BioLiP

>protein
TDSFWEVGNYKRTVKRIDDGHRLCNDLMNCVQERAKIEKAYGQQLTDWAKRWRQLIEKGPQYGSLERAWGAIMTEADKVS
ELHQEVKNNLLNEDLEKVKNWQKDAYHKQIMGGFKETKEAEDGFRKAQKPWAKKMKELEAAKKAYHLACKEEKLAMQDKV
DKCKQDVQKTQEKYEKVLEDVGKTTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKRLVFLKEVLLDIKRHLNLAENSSYIHVYRELEQAI
RGADAQEDLRWFRSTSGPGMPMNWPQFEE

The query sequence (length=269) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3q84:G	287	284	1.0000	0.9373	0.9472	0.0	3hah:A, 3hah:B, 3q84:B, 3q84:N, 3qni:A, 3qni:B
2	3q0k:D	289	288	0.7472	0.6955	0.6979	9.06e-147	3aco:A, 3haj:A, 3haj:B, 3lll:A, 3lll:B, 3q0k:A, 3q0k:B, 3q0k:C
3	3qe6:B	286	282	0.5576	0.5245	0.5319	1.28e-118	3qe6:A
4	7aam:B	287	286	0.2193	0.2056	0.2063	4.45e-04	7aam:A
5	7zjs:A	929	44	0.0595	0.0172	0.3636	2.2	8k4d:A, 6qnx:A, 7zjs:C
6	1tqh:A	242	81	0.0855	0.0950	0.2840	2.6
7	2q9c:A	304	87	0.0967	0.0855	0.2989	3.0	2cnw:D, 2cnw:E, 2cnw:F, 2iyl:D, 2j7p:D, 2j7p:E, 2q9b:A, 2xkv:D
8	3bga:A	1003	75	0.0743	0.0199	0.2667	4.5	3bga:B
9	7ok0:B	1109	38	0.0409	0.0099	0.2895	5.2	7oq4:B, 7oqy:B
10	7xin:A	470	108	0.0781	0.0447	0.1944	6.4	7xin:C, 7xin:E
11	6ujf:A	301	58	0.0743	0.0664	0.3448	7.9
12	5vdk:A	260	33	0.0520	0.0538	0.4242	8.5
13	8a1r:A	593	48	0.0483	0.0219	0.2708	9.1	8a1r:B, 7b02:A, 6fmu:A, 6fmz:A, 6fp4:A, 6ftc:A, 3h4k:A, 4la1:A, 4la1:B, 7npx:A, 7npx:B, 8pdd:A, 8pdd:B, 8pl0:A, 8pl0:B, 8pl1:A, 8pl1:B, 8pl2:A, 8pl2:B, 8pl3:A, 8pl3:B, 8pl4:A, 8pl4:B, 8pl5:A, 8pl5:B, 8pl6:A, 8pl7:A, 8pl7:B, 8pl8:A, 8pl9:A, 8pl9:B, 8pla:A, 8pla:B, 8plb:A, 8plb:B, 8plc:A, 8plc:B, 8pld:A, 8pld:B, 8ple:A, 8ple:B, 8plf:A, 8plf:B, 8plg:A, 8plh:A, 8pli:A, 8pli:B, 8plj:A, 8plj:B, 8plk:A, 8plk:B, 8pll:A, 8plm:A, 8pln:A, 8plo:A, 8plo:B, 8plp:A, 8plp:B, 8plq:A, 8plq:B, 8plr:A, 8plr:B, 8pls:A, 8pls:B, 8plt:A, 8plt:B, 8plu:A, 8plu:B, 8plv:A, 8plv:B, 8plw:A, 8plw:B, 8plx:A, 8plx:B, 8ply:A, 8ply:B, 6rtj:A, 6rtm:A, 6rto:A, 2v6o:A, 2x8c:A, 2x8c:B, 2x8g:A, 2x8h:A, 2x99:A, 6zlb:A, 6zlp:A, 6zp3:A, 6zst:A
14	8opt:A	783	28	0.0335	0.0115	0.3214	9.2	8ops:A, 5w0m:B, 5w0n:C, 5w0o:A, 5w0o:B

[Back]