BioLiP

>protein
TDQAAFDTNIVTLTRFVMEQGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVAAISTAVRKAGIAHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDL
VINVLKSSFATCVLVTEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLV
AAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRNVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPY
GARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGS
PEDVTELLEIYQKHAAK

The query sequence (length=337) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1fsa:A	337	337	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7c9q:A, 7c9q:D, 7c9q:B, 1cnq:A, 1eyi:A, 1eyj:A, 1eyj:B, 1eyk:A, 1eyk:B, 2f3b:A, 2f3d:A, 1fbc:A, 1fbc:B, 1fbd:A, 1fbd:B, 1fbe:A, 1fbe:B, 1fbf:A, 1fbf:B, 1fbg:A, 1fbg:B, 1fbh:A, 1fbh:B, 1fbp:A, 1fbp:B, 3fbp:A, 3fbp:B, 4fbp:A, 4fbp:B, 4fbp:D, 4fbp:C, 5fbp:A, 5fbp:B, 2fhy:A, 2fhy:L, 2fhy:D, 2fhy:H, 1fj6:A, 1fj9:A, 1fj9:B, 1fpb:A, 1fpb:B, 1fpd:A, 1fpd:B, 1fpe:A, 1fpe:B, 1fpf:A, 1fpf:B, 1fpg:A, 1fpg:B, 1fpi:A, 1fpi:B, 1fpj:A, 1fpj:B, 1fpk:A, 1fpk:B, 1fpl:A, 1fpl:B, 1frp:A, 1frp:B, 1fsa:B, 4gbv:A, 4gbw:A, 4gws:A, 4gws:B, 4gwu:A, 4gww:A, 4gwx:A, 4gwy:A, 4gwz:A, 4gwz:B, 4gx3:A, 4gx3:B, 4gx4:A, 4gx4:B, 4gx6:A, 4gx6:B, 4h45:A, 4h46:A, 4kxp:A, 4kxp:B, 1kz8:A, 1kz8:F, 1lev:A, 1lev:F, 6ls5:B, 6ls5:A, 6ls5:D, 1nuw:A, 1nux:A, 1nuy:A, 1nuz:A, 1nv0:A, 1nv1:A, 1nv2:A, 1nv3:A, 1nv4:A, 1nv5:A, 1nv6:A, 1nv7:A, 1nv7:B, 5q0b:A, 1q9d:A, 1q9d:B, 2qvu:A, 2qvu:B, 2qvv:A, 2qvv:B, 1rdx:A, 1rdx:B, 1rdy:A, 1rdy:B, 1rdz:A, 1rdz:B, 7wjv:A, 7wjv:B, 7wjv:C, 1yxi:A, 1yyz:A, 1yz0:A, 1yz0:B
2	7ezf:D	329	329	0.8724	0.8936	0.8936	0.0	3a29:A, 3a29:B, 3a29:C, 3a29:D, 7c9q:C, 7cvh:A, 7cvh:C, 7cvh:B, 7cvh:D, 7cvn:A, 7cvn:C, 7cvn:B, 7cvn:D, 7cwe:A, 7cwe:B, 7ezf:A, 7ezf:B, 7ezf:C, 7ezp:A, 7ezp:B, 7ezp:C, 7ezp:D, 7ezr:A, 7ezr:B, 7ezr:C, 7ezr:D, 2fie:A, 2fie:L, 2fie:D, 2fie:H, 2fix:A, 2fix:L, 2fix:D, 2fix:H, 1fta:A, 1fta:B, 1fta:C, 1fta:D, 2jjk:A, 2jjk:C, 2jjk:B, 2jjk:D, 3kbz:A, 3kbz:B, 3kbz:C, 3kbz:D, 3kc0:A, 3kc0:B, 3kc0:C, 3kc0:D, 3kc1:A, 3kc1:B, 3kc1:C, 3kc1:D, 5ldz:A, 5ldz:B, 5ldz:C, 5ldz:D, 5ldz:E, 5ldz:F, 6ls5:C, 6lw2:A, 6lw2:B, 6lw2:C, 6lw2:D, 4mjo:A, 4mjo:B, 4mjo:C, 4mjo:D, 4mjo:E, 4mjo:F, 4mjo:G, 4mjo:H, 5pzq:A, 5pzq:B, 5pzq:C, 5pzq:D, 5pzr:A, 5pzr:C, 5pzr:B, 5pzr:D, 5pzs:A, 5pzs:C, 5pzs:B, 5pzs:D, 5pzt:A, 5pzt:B, 5pzt:C, 5pzt:D, 5pzt:E, 5pzt:F, 5pzt:G, 5pzt:H, 5pzu:A, 5pzu:B, 5pzu:C, 5pzu:D, 5pzv:A, 5pzv:B, 5pzv:C, 5pzv:D, 5pzw:A, 5pzw:C, 5pzw:B, 5pzw:D, 5pzx:A, 5pzx:B, 5pzx:C, 5pzx:D, 5pzx:E, 5pzx:F, 5pzx:G, 5pzx:H, 5pzy:A, 5pzy:B, 5pzy:C, 5pzy:D, 5pzy:E, 5pzy:F, 5pzy:G, 5pzy:H, 5pzz:A, 5pzz:B, 5pzz:C, 5pzz:D, 5pzz:E, 5pzz:F, 5pzz:G, 5pzz:H, 5q00:A, 5q00:B, 5q00:C, 5q00:D, 5q00:E, 5q00:F, 5q00:G, 5q00:H, 5q01:A, 5q01:B, 5q01:C, 5q01:D, 5q01:E, 5q01:F, 5q01:G, 5q01:H, 5q02:A, 5q02:B, 5q02:C, 5q02:D, 5q03:A, 5q03:B, 5q03:C, 5q03:D, 5q03:E, 5q03:F, 5q03:G, 5q03:H, 5q04:A, 5q04:B, 5q04:C, 5q04:D, 5q04:E, 5q04:F, 5q04:G, 5q04:H, 5q05:A, 5q05:B, 5q05:C, 5q05:D, 5q05:E, 5q05:F, 5q05:G, 5q05:H, 5q06:A, 5q06:B, 5q06:C, 5q06:D, 5q07:A, 5q07:C, 5q07:B, 5q07:D, 5q07:E, 5q07:F, 5q07:G, 5q07:H, 5q08:A, 5q08:B, 5q08:C, 5q08:D, 5q08:E, 5q08:F, 5q08:G, 5q08:H, 5q09:A, 5q09:B, 5q09:D, 5q09:C, 5q09:E, 5q09:F, 5q09:G, 5q09:H, 5q0a:A, 5q0a:C, 5q0a:B, 5q0a:D, 5q0b:B, 5q0b:C, 5q0b:D, 2vt5:A, 2vt5:B, 2vt5:C, 2vt5:D, 2vt5:E, 2vt5:F, 2vt5:G, 2vt5:H, 2wbb:A, 2wbb:H, 2wbb:B, 2wbb:C, 2wbb:D, 2wbb:E, 2wbb:F, 2wbb:G, 2wbd:A, 2wbd:B, 2wbd:C, 2wbd:D, 2wbd:E, 2wbd:F, 2wbd:G, 2wbd:H, 7wjv:D, 2y5k:A, 2y5k:C, 2y5k:B, 2y5k:D, 2y5l:A, 2y5l:B, 2y5l:C, 2y5l:D, 2y5l:E, 2y5l:F, 2y5l:G, 2y5l:H, 5zwk:A, 5zwk:B, 5zwk:C, 5zwk:D
3	1bk4:A	314	332	0.8309	0.8917	0.8434	0.0
4	5q0c:A	328	327	0.7418	0.7622	0.7645	0.0	5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H
5	5k55:A	290	326	0.6528	0.7586	0.6748	1.44e-148	5et8:A
6	7ns5:A	319	325	0.4362	0.4608	0.4523	5.19e-92	7ns5:D, 7ns5:B, 7ns5:C
7	5oey:C	326	319	0.4243	0.4387	0.4483	1.24e-89	5oey:A, 5oey:B, 5ofu:A, 5ofu:B, 5ofu:C, 5ofu:D
8	2qvr:A	332	324	0.4154	0.4217	0.4321	3.80e-87	2owz:A, 2ox3:A
9	5oey:D	301	313	0.4095	0.4585	0.4409	1.71e-81
10	2gq1:A	310	324	0.3976	0.4323	0.4136	1.62e-76	2q8m:A, 2q8m:B
11	5iz3:A	316	321	0.2997	0.3196	0.3146	3.89e-31	5iz3:B
12	2czi:A	259	85	0.0682	0.0888	0.2706	0.059	2czh:B
13	1dk4:A	252	82	0.0682	0.0913	0.2805	0.14	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
14	1e3d:B	537	87	0.0801	0.0503	0.3103	0.38	1e3d:D
15	8wdq:A	273	99	0.0682	0.0842	0.2323	0.97	8wdq:B
16	7pah:f	145	73	0.0504	0.1172	0.2329	1.6	7ood:f, 7p6z:f, 7pai:f, 7paj:f, 7pak:f, 7pal:f, 7pam:f, 7pan:f, 7pao:f, 7paq:f, 7par:f, 7pas:f, 7pat:f, 7pau:f, 7ph9:f, 7pha:f, 7phb:f, 7phc:f, 7pi8:f, 7pi9:f, 7pia:f, 7pib:f, 7pic:f, 7pio:f, 7pip:f, 7piq:f, 7pir:f, 7pis:f, 7pit:f
17	4xau:C	374	213	0.1543	0.1390	0.2441	3.9
18	5u23:D	366	103	0.0623	0.0574	0.2039	4.2	5u21:A, 5u21:B, 5u21:C, 5u21:D, 5u23:C, 5u23:A, 5u23:B, 5u24:A, 5u24:B, 5u24:C, 5u24:D
19	7qep:S4	259	54	0.0445	0.0579	0.2778	6.0
20	1y9i:A	159	36	0.0445	0.0943	0.4167	7.4	1y9i:B, 1y9i:C, 1y9i:D
21	5l8e:A	517	35	0.0386	0.0251	0.3714	8.6
22	1usy:B	275	59	0.0564	0.0691	0.3220	8.6	1usy:C, 1usy:D
23	7yes:A	1369	30	0.0326	0.0080	0.3667	8.8	8jsl:A, 8jsm:A, 8jsn:A, 7yer:A
24	7yet:A	999	30	0.0326	0.0110	0.3667	9.4

[Back]