Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SYLVLIRITPDEDGKFGFNLKGGVDQKMPLVVSRINPESPADTCIPKLNEGDQIVLINGRDISEHTHDQVVMFIKASRES
HSRELALVIRR

The query sequence (length=91) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6hks:B 94 91 1.0000 0.9681 1.0000 1.04e-63 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
2 5ez0:D 95 88 0.7033 0.6737 0.7273 3.27e-46 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
3 2pdz:A 86 72 0.2747 0.2907 0.3472 1.09e-09
4 4ydp:A 83 84 0.3407 0.3735 0.3690 1.11e-09 4ydp:B
5 7p70:A 407 70 0.2747 0.0614 0.3571 4.26e-08 7pc4:A, 7qql:A
6 4e34:A 87 68 0.2418 0.2529 0.3235 8.63e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
7 2r4h:C 98 76 0.2747 0.2551 0.3289 3.52e-07
8 7qqn:C 414 77 0.2747 0.0604 0.3247 6.08e-07 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
9 2m0u:A 117 78 0.2857 0.2222 0.3333 1.60e-05
10 5zys:A 90 77 0.2527 0.2556 0.2987 2.62e-05
11 5heb:A 119 65 0.2418 0.1849 0.3385 4.16e-05 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
12 1n7t:A 103 79 0.2637 0.2330 0.3038 5.47e-05 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
13 7d6f:A 87 65 0.2637 0.2759 0.3692 1.14e-04
14 2l4t:A 124 67 0.2527 0.1855 0.3433 1.81e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
15 3jxt:A 96 60 0.2418 0.2292 0.3667 2.06e-04 3jxt:B
16 7p73:A 420 67 0.2857 0.0619 0.3881 3.70e-04 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
17 7weg:B 96 78 0.2527 0.2396 0.2949 5.28e-04 7weg:A
18 6xa7:B 96 82 0.2857 0.2708 0.3171 8.68e-04 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
19 1ihj:B 95 78 0.2747 0.2632 0.3205 0.001 1ihj:A
20 7qqm:A 413 84 0.2747 0.0605 0.2976 0.001
21 7pcb:A 415 97 0.3297 0.0723 0.3093 0.003 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
22 3ch8:A 190 70 0.2308 0.1105 0.3000 0.003 2qbw:A
23 6x23:A 89 65 0.2418 0.2472 0.3385 0.004
24 6q0m:B 94 79 0.2418 0.2340 0.2785 0.005
25 4wyu:A 201 90 0.2747 0.1244 0.2778 0.005 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
26 7x2e:A 163 63 0.2418 0.1350 0.3492 0.007 2kbs:A
27 3bpu:A 86 80 0.2747 0.2907 0.3125 0.008
28 5wou:A 95 62 0.2088 0.2000 0.3065 0.011
29 8blu:B 195 83 0.2527 0.1179 0.2771 0.024 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
30 2egn:A 83 63 0.2418 0.2651 0.3492 0.025
31 5n7d:A 423 61 0.2198 0.0473 0.3279 0.055 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
32 2kpl:A 129 72 0.2527 0.1783 0.3194 0.064
33 7pc5:A 405 78 0.2418 0.0543 0.2821 0.074
34 3tsz:A 341 58 0.2088 0.0557 0.3276 0.10 3shw:A
35 2qt5:A 194 71 0.1868 0.0876 0.2394 0.11 2qt5:B
36 2m0v:A 128 63 0.2308 0.1641 0.3333 0.14
37 2m0z:A 97 70 0.1758 0.1649 0.2286 0.15 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
38 6yx0:B 112 91 0.2637 0.2143 0.2637 0.24 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
39 3pv3:A 392 37 0.1648 0.0383 0.4054 0.56 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
40 2i0i:A 81 47 0.1868 0.2099 0.3617 0.73 2i0i:B, 2i0i:C
41 8bq8:C 93 73 0.2198 0.2151 0.2740 0.93 8bq8:A, 8bq8:B
42 2os6:A 89 70 0.1978 0.2022 0.2571 1.0
43 6ew9:A 305 31 0.1209 0.0361 0.3548 1.1 6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
44 2ejy:A 85 31 0.1209 0.1294 0.3548 1.2
45 7pc3:A 405 69 0.2308 0.0519 0.3043 1.5 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
46 5gm8:B 173 46 0.1209 0.0636 0.2391 2.0 5gm8:A, 5gm8:C, 5gm8:D
47 3vqg:A 85 82 0.2637 0.2824 0.2927 2.4
48 2mnj:B 88 63 0.1868 0.1932 0.2698 3.1
49 6ar4:B 87 70 0.1868 0.1954 0.2429 4.2 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
50 7tj3:A 164 68 0.1868 0.1037 0.2500 5.7
51 4xh7:A 110 65 0.1868 0.1545 0.2615 5.8
52 1u96:A 69 41 0.1319 0.1739 0.2927 6.2
53 1rzx:A 98 55 0.1538 0.1429 0.2545 6.5 5i7z:A, 1x8s:A
54 8esq:r 166 45 0.1209 0.0663 0.2444 7.8 8esr:r, 8etc:r, 8etg:r, 8eti:r, 8etj:r, 8eup:r, 8euy:r, 8ev3:r
55 7ykg:A 188 67 0.1758 0.0851 0.2388 8.5 7ykf:A, 7ykf:C, 7ykg:C, 7ykh:A, 7ykh:C, 7yki:A, 7yki:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218