Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
TEKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDEVHNVWATHACVPTDPNPQEVVLENVTEHFNMWKNNMVEQMQEDIISLWDQSL
KPCVKLTPLCVTLNCKDVNATERGEIKNCSFNITTSIRDEVQKEYALFYKLDVVPIDNNNTSYRLISCDTSVITQACPKI
SFEPIPIHYCAPAGFAILKCNDKTFNGKGPCKNVSTVQCTHGIRPVVSTQLLLNGSLAEEEVVIRSDNFTNNAKTIIVQL
KESVEINCTRPNNNTRKSIHIGPGRAFYTTGEIIGDIRQAHCNISRAKWNDTLKQIVIKLREQFENKTIVFNHSSGGDPE
IVMHSFNCGGEFFYCNSTQLFNSTWNNNTTEGNTITLPCRIKQIINMWQEVGKAMYAPPIRGQIRCSSNITGLLLTRDGG
INENGTEIFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTKAKRRVVQR

The query sequence (length=449) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7n6u:B 595 452 0.9866 0.7445 0.9801 0.0 5fuu:A, 5fuu:D, 5fuu:E, 5fuu:F, 6j5e:K, 7n6u:C, 7n6u:A, 7n6w:A, 7n6w:B, 7n6w:C, 6olp:C, 7ska:B, 7ska:O, 7ska:Z, 6vpx:C, 5y14:C, 5y14:A, 5y14:B, 5yc0:B, 5yc0:C, 5yc0:F
2 8fae:A 468 468 0.8976 0.8611 0.8611 0.0 8fad:C, 8fad:E, 8fad:A, 8fae:C, 8fae:E
3 6ch9:G 448 450 0.8530 0.8549 0.8511 0.0 6mug:G
4 6pwu:A 615 472 0.7684 0.5610 0.7309 0.0 6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
5 8d0y:G 455 457 0.7706 0.7604 0.7571 0.0 5cez:G, 6ch8:G, 6de7:G, 5i8h:A, 5i8h:C, 7l7u:A, 7l7u:C, 7l7u:E, 6mtj:G, 6mtn:G, 6mu6:G, 6mu7:G, 6mu8:G, 7pc2:A, 7rai:A, 7rai:C, 7rai:E, 8s2e:E, 5t3z:G, 8tjr:B, 8tjr:C, 8tjs:G, 8tjs:N, 8tjs:O, 8ttw:E, 8ttw:I, 8ttw:A, 4tvp:G, 5u7m:G, 5u7o:G, 7ucf:G, 5utf:G, 5v7j:G, 4zmj:G
6 8czz:A 440 448 0.7506 0.7659 0.7522 0.0 8czz:E, 8czz:I
7 6edu:D 401 441 0.7728 0.8653 0.7868 0.0 6edu:E, 6edu:F
8 6meo:G 398 442 0.7661 0.8643 0.7783 0.0 6met:G
9 7mxd:A 472 472 0.7595 0.7225 0.7225 0.0 7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
10 7lu9:e 461 463 0.7483 0.7289 0.7257 0.0 7lu9:f
11 8d53:G 446 453 0.7416 0.7466 0.7351 0.0
12 8tgw:A 387 442 0.7595 0.8811 0.7715 0.0
13 6opp:A 389 451 0.7483 0.8638 0.7450 0.0 6opo:A, 6opo:D, 6opo:J, 6opp:D, 6opp:J, 6opq:A, 6opq:D, 6opq:E, 5vn3:G, 5vn3:I, 5vn3:J
14 5fyj:G 479 465 0.7261 0.6806 0.7011 0.0
15 7txd:A 397 449 0.6993 0.7909 0.6993 0.0 7txd:E
16 6cm3:D 372 445 0.6570 0.7930 0.6629 0.0 6cm3:E, 6cm3:F, 7lo6:C, 7lo6:A, 7lo6:E, 7lok:A, 7lok:C, 7lok:E, 6u0l:B, 6u0l:C, 6u0n:A, 6u0n:C
17 1gc1:G 297 381 0.5724 0.8653 0.6745 3.31e-168
18 6x5b:A 353 448 0.5813 0.7394 0.5826 1.56e-162 6opn:A, 6opn:D, 6opn:G, 6x5b:D, 6x5b:J, 6x5c:A, 6x5c:D, 6x5c:E
19 4laj:A 343 289 0.5167 0.6764 0.8028 3.47e-159 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
20 4laj:A 343 80 0.1581 0.2070 0.8875 3.37e-40 4dvr:G, 2i5y:G, 2i5y:P, 2i60:G, 2i60:P, 4jzw:G, 4jzw:A, 4jzz:A, 4k0a:A, 4ka2:A, 4laj:J, 4laj:F, 4laj:B, 4r4f:A, 1yyl:G, 1yyl:P, 1yym:G, 1yym:P
21 5fa2:A 336 423 0.5167 0.6905 0.5485 2.97e-149
22 5w4l:G 357 433 0.5167 0.6499 0.5358 1.09e-145 6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
23 4r4n:B 342 283 0.4499 0.5906 0.7138 1.26e-142 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
24 4r4n:B 342 79 0.1403 0.1842 0.7975 5.47e-36 4r4n:A, 4r4n:E, 4r4n:I, 4r4n:M, 4r4n:P, 4r4n:S, 4r4n:V
25 4xmp:G 337 283 0.4499 0.5994 0.7138 7.46e-141
26 4xmp:G 337 79 0.1470 0.1958 0.8354 1.16e-36
27 4j6r:G 343 286 0.4321 0.5656 0.6783 1.54e-135
28 4j6r:G 343 80 0.1425 0.1866 0.8000 4.79e-36
29 3tgs:A 345 289 0.4343 0.5652 0.6747 2.59e-135 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
30 3tgs:A 345 80 0.1492 0.1942 0.8375 3.22e-38 5f4l:A, 5f4l:B, 5f4p:D, 5f4p:A, 5f4r:A, 5f4r:C, 5f4u:A, 5f4u:B, 8fly:A, 8fly:B, 8fly:C, 8fly:D, 8flz:A, 8flz:D, 8flz:B, 8flz:C, 8fm0:B, 8fm0:A, 8fm0:C, 8fm0:D, 8fm2:D, 8fm2:B, 8fm2:A, 8fm2:C, 8fm3:A, 8fm3:C, 8fm3:D, 8fm3:B, 8fm4:B, 8fm4:D, 8fm4:A, 8fm4:C, 8fm5:D, 8fm5:A, 8fm5:C, 8fm5:B, 8fm7:A, 8fm7:B, 8fm7:C, 8fm7:D, 8fm8:C, 8fm8:D, 8fm8:A, 8fm8:B, 4i53:A, 4i53:B, 7rsx:C, 7rsx:B, 7rsx:A, 7rsx:D, 7rsy:A, 7rsy:B, 7rsy:C, 7rsy:D, 7rsz:B, 7rsz:A, 7rsz:C, 7rsz:D, 3tgs:B, 7tjo:D, 7tjo:A, 7tjo:C, 7tjo:B, 7tjp:A, 7tjp:B, 7tjp:D, 7tjp:C
31 5te4:G 341 290 0.3987 0.5249 0.6172 6.48e-119
32 5te4:G 341 79 0.1381 0.1818 0.7848 8.94e-35
33 7t4g:A 493 500 0.3786 0.3448 0.3400 1.49e-76 7t4g:C, 7t4g:E
34 6tyb:G 345 434 0.2739 0.3565 0.2834 5.05e-34 3fus:A
35 5esv:G 187 64 0.0869 0.2086 0.6094 8.10e-18 5esv:E, 5esv:F
36 6exn:O 320 89 0.0535 0.0750 0.2697 0.56 6bk8:S
37 4z67:A 309 35 0.0245 0.0356 0.3143 1.9 6e13:A, 3jxp:A, 1xto:A, 4z5y:A, 4z5z:A, 4z60:A, 4z6x:A
38 7rsw:B 125 28 0.0267 0.0960 0.4286 6.5
39 6wb6:A 653 59 0.0290 0.0199 0.2203 7.2 6wb6:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218