Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
TEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILATKVQDIKNNLKEAIETIVAARACY
ERSNEYQLIDDQDLLRCRIFETKFQVDKVNFHMFDVGDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALN
LFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTA
SGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELL

The query sequence (length=283) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8uo1:A 334 334 0.9965 0.8443 0.8443 0.0 8gga:A
2 8ggb:A 310 311 0.9859 0.9000 0.8971 0.0 8gg9:A, 8ggc:A
3 6eg8:I 372 372 1.0000 0.7608 0.7608 0.0 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
4 8uo4:A 292 306 0.9399 0.9110 0.8693 0.0 8uo2:A
5 8unx:A 244 286 0.8445 0.9795 0.8357 8.67e-172 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
6 8htg:B 334 334 0.7527 0.6377 0.6377 1.80e-143 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
7 8xql:A 240 286 0.7350 0.8667 0.7273 5.21e-141
8 7rkf:A 350 363 0.4382 0.3543 0.3416 3.53e-49
9 3v00:C 353 364 0.4346 0.3484 0.3379 1.98e-48 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
10 8pjk:A 222 280 0.3534 0.4505 0.3571 2.99e-45 7e2x:A, 7e2z:A
11 1agr:A 350 289 0.3569 0.2886 0.3495 5.07e-42 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
12 1agr:A 350 49 0.0954 0.0771 0.5510 1.07e-07 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
13 3c7k:C 311 327 0.3958 0.3601 0.3425 4.66e-41 3c7k:A
14 8iys:A 355 367 0.4205 0.3352 0.3243 1.19e-39 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
15 8fn0:B 212 278 0.3569 0.4764 0.3633 3.57e-39
16 1shz:D 327 339 0.3958 0.3425 0.3304 2.57e-38 1shz:A
17 3ab3:A 322 339 0.4064 0.3571 0.3392 2.77e-37 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
18 1zca:A 318 189 0.2686 0.2390 0.4021 1.51e-33 1zca:B
19 1zca:A 318 22 0.0601 0.0535 0.7727 7.63e-04 1zca:B
20 3ffb:A 327 286 0.3145 0.2722 0.3112 1.24e-27 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
21 3ffb:A 327 49 0.0954 0.0826 0.5510 9.10e-08 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
22 2xtz:C 270 275 0.3074 0.3222 0.3164 2.80e-24
23 4fid:A 318 322 0.3180 0.2830 0.2795 3.13e-24 4fid:B
24 2xtz:B 291 298 0.3039 0.2955 0.2886 2.23e-21
25 2xtz:A 343 250 0.2367 0.1953 0.2680 4.43e-15
26 2xtz:A 343 22 0.0601 0.0496 0.7727 0.002
27 5uf8:D 160 154 0.1413 0.2500 0.2597 0.008
28 2k5u:A 181 155 0.1307 0.2044 0.2387 0.009 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
29 3lvq:E 420 181 0.1484 0.1000 0.2320 0.012 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
30 6a8d:A 181 157 0.1307 0.2044 0.2357 0.015
31 2b6h:A 171 154 0.1272 0.2105 0.2338 0.031
32 5di3:B 204 87 0.0777 0.1078 0.2529 0.035 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
33 6bbp:A 520 155 0.1272 0.0692 0.2323 0.064 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
34 1z6x:A 175 157 0.1343 0.2171 0.2420 0.066 1z6x:B
35 3aq4:A 170 154 0.1343 0.2235 0.2468 0.075 3aq4:B
36 4v0l:A 168 91 0.0919 0.1548 0.2857 0.082 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
37 2h57:B 167 156 0.1307 0.2216 0.2372 0.12 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
38 6e67:B 476 16 0.0495 0.0294 0.8750 0.16 3d4s:A, 5d5a:A, 5d5b:A, 5d6l:A, 6e67:A, 3ny8:A, 3ny9:A, 3nya:A, 6oba:A, 3pds:A, 6prz:A, 6ps0:A, 6ps1:A, 6ps2:A, 6ps3:A, 6ps4:A, 6ps5:A, 6ps6:A, 2rh1:A, 5x7d:A
39 3o47:A 289 154 0.1343 0.1315 0.2468 0.20 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
40 8d4c:C 180 157 0.1343 0.2111 0.2420 0.30 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
41 2x77:A 181 85 0.0813 0.1271 0.2706 0.57 2x77:B
42 4y0v:A 165 154 0.1272 0.2182 0.2338 0.89 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
43 3doe:A 189 171 0.1484 0.2222 0.2456 0.90 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
44 3lrp:A 181 157 0.1201 0.1878 0.2166 1.1
45 4bas:A 172 42 0.0530 0.0872 0.3571 1.3
46 4kmn:A 103 20 0.0424 0.1165 0.6000 2.6 7trl:A
47 8e0h:A 179 56 0.0459 0.0726 0.2321 3.5 8dzm:A, 8dzm:B, 8dzn:A, 8dzn:B, 8dzo:A, 8dzo:B, 8dzt:A, 8dzt:B, 8e0h:B, 2gao:A, 2gao:B
48 6zga:C 168 85 0.0707 0.1190 0.2353 3.6 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
49 1yzg:A 168 167 0.1272 0.2143 0.2156 3.8
50 2uvl:B 95 20 0.0389 0.1158 0.5500 4.2 2uvl:A
51 2xt3:A 300 73 0.0777 0.0733 0.3014 4.5 4a14:A
52 4zi2:A 185 156 0.1201 0.1838 0.2179 6.2 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
53 8v4h:B 342 101 0.0919 0.0760 0.2574 6.2 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
54 3t6p:A 330 20 0.0424 0.0364 0.6000 7.4 3d9t:A, 3d9t:B, 3d9u:A, 8dsf:A, 8dsf:B, 8dsf:C, 8dsf:D, 8dso:D, 4eb9:A, 4eb9:B, 4eb9:C, 4eb9:D, 6exw:A, 6exw:C, 6hpr:A, 4hy4:A, 4hy4:B, 4hy5:A, 4hy5:B, 4lge:A, 4lge:B, 4lgu:A, 4lgu:B, 5m6n:A, 5m6n:B, 4mti:A, 4mti:B, 3mup:A, 3mup:B, 3mup:C, 3mup:D, 4mu7:A, 4mu7:B, 3oz1:A, 3oz1:B, 3oz1:C, 3oz1:D, 1qbh:A, 7trm:A, 3uw4:A, 6w74:A, 6w7o:C, 6w7o:D, 6w8i:F, 6w8i:D, 6w8i:E
55 4u60:C 274 25 0.0424 0.0438 0.4800 7.6 6hku:B, 6hku:C, 6hku:F, 6hku:I, 6hku:J, 6hku:D, 6hkv:A, 6hkv:B, 6hkv:C, 6hkv:D, 6hkv:E, 6hkv:F, 6hkv:G, 6hkv:H, 6hkv:I, 6hkv:J, 4u60:A, 4u60:D, 4u60:E, 4u60:B, 4u61:A, 4u61:B, 4u61:C, 4u61:E, 4u61:H, 4u61:I, 4u61:J, 4u62:B, 4u62:C, 4u62:J
56 7zhf:A 250 68 0.0671 0.0760 0.2794 8.4 7zhk:A, 7zhk:B, 7zhk:C
57 4iw3:B 380 51 0.0565 0.0421 0.3137 8.5 4iw3:K, 4j0q:A, 4j0q:B, 4j0q:C, 4j0q:D, 4j0q:E
58 6yxx:EA 532 192 0.1449 0.0771 0.2135 9.3 7aoi:XL, 6yxy:EA

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218