Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVYDAAAQLTADVKKDLRDSWKVIGSDKKGNGVALATTLFADNQETIGYFKRLGDVSQGMANDKLRGHSITLMYALQNFI
DQLDNPDDLVCVVEKFAVNHITRKISAAEFGKINGPIKKVLASKNFGDKYANAWAKLVAVVQAAL

The query sequence (length=145) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3g46:A 146 145 0.9931 0.9863 0.9931 9.85e-104 2auo:A, 2auo:B, 2aup:A, 2aup:B, 2auq:A, 2auq:B, 2aur:A, 2aur:B, 2av0:A, 2av0:B, 2av3:A, 2av3:B, 3g46:B, 3g4q:A, 3g4q:B, 3g4r:A, 3g4r:B, 3g4u:A, 3g4u:B, 3g4v:A, 3g4v:B, 3g4w:A, 3g4w:B, 3g4y:A, 3g4y:B, 3g52:A, 3g52:B, 3g53:A, 3g53:B, 2grf:A, 2grf:B, 2grh:A, 2grh:B, 2grz:A, 2grz:B, 1hbi:A, 1hbi:B, 4hbi:A, 4hbi:B, 5hbi:A, 5hbi:B, 6hbi:A, 6hbi:B, 7hbi:A, 7hbi:B, 1jwn:A, 1jwn:B, 1jwn:C, 1jwn:D, 1jzk:A, 1jzk:B, 1jzk:C, 1jzk:D, 1jzl:A, 1jzl:B, 1jzm:A, 1jzm:B, 1nwi:A, 1nwi:B, 1nwi:C, 1nwi:D, 1nwn:A, 1nwn:B, 1nxf:A, 1nxf:B, 3qob:A, 3qob:B, 2r4w:A, 2r4w:B, 2r4x:A, 2r4x:B, 2r4y:A, 2r4y:B, 2r4z:A, 2r4z:B, 3sdh:A, 3sdh:B, 4sdh:A, 4sdh:B, 3ugy:A, 3ugy:B, 3ugz:A, 3ugz:B, 3uh3:A, 3uh3:B, 3uh5:A, 3uh5:B, 3uh6:A, 3uh6:B, 3uh7:A, 3uh7:B, 3uhb:A, 3uhb:B, 3uhc:A, 3uhc:B, 3uhd:A, 3uhd:B, 3uhe:A, 3uhe:B, 3uhg:A, 3uhg:B, 3uhh:A, 3uhh:B, 3uhi:A, 3uhi:B, 3uhi:C, 3uhi:D, 3uhk:A, 3uhk:B, 3uhk:C, 3uhk:D, 3uhn:A, 3uhn:B, 3uhq:A, 3uhq:B, 3uhr:A, 3uhr:B, 3uhs:A, 3uhs:B, 3uht:A, 3uht:B, 3uhu:A, 3uhu:B, 3uhv:A, 3uhv:B, 3uhw:A, 3uhw:B, 3uhx:A, 3uhx:B, 3uhy:A, 3uhy:B, 3uhz:A, 3uhz:B, 3ui0:A, 3ui0:B, 2z85:A, 2z85:B, 2z8a:A, 2z8a:B
2 4hrr:B 151 138 0.5448 0.5232 0.5725 1.79e-47 4hrr:D, 4hrr:F, 4hrr:H, 4hrt:B, 4hrt:D, 4hrt:F, 4hrt:H
3 4hrr:A 149 136 0.5103 0.4966 0.5441 5.09e-46 4hrr:C, 4hrr:E, 4hrr:G, 4hrt:A, 4hrt:C, 4hrt:E, 4hrt:G
4 8oup:B 151 137 0.3241 0.3113 0.3431 6.01e-16 8oup:A, 8oup:C, 8oup:D
5 6q6p:B 157 146 0.2483 0.2293 0.2466 6.48e-09 6q6p:A
6 2olp:A 151 105 0.2207 0.2119 0.3048 1.44e-08 2olp:B, 6otw:A, 6otx:A, 6oty:A, 3pi1:A, 3pi1:B, 3pi2:A, 3pi2:B, 3pi3:A, 3pi3:B, 3pi4:A, 3pi4:B, 3pt7:A, 3pt8:A
7 2dc3:A 172 137 0.2345 0.1977 0.2482 2.27e-07 3ag0:A, 4b3w:A, 4b3w:B, 2dc3:B, 1umo:A, 1umo:B, 1urv:A, 1urv:B, 1ury:A, 1ury:B, 1ut0:A, 1ut0:B, 1ux9:A, 1ux9:B, 1v5h:A
8 1dm1:A 146 132 0.2345 0.2329 0.2576 3.83e-07 2fal:A, 2fam:A, 1mba:A, 3mba:A, 4mba:A, 5mba:A
9 6otw:B 152 140 0.2483 0.2368 0.2571 1.31e-06 6otx:B, 6oty:B, 3pt7:B, 3pt8:B
10 1hbr:A 141 140 0.2483 0.2553 0.2571 3.99e-06 1hbr:C
11 1hlb:A 157 146 0.2414 0.2229 0.2397 6.88e-06
12 1hlm:A 158 148 0.2207 0.2025 0.2162 2.68e-05
13 1a9w:E 145 144 0.2552 0.2552 0.2569 8.88e-04 1a9w:F
14 3rgk:A 149 117 0.2207 0.2148 0.2735 0.002
15 1fhj:B 146 145 0.2828 0.2808 0.2828 0.011 2b7h:B, 2b7h:D, 1fhj:D, 3gou:B, 3gou:D, 3pel:B, 2qls:B, 2qls:D
16 3d4x:B 145 144 0.2828 0.2828 0.2847 0.016 3d4x:D, 3gqp:B, 3gqp:D, 3gqr:B, 3gqr:D, 3gqr:F, 3gqr:H, 3gys:B, 3gys:D, 3gys:F, 3gys:H
17 8kfh:A 160 117 0.2069 0.1875 0.2564 0.028 101m:A, 102m:A, 103m:A, 104m:A, 105m:A, 106m:A, 107m:A, 108m:A, 109m:A, 110m:A, 111m:A, 112m:A, 3a2g:A, 7a44:A, 7a45:A, 1a6g:A, 1a6k:A, 1a6m:A, 1a6n:A, 1abs:A, 1ajg:A, 1ajh:A, 3ase:A, 5b84:A, 5b85:A, 2blh:A, 2bli:A, 2blj:M, 6bmg:A, 6bmg:B, 1bvc:A, 1bvd:A, 2bw9:M, 2bwh:A, 1bz6:A, 1bzp:A, 1bzr:A, 5c6y:A, 7cen:A, 7cez:A, 6cf0:A, 1ch1:A, 1ch2:A, 1ch3:A, 1ch5:A, 1ch7:A, 1ch9:A, 1cik:A, 1cio:A, 2cmm:A, 1co8:A, 1co9:A, 1cp0:A, 1cp5:A, 1cpw:A, 1cq2:A, 6d45:A, 2d6c:A, 2d6c:B, 1do1:A, 1do3:A, 1do4:A, 1do7:A, 1dti:A, 1dtm:A, 1duk:A, 1duo:A, 1dxc:A, 1dxd:A, 6e02:A, 6e03:A, 6e04:A, 2e2y:A, 3e4n:A, 3e55:A, 3e5i:A, 3e5o:A, 1ebc:A, 2eb8:A, 2eb9:A, 3ecl:A, 3ecx:A, 3ecz:A, 3ed9:A, 3eda:A, 3edb:A, 2ef2:A, 7ehx:A, 2ekt:A, 2eku:A, 8eko:A, 8ess:A, 8esu:A, 2evk:A, 2evp:A, 6f17:A, 6f18:A, 6f19:A, 6f1a:A, 1f63:A, 1f65:A, 1f6h:A, 8f9h:A, 8f9i:A, 8f9i:B, 8f9j:A, 8f9n:A, 8fb0:A, 1fcs:A, 8fdj:A, 4fwx:A, 4fwy:A, 4fwz:A, 2g0r:A, 2g0s:A, 2g0v:A, 2g0x:A, 2g0z:A, 2g10:A, 2g11:A, 2g12:A, 2g14:A, 6g5a:A, 6g5b:A, 6g5t:A, 4h07:A, 4h0b:A, 1h1x:A, 3h57:A, 3h58:A, 5hav:A, 1hjt:A, 5hlq:A, 5hlu:A, 5hlx:A, 5iks:A, 5ile:A, 5ilm:A, 5ilp:A, 5ilr:A, 1iop:A, 1irc:A, 4it8:A, 1j3f:A, 8j4k:A, 8j4l:A, 1j52:A, 1jdo:A, 2jho:A, 5jom:A, 1jp6:A, 1jp8:A, 1jp9:A, 1jpb:A, 6jp1:A, 6jp1:B, 1jw8:A, 3k9z:A, 5kd1:A, 8kfh:B, 8kfi:A, 8kfi:B, 8kfj:A, 8kfj:B, 5kkk:A, 6krc:A, 6krf:A, 7kyr:A, 1l2k:A, 7l3u:A, 7l3y:A, 4lpi:A, 1ltw:A, 1lue:A, 3m38:A, 3m39:A, 3m3a:A, 3m3b:A, 5m3s:A, 6m8f:A, 1mbc:A, 1mbd:A, 1mbi:A, 1mbn:A, 1mbo:A, 2mb5:A, 2mbw:A, 4mbn:A, 5mbn:A, 1mcy:A, 1mgn:A, 2mga:A, 2mgb:A, 2mgc:A, 2mgd:A, 2mge:A, 2mgf:A, 2mgg:A, 2mgh:A, 2mgi:A, 2mgj:A, 2mgk:A, 2mgl:A, 2mgm:A, 1mlf:A, 1mlg:A, 1mlh:A, 1mlj:A, 1mlk:A, 1mll:A, 1mlm:A, 1mln:A, 1mlo:A, 1mlq:A, 1mlr:A, 1mls:A, 1mlu:A, 3mn0:A, 1moa:A, 1mob:A, 1moc:A, 1mod:A, 1mti:A, 1mtj:A, 1mtk:A, 6mv0:A, 4mxk:A, 4mxl:A, 1myf:A, 1mym:A, 1myz:A, 2mya:A, 2myb:A, 2myc:A, 2myd:A, 2mye:A, 1mz0:A, 6n02:A, 6n03:A, 1n9f:A, 1n9h:A, 1n9i:A, 1n9x:A, 1naz:A, 3nml:A, 4nxa:A, 4nxc:A, 1o16:A, 5o41:A, 3o89:A, 1obm:A, 1ofj:A, 1ofk:A, 4of9:A, 3ogb:A, 2oh8:A, 2oh9:A, 2oha:A, 2ohb:A, 5oj9:A, 5oja:A, 5ojb:A, 5ojc:A, 4ood:A, 4pnj:A, 4pq6:A, 4pqb:A, 4pqc:A, 4qau:A, 8qba:A, 8qbc:A, 3sdn:A, 7slh:A, 7sli:A, 1spe:A, 2spl:A, 2spm:A, 2spn:A, 2spo:A, 7spe:A, 7spf:A, 7spg:A, 7sph:A, 1swm:A, 1tes:A, 4tyx:A, 3u3e:A, 1u7r:A, 1u7s:A, 1ufj:A, 5ut7:A, 5ut8:A, 5ut9:A, 5uta:A, 5utb:A, 5utc:A, 5utd:A, 1v9q:A, 7vdn:A, 5vnu:A, 5vrt:A, 7vuc:A, 7vw4:A, 1vxa:A, 1vxb:A, 1vxc:A, 1vxd:A, 1vxe:A, 1vxf:A, 1vxg:A, 1vxh:A, 5vzn:A, 5vzo:A, 5vzp:A, 5vzq:A, 2w6w:A, 2w6x:A, 2w6y:A, 5wjk:A, 1wvp:A, 7xc9:A, 7xcf:A, 7xcq:A, 5xkv:A, 5xkw:A, 5xl0:A, 5yce:A, 5ych:A, 5yci:A, 5ycj:A, 7ylk:A, 1yog:A, 1yoh:A, 1yoi:A, 5yzf:A, 6z4r:A, 6z4t:A, 2z6s:A, 2z6t:A, 5zeo:A, 2zsn:A, 2zso:A, 2zsp:A, 2zsq:A, 2zsr:A, 2zss:A, 2zst:A, 2zsx:A, 2zsy:A, 2zsz:A, 2zt0:A, 2zt1:A, 2zt2:A, 2zt3:A, 2zt4:A, 5zzf:A, 5zzg:A
18 2vyw:A 148 85 0.1724 0.1689 0.2941 0.030
19 1b0b:A 142 104 0.1724 0.1761 0.2404 0.042 1ebt:A, 1flp:A, 1moh:A
20 4f4o:B 146 145 0.2828 0.2808 0.2828 0.047 4f4o:E, 4f4o:H, 4f4o:K, 2pgh:B, 2pgh:D, 1qpw:B, 1qpw:D
21 2gtl:C 149 122 0.2345 0.2282 0.2787 0.10 2gtl:G, 2gtl:K, 5m3l:C, 5m3l:G, 5m3l:K, 1x9f:C, 1x9f:G, 1x9f:K
22 5yci:B 157 117 0.2207 0.2038 0.2735 0.13 1azi:A, 5azq:A, 5azr:A, 3ba2:A, 1bje:A, 8bkh:A, 8bkn:A, 5cmv:A, 5cn4:A, 5cn5:A, 5cn6:A, 5cn7:A, 5cn8:A, 5cn9:A, 5cnb:A, 5cnc:A, 5cnd:A, 5cne:A, 5cnf:A, 5cng:A, 5d5r:A, 4dc7:A, 4dc8:A, 7ddr:A, 7dds:A, 7ddt:A, 7dgj:A, 7dgj:B, 7dgk:A, 7dgk:B, 7dgl:A, 7dgl:B, 7dgm:A, 7dgm:B, 7dgn:A, 7dgn:B, 7dgo:A, 7dgo:B, 1dwr:A, 1dws:A, 1dwt:A, 2frf:A, 2fri:X, 2frj:X, 2frk:X, 1gjn:A, 3hc9:A, 3hen:A, 3heo:A, 3hep:A, 1hrm:A, 1hsy:A, 2in4:A, 3lr7:A, 3lr9:A, 6ls8:A, 6ls8:C, 6ls8:E, 6ls8:G, 6ls8:I, 6ls8:K, 6ltl:A, 6ltl:B, 6ltm:A, 6ltm:B, 1m6c:A, 1m6c:B, 1m6m:A, 1m6m:B, 1mdn:A, 1mdn:B, 1mnh:A, 1mni:A, 1mni:B, 1mnj:A, 1mnj:B, 1mnk:A, 1mnk:B, 1mno:A, 1mno:B, 1mwc:A, 1mwc:B, 1mwd:A, 1mwd:B, 1myg:A, 1myg:B, 1myh:A, 1myh:B, 1myi:A, 1myi:B, 1myj:A, 1myj:B, 1npf:A, 1npg:A, 2nsr:A, 2nss:A, 4ns2:A, 1nz2:A, 1nz3:A, 1nz4:A, 1nz5:A, 2o58:X, 2o5b:X, 2o5l:X, 2o5m:X, 2o5o:X, 2o5q:X, 2o5s:X, 2o5t:X, 1pmb:A, 1pmb:B, 8r8f:A, 8r8g:A, 8r8h:A, 8r8i:A, 8r8j:A, 8r8w:A, 8r8x:A, 8r8y:A, 8r8z:A, 8r90:A, 8r91:A, 8r92:A, 8r93:A, 8r94:A, 8r95:A, 8r9c:A, 8r9d:A, 8r9e:A, 8r9f:A, 8r9g:A, 8r9h:A, 8r9i:A, 8r9j:A, 8r9k:A, 8r9l:A, 8r9m:A, 8r9n:A, 8r9p:A, 8r9q:A, 8ra1:A, 8ra2:A, 8ra3:A, 8ra4:A, 8ra5:A, 8ra6:A, 8ra7:A, 8ra8:A, 8ra9:A, 8raa:A, 8rab:A, 8rac:A, 8rad:A, 8rae:A, 3rj6:A, 3rj6:B, 3rjn:B, 1rse:A, 4twu:A, 4twv:A, 2v1e:A, 2v1f:A, 2v1g:A, 2v1h:A, 2v1i:A, 2v1j:A, 2v1k:A, 3v2v:A, 3v2z:A, 7v5p:A, 7v5p:B, 7v5q:A, 7v5q:B, 7v5r:A, 7v5r:B, 3vau:A, 2vlx:A, 2vly:A, 2vlz:A, 2vm0:A, 3vm9:A, 3vm9:B, 3wft:A, 3wfu:A, 8wf5:A, 3wi8:A, 1wla:A, 3wyo:A, 3wyo:B, 3wyo:C, 3wyo:D, 1xch:A, 1yca:A, 1yca:B, 1ycb:A, 1ycb:B, 5ycg:A, 5ycj:B, 5yl3:A, 1yma:A, 1ymb:A, 1ymc:A, 5z7e:A, 5z7f:A, 5zze:A
23 1fdh:G 146 144 0.2276 0.2260 0.2292 0.14 1fdh:H, 1i3d:A, 1i3d:B, 1i3e:A, 1i3e:B, 4mqj:B, 4mqj:H, 4mqj:D, 4mqj:F, 4mqk:B, 4mqk:D, 4mqk:F, 4mqk:H, 7qu4:G, 7qu4:H
24 1emy:A 153 118 0.2000 0.1895 0.2458 0.21
25 1spg:B 147 105 0.1793 0.1769 0.2476 0.22
26 4h2l:A 141 59 0.1310 0.1348 0.3220 0.26 3hrw:A, 3hrw:C, 5ker:C, 5ker:E, 5ker:G, 5ker:A
27 6iyi:B 146 107 0.1793 0.1781 0.2430 0.33 6iyh:B
28 3gdj:B 146 145 0.2690 0.2671 0.2690 0.34 3gdj:D
29 1f5o:A 149 97 0.1448 0.1409 0.2165 0.41 1f5o:B, 1f5o:C, 1f5o:D, 1f5o:E, 1f5o:F, 1f5p:A, 1f5p:B, 1f5p:C, 1f5p:D, 1f5p:E, 1f5p:F, 2lhb:A, 3lhb:A, 3lhb:B, 3lhb:C, 3lhb:D, 3lhb:E, 3lhb:F, 3lhb:G, 3lhb:H, 3lhb:I, 3lhb:J, 3lhb:K, 3lhb:L, 1uc3:A, 1uc3:B, 1uc3:C, 1uc3:D, 1uc3:E, 1uc3:F, 1uc3:G, 1uc3:H, 1uc3:I, 1uc3:J, 1uc3:K, 1uc3:L
30 2gtl:B 145 101 0.1862 0.1862 0.2673 0.46 2gtl:F, 2gtl:J, 5m3l:B, 5m3l:F, 5m3l:J, 1x9f:B, 1x9f:F, 1x9f:J
31 4u8u:B 142 100 0.1448 0.1479 0.2100 0.47 4u8u:F, 4u8u:J, 4u8u:Q, 4u8u:U, 4u8u:Y, 4u8u:f, 4u8u:j, 4u8u:n
32 1dxt:B 147 145 0.2414 0.2381 0.2414 0.64 1a00:B, 1a00:D, 1a01:B, 1a01:D, 1a0u:B, 1a0u:D, 1a0z:B, 1a0z:D, 1a3n:B, 1a3n:D, 1a3o:B, 1a3o:D, 1abw:B, 1abw:D, 1aby:B, 1aby:D, 7aet:BBB, 7aet:DDD, 7aeu:BBB, 7aeu:DDD, 7aev:BBB, 7aev:DDD, 1aj9:B, 3b75:B, 3b75:D, 3b75:F, 3b75:H, 3b75:T, 1b86:B, 1b86:D, 1bab:B, 1bab:D, 1bbb:B, 1bbb:D, 6bb5:B, 1bij:B, 1bij:D, 6bnr:B, 6bnr:D, 1buw:B, 1buw:D, 6bwp:B, 6bwp:D, 6bwu:B, 1bz0:B, 1bz0:D, 1bz1:B, 1bz1:D, 1bzz:B, 1bzz:D, 1c7b:B, 1c7b:D, 1c7c:B, 1c7c:D, 1c7d:B, 1c7d:D, 1cbl:A, 1cbl:B, 1cbl:C, 1cbl:D, 1cbm:A, 1cbm:B, 1cbm:C, 1cbm:D, 1cls:B, 1cls:D, 1cmy:B, 1cmy:D, 1coh:B, 1coh:D, 7cue:B, 7cue:D, 3d17:B, 3d17:D, 2d5z:D, 2d5z:B, 2d60:B, 2d60:D, 3d7o:B, 6di4:B, 6di4:D, 1dke:B, 1dke:D, 2dn1:B, 2dn2:B, 2dn2:D, 2dn3:B, 8dov:B, 8dov:D, 8dov:F, 8dov:H, 3dut:B, 3dut:D, 1dxt:D, 1dxu:B, 1dxu:D, 1dxv:B, 1dxv:D, 2dxm:B, 2dxm:D, 7dy3:B, 7dy3:D, 7dy3:F, 7dy3:H, 7dy4:B, 7dy4:D, 7dy4:F, 7dy4:H, 5e29:B, 5e29:D, 5e6e:B, 5e83:B, 5e83:D, 5ee4:D, 5ee4:F, 8egi:B, 8egi:D, 4fc3:B, 8fdk:B, 8fdk:D, 8fdl:B, 8fdl:D, 8fdm:B, 8fdm:D, 8fdn:B, 8fdn:D, 1fn3:B, 1fn3:D, 6fqf:A, 6fqf:B, 6fqf:C, 6fqf:D, 1g9v:B, 1g9v:D, 1gbu:B, 1gbu:D, 1gbv:B, 1gbv:D, 1gli:B, 1gli:D, 1gzx:B, 1gzx:D, 2h35:B, 2h35:D, 1hab:B, 1hab:D, 1hac:B, 1hac:D, 6hal:B, 6hal:D, 1hba:B, 1hba:D, 1hbb:B, 1hbb:D, 1hbs:B, 1hbs:D, 1hbs:F, 1hbs:H, 2hbc:B, 2hbd:B, 2hbe:B, 2hbf:B, 2hbs:B, 2hbs:D, 2hbs:F, 2hbs:H, 6hbw:B, 6hbw:D, 1hco:B, 2hco:B, 1hdb:B, 1hdb:D, 1hga:B, 1hga:D, 1hgb:B, 1hgb:D, 1hgc:B, 1hgc:D, 1hho:B, 2hhb:B, 2hhb:D, 2hhd:B, 2hhd:D, 2hhe:B, 2hhe:D, 3hhb:B, 3hhb:D, 4hhb:B, 4hhb:D, 6hk2:B, 6hk2:D, 5hu6:B, 3hxn:B, 3hxn:D, 5hy8:D, 5hy8:B, 5hy8:F, 5hy8:H, 5hy8:T, 3ic0:B, 3ic0:D, 3ic2:B, 3ic2:D, 4ij2:B, 4ij2:D, 1ird:B, 1j3y:B, 1j3y:D, 1j3y:F, 1j3y:H, 1j3z:B, 1j3z:D, 1j3z:F, 1j3z:H, 1j40:B, 1j40:D, 1j40:F, 1j40:H, 1j41:B, 1j41:D, 1j41:F, 1j41:H, 1j7s:B, 1j7s:D, 1j7w:B, 1j7w:D, 1j7y:B, 1j7y:D, 5jdo:D, 5jdo:F, 7jjq:B, 7jjq:D, 7jxz:B, 7jxz:D, 1jy7:B, 1jy7:D, 1jy7:Q, 1jy7:S, 1jy7:V, 1jy7:X, 7jy0:B, 7jy0:D, 7jy1:B, 7jy1:D, 7jy3:B, 7jy3:D, 1k0y:B, 1k0y:D, 1k1k:B, 7k4m:B, 7k4m:D, 7k4m:F, 7k4m:H, 7k4m:J, 6ka9:B, 6ka9:D, 6ka9:F, 6ka9:H, 6kae:B, 6kae:D, 6kae:F, 6kae:H, 6kah:B, 6kah:D, 6kah:F, 6kah:H, 6kai:B, 6kai:D, 6kai:F, 6kai:H, 6kao:B, 6kap:B, 6kaq:B, 6kar:B, 6kas:B, 6kas:D, 6kat:B, 6kat:D, 6kau:B, 6kau:D, 6kav:B, 6kav:D, 1kd2:B, 1kd2:D, 5kdq:B, 5kdq:D, 3kmf:C, 3kmf:G, 5ksi:D, 5ksi:B, 5ksj:B, 5ksj:D, 6kye:B, 6kye:D, 6kye:F, 6kye:H, 6kye:J, 6kye:L, 6l5v:B, 6l5w:B, 6l5x:B, 6l5x:D, 6l5y:B, 6l5y:D, 4l7y:B, 4l7y:D, 6lcw:B, 6lcw:D, 6lcw:F, 6lcw:H, 6lcx:B, 6lcx:D, 6lcx:F, 6lcx:H, 1lfl:B, 1lfl:D, 1lfl:Q, 1lfl:S, 1lfq:B, 1lft:B, 1lfv:B, 1lfy:B, 1lfz:B, 1ljw:B, 3lqd:B, 3lqd:D, 4m4a:B, 4m4b:B, 2m6z:B, 2m6z:D, 1m9p:B, 1m9p:D, 1mko:B, 1mko:D, 4mqc:B, 4mqg:B, 4mqh:B, 4mqi:B, 4n7n:B, 4n7n:D, 4n7n:F, 4n7n:H, 4n7n:J, 4n7n:L, 4n7o:B, 4n7o:D, 4n7o:F, 4n7o:H, 4n7o:J, 4n7o:L, 4n7p:B, 4n7p:D, 4n7p:F, 4n7p:H, 4n7p:J, 4n7p:L, 4n8t:B, 6nbc:B, 6nbc:D, 6nbd:B, 6nbd:D, 1nej:B, 1nej:D, 1nih:B, 1nih:D, 4ni0:B, 4ni1:B, 5ni1:B, 5ni1:D, 3nl7:B, 3nmm:B, 3nmm:D, 1nqp:B, 1nqp:D, 6nq5:B, 1o1i:B, 1o1j:B, 1o1j:D, 1o1k:B, 1o1k:D, 1o1l:B, 1o1l:D, 1o1m:B, 1o1m:D, 1o1n:B, 1o1n:D, 1o1o:B, 1o1o:D, 1o1p:B, 1o1p:D, 3odq:B, 3odq:D, 3onz:B, 3oo4:B, 3oo5:B, 3p5q:B, 7pcf:B, 7pch:B, 7pch:D, 7pcq:B, 7pcq:D, 1qi8:B, 1qi8:D, 3qjb:B, 3qjc:B, 3qjd:B, 3qjd:D, 3qje:B, 3qje:D, 1qsh:B, 1qsh:D, 1qsi:B, 1qsi:D, 1qxd:B, 1qxd:D, 1qxe:B, 1qxe:D, 1r1x:B, 1r1y:B, 1r1y:D, 3r5i:B, 3r5i:D, 2rao:B, 2rao:D, 4rol:B, 4rol:D, 4rom:B, 4rom:D, 1rps:B, 1rps:D, 1rq3:B, 1rq3:D, 1rq4:B, 1rq4:D, 1rqa:B, 1rqa:D, 1rvw:B, 3s65:B, 3s65:D, 3s66:B, 1sdk:B, 1sdk:D, 1sdl:B, 1sdl:D, 1shr:B, 1shr:D, 1si4:B, 1si4:D, 5sw7:B, 3szk:B, 3szk:E, 6tb2:B, 1thb:B, 1thb:D, 5u3i:B, 5u3i:D, 5ucu:B, 7ud7:B, 7ud7:D, 7ud8:B, 7ud8:D, 5ufj:B, 5ufj:D, 7uf6:B, 7uf6:D, 7uf7:B, 7uf7:D, 1uiw:B, 1uiw:D, 1uiw:F, 1uiw:H, 5urc:B, 5urc:D, 7uvb:B, 7uvb:D, 7vde:B, 7vde:D, 1vwt:B, 1vwt:D, 8vyl:B, 8vyl:D, 3w4u:B, 3w4u:D, 3w4u:F, 2w6v:B, 2w6v:D, 2w72:B, 2w72:D, 3wcp:B, 3wcp:D, 3whm:B, 3whm:F, 4wjg:B, 4wjg:G, 4wjg:L, 4wjg:Q, 4wjg:V, 4wjg:1, 8wj0:B, 8wj1:B, 8wj2:B, 5wog:C, 5wog:D, 5woh:B, 5woh:D, 4x0l:B, 5x2r:B, 5x2r:D, 5x2r:F, 5x2r:H, 5x2r:J, 5x2r:L, 5x2s:B, 5x2s:D, 5x2s:F, 5x2s:H, 5x2s:J, 5x2s:L, 5x2t:B, 5x2t:D, 5x2t:F, 5x2t:H, 5x2t:J, 5x2t:L, 5x2u:B, 5x2u:D, 5x2u:F, 5x2u:H, 5x2u:J, 5x2u:L, 6xd9:B, 6xd9:D, 6xdt:B, 6xdt:D, 6xe7:B, 6xe7:D, 7xgy:B, 7xgy:D, 4xs0:B, 1xxt:B, 1xxt:D, 1xy0:B, 1xy0:D, 1xye:B, 1xye:D, 1xz2:B, 1xz2:D, 1xz4:B, 1xz4:D, 1xz5:B, 1xz5:D, 1xz7:B, 1xz7:D, 1xzu:B, 1xzu:D, 1xzv:B, 1xzv:D, 1y09:B, 1y09:D, 1y0a:B, 1y0a:D, 1y0c:B, 1y0c:D, 1y0d:B, 1y0d:D, 1y0t:B, 1y0t:D, 1y0w:B, 1y0w:D, 1y22:B, 1y22:D, 1y2z:B, 1y2z:D, 1y31:B, 1y31:D, 1y35:B, 1y35:D, 1y45:B, 1y45:D, 1y46:B, 1y46:D, 1y4b:B, 1y4b:D, 1y4f:B, 1y4f:D, 1y4g:B, 1y4g:D, 1y4p:B, 1y4p:D, 1y4q:B, 1y4q:D, 1y4r:B, 1y4r:D, 1y4v:B, 1y4v:D, 1y5f:B, 1y5f:D, 1y5j:B, 1y5j:D, 1y5k:B, 1y5k:D, 1y7c:B, 1y7c:D, 1y7d:B, 1y7d:D, 1y7g:B, 1y7g:D, 1y7z:B, 1y7z:D, 1y83:B, 1y83:D, 1y85:B, 1y85:D, 1y8w:B, 1y8w:D, 1ydz:B, 1ydz:D, 1ye0:B, 1ye0:D, 1ye1:B, 1ye1:D, 1ye2:B, 1ye2:D, 1yen:B, 1yen:D, 1yeo:B, 1yeo:D, 1yeq:B, 1yeq:D, 1yeu:B, 1yeu:D, 1yev:B, 1yev:D, 1yff:B, 1yff:D, 1yff:F, 1yff:H, 1yg5:B, 1yg5:D, 1ygd:B, 1ygd:D, 1ygf:B, 1ygf:D, 1yh9:B, 1yh9:D, 1yhe:B, 1yhe:D, 1yhr:B, 1yhr:D, 1yie:B, 1yie:D, 1yih:B, 1yih:D, 2yrs:B, 2yrs:D, 2yrs:K, 2yrs:O, 1yvq:B, 1yvq:D, 1yvt:B, 1yzi:B
33 1a4f:B 146 141 0.2207 0.2192 0.2270 0.80 3a59:B, 3a59:D, 3a59:F, 3a59:H, 1c40:B, 3dhr:B, 3dhr:D, 3dhr:F, 3dhr:H, 3eok:B, 1faw:B, 1faw:D, 3fs4:B, 3fs4:D, 1hbr:B, 1hbr:D, 1hv4:B, 1hv4:D, 1hv4:F, 1hv4:H, 3k8b:B, 3k8b:D, 3mjp:B, 3mjp:D, 3mju:B, 2qmb:B, 2qmb:D, 2r80:B, 2r80:D, 3wr1:B, 3wtg:B, 3wtg:D, 2zfb:B, 6zmx:B, 6zmx:D, 6zmy:B, 6zmy:D
34 3fh9:B 146 145 0.2483 0.2466 0.2483 0.81
35 7ddu:A 154 126 0.2069 0.1948 0.2381 0.83 7ddu:C, 1mbs:A
36 1v4w:B 146 104 0.1862 0.1849 0.2596 0.90 1v4u:B, 1v4u:D, 1v4w:D, 1v4x:B, 1v4x:D
37 1yhu:B 144 122 0.1931 0.1944 0.2295 1.1 1yhu:F, 1yhu:J, 1yhu:N, 1yhu:R, 1yhu:V
38 6e85:A 331 64 0.1034 0.0453 0.2344 1.2
39 2gtl:D 140 80 0.1448 0.1500 0.2625 1.3 2gtl:H, 2gtl:L, 5m3l:D, 5m3l:H, 5m3l:L, 1x9f:D, 1x9f:H, 1x9f:L
40 1ch4:A 146 81 0.1586 0.1575 0.2840 1.9 1ch4:B, 1ch4:C, 1ch4:D
41 2d2m:B 142 86 0.1310 0.1338 0.2209 2.0 2d2n:B, 7e96:B, 7e97:B, 7e98:B, 7e99:B, 2zfo:B, 2zs0:B, 2zs1:B
42 5c6e:B 146 81 0.1448 0.1438 0.2593 2.7 2d5x:B, 2dhb:B, 1g0b:B, 1ibe:B, 1iwh:B, 2mhb:B, 1ns6:B, 1ns9:B, 8puq:B, 8pur:B, 6r2o:B, 6r2o:D, 1s0h:B, 6sva:B, 1y8h:B, 1y8h:D, 1y8i:B, 1y8i:D, 1y8k:B, 1y8k:D, 2zlt:B, 2zlu:B, 2zlv:B, 2zlw:B, 2zlw:D, 2zlx:B, 2zlx:D
43 5eui:B 146 40 0.0897 0.0890 0.3250 2.8
44 3hf4:F 146 81 0.1655 0.1644 0.2963 4.8 3dht:B, 3hf4:B, 3hrw:B, 3hrw:D, 1jeb:B, 1jeb:D
45 3hf4:A 141 59 0.1379 0.1418 0.3390 5.3 3dht:A, 3hf4:E
46 6h6c:A 151 136 0.2000 0.1921 0.2132 5.9 5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
47 8ii8:A 225 99 0.1793 0.1156 0.2626 6.3
48 3bj2:B 146 120 0.1793 0.1781 0.2167 6.7 3bj1:B, 3bj1:D, 3bj2:D, 3bj3:B, 3bj3:D, 1xq5:B, 1xq5:D
49 3ciu:B 145 144 0.2690 0.2690 0.2708 6.8 3ciu:D, 3cy5:B, 3cy5:D, 3d1a:B, 3d1a:D, 3eu1:B, 3eu1:D, 1fsx:B, 1fsx:D, 1g08:B, 1g08:D, 1g09:B, 1g09:D, 1g0a:B, 1g0a:D, 1hda:B, 1hda:D, 6ihx:B, 6ihx:D, 6ii1:B, 6ii1:D, 3pi8:B, 3pi8:D, 3pi9:B, 3pi9:D, 3pia:B, 3pia:D, 2qsp:B, 2qsp:D, 2qss:B, 2qss:D, 2qu0:B, 2qu0:D, 2ri4:B, 2ri4:D, 2ri4:J, 2ri4:L
50 6iyi:A 142 142 0.2276 0.2324 0.2324 9.2

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218