BioLiP

>protein
TCPFYKKIPGTGFTVDAFQYGVVEGCTAYFLTHFHSDHYAGLSKHFTFPVYCSEITGNLLKNKLHVQEQYIHPLPLDTEC
IVNGVKVVLLDANHCPGAVMILFYLPNGTVILHTGDFRADPSMERSLLADQKVHMLYLDTTYCSPEYTFPSQQEVIRFAI
NTAFEAVTLNPHALVVCGTYSIGKEKVFLAIADVLGSKVGMSQEKYKTLQCLNIPEINSLITTDMCSSLVHLLPMMQINF
KGLQSHLKKCGGKYNQILAFRPTGWTVIPQTKGNISIYGIPYSEHSSYLEMKRFVQWLKPQKIIPTVNVGTWKSRSTMEK
YFREWKLEAGY

The query sequence (length=331) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8c8b:A	341	341	1.0000	0.9707	0.9707	0.0	5ahr:A, 4b87:A, 8c8d:A, 8c8s:A, 8cew:A, 8cf0:A, 8cg9:A, 5nzw:A, 5nzx:A, 5nzy:A, 5q1j:A, 5q1k:A, 5q1l:A, 5q1m:A, 5q1n:A, 5q1o:A, 5q1p:A, 5q1q:A, 5q1r:A, 5q1s:A, 5q1t:A, 5q1u:A, 5q1v:A, 5q1w:A, 5q1x:A, 5q1y:A, 5q1z:A, 5q20:A, 5q22:A, 5q23:A, 5q24:A, 5q25:A, 5q26:A, 5q27:A, 5q28:A, 5q29:A
2	7a1f:L	335	314	0.3384	0.3343	0.3567	1.12e-48	7a1f:A, 5aho:A
3	7sgl:D	406	347	0.3112	0.2537	0.2968	1.15e-21	7abs:A, 7af1:A, 7afs:A, 7afu:A, 7agi:A, 7apv:A, 6tt5:AAA, 6wnl:A, 6wnl:B, 6wo0:A
4	5a0t:A	454	343	0.2326	0.1696	0.2245	1.75e-04	5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B
5	3zq4:A	550	143	0.1178	0.0709	0.2727	2.52e-04	3zq4:C, 3zq4:D, 3zq4:E
6	7wnu:B	554	148	0.1420	0.0848	0.3176	5.73e-04	7wnt:A, 7wnu:A
7	3t3o:A	553	159	0.1269	0.0759	0.2642	6.65e-04	3bk1:A, 3bk2:A, 3t3n:A
8	6k6s:A	443	145	0.1178	0.0880	0.2690	0.003	6k6s:B
9	4xww:A	545	150	0.1269	0.0771	0.2800	0.018	4xwt:A, 4xwt:B, 4xww:B
10	6r79:A	220	41	0.0514	0.0773	0.4146	0.054	6r73:A, 6r73:B, 6r78:A, 6r78:B, 6r79:D, 6r79:B, 6r79:C, 6rzr:A, 6rzr:B, 6rzs:A, 6rzs:B, 6s0h:A, 6s0h:B, 4ubq:A, 6yi4:AAA, 6yi4:BBB, 6yi4:CCC
11	6jka:C	228	83	0.0695	0.1009	0.2771	0.16	4c1f:A, 4c1f:B, 4c1g:A, 4c1g:B, 1dd6:A, 1dd6:B, 1ddk:A, 2doo:A, 2doo:B, 7dtm:A, 7dtm:B, 7dtm:C, 7dtm:D, 7dtn:A, 7dtn:B, 7dtn:C, 7dtn:D, 5ev6:A, 5ev6:B, 5ev6:C, 5ev6:D, 5ev8:A, 5ev8:C, 5ev8:B, 5ev8:D, 5ewa:A, 5ewa:B, 5ewa:C, 5ewa:D, 4f6h:A, 4f6z:A, 5hh4:A, 5hh4:B, 5hh4:C, 5hh4:D, 8hyb:A, 8hyb:B, 8hyb:C, 8hyb:D, 8jao:A, 8jao:B, 6jed:A, 1jje:A, 1jje:B, 1jjt:A, 1jjt:B, 6jka:A, 6jka:B, 6jka:D, 6lbl:A, 4uam:A, 4uam:B, 4uam:C, 4uam:D, 1vgn:A, 1vgn:B, 1wuo:A, 1wuo:B, 1wuo:C, 1wuo:D, 1wup:A, 1wup:B, 1wup:C, 1wup:D, 3wxc:A, 3wxc:B, 7wzu:A, 7wzu:B, 7wzu:C, 7wzu:D, 7xhw:A, 7xhw:B, 7xhw:C, 7xhw:D, 7xhx:A, 7xhx:B, 7xhx:C, 7xhx:D, 8y0s:A, 8y0s:B, 8y0s:C, 8y0s:D, 5y5b:A, 7yh9:A, 7yh9:B, 7yh9:C, 7yh9:F, 7yh9:D, 7yh9:E, 7yha:A, 7yha:B, 7yha:C, 7yha:D, 8z5l:A, 8z5l:B, 8z5l:C, 8z5l:D, 6zyr:A, 6zyr:B, 6zyr:C, 6zyr:D, 6zys:A, 6zys:B, 6zys:C, 6zys:D
12	6l3s:A	218	40	0.0483	0.0734	0.4000	0.37	6l3s:B
13	8fn0:B	212	59	0.0514	0.0802	0.2881	0.90
14	5b3r:B	219	38	0.0483	0.0731	0.4211	1.6	5b3r:A
15	4ojv:A	363	23	0.0363	0.0331	0.5217	1.8	4ojx:A
16	1e5e:A	394	75	0.0604	0.0508	0.2667	2.7	1e5e:B, 1e5f:A, 1e5f:B
17	5min:B	453	147	0.0997	0.0728	0.2245	3.6	1c9u:A, 1c9u:B, 1cq1:A, 1cq1:B, 1cru:A, 1cru:B, 5min:A, 1qbi:A, 1qbi:B, 8re0:A, 8re0:B, 8rfk:A, 8rfk:B, 8rg1:A, 8rg1:B
18	7qv7:A	174	85	0.0544	0.1034	0.2118	3.8	7qv7:G
19	4xeb:A	430	94	0.0755	0.0581	0.2660	4.5
20	3fm2:A	134	55	0.0483	0.1194	0.2909	6.3	3fm2:B
21	1x9p:A	460	62	0.0514	0.0370	0.2742	6.7	2c9f:A, 2c9f:B, 2c9f:C, 2c9f:D, 2c9f:E, 3izo:A, 3izo:B, 3izo:C, 3izo:D, 3izo:E, 4v4u:A, 4v4u:B, 4v4u:C, 4v4u:D, 4v4u:E, 1x9t:A

[Back]