BioLiP

>protein
SYNNIPAGKDAPNDIYVIIEIPANAAPIKYEIDKDSDALFVDRFMGTAMFYPANYGYVPNTLSEDGDPLDVLVVTPYPVA
AGSVIRCRPVGKLNMEDDGGIDAKLIAVPHEKLSPLYKDVKEYTDLPQLLINQVEHFFSHYKDLEPGKWVKISGWEGADV
AKAEVIKAIEAAK

The query sequence (length=173) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6k21:A	173	173	1.0000	1.0000	1.0000	9.52e-126	6k27:A, 6k27:B, 6k27:C, 6k27:D, 6k27:E, 6k27:F, 6k27:G, 6k27:H, 6ki8:A, 6ki8:B, 6ki8:C
2	2au6:A	175	173	0.6821	0.6743	0.6821	4.46e-85	2au7:A, 2au8:A, 2au9:A, 2auu:A, 1i40:A, 1i6t:A, 1ino:A, 1ipw:A, 1ipw:B, 1jfd:A, 1jfd:B, 1mjw:A, 1mjw:B, 1mjx:A, 1mjx:B, 1obw:A, 1obw:B, 1obw:C, 4um4:A, 4um4:B, 4um4:C
3	3ej2:A	182	169	0.5434	0.5165	0.5562	8.31e-71	3eiy:A, 3ej0:A
4	3tr4:B	171	165	0.4855	0.4912	0.5091	9.88e-56	3tr4:A, 3tr4:C, 3tr4:D, 3tr4:E, 3tr4:F
5	1qez:A	169	163	0.4913	0.5030	0.5215	4.37e-55	1qez:F, 1qez:B, 1qez:C, 1qez:D, 1qez:E
6	2bqy:A	170	159	0.4624	0.4706	0.5031	2.53e-50
7	3q46:A	178	172	0.3988	0.3876	0.4012	8.13e-42	3i98:A, 3i98:B, 3i98:C, 3i98:D, 3i98:E, 3i98:F, 3q3l:A, 3q3l:B, 3q3l:C, 3q3l:D, 3q3l:E, 3q3l:F, 3q4w:A, 3q5v:A, 3q5v:B, 3r5u:A, 3r5u:B, 3r5v:A, 3r5v:B, 3r5v:C, 3r5v:D, 3r5v:E, 3r5v:F, 5ucq:A, 5ucq:B, 5ucq:C
8	4z71:B	163	157	0.3873	0.4110	0.4268	7.79e-39	5kde:A, 5kdf:A, 1wcf:A, 4z70:A, 4z70:B, 4z70:C, 4z71:A, 4z71:C, 4z72:A, 4z73:A, 4z73:B, 4z73:C, 4z73:D, 4z73:F, 4z73:G, 4z73:E, 4z73:H, 4z73:I, 4z73:J, 4z73:K, 4z73:L, 4z74:A, 4z74:B, 4z74:C, 4z74:D, 4z74:F, 4z74:G, 4z74:E, 4z74:H, 4z74:I, 4z74:J, 4z74:K, 4z74:L
9	5tea:B	174	156	0.3642	0.3621	0.4038	9.11e-32	5tea:A, 5tea:C, 5tea:D, 5tea:E, 5tea:F
10	8qpt:B	289	171	0.2775	0.1661	0.2807	1.75e-06	8qpt:A
11	5cuv:A	382	108	0.1734	0.0785	0.2778	3.87e-06	5cuu:A, 5cuu:B, 5cuv:B, 5cux:A, 5cux:B
12	4qlz:A	284	132	0.2254	0.1373	0.2955	7.78e-06	4qlz:B
13	2ik0:B	286	183	0.2775	0.1678	0.2623	2.01e-05	117e:A, 117e:B, 1e6a:A, 1e6a:B, 1e9g:A, 1e9g:B, 1huj:A, 1huj:B, 1huk:A, 1huk:B, 2ihp:A, 2ihp:B, 2ik0:A, 2ik1:A, 2ik1:B, 2ik2:A, 2ik2:B, 2ik4:A, 2ik4:B, 2ik6:A, 2ik6:B, 2ik7:A, 2ik7:B, 2ik9:A, 1m38:A, 1m38:B, 8prk:A, 8prk:B, 1wgi:A, 1wgi:B, 1wgj:A, 1wgj:B, 1ypp:A, 1ypp:B
14	7btn:A	275	95	0.1676	0.1055	0.3053	7.13e-05
15	5cuy:D	396	109	0.1561	0.0682	0.2477	7.26e-05	5c5v:A, 5c5v:B, 5cuy:A, 5cuy:B, 5cuy:C
16	5wrt:A	235	168	0.2486	0.1830	0.2560	7.30e-05	5wrt:B
17	5wru:B	308	168	0.2312	0.1299	0.2381	9.37e-05
18	8axs:A	573	80	0.1387	0.0419	0.3000	0.17	8axi:A, 8axi:B, 8axs:B, 8axt:A, 8axt:B, 8hls:A, 8hls:B
19	8gyw:B	380	56	0.0983	0.0447	0.3036	0.26	8gyw:A, 8gyx:B, 8gyx:A
20	5t25:A	293	42	0.0925	0.0546	0.3810	1.8	2ats:A, 2ats:B, 3i7s:A, 3i7s:B, 7jz8:A, 7jz8:B, 7jza:A, 7jza:B, 7jzb:A, 7jzb:B, 7jzg:A, 7jzg:B, 5t25:B, 1yxd:A, 1yxd:B
21	6s5f:A	188	36	0.0809	0.0745	0.3889	2.3
22	3bj1:A	142	15	0.0520	0.0634	0.6000	5.4	3bj1:C, 3bj2:A, 3bj2:C, 3bj3:A, 3bj3:C, 1xq5:A, 1xq5:C
23	3bcq:A	142	15	0.0520	0.0634	0.6000	6.4	3bcq:C
24	6g4r:B	322	53	0.0983	0.0528	0.3208	6.4	6g1b:J, 6g4r:E

[Back]