BioLiP

>protein
TDTTPPTITLPQEVIAYRGEEFEFFVETTDDSGRVNRVIVRNIEGADNSTYLDPNWIRYSTDNLSVPGNATPANPLRTRV
YGIVPINHGVGPGDRYTKYVRAEDAAGNITALVDKQSERFVLVIRPQTEKYTPQVPTLTYVQNANSLTQTDKDAVIAAVK
SANPNLPATSTYSVSENGTVTITYPDGSTDTIAAAQTVDTDRVAPVFVDEGRDYIFYRGEEGTAELHFYDNSGKITNVNF
AGDLAASSTYNTLLGLGFTFNTPNINNPNNATEQNPLVTTIRGTIPKSLPAGPGGKYTFKVRATDASGLTSEAKIFRIVF
ANQTDKYTPNNPGSLTGVLNPQQLSTSEKTAIEEKVRAANTGNLPNNVQYVVNNDGSVTVIYPDDTPASRSRDTITADRT
VQDLRPRNS

The query sequence (length=409) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6vs7:A	409	409	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6vs7:E, 6vt2:A, 6vt2:E, 6vu6:A, 6vu6:E
2	5eq2:A	201	202	0.2641	0.5373	0.5347	7.20e-62	5eq2:B, 5eq3:A, 5eq3:B, 5eq4:A, 5eq4:B, 5eq4:C, 5eq4:D, 5iiy:A, 5iiy:B, 5ij1:A, 5ij1:B, 5ij2:A, 5ij2:B, 5ij3:A, 5ij3:B, 5kiq:A, 5kiq:B
3	5eq2:A	201	196	0.1907	0.3881	0.3980	2.71e-28	5eq2:B, 5eq3:A, 5eq3:B, 5eq4:A, 5eq4:B, 5eq4:C, 5eq4:D, 5iiy:A, 5iiy:B, 5ij1:A, 5ij1:B, 5ij2:A, 5ij2:B, 5ij3:A, 5ij3:B, 5kiq:A, 5kiq:B
4	6efd:A	206	201	0.2592	0.5146	0.5274	1.64e-61	6efc:A, 7kmj:A, 8st6:A, 6x3k:A, 6x3q:A
5	6efd:A	206	205	0.1858	0.3689	0.3707	1.04e-16	6efc:A, 7kmj:A, 8st6:A, 6x3k:A, 6x3q:A
6	6efi:B	208	203	0.2494	0.4904	0.5025	2.72e-59	6efi:A
7	6efi:B	208	205	0.1932	0.3798	0.3854	1.09e-20	6efi:A
8	6eff:B	206	190	0.2421	0.4806	0.5211	1.47e-47	6eff:A, 6eff:C, 6eff:D
9	6eff:B	206	202	0.1809	0.3592	0.3663	6.38e-16	6eff:A, 6eff:C, 6eff:D
10	3qc5:X	352	219	0.1980	0.2301	0.3699	5.04e-26	6ef7:A, 6efa:A, 5iuc:A, 5iuc:B, 3qc6:X
11	6efb:A	201	215	0.1834	0.3731	0.3488	4.85e-23
12	6efb:A	201	134	0.1027	0.2090	0.3134	3.44e-05
13	8pxc:A	252	236	0.1443	0.2341	0.2500	1.98e-05
14	8pxc:A	252	144	0.0954	0.1548	0.2708	0.013
15	4dpv:Z	559	87	0.0489	0.0358	0.2299	1.2	1c8d:A, 1c8f:A, 1c8g:A, 1ijs:P, 1p5w:A, 4qyk:K, 4qyk:V, 4qyk:E, 4qyk:J, 4qyk:S, 4qyk:B, 4qyk:c, 4qyk:W, 4qyk:H, 4qyk:I, 4qyk:T, 4qyk:L, 4qyk:M, 4qyk:C, 4qyk:R, 4qyk:A, 4qyk:b, 4qyk:Y, 4qyk:d, 4qyk:F
16	3ftq:B	252	121	0.0660	0.1071	0.2231	1.7	3ftq:C, 3ftq:D, 2qnr:B, 6upa:A
17	5nxb:A	644	52	0.0391	0.0248	0.3077	2.2	4ccc:A, 4ccd:A, 4cce:A, 5nxb:B, 4ufh:A, 4ufi:A, 4ufj:A, 4ufk:A, 4ufl:A, 4ufm:A, 6y6s:A, 6y6t:A, 3zr5:A, 3zr6:A
18	7wfx:A	493	43	0.0367	0.0304	0.3488	3.9	7wfx:B, 7wg1:A, 7wg1:B, 7wg2:A, 7wg4:A
19	6yxx:EM	308	48	0.0342	0.0455	0.2917	4.2
20	6yxy:EM	330	48	0.0342	0.0424	0.2917	4.3
21	7am2:BT	300	48	0.0367	0.0500	0.3125	4.8
22	7w78:A	218	114	0.0709	0.1330	0.2544	5.3	7w79:A
23	2r5w:B	345	37	0.0244	0.0290	0.2703	6.6	2qjt:B, 2qjt:A, 2r5w:A
24	3e18:A	348	79	0.0587	0.0690	0.3038	8.7	3e18:B
25	6a0f:B	305	96	0.0636	0.0852	0.2708	9.9	6a0f:A, 6a0h:A, 6a0h:B

[Back]