmc:B, 3bmc:C, 3bmc:D, 3bmn:A, 3bmn:B, 3bmn:C, 3bmn:D, 3bmo:A, 3bmo:B, 3bmo:C, 3bmo:D, 3bmq:A, 3bmq:B, 3bmq:C, 3bmq:D, 2c7v:A, 2c7v:B, 2c7v:D, 4cl8:A, 4cl8:B, 4cl8:C, 4cl8:D, 4cld:A, 4cld:B, 4cld:C, 4cld:D, 4cle:A, 4cle:B, 4cle:C, 4cle:D, 4clh:A, 4clh:B, 4clh:C, 4clh:D, 4clo:A, 4clo:B, 4clo:C, 4clo:D, 4clr:A, 4clr:B, 4clr:C, 4clr:D, 4clx:A, 4clx:B, 4clx:C, 4clx:D, 4cm1:A, 4cm1:B, 4cm1:C, 4cm1:D, 4cm3:A, 4cm3:B, 4cm3:C, 4cm3:D, 4cm4:A, 4cm4:B, 4cm4:C, 4cm4:D, 4cm5:A, 4cm5:B, 4cm5:C, 4cm5:D, 4cm6:A, 4cm6:B, 4cm6:C, 4cm6:D, 4cm7:A, 4cm7:B, 4cm7:C, 4cm7:D, 4cm8:A, 4cm8:B, 4cm8:C, 4cm8:D, 4cm9:A, 4cm9:B, 4cm9:C, 4cm9:D, 4cma:A, 4cma:B, 4cma:C, 4cma:D, 4cmb:A, 4cmb:B, 4cmb:C, 4cmb:D, 4cmc:A, 4cmc:B, 4cmc:C, 4cmc:D, 4cme:A, 4cme:B, 4cme:C, 4cme:D, 4cmg:A, 4cmg:B, 4cmg:C, 4cmg:D, 4cmi:A, 4cmi:B, 4cmi:C, 4cmi:D, 4cmj:A, 4cmj:B, 4cmj:C, 4cmj:D, 4cmk:A, 4cmk:B, 4cmk:C, 4cmk:D, 6gck:A, 6gck:B, 6gck:C, 6gck:D, 6gcl:A, 6gcl:B, 6gcl:C, 6gcl:D, 6gcp:A, 6gcp:B, 6gcp:C, 6gcp:D, 6gcq:A, 6gcq:B, 6gcq:C, 6gcq:D, 6gd0:A, 6gd0:B, 6gd0:D, 6gd4:A, 6gd4:B, 6gd4:C, 6gd4:D, 6gdo:A, 6gdo:B, 6gdo:C, 6gdo:D, 6gdp:A, 6gdp:B, 6gdp:C, 6gdp:D, 6gex:A, 6gex:B, 6gex:C, 6gex:D, 6gey:A, 6gey:B, 6gey:C, 6gey:D, 3gn1:A, 3gn1:B, 3gn1:C, 3gn1:D, 3gn2:A, 3gn2:B, 3gn2:C, 3gn2:D, 6hnc:A, 6hnc:B, 6hnc:C, 6hnc:D, 6hnr:A, 6hnr:B, 6hnr:C, 6hnr:D, 6how:A, 6how:B, 6how:D, 5izc:A, 5izc:B, 5izc:D, 5jcj:A, 5jcj:B, 5jcj:D, 5jcx:A, 5jcx:B, 5jcx:D, 5jdc:A, 5jdc:B, 5jdc:D, 5jdi:A, 5jdi:B, 5jdi:C, 5jdi:D, 3jq6:A, 3jq6:B, 3jq6:C, 3jq6:D, 3jq7:A, 3jq7:B, 3jq7:D, 3jq8:A, 3jq8:B, 3jq8:C, 3jq8:D, 3jq9:A, 3jq9:B, 3jq9:C, 3jq9:D, 3jqa:A, 3jqa:B, 3jqa:C, 3jqa:D, 3jqb:A, 3jqb:B, 3jqb:C, 3jqb:D, 3jqc:A, 3jqc:B, 3jqc:C, 3jqc:D, 3jqd:A, 3jqd:B, 3jqd:C, 3jqd:D, 3jqe:A, 3jqe:B, 3jqe:C, 3jqe:D, 3jqf:A, 3jqf:B, 3jqf:C, 3jqf:D, 3jqg:A, 3jqg:B, 3jqg:C, 3jqg:D, 5k6a:A, 5k6a:B, 5k6a:D, 3mcv:A, 3mcv:B, 3mcv:C, 3mcv:D, 8of2:A, 8of2:B, 8of2:C, 8of2:D, 7opj:A, 7opj:B, 7opj:C, 7opj:D, 6rx0:A, 6rx0:B, 6rx0:D, 6rx5:A, 6rx5:B, 6rx5:D, 6rx6:A, 6rx6:B, 6rx6:C, 6rx6:D, 6tbx:A, 6tbx:B, 6tbx:D, 2vz0:A, 2vz0:B, 2vz0:C, 2vz0:D, 4wcd:A, 4wcd:B, 4wcd:D, 4wcf:A, 4wcf:B, 4wcf:C, 4wcf:D, 2wd7:A, 2wd7:B, 2wd7:C, 2wd7:D, 2wd8:A, 2wd8:B, 2wd8:C, 2wd8:D, 2x9g:A, 2x9g:B, 2x9g:C, 2x9g:D, 2x9n:A, 2x9n:B, 2x9n:C, 2x9n:D, 2x9v:A, 2x9v:B, 2x9v:C, 2x9v:D, 2yhi:A, 2yhi:B, 2yhi:C, 2yhi:D, 2yhu:A, 2yhu:B, 2yhu:C, 2yhu:D
41 1yxm:B 283 260 0.2664 0.2297 0.2500 2.75e-04
42 1xhl:A 274 207 0.2049 0.1825 0.2415 2.89e-04 1xhl:B
43 1x1t:A 236 242 0.2459 0.2542 0.2479 3.74e-04 2ztu:A
44 1w6u:A 288 86 0.1107 0.0938 0.3140 4.73e-04 1w6u:B, 1w6u:C, 1w6u:D, 1w73:A, 1w73:B, 1w73:C, 1w73:D, 1w8d:A, 1w8d:B, 1w8d:C, 1w8d:D
45 7emg:B 243 251 0.2500 0.2510 0.2430 4.98e-04 7emg:A
46 1xkq:A 272 198 0.1926 0.1728 0.2374 5.10e-04 1xkq:B, 1xkq:C, 1xkq:D
47 6oz7:A 242 188 0.1926 0.1942 0.2500 0.001
48 8ijg:C 250 259 0.2746 0.2680 0.2587 0.002 8ij6:A, 8ij6:B, 8ij6:C, 8ij6:D, 8ijg:A, 8ijg:B, 8ijg:D
49 6zyz:A 259 256 0.2582 0.2432 0.2461 0.002 6zyz:B, 6zyz:C, 6zyz:D, 6zzt:C
50 6jha:A 242 198 0.2172 0.2190 0.2677 0.003 6jhb:A
51 7wbc:A 250 263 0.2541 0.2480 0.2357 0.005 7wbc:B
52 6y4d:A 257 150 0.1557 0.1479 0.2533 0.006 6y4d:B
53 4fc6:B 276 256 0.2377 0.2101 0.2266 0.006 4fc6:A, 4fc6:C, 4fc6:D, 4fc7:A, 4fc7:B, 4fc7:C, 4fc7:D
54 4bo4:C 255 145 0.1639 0.1569 0.2759 0.008 4ag3:A, 4ag3:B, 4ag3:C, 4bnt:B, 4bnt:C, 4bnt:D, 4bnu:A, 4bnu:B, 4bnu:C, 4bnu:D, 4bnv:A, 4bnv:B, 4bnv:C, 4bnv:D, 4bnx:A, 4bnx:B, 4bnx:C, 4bnx:D, 4bny:A, 4bny:B, 4bny:C, 4bny:D, 4bnz:A, 4bnz:B, 4bnz:C, 4bnz:D, 4bo0:A, 4bo0:B, 4bo0:C, 4bo0:D, 4bo1:A, 4bo1:B, 4bo1:C, 4bo1:D, 4bo2:A, 4bo2:B, 4bo2:C, 4bo2:D, 4bo3:A, 4bo3:B, 4bo3:C, 4bo3:D, 4bo4:A, 4bo4:B, 4bo4:D, 4bo5:A, 4bo5:B, 4bo5:C, 4bo5:D, 4bo6:A, 4bo6:B, 4bo6:C, 4bo6:D, 4bo7:A, 4bo7:B, 4bo7:C, 4bo7:D, 4bo8:A, 4bo8:B, 4bo8:C, 4bo8:D, 4bo9:A, 4bo9:B, 4bo9:C, 4bo9:D
55 5jyd:B 292 200 0.2049 0.1712 0.2500 0.009 5jyd:A, 5jyd:C, 5jyd:D, 5jyd:E, 5jyd:F, 5jyd:G, 5jyd:H, 5u8p:A, 5u8p:B
56 4fn4:A 254 221 0.2090 0.2008 0.2308 0.011 4fn4:B, 4fn4:C, 4fn4:D
57 5b4t:A 260 200 0.1844 0.1731 0.2250 0.011 5b4u:A, 5b4v:A, 3vdq:A, 3vdq:B, 3vdq:C, 3vdq:D, 3vdr:A, 3vdr:B, 3vdr:C, 3vdr:D, 3w8d:A, 3w8e:A, 3w8f:A
58 6t77:A 244 254 0.2705 0.2705 0.2598 0.011 1q7b:A, 1q7b:D, 1q7b:B, 1q7b:C, 1q7c:A, 1q7c:B, 6t5x:A, 6t5x:B, 6t77:B
59 6jhb:B 264 202 0.2213 0.2045 0.2673 0.016 6jha:B
60 5el0:A 223 181 0.1762 0.1928 0.2376 0.016
61 4eso:B 251 170 0.1803 0.1753 0.2588 0.018 4eso:A, 4eso:C, 4eso:D
62 2ekp:A 238 100 0.1189 0.1218 0.2900 0.020
63 1a27:A 285 151 0.1516 0.1298 0.2450 0.026 6cgc:A, 6cgc:B, 6cge:A, 6cge:B, 3dey:X, 1dht:A, 3dhe:A, 6dtp:A, 1equ:A, 1equ:B, 1fds:A, 1fdt:A, 1fdu:A, 1fdu:B, 1fdu:C, 1fdu:D, 1fdv:A, 1fdv:B, 1fdv:C, 1fdv:D, 1fdw:A, 3hb4:X, 3hb5:X, 1i5r:A, 1iol:A, 1jtv:A, 3klm:X, 3klp:X, 3km0:A, 3km0:B, 6mnc:B, 6mne:A, 6mne:B, 1qyv:A, 1qyw:A, 1qyx:A, 7x3z:A, 7x3z:B
64 6k8w:A 545 219 0.2377 0.1064 0.2648 0.029 6k8w:B
65 4cqm:F 241 107 0.1189 0.1203 0.2710 0.031 4cqm:B, 4cqm:C, 4cqm:G, 4cqm:J, 4cqm:K, 4cqm:N, 4cqm:O
66 4gkb:B 258 214 0.2008 0.1899 0.2290 0.031 4gkb:A, 4gkb:C, 4glo:A, 4glo:B, 4glo:C, 4glo:D, 4gvx:A, 4gvx:B, 4gvx:C, 4gvx:D
67 3tsc:A 271 196 0.2131 0.1919 0.2653 0.039 3tsc:B, 3tsc:C, 3tsc:D
68 1mxh:A 248 95 0.1107 0.1089 0.2842 0.041 1mxf:A, 1mxf:B, 1mxf:C, 1mxf:D, 1mxh:B, 1mxh:C, 1mxh:D
69 2bgl:A 267 216 0.2213 0.2022 0.2500 0.066 2bgm:A
70 6ds1:B 260 242 0.2336 0.2192 0.2355 0.069 6ds1:A, 6ds1:C, 6ds1:D
71 5itv:D 227 191 0.1803 0.1938 0.2304 0.072
72 2ewm:B 247 195 0.1926 0.1903 0.2410 0.072 2ewm:A
73 5ff9:B 257 132 0.1434 0.1362 0.2652 0.078 5feu:A, 5ff9:A, 5ff9:C, 5ff9:D, 5fff:A, 5fff:B
74 6ach:A 364 54 0.0697 0.0467 0.3148 0.080 6ach:B, 6ach:C, 6ach:D, 6ach:E, 6ach:F, 6ach:G, 6ach:H
75 5z2l:K 244 82 0.1270 0.1270 0.3780 0.100 5z2l:A, 5z2l:D, 5z2l:B, 5z2l:C, 5z2l:E, 5z2l:J, 5z2l:H, 5z2l:I, 5z2l:F, 5z2l:G, 5z2l:L
76 2jah:C 246 93 0.1107 0.1098 0.2903 0.11 2jah:A, 2jah:B, 2jah:D, 2jap:A, 2jap:B, 2jap:C, 2jap:D
77 6zzo:C 265 199 0.1967 0.1811 0.2412 0.12 6zzo:A, 6zzo:B, 6zzo:D, 6zzp:A, 6zzp:B, 6zzp:C, 6zzp:D
78 1ae1:B 258 135 0.1557 0.1473 0.2815 0.15 1ae1:A
79 6uh2:B 255 210 0.1926 0.1843 0.2238 0.15 6uh2:A
80 4nbu:B 244 247 0.2254 0.2254 0.2227 0.16 4nbu:A, 4nbu:C, 4nbu:D
81 4nbw:A 253 88 0.1066 0.1028 0.2955 0.19 4nbw:B, 4nbw:C, 4nbw:D
82 3iah:A 253 203 0.2090 0.2016 0.2512 0.21 3iah:B
83 1iy8:A 258 171 0.1803 0.1705 0.2573 0.21 1iy8:B, 1iy8:C, 1iy8:D, 1iy8:E, 1iy8:F, 1iy8:G, 1iy8:H
84 8bcj:B 250 251 0.2910 0.2840 0.2829 0.23 8bcj:A, 8bcj:C, 8bcj:D
85 5itv:A 255 210 0.1844 0.1765 0.2143 0.29 5itv:B, 5itv:C
86 4yai:A 273 244 0.2541 0.2271 0.2541 0.29 4yag:A, 4yag:B, 4yai:B
87 1g0o:C 281 123 0.1352 0.1174 0.2683 0.30 1doh:A, 1doh:B, 1g0n:A, 1g0n:B, 1g0o:A, 1g0o:B, 1g0o:D, 1ybv:A, 1ybv:B
88 7b81:A 256 266 0.2664 0.2539 0.2444 0.32 7b81:B, 7do6:A, 7do6:B, 7do6:C, 7do6:D, 7do6:E, 7do6:F, 7do6:G, 7do6:H, 7do7:A, 7do7:B
89 4za2:D 247 66 0.0861 0.0850 0.3182 0.40
90 8hr6:A 359 57 0.0697 0.0474 0.2982 0.41 8hr6:B
91 4qec:A 248 220 0.1967 0.1935 0.2182 0.42 4qec:B, 4qed:A, 4qed:B
92 3d3w:A 244 154 0.1598 0.1598 0.2532 0.44 3d3w:B, 1pr9:A, 1pr9:B, 1wnt:A, 1wnt:B, 1wnt:C, 1wnt:D
93 1wmb:A 260 263 0.2500 0.2346 0.2319 0.47 1wmb:B, 2ztl:A, 2ztl:B, 2ztl:C, 2ztl:D, 2ztm:A, 2ztm:C, 2ztm:D, 2ztu:C, 2ztu:D, 2ztv:A, 2ztv:B, 2ztv:C, 2ztv:D
94 6t62:A 244 208 0.1926 0.1926 0.2260 0.49 6t62:B, 6wpr:A, 6wpr:B
95 5ovk:A 242 87 0.1189 0.1198 0.3333 0.57 5ovk:B, 5ovk:C, 5ovk:D, 5ovl:A, 5ovl:B, 5ovl:C, 5ovl:D
96 4iqg:D 248 114 0.1311 0.1290 0.2807 0.80 4iqg:C, 4iqg:A, 4iqg:B
97 8hi6:A 534 69 0.0902 0.0412 0.3188 0.94
98 5wjs:A 258 38 0.0574 0.0543 0.3684 1.0 5wjs:B
99 5bxy:A 155 47 0.0656 0.1032 0.3404 1.1 5bxy:B
100 5ojg:A 260 165 0.1762 0.1654 0.2606 1.3 5ojg:B, 5oji:A, 5oji:B
101 7djs:D 251 205 0.2172 0.2112 0.2585 1.4 7djs:A, 7djs:B, 7djs:C
102 4itu:A 253 118 0.1516 0.1462 0.3136 1.5 4gh5:A, 4gh5:B, 4gh5:C, 4gh5:D, 4itu:B, 4itu:C, 4itu:D
103 6j7u:A 247 33 0.0615 0.0607 0.4545 1.6 6j7u:B, 6j7u:C, 6j7u:D
104 8u9a:A 220 106 0.1475 0.1636 0.3396 1.6 8sbv:B, 8u9a:B
105 4cql:I 251 40 0.0574 0.0558 0.3500 1.6 4cql:A, 4cql:D, 4cql:E, 4cql:H, 4cql:L, 4cql:M, 4cql:P, 4cqm:A, 4cqm:D, 4cqm:E, 4cqm:H, 4cqm:I, 4cqm:L, 4cqm:M, 4cqm:P, 2pd6:A, 2pd6:B, 2pd6:C, 2pd6:D
106 8sbz:A 245 60 0.0943 0.0939 0.3833 2.8 8sby:A, 8sby:B, 8sbz:B, 8sc0:C, 8sc0:D
107 2cfc:A 250 140 0.1393 0.1360 0.2429 3.1 2cfc:B, 2cfc:C, 2cfc:D
108 5yss:B 255 37 0.0697 0.0667 0.4595 3.4 5yss:D
109 5nw7:A 440 126 0.1148 0.0636 0.2222 4.1 1pmi:A
110 6ow4:F 284 87 0.1107 0.0951 0.3103 4.2 6ow4:A, 6ow4:B, 6ow4:C, 6ow4:D, 6ow4:E, 6ow4:G, 6ow4:H
111 8gxd:A 366 42 0.0533 0.0355 0.3095 4.2
112 6c95:A 773 33 0.0492 0.0155 0.3636 4.7 6c9m:A, 6c9m:C, 6ppl:B, 6pw9:B
113 9f1b:DB 837 33 0.0492 0.0143 0.3636 4.8 9f1c:DB, 9f1d:DB, 9fpz:B, 9fq0:B
114 3osu:A 246 112 0.1230 0.1220 0.2679 5.9 3sj7:A, 3sj7:B
115 3pgx:A 270 145 0.1516 0.1370 0.2552 6.2 3pgx:B, 3pgx:C, 3pgx:D
116 8y46:A 251 269 0.2582 0.2510 0.2342 6.5 8y11:A, 8y11:B, 8y11:D, 8y46:B, 8y46:D, 8y4b:A, 8y4b:B, 8y4b:C, 8y4b:D, 8y4j:A, 8y4j:C, 8y4j:D
117 5t5q:C 245 240 0.2336 0.2327 0.2375 7.1 5t5q:A, 5t5q:B, 5t5q:D
118 2o2h:A 294 85 0.0902 0.0748 0.2588 7.7 2o2i:A
119 3pxx:A 282 226 0.1967 0.1702 0.2124 8.1 3pxx:B, 3pxx:C, 3pxx:D, 3pxx:E, 3pxx:F
120 7rlu:A 583 108 0.1189 0.0497 0.2685 8.5 4gnz:A, 4gnz:B, 4gnz:C, 4gnz:D, 4go0:A, 4go0:B, 4go0:C, 4go0:D, 4go2:A, 4go2:B, 4go2:C, 4go2:D, 2o2q:A, 2o2q:B, 2o2q:C, 2o2q:D, 2o2r:A, 2o2r:B, 2o2r:C, 2o2r:D, 3rhj:A, 3rhj:B, 3rhj:C, 3rhj:D, 3rhl:A, 3rhl:B, 3rhl:C, 3rhl:D, 3rho:A, 3rho:B, 3rho:C, 3rho:D, 3rhq:A, 3rhq:B, 3rhq:C, 3rhq:D, 3rhr:A, 3rhr:B, 3rhr:C, 3rhr:D, 7rlt:A, 7rlt:C, 7rlt:B, 7rlt:D, 7rlu:C, 7rlu:B, 7rlu:D, 7yjj:C, 7yjj:D
121 1ddz:A 481 61 0.0779 0.0395 0.3115 8.9 1ddz:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218