Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SVTANIENVKKVAHHIQKLTSIVPEIGIICGSGLGKLADGVKDKITIPYTKIPNFPQTSVVGHSGNLIFGTLSGRKVVVM
QGRFHMYEGYSNDTVALPIRVMKLLGVKILMVSNAAGGLNRSLKLGDFVILKDHIYLPGLGLNNILVGPNQEAFGTRFPA
LSNAYDRDLRKLAVQVAEENGFGNLVHQGVYVMNGGPCYETPAECTMLLNMGCDVVGMSTIPEVVIARHCGIQVFAVSLV
TNISVLDVESDLKPNHEEVLATGAQRAELMQSWFEKIIEKLP

The query sequence (length=282) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3e0q:C 285 282 1.0000 0.9895 1.0000 0.0 3djf:A, 3djf:B, 3djf:C, 3e0q:A, 3e0q:B, 3e9r:B, 3e9z:A, 3e9z:C, 3f8w:A, 3f8w:B, 3f8w:C, 3faz:A, 3faz:B, 3faz:C, 3fb1:A, 3fb1:B, 3fb1:C, 3fnq:A, 3fnq:B, 3fnq:C, 3iex:A, 3iex:C, 1tcu:A, 1tcu:B, 1tcu:C, 1tcv:A, 1tcv:B, 1tcv:C, 1td1:A, 1td1:B, 1td1:C
2 5ko6:A 285 281 0.6170 0.6105 0.6192 3.15e-137 6awe:A, 6axa:A, 6b2l:A, 6b37:A, 6b3l:A, 6b4q:A, 6b4t:A, 6b56:A, 6b6k:A, 6b71:A, 6b7i:A, 6bb7:A, 6bfv:A, 6bhb:A, 6bi1:A, 6bi9:A, 6bif:A, 6bj6:A, 6bj7:A, 5ko5:A, 5tbs:A, 5tbt:A, 5tbu:A, 5tbv:A
3 1a9o:A 289 276 0.4823 0.4706 0.4928 4.73e-101 1a9p:A, 1a9q:A, 1a9r:A, 1a9s:A, 1a9t:A, 2ai1:A, 2ai2:A, 2ai3:A, 1b8n:A, 1b8o:A, 3fuc:A, 3fuc:B, 3fuc:C, 1fxu:A, 1lv8:A, 1lv8:B, 1lv8:C, 1lv8:D, 1lv8:E, 1lv8:F, 1lvu:A, 1lvu:B, 1lvu:C, 1lvu:D, 1lvu:E, 1lvu:F, 2qpl:A, 1v48:A, 1vfn:A
4 3d1v:A 288 276 0.4823 0.4722 0.4928 1.62e-98 2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
5 3khs:B 270 273 0.4468 0.4667 0.4615 5.58e-85 3khs:A, 3khs:C, 3khs:D
6 2p4s:A 282 275 0.4113 0.4113 0.4218 1.83e-80 2p4s:B, 2p4s:C
7 8swu:A 269 273 0.4504 0.4721 0.4652 6.11e-80 8swu:B, 8swu:C
8 8swt:A 278 282 0.4326 0.4388 0.4326 5.49e-75 8swt:B
9 4nsn:A 273 263 0.4468 0.4615 0.4791 4.35e-72 4ns1:A, 4ns1:B, 4ns1:C, 4ns1:D, 4nsn:B, 4nsn:C
10 4m1e:B 273 274 0.4255 0.4396 0.4380 2.04e-68 4m1e:A, 4m1e:F, 4m1e:E, 4m1e:C, 4m1e:D
11 4lna:A 269 275 0.4184 0.4387 0.4291 3.53e-68
12 8swq:A 302 277 0.4043 0.3775 0.4116 1.08e-65 5ifk:A, 5ifk:B, 5ifk:C, 8swp:A, 8swp:D, 8swp:E, 8swq:D, 8swr:A, 8swr:D, 8sws:A, 8sws:D, 8sws:E
13 3odg:A 273 273 0.4078 0.4212 0.4212 1.29e-64
14 3lba:A 260 221 0.3688 0.4000 0.4706 6.93e-63
15 1yqq:A 273 258 0.4043 0.4176 0.4419 1.88e-62 1yqq:B, 1yqq:C, 1yqu:A, 1yqu:B, 1yqu:C, 1yr3:A, 1yr3:B, 1yr3:C, 1yr3:D, 1yr3:E, 1yr3:F
16 8swq:B 278 278 0.3617 0.3669 0.3669 3.15e-51 8swp:B, 8swq:E, 8swr:B, 8sws:B
17 4uc0:A 247 227 0.2979 0.3401 0.3700 3.46e-45
18 7zsq:C 268 277 0.3298 0.3470 0.3357 5.45e-43 8c25:A, 8c25:B, 1g2o:A, 1g2o:B, 1g2o:C, 1i80:A, 1i80:B, 1i80:C, 3iom:A, 3iom:B, 3ix2:A, 3ix2:B, 3ix2:C, 1n3i:A, 1n3i:B, 1n3i:C, 3scz:A, 3scz:B, 7zsq:A, 7zsq:B, 7zsr:A, 7zsr:B, 7zsr:C
19 1c3x:A 266 274 0.3156 0.3346 0.3248 1.71e-32 1c3x:B, 1c3x:C, 1qe5:A, 1qe5:B, 1qe5:C
20 3t94:A 270 263 0.2518 0.2630 0.2700 3.40e-15 2a8y:A, 2a8y:B, 2a8y:C, 2a8y:D, 2a8y:E, 2a8y:F, 2a8y:G, 2a8y:H, 2a8y:I, 2a8y:J, 2a8y:K, 2a8y:L, 3t94:B, 3t94:C, 3t94:D, 3t94:E, 3t94:F
21 5tc5:A 286 249 0.2234 0.2203 0.2530 3.87e-13 1cb0:A, 1cg6:A, 6dyz:A, 6dz0:A, 6dz2:A, 6dz2:B, 6dz2:C, 6dz3:A, 6dz3:B, 6dz3:C, 5eub:A, 1k27:A, 3ozc:A, 3ozd:A, 3ozd:B, 1sd1:A, 1sd2:A, 5tc5:B, 5tc5:C, 5tc6:A, 5tc7:A, 5tc8:A
22 9jd2:A 273 264 0.2340 0.2418 0.2500 7.86e-12 9jhv:A, 1wta:A
23 3ozb:A 241 215 0.2021 0.2365 0.2651 2.56e-10 3ozb:B, 3ozb:C, 3ozb:D, 3ozb:E, 3ozb:F
24 5f7j:B 291 169 0.1454 0.1409 0.2426 1.38e-08 5f76:A, 5f76:B, 5f76:C, 5f77:A, 5f77:B, 5f77:C, 5f7j:A, 5f7j:D, 5f7j:E, 5f7o:A, 5f7o:B, 5f7x:A, 5f7x:B, 5f7x:C, 5fak:A, 5fak:B, 5fak:D, 5fak:E, 4l5a:A, 4l5a:C, 4l5a:B, 4l5a:D, 4l5a:E, 4l5a:F, 4l5c:A, 4l5c:B, 4l5c:C, 4l5c:D, 4l5c:E, 4l5c:F, 4l6i:A, 4l6i:B, 4l6i:D, 4l6i:E
25 4glj:A 287 248 0.2199 0.2160 0.2500 8.11e-08
26 8itg:A 439 71 0.0957 0.0615 0.3803 0.006 8gq9:A, 8gqa:A, 8gqb:A, 8ith:A
27 1kqo:A 233 28 0.0390 0.0472 0.3929 0.63 1gzu:A, 1gzu:B, 1gzu:C, 1kqn:A, 1kqn:B, 1kqn:C, 1kqn:D, 1kqn:E, 1kqn:F, 1kqo:B, 1kqo:C, 1kqo:D, 1kqo:E, 1kqo:F, 1kr2:A, 1kr2:B, 1kr2:C, 1kr2:D, 1kr2:E, 1kr2:F, 8qe8:4, 8qe8:3
28 3qpb:C 254 121 0.1099 0.1220 0.2562 0.79 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
29 3vmw:A 324 108 0.0957 0.0833 0.2500 2.1
30 3bl6:A 230 97 0.0887 0.1087 0.2577 4.7
31 5ue1:A 233 73 0.0780 0.0944 0.3014 4.8 5ue1:B
32 6po4:A 233 74 0.0816 0.0987 0.3108 5.5 6po4:B, 6po4:C, 6po4:D, 6po4:E, 6po4:F
33 3u40:D 241 30 0.0461 0.0539 0.4333 7.2 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
34 3o70:A 55 27 0.0284 0.1455 0.2963 9.9 3o7a:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218