BioLiP

>protein
SVRKILRMGDPILRKISEPVTEDEIQTKEFKKLIRDMFDTMRHAEGVGLAAPQIGILKQIVVVGSEDNERYPGTPDVPER
IILNPVITPLTKDTSGFWEGCLSVPGMRGYVERPNQIRMQWMDEKGNQFDETIDGYKAIVYQHECDHLQGILYVDRLKDT
KLFGFNETLDSSHNVLD

The query sequence (length=177) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1y6h:A	177	177	1.0000	1.0000	1.0000	2.96e-132	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
2	5kob:A	171	168	0.4802	0.4971	0.5060	2.77e-57	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
3	6jfc:B	161	168	0.4689	0.5155	0.4940	1.82e-52	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
4	5hgw:A	174	168	0.4520	0.4598	0.4762	7.12e-46	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
5	5cy7:A	171	169	0.4011	0.4152	0.4201	1.11e-42	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
6	1ix1:A	169	173	0.3955	0.4142	0.4046	2.33e-40	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
7	6jes:A	159	157	0.3220	0.3585	0.3631	4.91e-35	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
8	6jex:A	172	157	0.3503	0.3605	0.3949	1.76e-32	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
9	4wxl:C	165	157	0.3390	0.3636	0.3822	2.58e-30	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
10	4dr8:A	188	165	0.3503	0.3298	0.3758	6.01e-30	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
11	1bs4:A	168	162	0.3446	0.3631	0.3765	2.14e-28	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
12	3uwb:A	149	154	0.3503	0.4161	0.4026	2.25e-28	3uwa:A
13	4je6:A	193	165	0.3390	0.3109	0.3636	3.13e-28	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
14	1jym:A	179	154	0.3220	0.3184	0.3701	4.47e-28	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
15	6ck7:A	172	170	0.3729	0.3837	0.3882	4.63e-28	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
16	3cpm:A	184	169	0.3333	0.3207	0.3491	5.23e-27	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
17	3fwx:A	165	170	0.3390	0.3636	0.3529	5.11e-26	3fwx:B
18	5j46:A	169	158	0.3220	0.3373	0.3608	1.95e-25
19	3g5k:A	183	172	0.2938	0.2842	0.3023	4.75e-25	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
20	3oca:A	179	170	0.3446	0.3408	0.3588	1.13e-24	3oca:B, 3u04:A
21	5jex:A	203	184	0.3446	0.3005	0.3315	2.98e-22	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
22	3qu1:A	168	162	0.3277	0.3452	0.3580	1.15e-21	3qu1:B
23	3l87:A	200	178	0.3277	0.2900	0.3258	8.85e-21
24	2os1:A	179	180	0.3333	0.3296	0.3278	1.04e-20
25	3cmd:B	188	176	0.3164	0.2979	0.3182	1.58e-20	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
26	6ow7:P	196	178	0.3446	0.3112	0.3427	1.59e-20	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
27	2os3:A	205	182	0.3333	0.2878	0.3242	5.97e-20
28	2okl:A	185	177	0.3164	0.3027	0.3164	1.83e-19	2okl:B
29	1lm4:A	190	170	0.3277	0.3053	0.3412	2.17e-19	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
30	1ws1:A	151	130	0.2712	0.3179	0.3692	4.05e-19
31	2ew5:A	166	173	0.3051	0.3253	0.3121	2.25e-18	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
32	3e3u:A	196	169	0.3277	0.2959	0.3432	4.73e-18
33	1lqy:A	184	180	0.3220	0.3098	0.3167	1.42e-17
34	5mtc:A	137	148	0.2825	0.3650	0.3378	1.32e-15	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
35	4q24:A	224	108	0.1469	0.1161	0.2407	1.9
36	8sbg:A	456	91	0.1356	0.0526	0.2637	3.4
37	4f4f:A	464	25	0.0508	0.0194	0.3600	3.9	4f4f:B
38	2e37:C	310	82	0.1017	0.0581	0.2195	4.1	2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
39	6s32:D	352	42	0.0847	0.0426	0.3571	6.8	6s32:A, 6s32:B, 6s32:C
40	2bz8:B	57	39	0.0734	0.2281	0.3333	8.0	2bz8:A

[Back]