Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SYAHFGIHEEMLKDEVRTLTYRNSMYHNKHVFKDKVVLDVGSGTGILSMFAAKAGAKKVFGIECSSISDYSEKIIKANHL
DNIITIFKGKVEEVELPVEKVDIIISEWMGYCLFYESMLNTVIFARDKWLKPGGLMFPDRAALYVVAIEDRQYKDFKIHW
WENVYGFDMTCIRDVAMKEPLVDIVDPKQVVTNACLIKEVDIYTVKTEELSFTSAFCLQIQRNDYVHALVTYFNIEFTKC
HKKMGFSTAPDAPYTHWKQTVFYLEDYLTVRRGEEIYGTISMKPNAKNVRDLDFTVDLDFKGQLCETSVSNDYKMR

The query sequence (length=316) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5dst:C 317 316 1.0000 0.9968 1.0000 0.0 5dst:A, 5dst:B, 5dst:D, 5dst:E, 5dst:F, 5dst:G, 5dst:H, 5dst:I, 5dst:J, 5dst:K, 5dst:L, 5dst:M, 5dst:N, 5dst:O, 4x41:A
2 6nt2:A 330 316 0.8354 0.8000 0.8354 0.0 6nt2:D, 6nt2:B, 6nt2:C, 1or8:A, 1orh:A, 1ori:A, 3q7e:A
3 6dnz:A 317 317 0.5063 0.5047 0.5047 1.84e-107 6dnz:C
4 6cu5:A 314 316 0.4968 0.5000 0.4968 3.48e-106 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
5 1f3l:A 321 304 0.4652 0.4579 0.4836 3.31e-103 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A
6 8pjd:A 347 318 0.3449 0.3141 0.3428 3.30e-65 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
7 4y2h:B 352 305 0.3449 0.3097 0.3574 3.47e-64 4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B
8 5fub:A 337 306 0.3291 0.3086 0.3399 1.42e-62 5g02:A
9 3r0q:G 353 333 0.3449 0.3088 0.3273 1.47e-60 3r0q:C, 3r0q:A, 3r0q:E
10 7qrd:C 364 317 0.3481 0.3022 0.3470 5.45e-57 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
11 4lwp:B 342 301 0.3165 0.2924 0.3322 1.68e-37 4lwp:A
12 5eku:B 347 175 0.1677 0.1527 0.3029 1.64e-16 5eku:A, 4m37:A, 4m38:A, 4m38:B
13 7rbq:A 614 153 0.1551 0.0798 0.3203 1.86e-13 7t39:A
14 3wst:I 644 122 0.1234 0.0606 0.3197 1.40e-10 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
15 4c4a:A 641 154 0.1392 0.0686 0.2857 4.83e-09 6ogn:A
16 4c4a:A 641 152 0.1424 0.0702 0.2961 1.55e-07 6ogn:A
17 3sxj:A 245 114 0.1013 0.1306 0.2807 1.27e-04 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
18 4lg1:A 217 99 0.0981 0.1429 0.3131 0.014 8hl6:A, 8hl7:A, 4lg1:B, 4lg1:C, 7oat:C
19 3grr:A 263 78 0.0918 0.1103 0.3718 0.037 3gru:A, 3grv:A, 3gry:A
20 3uj7:A 259 108 0.1044 0.1274 0.3056 0.059 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
21 3t7s:A 246 103 0.0886 0.1138 0.2718 0.070 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
22 4rfq:A 270 84 0.0791 0.0926 0.2976 0.077
23 4g56:A 617 120 0.0981 0.0502 0.2583 0.12 4g56:C
24 1wy7:D 204 73 0.0791 0.1225 0.3425 0.23 1wy7:A, 1wy7:B, 1wy7:C
25 3dlc:A 219 98 0.0886 0.1279 0.2857 0.24
26 7wzg:B 243 107 0.0981 0.1276 0.2897 0.32 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
27 5y6p:eZ 309 52 0.0475 0.0485 0.2885 0.45 5y6p:eY
28 3cjt:A 254 79 0.0665 0.0827 0.2658 0.49 3cjq:A, 3cjq:D, 3cjq:G, 3cjr:A, 3cjt:C, 3cjt:E, 3cjt:G, 3cjt:I, 3cjt:K, 3cjt:M, 3cjt:O, 3egv:A, 2nxe:A, 2nxe:B, 2zbp:A, 2zbq:A, 2zbr:A
29 4ese:A 193 95 0.0538 0.0881 0.1789 0.58
30 8x3w:A 270 94 0.0949 0.1111 0.3191 0.74 8x3w:B, 8x41:A, 8x41:B, 8x44:A, 8x44:B, 8x45:A, 8x45:B, 8x46:A, 8x46:B, 8x47:A, 8x4i:A, 8x4l:A, 8x4l:B, 8x4o:A, 8x4o:B, 8x4p:A, 8x4p:B
31 1wzn:A 244 175 0.1456 0.1885 0.2629 0.78 1wzn:B, 1wzn:C
32 2avn:A 247 100 0.0728 0.0931 0.2300 0.82 2avn:B
33 5fad:A 160 111 0.1044 0.2062 0.2973 0.84 5fa8:A
34 2zwv:A 373 109 0.1013 0.0858 0.2936 0.94 3dmf:A, 3dmg:A, 3dmh:A, 2zul:A
35 5z9o:A 373 36 0.0506 0.0429 0.4444 1.2 5z9o:B
36 1l3i:A 186 104 0.0949 0.1613 0.2885 1.3 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
37 5wp5:A 463 116 0.1076 0.0734 0.2931 1.5 5wp5:B
38 1g55:A 313 44 0.0475 0.0479 0.3409 1.8
39 1hyo:B 419 77 0.0570 0.0430 0.2338 2.2 1hyo:A, 2hzy:A, 2hzy:B, 1qcn:A, 1qcn:B, 1qco:A, 1qco:B, 1qqj:A, 1qqj:B
40 4qpn:A 203 25 0.0348 0.0542 0.4400 3.1
41 4mtl:B 219 26 0.0316 0.0457 0.3846 3.3 4mtl:A
42 6wlf:B 434 108 0.0949 0.0691 0.2778 3.8 6wlf:A
43 6h2v:A 210 31 0.0411 0.0619 0.4194 4.0 6h2u:A, 6h2v:C
44 3u43:B 132 42 0.0506 0.1212 0.3810 4.3
45 1jn1:A 157 90 0.0823 0.1656 0.2889 4.4 1jn1:B, 1jn1:C, 1vh8:A, 1vh8:B, 1vh8:C, 1vh8:D, 1vh8:E, 1vh8:F, 1vha:A, 1vha:B, 1vha:C, 1vha:D, 1vha:E, 1vha:F
46 1nfp:A 228 57 0.0506 0.0702 0.2807 5.2
47 5je1:A 244 109 0.0759 0.0984 0.2202 5.3 5jdy:A, 5jdy:B, 5jdz:A, 5jdz:B, 5je0:A, 5je0:B, 5je1:B, 5je2:A, 5je2:B, 5je3:A, 5je3:B, 5je4:A, 5je4:B, 5je5:A
48 3dtn:A 220 40 0.0443 0.0636 0.3500 6.0 3dtn:B
49 2oxt:A 265 78 0.0791 0.0943 0.3205 7.3 2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
50 6kms:C 210 79 0.0696 0.1048 0.2785 7.6 8cnc:A, 6h1d:A, 6h1e:A, 6k0x:A, 6khs:A, 6kmr:B, 6kms:D, 6ped:A, 8qdg:A, 8qdi:A
51 7bo7:AAA 625 81 0.0696 0.0352 0.2716 7.7 7boc:A, 5c9z:A, 6ckc:A, 8csg:A, 8ctb:A, 8cyi:A, 5emj:A, 5emk:A, 5eml:A, 5emm:A, 9eyu:A, 9eyv:A, 9eyw:A, 9eyx:A, 5fa5:A, 8g1u:A, 8g1u:E, 8g1u:I, 8g1u:M, 4gqb:A, 6k1s:A, 7kib:A, 7kic:A, 7kid:A, 7l1g:A, 7m05:A, 7m05:C, 7m05:E, 7m05:G, 7mx7:A, 7mxa:A, 7mxc:A, 7mxg:A, 7mxg:C, 7mxn:A, 6rll:A, 6rlq:A, 7s0u:A, 7s1p:A, 7s1q:A, 7s1r:A, 7s1s:A, 7ser:A, 7ses:A, 7u30:A, 7uoh:A, 6uxx:A, 6uxy:A, 7uy1:A, 7uyf:A, 6v0n:A, 6v0o:A, 6v0p:A, 8veo:A, 8vet:A, 8veu:A, 8vew:A, 8vex:A, 8vey:A, 4x60:A, 4x61:A, 4x63:A, 7zup:A, 7zuq:A, 7zuu:A, 7zuy:A, 7zv2:A, 7zvl:A, 7zvu:A
52 8rf0:A 2780 89 0.0696 0.0079 0.2472 8.3 8rfe:A, 8rfg:A
53 6sg9:F4 541 30 0.0348 0.0203 0.3667 9.2 6sgb:F4
54 7qos:A 352 85 0.0728 0.0653 0.2706 9.3 7qos:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218