BioLiP

>protein
TDNAVMEQRVDALFVLTKELGLVTDQTVPDYEDALMHDWLPQNGAKLVAKAWTDPVFKAQLLSEGVAASESLGFSFPKHH
KHFVVLENTPELHNVICCSLCSCTAFTIIGMAPDWYKELEYRARIVRQARTVLKEIGLDLPESIDIRVWDTTADTRYMVL
PLRPQGTEDWSEAQLATLITQDCLIGVSRLEAPFAALPAPAVALGA

The query sequence (length=206) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4fm4:A	206	206	1.0000	1.0000	1.0000	1.80e-154	4fm4:C, 4fm4:E, 4fm4:G, 4fm4:I, 4fm4:K, 4fm4:M, 4fm4:O, 4zgd:A, 4zgd:C, 4zgd:E, 4zgd:G, 4zgd:I, 4zgd:K, 4zgd:M, 4zgd:O, 4zge:A, 4zge:C, 4zge:E, 4zge:G, 4zge:I, 4zge:K, 4zge:M, 4zge:O, 4zgj:A, 4zgj:C, 4zgj:E, 4zgj:G, 4zgj:I, 4zgj:K, 4zgj:M, 4zgj:O
2	1ahj:A	198	191	0.4660	0.4848	0.5026	2.92e-64	3a8g:A, 3a8h:A, 3a8l:A, 3a8m:A, 3a8o:A, 1ahj:C, 1ahj:E, 1ahj:G, 2ahj:A, 2ahj:C, 2cyz:A, 2cz0:A, 2cz1:A, 2cz6:A, 2cz7:A, 2d0q:A, 2qdy:A, 3wvd:A, 3wve:A, 3x20:A, 3x24:A, 3x25:A, 3x26:A, 3x28:A, 2zcf:A, 2zpb:A, 2zpe:A, 2zpf:A, 2zpg:A, 2zph:A, 2zpi:A
3	3qxe:A	201	184	0.4612	0.4726	0.5163	8.03e-57	3qxe:C, 3qxe:E, 3qxe:G, 3qyg:A, 3qyg:C, 3qyg:E, 3qyg:G, 3qyh:A, 3qyh:C, 3qyh:E, 3qyh:G, 3qz5:A, 3qz5:C, 3qz5:E, 3qz5:G, 3qz9:A, 3qz9:C, 3qz9:E, 3qz9:G
4	1v29:A	203	187	0.4126	0.4187	0.4545	8.40e-53	2dpp:A, 3hht:A, 7qom:A, 7qop:A, 7qou:A, 7qov:A, 7qoy:A, 7z0v:A
5	4ob3:A	204	196	0.3981	0.4020	0.4184	5.10e-51	9d6k:A, 8i6n:A, 1ire:A, 4ob0:A, 4ob1:A, 4ob2:A, 1ugp:A, 1ugr:A, 1ugs:A, 3vyh:A, 7w8l:A, 7w8m:A
6	2zzd:F	218	216	0.4078	0.3853	0.3889	7.03e-48	2dd5:C, 2dd5:F, 2dd5:I, 2dd5:L, 2dxb:C, 2dxb:F, 2dxb:I, 2dxb:L, 2dxb:O, 2dxb:R, 2dxb:U, 2dxb:X, 2dxc:C, 2dxc:F, 2dxc:I, 2dxc:L, 3vyg:C, 3vyg:F, 3vyg:I, 3vyg:L, 2zzd:C, 2zzd:I, 2zzd:L
7	5f9h:G	653	54	0.0631	0.0199	0.2407	3.9	5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
8	7cte:D	406	103	0.1359	0.0690	0.2718	5.8	7ctf:D, 7ctg:D, 7jpo:D, 7jpp:D, 7jpq:D, 7jpr:D, 7jps:D, 5uj7:C, 5uj7:D, 5ujm:D
9	3f6h:B	125	64	0.0728	0.1200	0.2344	6.0	3f6g:B, 3f6g:A, 3f6h:A
10	7lu4:B	977	24	0.0631	0.0133	0.5417	7.3

[Back]