Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SWQNSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAIVTSWNLAY
EGGSGPAIEQGQDTF

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3ew2:C 124 104 1.0000 0.7661 0.9135 8.16e-61 3ew2:A, 3ew2:B, 3ew2:D, 3ew2:E, 3ew2:F, 3ew2:G
2 4jnj:A 115 103 0.6737 0.5565 0.6214 1.49e-36 4jnj:C, 4jnj:B, 4jnj:D, 6zyt:BBB, 6zyt:AAA, 6zyt:CCC, 6zyt:FFF, 6zyt:DDD, 6zyt:EEE
3 6hdt:A 127 104 0.5895 0.4409 0.5385 6.99e-29 6hdt:B, 6hdt:C, 6hdt:D
4 8an6:B 128 105 0.5368 0.3984 0.4857 7.33e-26 8an6:A, 8an6:C, 8an6:D, 8ass:A, 8ass:B, 8ass:C, 8ass:D, 8asu:A, 8asu:B, 8asu:C, 8asu:D, 8avp:A, 8avp:B, 8avp:C, 8avp:D, 8avp:E, 8avp:F, 8avp:G, 8avp:H, 8avp:I, 8avp:J, 8avp:K, 8avp:L, 8avp:M, 8avp:N, 8avp:O, 8avp:P, 8avp:S, 8avp:T, 8avp:Q, 8avp:R
5 7ouq:A 119 102 0.5579 0.4454 0.5196 5.55e-25 7ouq:B, 7p8z:A, 7p8z:B, 7p8z:C, 7p8z:D
6 4z28:A 127 87 0.4947 0.3701 0.5402 5.66e-25 4z28:B, 4z2o:A, 4z2p:A, 4z2p:B, 4z2v:A, 4z2v:B
7 3szj:A 120 100 0.4947 0.3917 0.4700 2.29e-22 3szj:B, 3t2w:A
8 4ggz:A 106 100 0.3895 0.3491 0.3700 2.32e-10 4ggz:B, 4ggz:C, 4ggz:D
9 6t1g:A 133 78 0.2947 0.2105 0.3590 2.80e-05 5f2b:A, 6t1e:A, 6t1g:B, 6t1k:A, 6t2l:A, 6t2y:A, 6t2y:B, 6t2z:A, 6t2z:B, 6t30:B, 6t30:A, 6t31:A, 6t31:B, 6t32:A, 6t32:B
10 2zsc:A 123 106 0.3368 0.2602 0.3019 7.35e-05 2zsc:B
11 3wzo:A 127 72 0.2526 0.1890 0.3333 1.76e-04 3wzn:A, 3wzn:B, 3wzo:B, 3wzo:C, 3wzo:D, 3wzp:B, 3wzp:D, 3wzq:A, 3wzq:B, 3wzq:C, 3wzq:D, 3x00:A, 3x00:B, 3x00:C, 3x00:D
12 6s50:A 248 72 0.2632 0.1008 0.3472 1.91e-04 7alx:AAA, 7alx:BBB, 6anx:A, 8aqd:A, 8aqj:A, 8aqo:A, 8aqo:D, 8aqo:B, 8aqo:C, 8aqx:A, 8aqx:B, 8aqx:C, 8aqx:D, 8aqy:A, 8aqy:C, 8aqy:B, 8aqy:D, 6auc:A, 6aue:A, 6auh:A, 6aul:A, 6auo:A, 6avk:A, 6avk:B, 5b5f:A, 5b5f:B, 5b5f:C, 5b5f:D, 5b5g:A, 5b5g:B, 5b5g:C, 5b5g:D, 7b74:AAA, 7b74:BBB, 7b74:CCC, 7b74:DDD, 4bx7:B, 8by0:A, 8by1:A, 4cpe:A, 4cpe:B, 4cpf:B, 4cph:B, 4cph:C, 4cpi:A, 4cpi:B, 4cpi:C, 4cpi:D, 8crn:A, 8crn:C, 8crn:B, 8crn:D, 8crp:A, 8crp:B, 8crp:D, 8crp:C, 5cse:A, 5cse:B, 1df8:A, 1df8:B, 4dne:A, 4dne:B, 7efc:A, 7efd:A, 4ekv:A, 6ess:A, 6esu:A, 2f01:A, 2f01:B, 6fh8:A, 6fry:A, 2g5l:A, 2g5l:B, 4gd9:A, 4gd9:C, 4gd9:D, 4gda:A, 4gda:B, 2gh7:A, 2gh7:B, 6gh7:A, 6gh7:B, 6gh7:C, 6gh7:D, 4gjs:A, 4gjs:B, 4gjv:A, 6gmi:A, 8gog:A, 8gog:B, 1hqq:A, 1hqq:B, 1hqq:C, 1hqq:D, 1hxl:A, 1hxl:B, 1hxz:A, 1hxz:B, 1hy2:A, 1hy2:B, 1hy2:C, 1hy2:D, 1i9h:A, 1i9h:B, 4irw:A, 5ira:A, 2izf:B, 2izf:D, 2izg:B, 2izg:D, 2izh:B, 2izh:D, 2izi:A, 2izj:A, 2izk:A, 2izl:B, 2izl:D, 6j6j:A, 6j6j:B, 6j6j:C, 6j6j:D, 5jd2:A, 5jd2:B, 5jd2:C, 5jd2:D, 4jo6:A, 4jo6:C, 4jo6:B, 4jo6:D, 5k67:A, 5k68:A, 7kby:A, 7kbz:A, 7kbz:B, 7kbz:C, 7kbz:D, 1kl3:A, 1kl3:D, 1kl3:B, 1kl3:C, 1kl5:A, 1kl5:B, 1kl5:C, 1kl5:D, 5l3y:A, 1lcv:A, 1lcv:B, 1lcw:A, 1lcw:B, 1lcz:A, 1lcz:B, 1luq:A, 1luq:B, 6m9b:A, 6m9b:B, 6m9b:C, 6m9b:D, 1mep:A, 1mep:B, 1mep:C, 1mep:D, 3mg5:A, 3mg5:B, 3mg5:C, 3mg5:D, 1mk5:A, 1mk5:B, 1n43:A, 1n43:B, 1n43:C, 1n43:D, 5n7x:B, 5n7x:M, 5n7x:A, 5n7x:K, 5n7x:F, 5n7x:H, 5n7x:E, 5n7x:O, 5n89:B, 5n89:D, 5n89:A, 5n89:F, 5n89:H, 5n89:M, 5n89:K, 5n89:O, 5n8b:A, 5n8b:B, 5n8b:D, 5n8b:G, 5n8e:B, 5n8e:D, 5n8e:A, 5n8e:C, 5n8j:D, 5n8j:A, 5n8j:B, 5n8t:A, 5n8w:B, 5n8w:A, 1n9m:A, 1n9m:B, 1n9m:C, 1n9m:D, 5n99:A, 5n99:B, 5n99:D, 5n99:G, 5n99:I, 5n99:K, 5n99:M, 5n99:O, 5n99:Q, 5n99:S, 5n99:U, 5n99:Y, 1nc9:A, 1ndj:A, 1ndj:B, 1ndj:C, 1ndj:D, 7nlv:AAA, 7nlv:BBB, 7nlv:CCC, 7nlv:DDD, 1nqm:A, 1nqm:B, 1nqm:C, 1nqm:D, 8ojw:A, 8ojx:A, 4oka:A, 8p5y:A, 8p5y:B, 8p5y:C, 8p5y:D, 8p5z:A, 8p5z:B, 8p5z:C, 8p5z:D, 3pk2:A, 6qbb:A, 6qbb:B, 2qcb:A, 8qex:A, 8qex:B, 8qq3:A, 8qq3:C, 8qq3:B, 8qq3:D, 6qsy:A, 6qw4:A, 3rdm:A, 3rdq:A, 1rst:B, 1rsu:B, 2rtd:B, 2rtd:D, 2rte:B, 2rte:D, 2rtf:B, 2rtf:D, 2rtg:B, 2rtg:D, 2rth:B, 2rth:D, 2rti:B, 2rti:D, 2rtj:A, 2rtk:A, 2rtl:A, 2rtm:A, 2rtn:B, 2rtn:D, 2rto:B, 2rto:D, 2rtp:B, 2rtp:D, 2rtq:B, 2rtq:D, 2rtr:B, 2rtr:D, 1rxh:A, 1rxh:B, 1rxj:A, 1rxj:B, 1rxj:C, 1rxj:D, 1rxk:A, 1rxk:B, 3ry2:A, 3ry2:B, 6s4q:A, 6s4q:B, 6s50:B, 1sld:B, 1sle:B, 1sle:D, 1slf:B, 1slf:D, 1slg:B, 1slg:D, 6sok:A, 6sok:B, 6sok:C, 6sok:D, 6sos:B, 6sos:C, 6sos:A, 6sos:D, 1sre:A, 1sre:B, 1srf:A, 1srf:B, 1srg:B, 1srg:A, 1srh:B, 1srh:A, 1sri:B, 1sri:A, 1srj:A, 1srj:B, 1stp:A, 1str:B, 1str:D, 1sts:B, 1sts:D, 1swd:A, 1swd:D, 1swe:A, 1swe:B, 1swe:C, 1swe:D, 1swg:A, 1swg:B, 1swg:D, 1swk:A, 1swk:B, 1swk:C, 1swk:D, 1swn:A, 1swn:C, 1swn:D, 1swp:A, 1swp:B, 1swp:C, 1swp:D, 1swr:A, 1swr:B, 1swr:C, 1swr:D, 1swt:A, 1swt:B, 3t6f:A, 3t6f:B, 6tip:A, 8ty0:B, 8ty0:C, 8ty0:A, 8ty0:D, 6uc3:A, 6uc3:B, 6udc:A, 6udc:B, 6udc:C, 6udc:D, 6ui0:A, 6uiu:A, 6uiy:A, 6uiz:A, 6us6:A, 5vcq:A, 5vcq:B, 5vcq:C, 5vcq:D, 6vjk:A, 6vjk:B, 6vjk:C, 6vjk:D, 6vjk:E, 6vjk:F, 6vjk:G, 6vjk:H, 6vjk:I, 6vjk:J, 6vjk:K, 6vjk:L, 6vjl:A, 5vkx:A, 5vl5:A, 5vl8:A, 6vo9:A, 6vob:A, 6voz:A, 6vp1:A, 6vp1:B, 6vp1:C, 6vp1:D, 6vp2:A, 6vp2:B, 6vp2:C, 6vp2:D, 6vp3:A, 6vp3:B, 6vp3:C, 6vp3:D, 1vwa:B, 1vwa:D, 1vwb:B, 1vwc:B, 1vwd:B, 1vwe:B, 1vwf:B, 1vwg:B, 1vwh:B, 1vwi:B, 1vwi:D, 1vwj:B, 1vwj:D, 1vwk:B, 1vwk:D, 1vwl:B, 1vwl:D, 1vwm:B, 1vwn:B, 1vwo:B, 1vwp:B, 1vwq:B, 1vwr:B, 5wba:A, 5wbb:A, 5wbc:A, 5wbd:A, 2wpu:A, 3wyp:A, 3wyp:B, 3wyp:D, 3wyp:C, 3wyq:A, 3wyq:B, 3wzp:A, 3wzp:C, 6y25:AAA, 6y2m:AAA, 6y2t:AAA, 2y3f:A, 6y33:AAA, 6y34:AAA, 6y3q:AAA, 4y59:A, 4y59:B, 4y59:C, 4y59:D, 4y5d:A, 4y5d:B, 4y5d:D, 4yvb:A, 4yvb:B, 4yvb:C, 4yvb:D, 7zof:A, 7zof:C, 7zof:B, 7zof:D, 7zx9:A, 7zxz:A, 7zxz:B
13 6s50:A 248 78 0.2842 0.1089 0.3462 2.61e-04 7alx:AAA, 7alx:BBB, 6anx:A, 8aqd:A, 8aqj:A, 8aqo:A, 8aqo:D, 8aqo:B, 8aqo:C, 8aqx:A, 8aqx:B, 8aqx:C, 8aqx:D, 8aqy:A, 8aqy:C, 8aqy:B, 8aqy:D, 6auc:A, 6aue:A, 6auh:A, 6aul:A, 6auo:A, 6avk:A, 6avk:B, 5b5f:A, 5b5f:B, 5b5f:C, 5b5f:D, 5b5g:A, 5b5g:B, 5b5g:C, 5b5g:D, 7b74:AAA, 7b74:BBB, 7b74:CCC, 7b74:DDD, 4bx7:B, 8by0:A, 8by1:A, 4cpe:A, 4cpe:B, 4cpf:B, 4cph:B, 4cph:C, 4cpi:A, 4cpi:B, 4cpi:C, 4cpi:D, 8crn:A, 8crn:C, 8crn:B, 8crn:D, 8crp:A, 8crp:B, 8crp:D, 8crp:C, 5cse:A, 5cse:B, 1df8:A, 1df8:B, 4dne:A, 4dne:B, 7efc:A, 7efd:A, 4ekv:A, 6ess:A, 6esu:A, 2f01:A, 2f01:B, 6fh8:A, 6fry:A, 2g5l:A, 2g5l:B, 4gd9:A, 4gd9:C, 4gd9:D, 4gda:A, 4gda:B, 2gh7:A, 2gh7:B, 6gh7:A, 6gh7:B, 6gh7:C, 6gh7:D, 4gjs:A, 4gjs:B, 4gjv:A, 6gmi:A, 8gog:A, 8gog:B, 1hqq:A, 1hqq:B, 1hqq:C, 1hqq:D, 1hxl:A, 1hxl:B, 1hxz:A, 1hxz:B, 1hy2:A, 1hy2:B, 1hy2:C, 1hy2:D, 1i9h:A, 1i9h:B, 4irw:A, 5ira:A, 2izf:B, 2izf:D, 2izg:B, 2izg:D, 2izh:B, 2izh:D, 2izi:A, 2izj:A, 2izk:A, 2izl:B, 2izl:D, 6j6j:A, 6j6j:B, 6j6j:C, 6j6j:D, 5jd2:A, 5jd2:B, 5jd2:C, 5jd2:D, 4jo6:A, 4jo6:C, 4jo6:B, 4jo6:D, 5k67:A, 5k68:A, 7kby:A, 7kbz:A, 7kbz:B, 7kbz:C, 7kbz:D, 1kl3:A, 1kl3:D, 1kl3:B, 1kl3:C, 1kl5:A, 1kl5:B, 1kl5:C, 1kl5:D, 5l3y:A, 1lcv:A, 1lcv:B, 1lcw:A, 1lcw:B, 1lcz:A, 1lcz:B, 1luq:A, 1luq:B, 6m9b:A, 6m9b:B, 6m9b:C, 6m9b:D, 1mep:A, 1mep:B, 1mep:C, 1mep:D, 3mg5:A, 3mg5:B, 3mg5:C, 3mg5:D, 1mk5:A, 1mk5:B, 1n43:A, 1n43:B, 1n43:C, 1n43:D, 5n7x:B, 5n7x:M, 5n7x:A, 5n7x:K, 5n7x:F, 5n7x:H, 5n7x:E, 5n7x:O, 5n89:B, 5n89:D, 5n89:A, 5n89:F, 5n89:H, 5n89:M, 5n89:K, 5n89:O, 5n8b:A, 5n8b:B, 5n8b:D, 5n8b:G, 5n8e:B, 5n8e:D, 5n8e:A, 5n8e:C, 5n8j:D, 5n8j:A, 5n8j:B, 5n8t:A, 5n8w:B, 5n8w:A, 1n9m:A, 1n9m:B, 1n9m:C, 1n9m:D, 5n99:A, 5n99:B, 5n99:D, 5n99:G, 5n99:I, 5n99:K, 5n99:M, 5n99:O, 5n99:Q, 5n99:S, 5n99:U, 5n99:Y, 1nc9:A, 1ndj:A, 1ndj:B, 1ndj:C, 1ndj:D, 7nlv:AAA, 7nlv:BBB, 7nlv:CCC, 7nlv:DDD, 1nqm:A, 1nqm:B, 1nqm:C, 1nqm:D, 8ojw:A, 8ojx:A, 4oka:A, 8p5y:A, 8p5y:B, 8p5y:C, 8p5y:D, 8p5z:A, 8p5z:B, 8p5z:C, 8p5z:D, 3pk2:A, 6qbb:A, 6qbb:B, 2qcb:A, 8qex:A, 8qex:B, 8qq3:A, 8qq3:C, 8qq3:B, 8qq3:D, 6qsy:A, 6qw4:A, 3rdm:A, 3rdq:A, 1rst:B, 1rsu:B, 2rtd:B, 2rtd:D, 2rte:B, 2rte:D, 2rtf:B, 2rtf:D, 2rtg:B, 2rtg:D, 2rth:B, 2rth:D, 2rti:B, 2rti:D, 2rtj:A, 2rtk:A, 2rtl:A, 2rtm:A, 2rtn:B, 2rtn:D, 2rto:B, 2rto:D, 2rtp:B, 2rtp:D, 2rtq:B, 2rtq:D, 2rtr:B, 2rtr:D, 1rxh:A, 1rxh:B, 1rxj:A, 1rxj:B, 1rxj:C, 1rxj:D, 1rxk:A, 1rxk:B, 3ry2:A, 3ry2:B, 6s4q:A, 6s4q:B, 6s50:B, 1sld:B, 1sle:B, 1sle:D, 1slf:B, 1slf:D, 1slg:B, 1slg:D, 6sok:A, 6sok:B, 6sok:C, 6sok:D, 6sos:B, 6sos:C, 6sos:A, 6sos:D, 1sre:A, 1sre:B, 1srf:A, 1srf:B, 1srg:B, 1srg:A, 1srh:B, 1srh:A, 1sri:B, 1sri:A, 1srj:A, 1srj:B, 1stp:A, 1str:B, 1str:D, 1sts:B, 1sts:D, 1swd:A, 1swd:D, 1swe:A, 1swe:B, 1swe:C, 1swe:D, 1swg:A, 1swg:B, 1swg:D, 1swk:A, 1swk:B, 1swk:C, 1swk:D, 1swn:A, 1swn:C, 1swn:D, 1swp:A, 1swp:B, 1swp:C, 1swp:D, 1swr:A, 1swr:B, 1swr:C, 1swr:D, 1swt:A, 1swt:B, 3t6f:A, 3t6f:B, 6tip:A, 8ty0:B, 8ty0:C, 8ty0:A, 8ty0:D, 6uc3:A, 6uc3:B, 6udc:A, 6udc:B, 6udc:C, 6udc:D, 6ui0:A, 6uiu:A, 6uiy:A, 6uiz:A, 6us6:A, 5vcq:A, 5vcq:B, 5vcq:C, 5vcq:D, 6vjk:A, 6vjk:B, 6vjk:C, 6vjk:D, 6vjk:E, 6vjk:F, 6vjk:G, 6vjk:H, 6vjk:I, 6vjk:J, 6vjk:K, 6vjk:L, 6vjl:A, 5vkx:A, 5vl5:A, 5vl8:A, 6vo9:A, 6vob:A, 6voz:A, 6vp1:A, 6vp1:B, 6vp1:C, 6vp1:D, 6vp2:A, 6vp2:B, 6vp2:C, 6vp2:D, 6vp3:A, 6vp3:B, 6vp3:C, 6vp3:D, 1vwa:B, 1vwa:D, 1vwb:B, 1vwc:B, 1vwd:B, 1vwe:B, 1vwf:B, 1vwg:B, 1vwh:B, 1vwi:B, 1vwi:D, 1vwj:B, 1vwj:D, 1vwk:B, 1vwk:D, 1vwl:B, 1vwl:D, 1vwm:B, 1vwn:B, 1vwo:B, 1vwp:B, 1vwq:B, 1vwr:B, 5wba:A, 5wbb:A, 5wbc:A, 5wbd:A, 2wpu:A, 3wyp:A, 3wyp:B, 3wyp:D, 3wyp:C, 3wyq:A, 3wyq:B, 3wzp:A, 3wzp:C, 6y25:AAA, 6y2m:AAA, 6y2t:AAA, 2y3f:A, 6y33:AAA, 6y34:AAA, 6y3q:AAA, 4y59:A, 4y59:B, 4y59:C, 4y59:D, 4y5d:A, 4y5d:B, 4y5d:D, 4yvb:A, 4yvb:B, 4yvb:C, 4yvb:D, 7zof:A, 7zof:C, 7zof:B, 7zof:D, 7zx9:A, 7zxz:A, 7zxz:B
14 3rdo:A 129 78 0.2632 0.1938 0.3205 6.64e-04
15 7cpz:A 120 110 0.3474 0.2750 0.3000 0.002
16 7nhk:d 206 57 0.1684 0.0777 0.2807 0.079 6o8w:c, 6o8x:c, 6o8y:c, 6o8z:c, 6o90:c, 7p7q:d, 7p7r:d, 7p7s:d, 7p7t:d, 7p7u:d, 6w6p:c, 6wua:c
17 4gd9:B 131 43 0.1789 0.1298 0.3953 0.10 1swg:C
18 5myj:AC 211 57 0.1579 0.0711 0.2632 0.14
19 4v59:D 1467 34 0.1263 0.0082 0.3529 2.6 4v59:A, 4v59:B, 4v59:C, 4v59:E, 4v59:F
20 8k69:A 458 45 0.1684 0.0349 0.3556 3.7 8k66:A, 8k66:B, 8k69:B
21 1lqa:A 346 30 0.1053 0.0289 0.3333 4.4 1lqa:B
22 4bbo:A 113 76 0.2737 0.2301 0.3421 5.6 4bbo:B, 4bbo:C, 4bbo:D
23 8ozh:D 405 52 0.1789 0.0420 0.3269 7.4 8ozh:H, 8ozh:L, 8ozp:H, 8ozp:L, 8ozq:H
24 3j9w:AC 210 57 0.1579 0.0714 0.2632 8.2 8buu:c, 8cdu:E, 8cec:H, 8ced:E, 8cee:E, 6ha1:c, 6ha8:c, 6htq:c, 5njt:C, 7o5b:C, 8qcq:c, 7qgu:h, 7qh4:g, 8qpp:C, 7qv1:c, 7qv2:c, 7qv3:c, 8r55:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218