Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREI

The query sequence (length=55) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2ak5:B 64 54 0.9818 0.8438 1.0000 7.51e-36 2df6:A, 2df6:B
2 1zsg:A 65 54 0.9455 0.8000 0.9630 2.15e-34 2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
3 2bz8:B 57 51 0.4909 0.4737 0.5294 2.79e-15 2bz8:A
4 2drk:A 59 53 0.4364 0.4068 0.4528 6.68e-14 2drm:A, 2drm:B, 2drm:C, 2drm:D
5 6a9c:B 66 53 0.4545 0.3788 0.4717 7.98e-14
6 5xhz:A 60 53 0.4364 0.4000 0.4528 1.31e-13 5xhz:B
7 4e6r:A 58 50 0.4545 0.4310 0.5000 8.23e-13
8 4x1v:A 59 53 0.4182 0.3898 0.4340 1.36e-12 3u23:A
9 6pbc:A 1070 54 0.4364 0.0224 0.4444 1.70e-12
10 7z3j:A 1119 54 0.4364 0.0214 0.4444 1.79e-12 2fci:A, 4k45:A, 7nxe:A, 2pld:A, 2ple:A, 5tq1:A, 5tqs:A, 5tqs:B, 5tqs:D, 5tqs:C, 1ywo:A
11 4lnp:A 61 50 0.3636 0.3279 0.4000 7.49e-12
12 2sem:B 59 50 0.4364 0.4068 0.4800 1.28e-11 1sem:A, 1sem:B, 2sem:A, 3sem:A, 3sem:B
13 2xmf:A 60 53 0.3636 0.3333 0.3774 4.00e-11
14 8t7c:A 1001 54 0.4364 0.0240 0.4444 8.43e-11
15 2d1x:C 66 48 0.3636 0.3030 0.4167 1.21e-10 2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
16 8dgo:B 218 55 0.4182 0.1055 0.4182 1.51e-10 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
17 8dgo:B 218 49 0.3636 0.0917 0.4082 1.00e-08 2aoa:A, 2aoa:B, 2aob:A, 2aob:B, 2aob:C, 2aob:D, 1aze:A, 1bm2:A, 1bmb:A, 3c7i:A, 5cdw:B, 5cdw:K, 5cdw:O, 5cdw:Y, 5cdw:d, 5cdw:Z, 5cdw:V, 5cdw:P, 5cdw:L, 5cdw:H, 5cdw:C, 5cdw:E, 5cdw:U, 5cdw:c, 5cdw:A, 5cdw:G, 1cj1:A, 1cj1:B, 1cj1:C, 1cj1:D, 1cj1:E, 1cj1:F, 1cj1:G, 1cj1:H, 1cj1:I, 1cj1:J, 1cj1:K, 1cj1:L, 1fyr:A, 1fyr:B, 1fyr:C, 1fyr:D, 1gbq:A, 2gbq:A, 3gbq:A, 4gbq:A, 2h5k:A, 2huw:A, 2huw:B, 3imd:A, 3imd:B, 3imj:A, 3imj:B, 3in7:A, 3in7:C, 3in8:A, 1io6:A, 1jyq:A, 1jyq:B, 1jyr:A, 3kfj:A, 7mph:A, 7mph:B, 7mph:C, 7mph:D, 7mph:E, 7mph:F, 3mxc:A, 3mxy:A, 3n7y:A, 3n7y:B, 3n7y:C, 3n84:A, 3n84:B, 3n84:C, 3n84:D, 3n84:E, 3n84:F, 3n8m:A, 3ov1:A, 3ove:A, 4p9v:A, 4p9z:A, 1qg1:E, 3s8l:A, 3s8n:A, 3s8o:A, 1tze:E, 2vwf:A, 2w0z:A, 3wa4:A, 6wm1:A, 6wm1:C, 6wo2:A, 6wo2:B, 1x0n:A, 1zfp:E
18 4wci:C 63 52 0.3818 0.3333 0.4038 1.71e-10 2j6f:A, 2j6o:A, 2j7i:A, 2j7i:B, 4wci:A, 4wci:E
19 1gbr:A 74 49 0.3636 0.2703 0.4082 3.15e-10
20 2w10:B 62 53 0.3636 0.3226 0.3774 1.47e-09 2d0n:A, 2d0n:C, 1h3h:A, 1oeb:B, 1oeb:A, 1uti:A, 2w10:A
21 1uj0:A 58 50 0.3636 0.3448 0.4000 1.57e-09
22 7uy0:A 448 50 0.3818 0.0469 0.4200 4.03e-09 7uy0:B, 7uy3:A
23 6ipz:Z 63 57 0.3818 0.3333 0.3684 1.04e-08 1a0n:B, 1azg:B, 4eik:A, 1fyn:A, 8kdx:A, 3ua7:A, 3ua7:D, 3ua7:C, 4znx:A, 4znx:D, 4znx:B, 4znx:C
24 4f14:A 56 51 0.3818 0.3750 0.4118 1.83e-08
25 1jeg:A 60 52 0.4000 0.3667 0.4231 2.20e-08
26 4hvw:A 61 50 0.3636 0.3279 0.4000 2.48e-08 6xx2:A, 6xx3:A
27 5ixf:A 68 50 0.3273 0.2647 0.3600 3.65e-08
28 8bq3:A 60 55 0.3636 0.3333 0.3636 5.29e-08
29 7a2w:A 61 57 0.3636 0.3279 0.3509 7.11e-08 7a2x:A, 7a2y:A, 7a2z:A
30 7ud6:A 265 53 0.3636 0.0755 0.3774 7.33e-08 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
31 1wlp:B 138 52 0.2909 0.1159 0.3077 1.19e-07 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
32 1wlp:B 138 40 0.2545 0.1014 0.3500 0.005 1ov3:A, 1ov3:B, 7yxw:A
33 1ssh:A 60 53 0.3818 0.3500 0.3962 1.27e-07
34 7pvt:C 56 50 0.3636 0.3571 0.4000 2.83e-07 7pvt:A
35 1y57:A 452 50 0.3455 0.0420 0.3800 3.63e-07 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
36 1w70:A 60 49 0.3636 0.3333 0.4082 3.75e-07 1w70:B
37 2jma:A 62 54 0.2727 0.2419 0.2778 4.71e-07 5ihk:A, 3thk:A, 3thk:B, 1u06:A
38 4iim:A 57 53 0.3455 0.3333 0.3585 5.88e-07 4iim:B
39 1b07:A 59 51 0.3455 0.3220 0.3725 6.34e-07 6atv:A, 1cka:A, 1ckb:A, 5ih2:A, 5ih2:B, 5l23:A, 5ul6:A
40 6f55:A 67 55 0.3455 0.2836 0.3455 8.03e-07
41 8hlo:A 67 53 0.4000 0.3284 0.4151 1.71e-06 2rqu:A
42 7pvx:A 60 50 0.3273 0.3000 0.3600 2.18e-06 7pvx:C
43 2o9v:A 67 53 0.4182 0.3433 0.4340 2.32e-06 4ln2:A
44 4iio:B 57 53 0.3636 0.3509 0.3774 3.35e-06
45 2oi3:A 86 56 0.3455 0.2209 0.3393 2.63e-05 2oj2:A
46 1wa7:A 60 56 0.3455 0.3167 0.3393 2.69e-05
47 2kxc:A 67 47 0.3636 0.2985 0.4255 3.04e-05
48 2vkn:A 66 41 0.3273 0.2727 0.4390 3.08e-05
49 6b27:A 118 51 0.2727 0.1271 0.2941 4.11e-05 6b27:B, 6b27:C, 6b27:D, 6b27:E, 6b27:F
50 3vs7:B 427 56 0.3455 0.0445 0.3393 4.95e-05 4lud:B, 4lud:A, 4lue:B, 4lue:A, 3vs1:A
51 1qcf:A 450 56 0.3455 0.0422 0.3393 5.98e-05 1ad5:B, 1ad5:A, 2c0i:A, 2c0i:B, 2c0o:A, 2c0o:B, 2c0t:A, 2c0t:B, 5h09:A, 5h0b:A, 5h0e:A, 5h0g:A, 5h0h:A, 2hck:B, 2hck:A, 2hk5:A, 3vry:A, 3vry:B, 3vrz:A, 3vrz:B, 3vs0:A, 3vs0:B, 3vs1:B, 3vs2:A, 3vs2:B, 3vs3:A, 3vs3:B, 3vs4:B, 3vs4:A, 3vs5:A, 3vs5:B, 3vs6:A, 3vs6:B, 3vs7:A, 5zj6:A, 5zj6:B
52 4cc3:C 64 57 0.3273 0.2812 0.3158 6.48e-05 4cc2:A, 4cc2:C, 4cc3:A, 4cc3:E, 4cc3:G, 4cc7:A, 4cc7:C, 4cc7:K, 4cc7:E, 4cc7:G, 4cc7:I, 4cc7:M
53 1zuk:A 65 55 0.3818 0.3231 0.3818 9.89e-05 1zuk:B
54 2rpn:A 59 50 0.3091 0.2881 0.3400 2.45e-04
55 2fpd:C 62 55 0.3818 0.3387 0.3818 6.48e-04 7nyl:AAA
56 4wsi:A 372 47 0.2909 0.0430 0.3404 7.79e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
57 1n5z:A 71 60 0.3455 0.2676 0.3167 8.66e-04 1n5z:B, 2v1r:B, 2v1r:A
58 5ypr:A 267 53 0.3091 0.0637 0.3208 0.001 7f7g:A, 7f7g:B, 7f7i:A, 7f7i:D, 7f7i:B, 7f7i:C, 7f7i:E, 7f7i:F, 5gnv:A, 1jxm:A, 3wp0:A, 3wp1:B, 5ypo:B, 5ypo:A
59 2lcs:A 67 53 0.2727 0.2239 0.2830 0.001
60 8gmb:A 438 53 0.2909 0.0365 0.3019 0.002 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
61 8ssn:B 386 53 0.3273 0.0466 0.3396 0.002
62 2fo0:A 466 53 0.3273 0.0386 0.3396 0.003 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
63 5mo4:A 429 53 0.3273 0.0420 0.3396 0.003 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
64 5qu2:A 56 51 0.3091 0.3036 0.3333 0.004 5qu2:B
65 7oj9:A 67 53 0.3091 0.2537 0.3208 0.008
66 6vld:B 469 52 0.3455 0.0405 0.3654 0.009 6tkv:A, 6tkv:B, 6vld:A, 6vlg:A, 6vlg:B, 6vlg:C, 6vlg:D, 6x5h:A, 6x5h:B, 6x5h:C, 6x5r:B, 6x5r:A, 6x5s:A, 6x5s:B, 6x5t:A, 6x5t:B, 6x5t:C, 6x5t:D, 6x5t:E, 6x5t:F, 6x5t:G, 6x5t:H, 6x5u:E, 6x5u:B, 6x5u:D, 6x5u:F, 6x5u:A, 6x5u:G, 6x5u:C, 6x5u:H
67 4z88:D 70 44 0.3091 0.2429 0.3864 0.015 4z88:A, 4z88:B, 4z88:C, 4z88:E, 4z88:F, 4z88:G, 4z88:H, 4z88:I, 4z88:J, 4z88:K, 4z88:L, 4z89:A, 4z89:C, 4z89:B, 4z89:D, 4z89:J, 4z89:I, 4z89:E, 4z89:F, 4z89:G, 4z89:H
68 7tzk:A 64 50 0.2364 0.2031 0.2600 0.021 7tzk:B
69 3tvt:A 255 36 0.2364 0.0510 0.3611 0.028
70 3uat:A 276 59 0.3273 0.0652 0.3051 0.068
71 2rol:A 64 50 0.2727 0.2344 0.3000 0.12
72 8c3a:CR 260 51 0.2727 0.0577 0.2941 0.12 8c3a:G, 8cq7:G, 8cq7:CR, 8cqw:G, 8cqw:CR, 8cre:G, 8cre:CR, 8oeq:G, 8oeq:CR, 7pzy:F, 7q08:F, 7q0f:F, 7q0p:F, 7q0r:F, 8q5i:F
73 3rnj:A 67 57 0.3455 0.2836 0.3333 0.13
74 3rfv:A 265 19 0.1455 0.0302 0.4211 0.15 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
75 8bn3:S4 260 51 0.2545 0.0538 0.2745 0.20 7a1g:S, 7ajt:DE, 7aju:DE, 7b7d:S, 8bqd:S, 8bqx:S, 8c00:S, 8c01:S, 8c83:S, 8cah:S, 8cas:S, 8cbj:E, 8ccs:h, 8cdl:h, 8cdr:h, 8ceh:h, 8cf5:h, 8cg8:h, 8cgn:h, 8civ:h, 8cku:h, 8cmj:h, 7d4i:SF, 7d5t:SF, 7d63:SF, 5dat:S4, 5dat:s4, 5dc3:S4, 5dc3:s4, 5dge:S4, 5dge:s4, 5dgf:S4, 5dgf:s4, 5dgv:S4, 5dgv:s4, 6eml:S, 8eub:BE, 8evp:BE, 8evq:BE, 8evr:BE, 8evs:BE, 8evt:BE, 8ewb:BE, 8ewc:BE, 6fai:E, 5fci:S4, 5fci:s4, 5fcj:S4, 5fcj:s4, 6fyx:E, 6fyy:E, 6gq1:u, 6gqb:u, 6gqv:u, 6gsm:E, 6gsn:E, 6hhq:F, 6hhq:s4, 5i4l:S4, 5i4l:s4, 6i7o:Sb, 6i7o:S, 8i7j:E, 5it7:E, 5it9:E, 3j6x:S4, 3j6y:S4, 3j77:S4, 3j78:S4, 3j80:E, 3j81:E, 3jam:E, 3jap:E, 5juo:BB, 5jup:BB, 5jus:BB, 5jut:BB, 5juu:BB, 8k2d:SE, 8k82:SE, 6ke6:SF, 5ll6:S, 6lqp:SF, 6lqq:SF, 6lqr:SF, 6lqs:SF, 6lqt:SF, 6lqu:SF, 6lqv:SF, 5lyb:S4, 5lyb:s4, 5m1j:E2, 5mc6:S, 5mei:s4, 5mei:F, 7mpi:BE, 7mpj:BE, 7n8b:BE, 5ndg:S4, 5ndg:s4, 5ndv:S4, 5ndv:s4, 5ndw:S4, 5ndw:s4, 7nrc:SS, 7nrd:SS, 5obm:S4, 5obm:s4, 5on6:s4, 5on6:F, 7osa:eS4, 7osm:eS4, 6q8y:S, 6rbd:E, 6rbe:E, 7rr5:SE, 8rw1:E, 6s47:BF, 8s8d:E, 8s8e:E, 8s8f:E, 8s8g:E, 8s8h:E, 8s8i:E, 8s8j:E, 6snt:E, 7suk:L4, 6sv4:Sb, 6sv4:S, 6sv4:Sc, 6t4q:SE, 6t7i:SE, 6t7t:SE, 6t83:Eb, 6t83:f, 5tbw:F, 5tbw:s4, 6tb3:S, 5tga:S4, 5tga:s4, 5tgm:S4, 5tgm:s4, 6tnu:S, 5tzs:5, 4u3m:S4, 4u3m:s4, 4u3n:S4, 4u3n:s4, 4u3u:S4, 4u3u:s4, 4u4n:S4, 4u4n:s4, 4u4o:S4, 4u4o:s4, 4u4q:S4, 4u4q:s4, 4u4r:S4, 4u4r:s4, 4u4u:S4, 4u4u:s4, 4u4y:S4, 4u4y:s4, 4u4z:S4, 4u4z:s4, 4u50:S4, 4u50:s4, 4u51:S4, 4u51:s4, 4u52:S4, 4u52:s4, 4u53:S4, 4u53:s4, 4u55:S4, 4u55:s4, 4u56:S4, 4u56:s4, 4u6f:S4, 4u6f:s4, 4uer:W, 6uz7:E, 4v6i:AD, 4v88:AE, 4v88:CE, 4v8y:AE, 4v8z:AE, 4v92:BE, 6wdr:E, 5wlc:L4, 6woo:EE, 7wtl:SE, 7wtm:SE, 7wtn:SE, 7wto:SE, 7wtp:SE, 7wtq:SE, 7wtr:SE, 5wyj:SF, 5wyk:SF, 6xiq:u, 6xir:u, 8y0u:SE, 6y7c:E, 6z6j:SE, 6z6k:SE, 6zce:F, 7zpq:AE, 6zqb:DE, 6zqc:DE, 6zqd:DE, 6zqe:DE, 6zqf:DE, 6zqg:DE, 7zrs:AE, 6zu9:S, 7zuw:AE, 7zux:DE, 6zvi:m, 7zw0:sS
76 5i22:A 81 68 0.3091 0.2099 0.2500 0.70 1mv0:B
77 8bbq:A 324 48 0.2909 0.0494 0.3333 0.77 8bbq:B, 8bbr:A, 8bbr:B
78 6ryk:A 133 28 0.1818 0.0752 0.3571 1.4 6ryk:B
79 5ixb:A 105 65 0.3455 0.1810 0.2923 1.5 5ixb:B
80 3err:A 527 22 0.2000 0.0209 0.5000 1.7 3err:B, 1ser:A
81 8dgq:A 272 35 0.2545 0.0515 0.4000 1.8 8dgq:B, 6pxc:A, 6way:A
82 1ser:B 421 22 0.2000 0.0261 0.5000 2.2 1ses:A, 1ses:B, 1set:A, 1set:B
83 6mf5:B 262 48 0.2727 0.0573 0.3125 2.8 6mf4:A, 6mf5:A, 6mf6:B, 6mf6:A
84 5v2p:A 287 57 0.2727 0.0523 0.2632 3.7 4dey:A
85 8e0e:A 322 57 0.2727 0.0466 0.2632 3.7 1t0j:B, 1t3l:A, 5v2q:A
86 6rm3:SE0 256 20 0.1818 0.0391 0.5000 4.7
87 7f0r:D 1339 36 0.2545 0.0105 0.3889 6.4 7vf9:D, 7xl3:D, 7xl4:D, 7xya:D, 7xyb:D
88 3e8u:L 216 27 0.1636 0.0417 0.3333 6.7 1f58:L, 2f58:L, 1qnz:L

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218