Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TDERVYESIGQYGGETVKIVRIEKARDIPLGATVRNEMDSVIISRIVKGGAAEKSGLLHEGDEVLEINGIEIRGKDVNEV
FDLLSDMHGTLTFVLIPS

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4wsi:A 372 92 0.9388 0.2473 1.0000 8.85e-59 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
2 6nid:B 88 83 0.3367 0.3750 0.3976 7.05e-19 6nid:A, 6nid:C
3 2ejy:A 85 83 0.2755 0.3176 0.3253 3.27e-13
4 1rzx:A 98 97 0.3571 0.3571 0.3608 1.63e-11 5i7z:A, 1x8s:A
5 1n7f:A 86 68 0.2755 0.3140 0.3971 3.13e-10 1n7f:B
6 6xa7:B 96 55 0.2041 0.2083 0.3636 1.58e-06 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7 4e34:A 87 54 0.1939 0.2184 0.3519 2.04e-05 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
8 1u38:A 89 37 0.1735 0.1910 0.4595 7.34e-05
9 6kz1:A 97 60 0.1939 0.1959 0.3167 1.48e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
10 1b8q:A 127 34 0.1735 0.1339 0.5000 1.62e-04
11 5heb:A 119 56 0.1837 0.1513 0.3214 1.66e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
12 7qqn:C 414 46 0.2143 0.0507 0.4565 2.22e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
13 4xh7:A 110 67 0.2041 0.1818 0.2985 8.20e-04
14 8blu:B 195 108 0.2857 0.1436 0.2593 0.002 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
15 2r4h:C 98 69 0.2449 0.2449 0.3478 0.002
16 3jxt:A 96 35 0.1429 0.1458 0.4000 0.003 3jxt:B
17 2m0z:A 97 34 0.1327 0.1340 0.3824 0.003 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
18 2qt5:A 194 61 0.1735 0.0876 0.2787 0.003 2qt5:B
19 2qt5:A 194 80 0.2449 0.1237 0.3000 0.64 2qt5:B
20 7p70:A 407 49 0.1837 0.0442 0.3673 0.003 7pc4:A, 7qql:A
21 6q0m:B 94 86 0.2143 0.2234 0.2442 0.003
22 1zub:A 109 44 0.1735 0.1560 0.3864 0.004
23 2ka9:A 189 58 0.1735 0.0899 0.2931 0.004 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
24 7p73:A 420 46 0.1633 0.0381 0.3478 0.005 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
25 7pcb:A 415 42 0.1531 0.0361 0.3571 0.005 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
26 8bv7:A 95 36 0.1429 0.1474 0.3889 0.006 8buw:A, 8buw:B
27 7pc3:A 405 32 0.1327 0.0321 0.4062 0.007 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
28 7d6f:A 87 55 0.1735 0.1954 0.3091 0.007
29 4c2c:A 433 51 0.2143 0.0485 0.4118 0.008 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
30 3vqg:A 85 33 0.1531 0.1765 0.4545 0.011
31 5wou:A 95 61 0.1837 0.1895 0.2951 0.015
32 2koh:A 111 44 0.1531 0.1351 0.3409 0.018 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
33 3ch8:A 190 66 0.1633 0.0842 0.2424 0.018 2qbw:A
34 2i0i:A 81 35 0.1327 0.1605 0.3714 0.020 2i0i:B, 2i0i:C
35 8b82:A 108 46 0.1531 0.1389 0.3261 0.020 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
36 1n7t:A 103 66 0.1633 0.1553 0.2424 0.029 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
37 2exg:A 101 53 0.1531 0.1485 0.2830 0.032 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
38 5zys:A 90 47 0.1633 0.1778 0.3404 0.067
39 2pdz:A 86 54 0.2041 0.2326 0.3704 0.070
40 1ihj:B 95 82 0.2551 0.2632 0.3049 0.14 1ihj:A
41 4wyu:A 201 58 0.1837 0.0896 0.3103 0.20 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
42 4wyu:A 201 44 0.1633 0.0796 0.3636 0.62 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
43 8bq8:C 93 58 0.1327 0.1398 0.2241 0.26 8bq8:A, 8bq8:B
44 6ar4:B 87 54 0.1531 0.1724 0.2778 0.39 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
45 6gbe:A 119 50 0.1531 0.1261 0.3000 0.41
46 1l6o:A 95 47 0.1429 0.1474 0.2979 0.64 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
47 5ez0:D 95 34 0.1531 0.1579 0.4412 1.1 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
48 7qct:A 90 39 0.1429 0.1556 0.3590 1.1 7qct:B
49 6bxg:A 98 52 0.1939 0.1939 0.3654 1.2
50 3cyy:B 81 55 0.1531 0.1852 0.2727 1.7 3cyy:A
51 5t63:A 283 36 0.1122 0.0389 0.3056 1.7 5b6l:A, 5gnd:A
52 5oak:A 90 59 0.1939 0.2111 0.3220 2.4 5oak:C
53 2egn:A 83 67 0.1531 0.1807 0.2239 2.5
54 6zbq:A 89 31 0.1224 0.1348 0.3871 2.7 6zc4:A
55 8xud:D 651 36 0.1224 0.0184 0.3333 2.7 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
56 2kaw:A 90 32 0.1122 0.1222 0.3438 2.9 6lcb:A, 2mx6:A
57 6gaw:BC 571 48 0.1531 0.0263 0.3125 4.5 6gaz:BC, 6gb2:BC, 7po2:7, 8qrn:7, 6rw5:7
58 7qqm:A 413 55 0.1531 0.0363 0.2727 4.7
59 8ow8:A 401 24 0.0918 0.0224 0.3750 5.6
60 1cf3:A 581 53 0.1429 0.0241 0.2642 5.6 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
61 8c1t:A 90 29 0.1020 0.1111 0.3448 6.0 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
62 4xhv:A 94 64 0.1531 0.1596 0.2344 6.4
63 2ych:A 336 51 0.1735 0.0506 0.3333 6.5
64 6rm3:SB0 210 56 0.1735 0.0810 0.3036 6.7
65 2hxv:A 349 76 0.2245 0.0630 0.2895 7.2
66 2os6:A 89 75 0.2143 0.2360 0.2800 8.3
67 4bjr:A 500 44 0.1735 0.0340 0.3864 8.5 4b0t:A, 4b0t:B, 4bjr:B
68 9f8x:A 572 47 0.1429 0.0245 0.2979 8.5 9f8x:B, 9f8x:C, 9f8x:D, 1qni:A, 1qni:B, 1qni:C, 1qni:D, 1qni:E, 1qni:F
69 6x23:A 89 23 0.1020 0.1124 0.4348 8.6
70 8rd8:Sn 88 19 0.0918 0.1023 0.4737 9.2 8rdv:Sn, 8rdw:Sn
71 6n8e:A 1332 20 0.0816 0.0060 0.4000 9.2
72 2m0u:A 117 27 0.1327 0.1111 0.4815 9.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218