Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
TARSKVGGSGDQTWVQCDACLKWRKLPDGMDQLPEKWYCSNNPDPQFRNCEVPEEPE

The query sequence (length=57) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6o5w:A 57 57 1.0000 1.0000 1.0000 1.60e-38
2 6o1e:A 431 47 0.8246 0.1090 1.0000 1.84e-33 5ix1:B, 5ix2:A, 5ix2:B, 4qq4:A, 4qq4:B, 5svi:A, 5svi:B, 5svx:A, 5svy:A
3 5ix1:A 414 47 0.8070 0.1111 0.9787 4.38e-33
4 7k7t:A 390 47 0.5088 0.0744 0.6170 2.88e-13 7k7t:B
5 5ofb:B 541 45 0.3860 0.0407 0.4889 7.33e-10 5of9:A, 5of9:B, 5ofa:B, 5ofa:A, 5ofb:A
6 6qxz:A 79 57 0.3684 0.2658 0.3684 5.97e-08
7 2l7p:A 100 50 0.3333 0.1900 0.3800 7.95e-08 5yvx:A
8 2e61:A 69 47 0.3684 0.3043 0.4468 1.39e-06 2rr4:A
9 4o62:B 57 50 0.3509 0.3509 0.4000 9.17e-06 4o62:A, 4o62:C, 4z0o:A, 4z0r:B, 4z0r:A, 4z0r:C
10 8e1u:A 1126 18 0.1754 0.0089 0.5556 2.2 8e1u:B, 8e1u:C, 8e1u:D, 8e1u:E, 8e1u:F, 8e1u:G, 8e1u:H
11 6ghs:A 285 24 0.1404 0.0281 0.3333 2.6
12 3n9m:A 503 34 0.2281 0.0258 0.3824 2.7 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
13 7yet:A 999 17 0.1404 0.0080 0.4706 3.0
14 5kqu:C 459 22 0.1579 0.0196 0.4091 3.2 5kqt:A, 5kqu:A, 5kqu:D, 5kqu:B, 5kqu:E, 5kqu:F
15 7yes:A 1369 17 0.1404 0.0058 0.4706 3.4 8jsl:A, 8jsm:A, 8jsn:A, 7yer:A
16 3fz3:A 388 18 0.1404 0.0206 0.4444 4.2 3fz3:D, 3fz3:E
17 3fz3:B 410 18 0.1404 0.0195 0.4444 4.2 3fz3:C, 3fz3:F
18 3jcs:N 213 19 0.1228 0.0329 0.3684 7.1 6az3:N, 8ovj:N, 8rxh:LN, 8rxx:LN, 5t2a:J
19 9ja1:A 1286 32 0.1930 0.0086 0.3438 7.2
20 8tvs:A 1316 32 0.1930 0.0084 0.3438 7.2
21 8u9x:A 1398 32 0.1930 0.0079 0.3438 7.2 6blo:A, 6blp:A, 6bm2:A, 6bm4:A, 6bqf:A, 1i6h:A, 7ked:A, 1nik:A, 1r5u:A, 1r9s:A, 7rim:A, 7rip:A, 7riw:A, 7rix:A, 7riy:A, 8u9r:A, 8ukq:A, 8ukr:A, 8uks:A, 8ukt:A, 8uku:A, 6upx:A, 6upy:A, 6upz:A, 6uq0:A, 6uq1:A, 6uq2:A, 6uq3:A, 5w4u:A, 5w51:A
22 2e8y:A 712 21 0.1754 0.0140 0.4762 7.3 2e8y:B, 2e8z:A, 2e8z:B, 2e9b:A, 2e9b:B
23 7z1i:A 493 31 0.2281 0.0264 0.4194 7.4 7z1i:B, 7z1i:D
24 8tug:A 1367 32 0.1930 0.0080 0.3438 7.4 8tvp:A, 8tvq:A, 8tvv:A, 8tvw:A, 8tvx:A
25 193l:A 129 26 0.1579 0.0698 0.3462 7.5 194l:A, 3a34:A, 6a4n:A, 6a4o:A, 6a4p:A, 6a4q:A, 3a91:A, 3a92:A, 3a93:A, 3a94:A, 3a95:A, 8a9e:AAA, 8aaz:A, 6ad5:A, 6adf:A, 6aea:A, 3agi:A, 6agn:A, 6agr:A, 6ahh:A, 6ahl:A, 3ajn:A, 8aj3:A, 8aj4:AAA, 8aj5:AAA, 3ato:A, 1azf:A, 1b0d:A, 2b5z:A, 5b59:A, 5b5j:A, 3b6l:A, 3b72:A, 4bad:A, 4baf:A, 4bap:A, 7bcu:A, 7bcx:A, 7bd0:A, 7bdz:AAA, 7be0:AAA, 7be1:AAA, 7be2:AAA, 7beb:AAA, 7bec:AAA, 7bmo:A, 7bmp:A, 7bmq:A, 7bms:A, 7bmt:A, 6bo1:A, 6bo2:A, 8bov:AAA, 8boy:AAA, 8bph:AAA, 8bpj:AAA, 8bpu:AAA, 8bqm:AAA, 8bqp:A, 8bqq:A, 8bqr:A, 8bqt:A, 1c10:A, 4c3w:A, 5c6i:A, 5c6j:A, 5c6l:A, 6ciw:A, 8cl5:A, 8cl6:A, 7cqo:A, 2d4i:A, 2d4i:B, 2d4k:A, 2d4k:N, 2d6b:A, 6d6f:A, 4dd0:A, 4dd1:A, 4dd1:B, 4dd2:A, 4dd3:A, 4dd7:A, 4dd9:A, 4ddb:A, 4ddc:A, 4ddc:B, 1dpw:A, 1dpx:A, 3e3d:A, 4e3u:A, 5e9r:A, 3ems:A, 9enz:AAA, 4eof:A, 9ex0:A, 9ex1:A, 9ex2:A, 5f14:A, 5f16:A, 6f1p:A, 6f1r:A, 6f2i:A, 6f2j:A, 2f30:A, 2f4a:A, 2f4g:A, 5f9u:A, 5f9x:A, 6f9x:A, 2fbb:A, 5fcp:A, 5fhw:A, 4fjr:A, 6fro:A, 2g4p:A, 2g4q:A, 4g49:A, 4g4b:A, 4g4c:A, 4g4h:A, 6g5c:A, 6g5v:A, 6g5y:A, 4gcb:A, 4gcc:A, 4gcd:A, 4gce:A, 6gnl:A, 6gob:A, 6goh:A, 1gwd:A, 4h1p:A, 1h6m:A, 1h87:A, 2h9j:A, 2h9k:A, 1hf4:A, 1hf4:B, 5hmj:A, 4hp0:A, 4hpi:A, 4hsf:A, 2htx:A, 2hu1:A, 6hy4:A, 6hy6:B, 6hy8:A, 6hyb:A, 5i4x:A, 5i53:A, 5i54:A, 1iee:A, 5iel:A, 4ii8:A, 5ii3:A, 4j7v:A, 1jj0:A, 7jmu:A, 7jmu:B, 1jse:A, 6k5q:A, 7kh5:A, 4kxi:A, 1lcn:A, 1lcn:B, 4lgk:A, 1lks:A, 1lpi:A, 1lsz:A, 4lt0:A, 4lt2:A, 4lt3:A, 2lyo:A, 3lyo:A, 9lyz:A, 1lz9:A, 2lzt:A, 3lzt:A, 4lzt:A, 4m4o:A, 4m6d:A, 4m6d:C, 4m6d:E, 4m6d:G, 4m6d:I, 4m6d:K, 4mr1:A, 6mx9:A, 4n0j:A, 4n0j:B, 1n4f:A, 5nbj:A, 4ng8:A, 4ngj:A, 4ngw:A, 4ngy:A, 4ngz:A, 4nhp:A, 4nhq:A, 4nhs:A, 4nht:A, 4nij:A, 5nj1:A, 4nsg:A, 4nsh:A, 4nsi:A, 4nwh:A, 5ob6:A, 5ob7:A, 5ob8:A, 5ob9:A, 5oer:A, 8om8:AAA, 8oms:AAA, 8omt:AAA, 4ooo:A, 4owb:A, 4owh:A, 8owc:A, 8p1c:A, 8p1d:A, 8p2q:A, 3p64:A, 3p65:A, 3p66:A, 3p68:A, 6pbb:A, 2pc2:A, 8pfv:AAA, 8pfw:A, 8pfx:A, 4phi:A, 4phi:B, 4phi:C, 4phi:D, 8ph5:AAA, 8ph6:A, 8ph7:A, 8ph8:AAA, 8piw:A, 6pl9:A, 6pla:A, 6plb:A, 8pob:A, 4prq:A, 4prq:C, 4prq:D, 4prq:B, 4pru:A, 4pru:B, 8pte:AAA, 2q0m:X, 7q0t:A, 7q0u:A, 7q0v:A, 6q8r:A, 8qcu:A, 3qe8:A, 3qe8:B, 6qea:A, 3qng:A, 1qtk:A, 6qww:A, 4qy9:A, 4r6c:A, 6ro3:A, 6ro5:A, 6ro5:B, 3rt5:X, 6rt9:A, 8rt2:A, 8rt3:A, 3ru5:A, 7rxy:AAA, 7rxy:BBB, 7ryd:AAA, 7ryd:BBB, 7ryk:AAA, 7ryk:BBB, 7rz0:AAA, 7rz1:A, 7rz2:AAA, 6seu:A, 6sew:A, 6sex:A, 6sez:A, 3sp3:A, 6sr0:A, 6sr1:A, 6sr2:A, 6sr3:A, 6sr4:A, 6sr5:A, 6syc:A, 6syc:B, 6syd:A, 6sye:A, 1t3p:A, 5t3f:A, 3t6u:A, 5tk0:A, 3tmu:A, 3tmv:A, 3tmw:A, 3tmx:A, 4tun:A, 4tun:B, 6tvl:A, 6tvy:A, 4tws:A, 3txe:A, 3txg:A, 3txh:A, 3txi:A, 3txk:A, 1uc0:A, 1uib:A, 1uih:A, 5v4g:A, 5v4h:A, 5v4i:A, 1v7s:A, 1v7t:A, 1v7t:B, 2vb1:A, 1w6z:A, 3w6a:A, 6w7p:A, 4w94:A, 4w96:A, 8wzf:A, 8wzg:A, 8wzr:A, 8wzt:A, 8wzv:A, 4xad:A, 2xjw:A, 2xth:A, 4xyy:A, 2ybh:A, 2ybi:A, 2ybj:A, 2ybl:A, 2ybm:A, 2ybn:A, 2ydg:A, 1yik:A, 1yil:A, 6yjx:A, 1yky:X, 1ykz:X, 7yrk:A, 2z12:A, 2z18:A, 2z19:A, 4z3m:A, 4z41:A, 4z46:A, 4zee:A, 4zfp:A, 6zs8:AAA, 7zu6:AAA, 2zyp:A
26 8cen:A 1508 32 0.1930 0.0073 0.3438 8.0 4a3b:A, 4a3c:A, 4a3d:A, 4a3e:A, 4a3f:A, 4a3g:A, 4a3i:A, 4a3j:A, 4a3k:A, 4a3l:A, 4a3m:A, 4a93:A, 2b63:A, 2b8k:A, 4bbr:A, 4bbs:A, 4bxx:A, 4bxz:A, 4by1:A, 4by7:A, 5c3e:A, 5c44:A, 5c4a:A, 5c4x:A, 8ceo:A, 2e2h:A, 2e2i:A, 2e2j:A, 3fki:A, 5fmf:A, 5fyw:A, 5fz5:A, 3gtj:A, 3gtl:A, 3gtm:A, 3gto:A, 3gtp:A, 3gtq:A, 6gyk:A, 6gyl:A, 6gym:A, 3h3v:B, 3hou:A, 3hou:M, 3hov:A, 3how:A, 3hox:A, 3hoy:A, 3hoz:A, 1i3q:A, 3i4m:A, 3i4n:A, 1i50:A, 6i84:A, 5ip7:A, 5ip9:A, 3j0k:A, 2ja5:A, 2ja6:A, 2ja7:A, 2ja7:M, 2ja8:A, 8jch:A, 3k1f:A, 8k5p:A, 3k7a:A, 7kee:A, 7kef:A, 3m3y:A, 3m4o:A, 7mei:a, 7mei:A, 7mk9:A, 7mka:a, 7ml0:A, 7ml1:A, 7ml2:A, 7ml4:A, 7nkx:A, 7nky:A, 2nvq:A, 2nvt:A, 2nvx:A, 2nvy:A, 2nvz:A, 7o4i:A, 7o4j:A, 6o6c:A, 7o72:A, 7o73:A, 7o75:A, 5oqj:A, 5oqm:A, 5ot2:A, 3po2:A, 3po3:A, 3qt1:A, 2r7z:A, 1r9t:A, 2r92:A, 2r93:A, 7riq:A, 3rzd:A, 3rzo:A, 3s14:A, 3s15:A, 3s16:A, 3s17:A, 3s1m:A, 3s1n:A, 3s1q:A, 3s1r:A, 3s2d:A, 3s2h:A, 1sfo:A, 5sva:A, 1twf:A, 5u5q:A, 4v1m:A, 4v1n:A, 4v1o:A, 2vum:A, 1wcm:A, 4x67:A, 4x6a:A, 1y1v:A, 1y1w:A, 4y52:A, 1y77:A, 4y7n:A, 2yu9:A, 7zs9:A, 7zsa:A, 7zsb:A
27 5vvs:A 1455 32 0.1930 0.0076 0.3438 8.2 5c4j:A, 3gtg:A, 3gtk:A, 8tvy:A, 5vvr:A
28 6d3a:A 347 9 0.1228 0.0202 0.7778 8.5 7akr:AAA, 7akr:BBB, 7akr:CCC, 7akr:DDD, 7aks:AAA, 7aks:CCC, 7aks:EEE, 7aks:GGG, 7arw:A, 7arw:B, 6d36:C, 6d36:D, 6d36:A, 6d36:B, 6d3a:C, 6d3a:D, 6d3a:B, 2foz:A, 2fp0:A, 2fp0:B, 2g4k:A, 7l9f:C, 7l9f:D, 7l9f:A, 7l9f:B, 7l9h:C, 7l9h:D, 7l9h:A, 7l9h:B, 7l9i:C, 7l9i:D, 7l9i:A, 7l9i:B, 2qty:A, 2qty:B, 5zqy:A
29 4kto:A 377 16 0.1579 0.0239 0.5625 9.2 4kto:C, 4kto:B, 4kto:D
30 6zu5:LI0 209 20 0.1404 0.0383 0.4000 9.5

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218