BioLiP

>protein
SVVLPVAKRGEDILKLIAAPVSANELNSNWLYQLADAMHATMLERNGVGIAAPQVYISKRVIIVASRPNPRYPDAPEMNA
VVMVNPEILEFSSEMCLGEEGCLSVPDERGQVERAEMVKVKYLTLQGEMVETVFQGFPARIVQHEVDHLNGILFVERIS

The query sequence (length=159) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6jes:A	159	159	1.0000	1.0000	1.0000	2.84e-116	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
2	1y6h:A	177	157	0.3585	0.3220	0.3631	4.41e-35	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
3	5kob:A	171	154	0.4088	0.3801	0.4221	3.26e-34	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
4	3uwb:A	149	134	0.3585	0.3826	0.4254	9.78e-30	3uwa:A
5	6jfc:B	161	154	0.3711	0.3665	0.3831	1.90e-28	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
6	4wxl:C	165	149	0.3711	0.3576	0.3960	1.38e-26	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
7	5hgw:A	174	154	0.3836	0.3506	0.3961	5.20e-26	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
8	5cy7:A	171	143	0.3396	0.3158	0.3776	3.42e-25	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
9	1bs4:A	168	157	0.3774	0.3571	0.3822	1.28e-24	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
10	1ix1:A	169	149	0.3585	0.3373	0.3826	1.33e-24	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
11	1ws1:A	151	129	0.3270	0.3444	0.4031	3.01e-23
12	1jym:A	179	129	0.3145	0.2793	0.3876	3.85e-23	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
13	3cpm:A	184	129	0.2893	0.2500	0.3566	7.39e-23	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
14	4dr8:A	188	149	0.3522	0.2979	0.3758	9.21e-23	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
15	6ck7:A	172	146	0.3648	0.3372	0.3973	2.67e-22	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
16	2os1:A	179	156	0.3962	0.3520	0.4038	3.01e-22
17	3fwx:A	165	157	0.3774	0.3636	0.3822	9.39e-22	3fwx:B
18	3cmd:B	188	157	0.3585	0.3032	0.3631	2.15e-21	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
19	6jex:A	172	157	0.3459	0.3198	0.3503	6.13e-21	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
20	6ow7:P	196	125	0.3459	0.2806	0.4400	1.09e-20	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
21	5j46:A	169	146	0.3522	0.3314	0.3836	1.15e-20
22	1lqy:A	184	167	0.3711	0.3207	0.3533	1.57e-20
23	3oca:A	179	132	0.3082	0.2737	0.3712	2.84e-20	3oca:B, 3u04:A
24	2okl:A	185	168	0.3711	0.3189	0.3512	1.13e-19	2okl:B
25	3qu1:A	168	126	0.2893	0.2738	0.3651	1.17e-19	3qu1:B
26	1lm4:A	190	120	0.2893	0.2421	0.3833	3.32e-19	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
27	2ew5:A	166	129	0.3019	0.2892	0.3721	7.18e-19	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
28	3l87:A	200	138	0.3522	0.2800	0.4058	2.53e-18
29	3g5k:A	183	163	0.3208	0.2787	0.3129	3.90e-18	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
30	4je6:A	193	158	0.3459	0.2850	0.3481	8.26e-18	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
31	2os3:A	205	127	0.3270	0.2537	0.4094	1.29e-17
32	5jex:A	203	124	0.3082	0.2414	0.3952	2.60e-17	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
33	3e3u:A	196	163	0.3459	0.2806	0.3374	4.12e-16
34	5mtc:A	137	115	0.2201	0.2555	0.3043	6.31e-11	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
35	8j6g:A	621	64	0.1132	0.0290	0.2812	2.2	3amo:A, 3amo:B, 1av4:A, 1avl:A, 2bt3:A, 2cfd:A, 2cfd:B, 2cfg:A, 2cfg:B, 2cfk:A, 2cfl:A, 2cfw:A, 2cg0:A, 2cg1:A, 2cwt:A, 2cwt:B, 2cwu:A, 2cwu:B, 2cwv:A, 2cwv:B, 2d1w:A, 2d1w:B, 2e2t:A, 2e2u:A, 2e2u:B, 2e2v:A, 2e2v:B, 7f8k:A, 1iqx:A, 1iqx:B, 1iu7:A, 1iu7:B, 1ivu:A, 1ivu:B, 1ivv:A, 1ivv:B, 1ivw:A, 1ivw:B, 1ivx:A, 1ivx:B, 3kii:A, 3kii:B, 3kn4:A, 6l9c:X, 1rjo:A, 1sih:A, 1sii:A, 1ui7:A, 1ui7:B, 1ui8:A, 1ui8:B, 1w4n:A, 1w4n:B, 1w5z:A, 1w6c:A, 1w6g:A, 3wa2:X, 3wa3:A, 3wa3:B, 7wir:A, 7wir:B, 7wis:A, 7wis:B, 1wmn:A, 1wmn:B, 1wmp:A, 1wmp:B, 7wno:X, 7wnp:X, 3x3x:A, 3x3x:B, 3x3y:A, 3x3y:B, 3x3z:A, 3x3z:B, 3x40:A, 3x40:B, 3x41:A, 3x41:B, 3x42:A, 3x42:B, 7ynh:A, 7ynh:B, 2yx9:A, 2yx9:B, 2zl8:A, 2zl8:B, 5zou:A, 5zou:B, 5zow:A, 5zow:B, 5zox:A, 5zox:B, 5zoy:A, 5zoy:B, 5zoz:A, 5zoz:B, 5zp0:A, 5zp0:B, 5zp1:A, 5zp1:B, 5zp2:A, 5zp2:B, 5zp3:A, 5zp3:B, 5zp4:A, 5zp4:B, 5zp5:A, 5zp5:B, 5zp6:A, 5zp6:B, 5zp7:A, 5zp7:B, 5zp8:A, 5zp8:B, 5zp9:A, 5zp9:B, 5zpa:A, 5zpa:B, 5zpb:A, 5zpb:B, 5zpc:A, 5zpc:B, 5zpd:A, 5zpd:B, 5zpe:A, 5zpe:B, 5zpf:A, 5zpf:B, 5zpg:A, 5zpg:B, 5zph:A, 5zph:B, 5zpi:A, 5zpi:B, 5zpj:A, 5zpj:B, 5zpk:A, 5zpk:B, 5zpl:A, 5zpl:B, 5zpm:A, 5zpm:B, 5zpn:A, 5zpn:B, 5zpo:A, 5zpo:B, 5zpp:A, 5zpp:B, 5zpq:A, 5zpq:B, 5zpr:A, 5zpr:B, 5zps:A, 5zps:B, 5zpt:A, 5zpt:B
36	6ykp:B	255	49	0.0881	0.0549	0.2857	3.1	6ykp:C, 6ykp:D, 6ykp:A, 6ykp:E, 6ykr:B, 6ykr:C, 6ykr:D, 6ykr:A, 6ykr:E
37	5ze9:F	456	41	0.0755	0.0263	0.2927	3.6	7coq:F, 7dqd:E, 7dqd:F, 7dqd:M, 7dqd:N, 8igv:D, 8igv:E, 8igw:D, 8igw:J, 8igw:L, 5knc:F, 3vr3:E, 3vr3:F, 3vr6:E, 3vr6:F, 7vw7:E, 7vw7:F, 5ze9:D, 5ze9:E
38	6c80:B	486	37	0.0755	0.0247	0.3243	4.1	6c80:A
39	6pdw:D	299	33	0.0818	0.0435	0.3939	4.5	6pdw:B, 6pdw:C, 6pdw:E, 6pdw:F, 6pdy:F, 6pdy:C, 6pdy:D, 6pdy:E, 6pdy:B, 6pe0:B, 6pe0:C, 6pe0:D, 6pe0:E, 6pe0:F
40	3jcu:R	232	29	0.0629	0.0431	0.3448	5.2	3jcu:r, 3pl9:A
41	5cvn:B	321	31	0.0692	0.0343	0.3548	7.0	5cvo:B, 5cvo:E, 6jlq:A
42	3ueq:A	632	48	0.0943	0.0237	0.3125	7.1	4fls:A, 1jg9:A, 1jgi:A, 1mvy:A, 1mw0:A, 1mw1:A, 1mw2:A, 1mw3:A, 5n6v:A, 5n7j:A, 1s46:A, 1zs2:A

[Back]