Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVRLSGYCGSPWRVIGYHVVVWMMAGIPLLLFRWKPLWGVRLRLRPCNLAHAETLVIEIWQLFTVQVQTEVLRYYLFQGQ
RYIWIETQQAFYQVSLLDHGRSCDDVHRSRHGLSLQDQMVRKAIYGPNVISIPVKSYPQLLVDEALNPYYGFQAFSIALW
LADHYYWYALCIFLISSISICLSLYKTRKQSQTLRDMVKLSMRVCVCRPGGEEEWVDSSELVPGDCLVLPQEGGLMPCDA
ALVAGECMVNESSLTGESIPVLKTALPEGLGPYCAETHRRHTLFCGTLILQARAYVGPHVLAVVTRTGFCTAKGGLVSSI
LHPFYKHSMKFVAALSVLALLGTIYSIFILYRNRVPLNEIVIRALDLVTVVVPPALPAAMTVCTLYAQSRLRRQGIFCIH
PLRINLGGKLQLVCFDKTGTLTEDGLDVMGVVPLKGQAFLPLVPEPRRLPVGPLLRALATCHALSRLQDTPVGDPMDLKM
VESTGWVLEDSAFGTQVPVPVSVLHRFPFSSALQRMSVVVAWPGATQPEAYVKGSPELVAGLCNPETVPTDFAQMLQSYT
AAGYRVVALASKPLPTVPSLEAAQQLTRDTVEGDLSLLGLLVMRNLLKPQTTPVIQALRRTRIRAVMVTGDNLQTAVTVA
RGCGMVAPQEHLIIVHATHPERGQPASLEFLPMESRSRHLALSGPTFGIIVKHFPKLLPKVLVQGTVFARMAPEQKTELV
CELQKLQYCVGMCGDGANDCGALKAADVGISLSQAEASVVSPFTSSMASIECVPMVIREGRCSLDTSFSVFKYMALYSLT
QFISVLILYTINTNLGDLQFLAIDLVITTTVAVLMSRTGPALVLGRVRPPGALLSVPVLSSLLLQMVLVTGVQLGGYFLT
LAQPWFVPLNRTVAAPDNLPNYENTVVFSLSSFQYLILAAAVSKGAPFRRPLYTNVPFLVALALLSSVLVGLVLVPGLLQ
GPLALRNITDTGFKLLLLGLVTLNFVGAFMLESVLDQCLPACLRRLRPKRASKKRFKQLERELAEQPWPP

The query sequence (length=1030) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7vpk:A 1055 1059 0.9951 0.9716 0.9679 0.0 8iek:P, 8ies:P, 7m5v:A, 7n70:A, 7n72:A, 7n73:A, 7n74:A, 7n77:A, 7n78:A, 7vpi:A, 7vpj:A, 7vpl:A
2 8ieo:P 1031 1048 0.9670 0.9661 0.9504 0.0 8iem:P
3 7m5x:A 1000 1033 0.9592 0.9880 0.9564 0.0 7fjp:B, 7fjq:A, 8ien:P, 7m5y:A
4 7op8:A 1118 1063 0.4058 0.3739 0.3932 0.0 7op1:A, 7op3:A, 7op5:A
5 6xmt:A 1092 930 0.2602 0.2454 0.2882 5.79e-99 6xmq:A, 6xms:A, 6xmu:A
6 6zhh:A 883 815 0.1767 0.2061 0.2233 1.98e-31 6zhf:A, 6zhg:A, 6zhh:B, 6zhh:C, 6zhh:D, 6zhh:E, 6zhh:F, 6zhh:G, 6zhh:H
7 5ksd:A 833 703 0.1670 0.2065 0.2447 1.64e-30 5ksd:B
8 3b8e:A 998 893 0.2058 0.2124 0.2374 9.29e-29 3b8e:C, 7d91:A, 7d92:A, 7d93:A, 7d93:C, 7d94:A, 7d94:C, 7ddf:A, 7ddf:C, 7ddh:A, 7ddh:C, 7ddi:A, 7ddi:C, 7ddk:A, 7ddk:C, 7ddl:A, 7ddl:C, 7e1z:A, 7e20:A, 7e21:A, 4hqj:A, 4hqj:C, 4hyt:A, 4hyt:C, 8jbk:A, 8jbk:C, 8jbl:A, 8jbl:C, 8jbm:A, 8jbm:C, 3kdp:A, 3kdp:C, 1mo8:A, 3n23:A, 3n23:C, 7qtv:A, 7qtv:C, 4res:A, 4res:C, 4ret:A, 4ret:C, 3wgu:A, 3wgu:C, 3wgv:A, 3wgv:C, 7wys:A, 7wys:C, 7wyt:A, 7wyt:C, 4xe5:A, 7yzr:A, 7yzr:C, 7z04:A, 7z04:C
9 8k1l:A 979 851 0.1922 0.2022 0.2327 2.68e-27
10 7x20:A 986 941 0.2058 0.2150 0.2253 4.77e-26 8ijl:A, 8ijm:A, 7x21:A, 7x22:A, 7x23:A, 7x24:A
11 7wyu:A 993 891 0.2068 0.2145 0.2391 9.95e-26 3a3y:A, 5avq:A, 5avr:A, 5avs:A, 5avt:A, 5avu:A, 5avv:A, 5avw:A, 5avx:A, 5avy:A, 5avz:A, 5aw0:A, 5aw1:A, 5aw2:A, 5aw3:A, 5aw4:A, 5aw5:A, 5aw6:A, 5aw7:A, 5aw8:A, 5aw9:A, 8jfz:C, 8jfz:A, 7wyu:C, 7wyv:A, 7wyv:C, 7wyw:A, 7wyw:C, 7wyx:A, 7wyx:C, 7wyy:A, 7wyy:C, 7wyz:A, 7wyz:C, 7wz0:A, 7wz0:C, 7y45:C, 7y45:A, 7y46:C, 7y46:A, 2zxe:A
12 8iwp:A 896 766 0.1718 0.1975 0.2311 6.04e-25 8iwr:A, 8iws:A, 8iwt:A, 8iwu:A, 8iww:A, 7yag:A, 7yah:A, 7yai:A, 7yaj:A, 7yam:A
13 7efl:A 987 803 0.1845 0.1925 0.2366 2.94e-23 7efm:A, 7efn:A, 7et1:A, 8ijv:A, 8ijw:A, 8ijx:A, 8jmn:A, 6jxh:A, 6jxi:A, 6jxj:A, 6jxk:A, 6jxk:E, 7w47:A, 7w48:A, 7w49:A, 7w4a:A, 8wa5:A, 5ylu:A, 5ylv:A
14 7nxf:A 829 578 0.1301 0.1616 0.2318 2.35e-21 7ny1:A, 7ny1:B, 7ny1:C, 7ny1:D, 7ny1:E, 7ny1:F
15 5zmw:A 1000 692 0.1612 0.1660 0.2399 3.42e-20 5a3q:A, 5a3r:A, 5a3s:A, 5a3s:B, 2agv:A, 2agv:B, 3ar2:A, 3ar3:A, 3ar4:A, 3ar5:A, 3ar6:A, 3ar7:A, 3ar8:A, 3ar9:A, 3b9b:A, 3b9r:A, 3b9r:B, 3ba6:A, 4bew:A, 4bew:B, 2by4:A, 2c88:A, 2c8k:A, 2c8l:A, 2c9m:A, 2c9m:B, 2dqs:A, 2ear:A, 2eat:A, 2eau:A, 3fgo:A, 3fgo:B, 3fpb:A, 3fps:A, 4h1w:A, 6hef:A, 1iwo:A, 1iwo:B, 4j2t:A, 3j7t:A, 4kyt:A, 3n5k:A, 3n5k:B, 3n8g:A, 3nal:A, 3nam:A, 3nan:A, 4nab:A, 5ncq:A, 2o9j:A, 2oa0:A, 8owa:A, 8owl:A, 6rb2:A, 1su4:A, 1t5s:A, 1t5t:A, 3tlm:A, 4uu0:A, 4uu1:A, 1vfp:A, 1vfp:B, 3w5a:A, 3w5a:B, 3w5b:A, 1wpg:A, 1wpg:B, 1wpg:C, 1wpg:D, 5xa7:A, 5xa8:A, 5xa9:A, 5xaa:A, 4xou:A, 1xp5:A, 6yaa:A, 4ycl:A, 4ycm:A, 4ycn:A, 2yfy:A, 6yso:A, 6yso:B, 2zbd:A, 2zbe:A, 2zbe:B, 2zbf:A, 2zbg:A
16 7vh6:A 768 568 0.1223 0.1641 0.2218 2.35e-19 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
17 7rd6:A 929 393 0.0874 0.0969 0.2290 2.89e-16 7rd7:A, 7rd8:A
18 8d3x:A 989 393 0.0951 0.0991 0.2494 3.92e-13 8d3u:A, 8d3w:A
19 8d3x:A 989 380 0.0903 0.0940 0.2447 4.55e-12 8d3u:A, 8d3w:A
20 7kyc:A 1178 311 0.0631 0.0552 0.2090 9.26e-13 7drx:A, 7dsh:A, 7dsi:A, 7f7f:A, 7ky6:A, 7kyb:A, 7whv:A, 7whw:A
21 6k7l:A 992 394 0.0864 0.0897 0.2259 1.93e-12 6k7i:A, 6k7j:A, 6k7k:A, 6k7m:A, 6k7n:A
22 6roh:A 1112 489 0.1000 0.0926 0.2106 9.62e-12 7oh4:A, 7oh5:A, 7oh6:A, 7oh7:A, 7pem:A, 6roi:A, 6roj:A
23 5ztf:A 972 331 0.0777 0.0823 0.2417 1.07e-11
24 5ztf:A 972 220 0.0573 0.0607 0.2682 1.74e-07
25 7w7t:A 1021 307 0.0718 0.0725 0.2410 1.92e-11 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
26 7w7t:A 1021 232 0.0592 0.0597 0.2629 4.70e-06 7bt2:A, 7e7s:A, 6hxb:A, 6jju:A, 6lle:A, 6lly:A, 6ln5:A, 6ln6:A, 6ln7:A, 6ln8:A, 6ln9:A, 5mpm:A, 2voy:B, 2voy:H, 2voy:E, 2voy:K, 7w7u:A, 7w7v:A, 7w7w:A
27 7kya:A 1174 318 0.0689 0.0605 0.2233 3.38e-11 7ky5:A, 7ky7:A, 7ky8:A, 7ky9:A
28 7r0h:A 654 347 0.0854 0.1346 0.2536 4.20e-11 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
29 7r0h:A 654 122 0.0408 0.0642 0.3443 6.21e-04 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
30 7r0h:A 654 43 0.0146 0.0229 0.3488 0.022 3a1c:A, 3a1c:B, 3a1d:A, 3a1d:B, 3a1e:A, 3a1e:B
31 7bsp:A 1028 413 0.0883 0.0885 0.2203 7.76e-11 7bsq:A, 7vsh:A
32 6lcp:A 1140 307 0.0680 0.0614 0.2280 6.48e-10 6lcr:A
33 7qbz:A 638 520 0.1165 0.1881 0.2308 2.64e-09 7qc0:A
34 7qbz:A 638 54 0.0204 0.0329 0.3889 0.030 7qc0:A
35 8oxa:A 1035 288 0.0641 0.0638 0.2292 2.97e-08 8ox5:A, 8oxb:A, 8oxc:A
36 7si6:A 873 559 0.1165 0.1375 0.2147 4.73e-08 7si3:A, 7si7:A
37 6lkn:A 1064 445 0.0913 0.0883 0.2112 5.38e-08 6lkn:E, 6lkn:I, 6lkn:M
38 8ioy:A 816 591 0.1204 0.1520 0.2098 8.52e-08
39 7nnl:B 682 488 0.1049 0.1584 0.2213 1.17e-07 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
40 7nnl:B 682 100 0.0282 0.0425 0.2900 0.024 2a00:A, 2a29:A, 7bgy:B, 7bh1:B, 7bh2:B, 6hra:B, 6hrb:B, 7lc3:B, 7lc6:B, 5mrw:B, 5mrw:F, 5mrw:J, 7nnp:B, 7zrd:B, 7zre:B, 7zrg:B, 7zrh:B, 7zri:B, 7zrj:B, 7zrk:B, 7zrl:B, 7zrm:B
41 8ox4:A 870 291 0.0650 0.0770 0.2302 1.97e-07
42 8ox8:A 1125 315 0.0680 0.0622 0.2222 9.12e-07 8ox7:A, 8ox9:A, 7py4:A, 7vgj:A
43 4bbj:A 664 266 0.0612 0.0949 0.2368 9.23e-06 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
44 4bbj:A 664 47 0.0204 0.0316 0.4468 4.25e-05 4bev:A, 4byg:A, 3rfu:A, 3rfu:B, 3rfu:C, 3rfu:D
45 7bss:A 816 174 0.0398 0.0502 0.2356 2.26e-05 7bsu:A, 7bsv:A, 7bsw:A, 7vsg:A
46 8q74:A 783 57 0.0252 0.0332 0.4561 2.48e-05 8q75:A, 8q76:A
47 8q74:A 783 201 0.0417 0.0549 0.2139 0.011 8q75:A, 8q76:A
48 8q74:A 783 52 0.0184 0.0243 0.3654 0.023 8q75:A, 8q76:A
49 3sky:A 261 45 0.0214 0.0843 0.4889 1.07e-04
50 7vgh:B 1183 331 0.0689 0.0600 0.2145 0.001 7vgi:B
51 4umv:A 605 92 0.0291 0.0496 0.3261 0.002 4umw:A
52 4umv:A 605 44 0.0175 0.0298 0.4091 0.19 4umw:A
53 4umv:A 605 89 0.0233 0.0397 0.2697 0.78 4umw:A
54 8ox6:A 575 49 0.0155 0.0278 0.3265 0.055
55 6zxv:A 325 71 0.0214 0.0677 0.3099 0.54 6zxv:B, 6zxw:G
56 3r4c:A 268 29 0.0136 0.0522 0.4828 1.1
57 1sly:A 618 219 0.0476 0.0793 0.2237 2.2
58 6z7p:A 1025 44 0.0155 0.0156 0.3636 2.4 8bqe:B, 8bqe:C, 8bqe:E, 8bqe:D, 8bqe:F, 8bqe:A, 5n8p:A, 5n8p:B, 5n8p:C, 5n8p:D, 5n8p:E, 5n8p:F, 5n97:A, 5n97:B, 5n97:C, 5n97:D, 5n97:E, 5n97:F, 7peo:A, 6t72:A
59 6mrm:C 315 104 0.0252 0.0825 0.2500 5.9 6mrm:A, 6mrm:B
60 8c0v:A 823 54 0.0175 0.0219 0.3333 7.1 8c0v:C, 8c0v:E, 8c0w:B, 8c0w:D, 8c0w:F, 8u0v:A, 8u0v:C, 8u0v:E
61 5t2a:3 249 35 0.0175 0.0723 0.5143 7.2 8a3w:SG, 8a98:SG, 6az1:G, 5osg:P, 8ovj:SG, 8rxh:SG, 8rxx:SG

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218