Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
TGEDVYCICKRPDYGELMVGCDGCDDWFHFTCLHIPEQFKDLVFSFYCPYCQAGITGKNKGSLPKTLWKRKCRISDCYKP
CLQDSKYCSEEHGREFVN

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6j2p:A 98 98 1.0000 1.0000 1.0000 1.49e-70 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
2 9c0o:A 63 50 0.1939 0.3016 0.3800 1.05e-09
3 1x4i:A 70 69 0.2959 0.4143 0.4203 2.33e-08 7zmx:A, 7zmx:B
4 2f6j:A 168 50 0.2041 0.1190 0.4000 1.81e-07 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
5 2k16:A 75 56 0.2245 0.2933 0.3929 1.92e-07 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
6 8f8y:B 433 49 0.1939 0.0439 0.3878 2.81e-07 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
7 1wep:A 79 50 0.1939 0.2405 0.3800 6.20e-07
8 3kv6:D 448 96 0.3061 0.0670 0.3125 6.52e-07 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
9 3kv4:A 432 50 0.1939 0.0440 0.3800 8.29e-07 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
10 1wem:A 76 61 0.2143 0.2763 0.3443 1.29e-06 4l7x:A, 2m3h:A
11 5wlf:A 60 51 0.1735 0.2833 0.3333 7.22e-06 5wle:A
12 5znp:B 186 48 0.1939 0.1022 0.3958 1.05e-05 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
13 1wes:A 71 62 0.2449 0.3380 0.3871 1.83e-05 2g6q:A
14 2mum:A 50 51 0.2143 0.4200 0.4118 3.38e-05
15 2qic:A 51 54 0.2143 0.4118 0.3889 3.64e-05
16 1weu:A 91 53 0.2041 0.2198 0.3774 1.27e-04 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
17 5z8l:A 204 50 0.1837 0.0882 0.3600 3.73e-04 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
18 2miq:A 94 44 0.1939 0.2021 0.4318 0.001
19 5oqd:C 192 62 0.2143 0.1094 0.3387 0.001 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
20 6wxk:B 51 48 0.1531 0.2941 0.3125 0.005 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
21 6fhq:A 58 50 0.2143 0.3621 0.4200 0.005 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
22 3o70:A 55 40 0.1429 0.2545 0.3500 0.005 3o7a:A
23 5xfr:A 309 53 0.2041 0.0647 0.3774 0.006 5xfr:B
24 3n9m:A 503 34 0.1531 0.0298 0.4412 0.009 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
25 2jmi:A 60 41 0.1633 0.2667 0.3902 0.020 2jmj:A
26 5tab:A 53 51 0.1531 0.2830 0.2941 0.024
27 7xga:A 126 58 0.1735 0.1349 0.2931 0.026 6vfo:A
28 2e6r:A 92 74 0.1939 0.2065 0.2568 0.040
29 1wee:A 72 48 0.1939 0.2639 0.3958 0.043
30 5yc3:A 60 37 0.1224 0.2000 0.3243 0.061 5yc4:A
31 1we9:A 64 37 0.1224 0.1875 0.3243 0.077
32 5y20:A 52 36 0.1122 0.2115 0.3056 0.11
33 2rsd:A 68 53 0.1633 0.2353 0.3019 0.11
34 5xfo:A 315 56 0.1939 0.0603 0.3393 0.11 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
35 2lv9:A 80 71 0.2347 0.2875 0.3239 0.13 4l58:A
36 2ke1:A 66 34 0.1633 0.2424 0.4706 0.21 2kft:A, 1xwh:A
37 5tbn:A 57 36 0.1224 0.2105 0.3333 0.26
38 4q6f:A 56 46 0.1531 0.2679 0.3261 0.32 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
39 2nax:A 76 57 0.1633 0.2105 0.2807 0.35 5m9z:A
40 1f62:A 51 47 0.1327 0.2549 0.2766 0.51
41 7tau:A 951 37 0.1224 0.0126 0.3243 0.79 7tau:C, 7tau:D, 7tau:E, 7tau:F, 7tau:H, 7tau:I, 7tau:G, 7tau:K, 7tau:L, 7tau:J, 5tx1:A, 5tx1:C, 5tx1:D, 5tx1:E, 5tx1:F, 5tx1:H, 5tx1:I, 5tx1:G, 5tx1:J, 5tx1:L
42 7klo:A 59 45 0.1735 0.2881 0.3778 0.83 7klr:A
43 5c11:A 52 35 0.1327 0.2500 0.3714 1.4 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
44 7lui:A 180 52 0.1735 0.0944 0.3269 1.6
45 2mny:A 55 46 0.1633 0.2909 0.3478 1.7 2mnz:A
46 7duf:A 62 51 0.1429 0.2258 0.2745 1.7 7duf:B
47 3a9b:A 374 36 0.1020 0.0267 0.2778 2.1 3abx:A, 3vof:A
48 7s78:H 933 37 0.1122 0.0118 0.2973 3.1 6b1t:E, 6b1t:F, 6b1t:D, 6b1t:A, 6b1t:C, 6cgv:A, 6cgv:C, 7s78:D, 7s78:F, 7s78:E, 7s78:G, 7s78:J, 7s78:L
49 6z7n:A 788 37 0.1122 0.0140 0.2973 3.2
50 6z7n:K 840 37 0.1122 0.0131 0.2973 3.2
51 6z7n:B 847 37 0.1122 0.0130 0.2973 3.2
52 6z7n:C 860 37 0.1122 0.0128 0.2973 3.2 6z7n:L
53 6z7n:H 894 37 0.1122 0.0123 0.2973 3.2 6z7n:G, 6z7n:D, 6z7n:E, 6z7n:F
54 6yba:E 917 37 0.1122 0.0120 0.2973 3.2 6yba:F, 6yba:D, 6yba:A, 6yba:C, 6yba:G, 6yba:I, 6yba:B, 6z7n:I, 6z7n:J
55 5hh7:A 192 73 0.2143 0.1094 0.2877 3.2
56 4gy5:A 215 32 0.1327 0.0605 0.4062 3.4 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
57 5tdr:A 70 33 0.1122 0.1571 0.3333 3.5 5tdw:A
58 1jug:A 125 29 0.1327 0.1040 0.4483 3.6
59 2puy:B 60 60 0.1837 0.3000 0.3000 4.1 2puy:A
60 6lqf:A 175 52 0.1735 0.0971 0.3269 4.2 6lqe:A
61 6mlc:C 85 40 0.1224 0.1412 0.3000 5.4 6mlc:A, 6mlc:B, 6mlc:D
62 2obe:A 915 37 0.1122 0.0120 0.2973 5.6 2obe:B, 2obe:C
63 7rd1:J 942 37 0.1122 0.0117 0.2973 5.6 7rd1:L, 7rd1:A, 7rd1:C, 7rd1:D, 7rd1:F, 7rd1:B, 7rd1:E, 7rd1:G, 7rd1:H, 7rd1:K, 7rd1:I
64 2ma5:A 61 35 0.1224 0.1967 0.3429 5.8
65 2ysm:A 111 53 0.1633 0.1441 0.3019 5.9
66 7mju:A 184 30 0.1327 0.0707 0.4333 7.0 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
67 2m85:A 65 38 0.1429 0.2154 0.3684 7.2
68 8i02:G 284 60 0.1633 0.0563 0.2667 7.8 8ifg:P
69 2ect:A 78 46 0.1531 0.1923 0.3261 7.9
70 9atn:A 98 31 0.1020 0.1020 0.3226 9.1
71 7w1m:H 322 27 0.0918 0.0280 0.3333 9.1 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
72 2ct1:A 77 27 0.0918 0.1169 0.3333 9.1
73 2yql:A 56 51 0.1735 0.3036 0.3333 9.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218